RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468253.1

NPHP4-206, Transcript of nephrocystin 4, humanhuman

TSL 2

Gene NPHP4, Length 781 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP4-206ENST00000468253 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
NPHP4-206ENST00000468253 TMEM150BA6NC51 233 aa22.36■■□□□ 1.17
NPHP4-206ENST00000468253 ZBTB39O15060 712 aa22.36■■□□□ 1.17
NPHP4-206ENST00000468253 MED24O75448 989 aa22.36■■□□□ 1.17
NPHP4-206ENST00000468253 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
NPHP4-206ENST00000468253 XKR9Q5GH70 373 aa22.36■■□□□ 1.17
NPHP4-206ENST00000468253 ODR4Q5SWX8 454 aa22.36■■□□□ 1.17
NPHP4-206ENST00000468253 AK8Q96MA6 479 aa22.36■■□□□ 1.17
NPHP4-206ENST00000468253 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
NPHP4-206ENST00000468253 ADAMTS10Q9H324 1103 aa22.36■■□□□ 1.17
NPHP4-206ENST00000468253 LAMA3Q16787 3333 aa22.36■■□□□ 1.17
NPHP4-206ENST00000468253 ZBBXA8MT70 800 aa22.35■■□□□ 1.17
NPHP4-206ENST00000468253 SLC26A4O43511 780 aa22.35■■□□□ 1.17
NPHP4-206ENST00000468253 CLCN3P51790 818 aa22.35■■□□□ 1.17
NPHP4-206ENST00000468253 TMEM62Q0P6H9 643 aa22.35■■□□□ 1.17
NPHP4-206ENST00000468253 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
NPHP4-206ENST00000468253 KRT79Q5XKE5 535 aa22.35■■□□□ 1.17
NPHP4-206ENST00000468253 PLA2G4FQ68DD2 849 aa22.35■■□□□ 1.17
NPHP4-206ENST00000468253 LRRC71Q8N4P6 559 aa22.35■■□□□ 1.17
NPHP4-206ENST00000468253 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
NPHP4-206ENST00000468253 SLC9A7Q96T83 725 aa22.35■■□□□ 1.17
NPHP4-206ENST00000468253 OSBPL7Q9BZF2 842 aa22.35■■□□□ 1.17
NPHP4-206ENST00000468253 AKT3Q9Y243 479 aa22.35■■□□□ 1.17
NPHP4-206ENST00000468253 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
NPHP4-206ENST00000468253 ASAP2O43150 1006 aa22.34■■□□□ 1.17
NPHP4-206ENST00000468253 DGAT1O75907 488 aa22.34■■□□□ 1.17
NPHP4-206ENST00000468253 GHRP10912 638 aa22.34■■□□□ 1.17
NPHP4-206ENST00000468253 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
NPHP4-206ENST00000468253 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
NPHP4-206ENST00000468253 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
NPHP4-206ENST00000468253 TCTN1Q2MV58 587 aa22.34■■□□□ 1.17
NPHP4-206ENST00000468253 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
NPHP4-206ENST00000468253 TCP11Q8WWU5 503 aa22.34■■□□□ 1.17
NPHP4-206ENST00000468253 SH2D3AQ9BRG2 576 aa22.34■■□□□ 1.17
NPHP4-206ENST00000468253 FTHL17Q9BXU8 183 aa22.34■■□□□ 1.17
NPHP4-206ENST00000468253 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
NPHP4-206ENST00000468253 CDHR5Q9HBB8 845 aa22.34■■□□□ 1.17
NPHP4-206ENST00000468253 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
NPHP4-206ENST00000468253 VTNP04004 478 aa22.33■■□□□ 1.17
NPHP4-206ENST00000468253 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
NPHP4-206ENST00000468253 KCNJ6P48051 423 aa22.33■■□□□ 1.17
NPHP4-206ENST00000468253 RARRES1P49788 294 aa22.33■■□□□ 1.17
NPHP4-206ENST00000468253 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
NPHP4-206ENST00000468253 WDR5P61964 334 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
NPHP4-206ENST00000468253 PIGOQ8TEQ8 1089 aa22.33■■□□□ 1.17
NPHP4-206ENST00000468253 PADI3Q9ULW8 664 aa22.33■■□□□ 1.17
NPHP4-206ENST00000468253 TET1Q8NFU7 2136 aa22.33■■□□□ 1.16
NPHP4-206ENST00000468253 GPR182O15218 404 aa22.32■■□□□ 1.16
NPHP4-206ENST00000468253 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
