RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466185.1

PRPF4B-204, Transcript of pre-mRNA processing factor 4B, humanhuman

TSL 5

Gene PRPF4B, Length 1,297 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4B-204ENST00000466185 ZNF174Q15697 407 aa7.57□□□□□ -1.2
PRPF4B-204ENST00000466185 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
PRPF4B-204ENST00000466185 PGM2L1Q6PCE3 622 aa7.57□□□□□ -1.2
PRPF4B-204ENST00000466185 RASSF3Q86WH2 238 aa7.57□□□□□ -1.2
PRPF4B-204ENST00000466185 NME9Q86XW9 330 aa7.57□□□□□ -1.2
PRPF4B-204ENST00000466185 CMIPQ8IY22 773 aa7.57□□□□□ -1.2
PRPF4B-204ENST00000466185 CPA6Q8N4T0 437 aa7.57□□□□□ -1.2
PRPF4B-204ENST00000466185 SH3RF2Q8TEC5 729 aa7.57□□□□□ -1.2
PRPF4B-204ENST00000466185 HHIPL1Q96JK4 782 aa7.57□□□□□ -1.2
PRPF4B-204ENST00000466185 JMJD8Q96S16 334 aa7.57□□□□□ -1.2
PRPF4B-204ENST00000466185 MS4A5Q9H3V2 200 aa7.57□□□□□ -1.2
PRPF4B-204ENST00000466185 EPB41L1Q9H4G0 881 aa7.57□□□□□ -1.2
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PRPF4B-204ENST00000466185 TOMM22Q9NS69 142 aa7.57□□□□□ -1.2
PRPF4B-204ENST00000466185 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa7.57□□□□□ -1.2
PRPF4B-204ENST00000466185 TNFRSF10DQ9UBN6 386 aa7.57□□□□□ -1.2
PRPF4B-204ENST00000466185 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
PRPF4B-204ENST00000466185 KNSTRNQ9Y448 316 aa7.57□□□□□ -1.2
PRPF4B-204ENST00000466185 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa7.57□□□□□ -1.2
PRPF4B-204ENST00000466185 OVOS2Q6IE36 1432 aa7.57□□□□□ -1.2
PRPF4B-204ENST00000466185 SLIT3O75094 1523 aa7.57□□□□□ -1.2
PRPF4B-204ENST00000466185 FADS2P1A8MWK0 482 aa7.56□□□□□ -1.2
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PRPF4B-204ENST00000466185 GSC2O15499 205 aa7.56□□□□□ -1.2
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PRPF4B-204ENST00000466185 FUCA1P04066 466 aa7.56□□□□□ -1.2
PRPF4B-204ENST00000466185 FSTP19883 344 aa7.56□□□□□ -1.2
PRPF4B-204ENST00000466185 LSP1P33241 339 aa7.56□□□□□ -1.2
PRPF4B-204ENST00000466185 SCAND1P57086 179 aa7.56□□□□□ -1.2
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PRPF4B-204ENST00000466185 TMEM240Q5SV17 173 aa7.56□□□□□ -1.2
PRPF4B-204ENST00000466185 GPR158Q5T848 1215 aa7.56□□□□□ -1.2
PRPF4B-204ENST00000466185 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa7.56□□□□□ -1.2
PRPF4B-204ENST00000466185 PLEKHO2Q8TD55 490 aa7.56□□□□□ -1.2
PRPF4B-204ENST00000466185 MAP6Q96JE9 813 aa7.56□□□□□ -1.2
PRPF4B-204ENST00000466185 MTA3Q9BTC8 594 aa7.56□□□□□ -1.2
PRPF4B-204ENST00000466185 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa7.56□□□□□ -1.2
PRPF4B-204ENST00000466185 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
PRPF4B-204ENST00000466185 RWDD3Q9Y3V2 267 aa7.56□□□□□ -1.2
PRPF4B-204ENST00000466185 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa7.56□□□□□ -1.2
PRPF4B-204ENST00000466185 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa7.55□□□□□ -1.2
PRPF4B-204ENST00000466185 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa7.55□□□□□ -1.2
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PRPF4B-204ENST00000466185 PF4V1P10720 104 aa7.55□□□□□ -1.2
PRPF4B-204ENST00000466185 KRT85P78386 507 aa7.55□□□□□ -1.2
PRPF4B-204ENST00000466185 ODF1Q14990 250 aa7.55□□□□□ -1.2
PRPF4B-204ENST00000466185 SLCO6A1Q86UG4 719 aa7.55□□□□□ -1.2
PRPF4B-204ENST00000466185 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