NPHP4-206ENST00000468253 LONP1P36776 959 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
NPHP4-206ENST00000468253 GPC3P51654 580 aa22.32■■□□□ 1.16
NPHP4-206ENST00000468253 PTPAQ15257 358 aa22.32■■□□□ 1.16
NPHP4-206ENST00000468253 KIZQ2M2Z5 673 aa22.32■■□□□ 1.16
NPHP4-206ENST00000468253 ZNF410Q86VK4 478 aa22.32■■□□□ 1.16
NPHP4-206ENST00000468253 CLIC4Q9Y696 253 aa22.32■■□□□ 1.16
NPHP4-206ENST00000468253 VWA3AA6NCI4 1184 aa22.31■■□□□ 1.16
NPHP4-206ENST00000468253 ENPP3O14638 875 aa22.31■■□□□ 1.16
NPHP4-206ENST00000468253 RPS6KA5O75582 802 aa22.31■■□□□ 1.16
NPHP4-206ENST00000468253 CD52P31358 61 aa22.31■■□□□ 1.16
NPHP4-206ENST00000468253 DRP2Q13474 957 aa22.31■■□□□ 1.16
NPHP4-206ENST00000468253 RAB30Q15771 203 aa22.31■■□□□ 1.16
NPHP4-206ENST00000468253 ECM1Q16610 540 aa22.31■■□□□ 1.16
NPHP4-206ENST00000468253 HYIQ5T013 277 aa22.31■■□□□ 1.16
NPHP4-206ENST00000468253 SNX29Q8TEQ0 813 aa22.31■■□□□ 1.16
NPHP4-206ENST00000468253 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
NPHP4-206ENST00000468253 LRCH3Q96II8 777 aa22.31■■□□□ 1.16
NPHP4-206ENST00000468253 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
NPHP4-206ENST00000468253 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
NPHP4-206ENST00000468253 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
NPHP4-206ENST00000468253 KIAA1024Q9UPX6 916 aa22.31■■□□□ 1.16
NPHP4-206ENST00000468253 DNM3Q9UQ16 869 aa22.31■■□□□ 1.16
NPHP4-206ENST00000468253 GINS2Q9Y248 185 aa22.31■■□□□ 1.16
NPHP4-206ENST00000468253 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
NPHP4-206ENST00000468253 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
NPHP4-206ENST00000468253 TMEM265A0A087WTH1 108 aa22.3■■□□□ 1.16
NPHP4-206ENST00000468253 AMHP03971 560 aa22.3■■□□□ 1.16
NPHP4-206ENST00000468253 POU5F1BQ06416 359 aa22.3■■□□□ 1.16
NPHP4-206ENST00000468253 PAK2Q13177 524 aa22.3■■□□□ 1.16
NPHP4-206ENST00000468253 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
NPHP4-206ENST00000468253 EMC2Q15006 297 aa22.3■■□□□ 1.16
NPHP4-206ENST00000468253 SLC39A14Q15043 492 aa22.3■■□□□ 1.16
NPHP4-206ENST00000468253 ATL3Q6DD88 541 aa22.3■■□□□ 1.16
NPHP4-206ENST00000468253 FAM173BQ6P4H8 233 aa22.3■■□□□ 1.16
NPHP4-206ENST00000468253 POTEGQ6S5H5 508 aa22.3■■□□□ 1.16
NPHP4-206ENST00000468253 HERC6Q8IVU3 1022 aa22.3■■□□□ 1.16
NPHP4-206ENST00000468253 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa22.3■■□□□ 1.16
NPHP4-206ENST00000468253 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
NPHP4-206ENST00000468253 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
NPHP4-206ENST00000468253 MTRQ99707 1265 aa22.3■■□□□ 1.16
NPHP4-206ENST00000468253 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
NPHP4-206ENST00000468253 ERVK-5Q9HDB9 667 aa22.3■■□□□ 1.16
NPHP4-206ENST00000468253 MSRAQ9UJ68 235 aa22.3■■□□□ 1.16
NPHP4-206ENST00000468253 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa22.3■■□□□ 1.16
NPHP4-206ENST00000468253 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
NPHP4-206ENST00000468253 DARSP14868 501 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
NPHP4-206ENST00000468253 NASPP49321 788 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
NPHP4-206ENST00000468253 RHPN2Q8IUC4 686 aa22.29■■□□□ 1.16
NPHP4-206ENST00000468253 MCPH1Q8NEM0 835 aa22.29■■□□□ 1.16
NPHP4-206ENST00000468253 TMEM40Q8WWA1 233 aa22.29■■□□□ 1.16
NPHP4-206ENST00000468253 TOP1MTQ969P6 601 aa22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16 ms