PRPF4B-204ENST00000466185 ZNF610Q8N9Z0 462 aa7.55□□□□□ -1.2
PRPF4B-204ENST00000466185 NLGN2Q8NFZ4 835 aa7.55□□□□□ -1.2
PRPF4B-204ENST00000466185 ASB11Q8WXH4 323 aa7.55□□□□□ -1.2
PRPF4B-204ENST00000466185 LINC01599Q8WXQ3 324 aa7.55□□□□□ -1.2
PRPF4B-204ENST00000466185 HRASLS5Q96KN8 279 aa7.55□□□□□ -1.2
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PRPF4B-204ENST00000466185 PCIF1Q9H4Z3 704 aa7.55□□□□□ -1.2
PRPF4B-204ENST00000466185 MYH16Q9H6N6 1097 aa7.55□□□□□ -1.2
PRPF4B-204ENST00000466185 MKS1Q9NXB0 559 aa7.55□□□□□ -1.2
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PRPF4B-204ENST00000466185 EBF1Q9UH73 591 aa7.55□□□□□ -1.2
PRPF4B-204ENST00000466185 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
PRPF4B-204ENST00000466185 SRPK3Q9UPE1 567 aa7.55□□□□□ -1.2
PRPF4B-204ENST00000466185 ZNF652Q9Y2D9 606 aa7.55□□□□□ -1.2
PRPF4B-204ENST00000466185 GIT1Q9Y2X7 761 aa7.55□□□□□ -1.2
PRPF4B-204ENST00000466185 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
PRPF4B-204ENST00000466185 PCDHGA9Q9Y5G4 932 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
PRPF4B-204ENST00000466185 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa7.55□□□□□ -1.2
PRPF4B-204ENST00000466185 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa7.55□□□□□ -1.2
PRPF4B-204ENST00000466185 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa7.55□□□□□ -1.2
PRPF4B-204ENST00000466185 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa7.55□□□□□ -1.2
PRPF4B-204ENST00000466185 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa7.55□□□□□ -1.2
PRPF4B-204ENST00000466185 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
PRPF4B-204ENST00000466185 LRP6O75581 1613 aa7.54□□□□□ -1.2
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PRPF4B-204ENST00000466185 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
PRPF4B-204ENST00000466185 A0A1W2PQY0 241 aa7.54□□□□□ -1.2
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PRPF4B-204ENST00000466185 GOLGA8AA7E2F4 631 aa7.54□□□□□ -1.2
PRPF4B-204ENST00000466185 GOLGA8BA8MQT2 603 aa7.54□□□□□ -1.2
PRPF4B-204ENST00000466185 SCDO00767 359 aa7.54□□□□□ -1.2
PRPF4B-204ENST00000466185 PLIN1O60240 522 aa7.54□□□□□ -1.2
PRPF4B-204ENST00000466185 HIP1RO75146 1068 aa7.54□□□□□ -1.2
PRPF4B-204ENST00000466185 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
PRPF4B-204ENST00000466185 DGKIO75912 1065 aa7.54□□□□□ -1.2
PRPF4B-204ENST00000466185 GPR3P46089 330 aa7.54□□□□□ -1.2
PRPF4B-204ENST00000466185 KIF11P52732 1056 aa7.54□□□□□ -1.2
PRPF4B-204ENST00000466185 AOC3Q16853 763 aa7.54□□□□□ -1.2
PRPF4B-204ENST00000466185 FIGNQ5HY92 759 aa7.54□□□□□ -1.2
PRPF4B-204ENST00000466185 CPZQ66K79 652 aa7.54□□□□□ -1.2
PRPF4B-204ENST00000466185 DGKHQ86XP1 1220 aa7.54□□□□□ -1.2
PRPF4B-204ENST00000466185 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa7.54□□□□□ -1.2
PRPF4B-204ENST00000466185 EXOC8Q8IYI6 725 aa7.54□□□□□ -1.2
PRPF4B-204ENST00000466185 MORC4Q8TE76 937 aa7.54□□□□□ -1.2
PRPF4B-204ENST00000466185 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP7.54□□□□□ -1.2
PRPF4B-204ENST00000466185 LMBR1Q8WVP7 490 aa7.54□□□□□ -1.2
PRPF4B-204ENST00000466185 DLG3Q92796 817 aa7.54□□□□□ -1.2
PRPF4B-204ENST00000466185 COG3Q96JB2 828 aa7.54□□□□□ -1.2
PRPF4B-204ENST00000466185 CD244Q9BZW8 370 aa7.54□□□□□ -1.2
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