RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459627.1

SH3BP5-208, Transcript of SH3 domain binding protein 5, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP5, Length 473 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP5-208ENST00000459627 CALCRLQ16602 461 aa26.85■■□□□ 1.89
SH3BP5-208ENST00000459627 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP26.85■■□□□ 1.89
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SH3BP5-208ENST00000459627 TMX3Q96JJ7 454 aa26.85■■□□□ 1.89
SH3BP5-208ENST00000459627 YME1L1Q96TA2 773 aa26.85■■□□□ 1.89
SH3BP5-208ENST00000459627 C17orf80Q9BSJ5 609 aa26.85■■□□□ 1.89
SH3BP5-208ENST00000459627 TMEM60Q9H2L4 133 aa26.85■■□□□ 1.89
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SH3BP5-208ENST00000459627 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa26.84■■□□□ 1.89
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SH3BP5-208ENST00000459627 CEP89Q96ST8 783 aa26.84■■□□□ 1.89
SH3BP5-208ENST00000459627 ERVK-5Q9HDB9 667 aa26.84■■□□□ 1.89
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SH3BP5-208ENST00000459627 FAM228AQ86W67 206 aa26.83■■□□□ 1.89
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SH3BP5-208ENST00000459627 ZNF174Q15697 407 aa26.82■■□□□ 1.88
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SH3BP5-208ENST00000459627 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP26.81■■□□□ 1.88
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SH3BP5-208ENST00000459627 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa26.79■■□□□ 1.88
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SH3BP5-208ENST00000459627 CEP170P1Q96L14 293 aa26.78■■□□□ 1.88
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SH3BP5-208ENST00000459627 GJB2P29033 226 aa26.77■■□□□ 1.88
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SH3BP5-208ENST00000459627 KSR1Q8IVT5 923 aa26.77■■□□□ 1.88
SH3BP5-208ENST00000459627 NLRP7Q8WX94 980 aa26.77■■□□□ 1.88
SH3BP5-208ENST00000459627 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP26.77■■□□□ 1.88
SH3BP5-208ENST00000459627 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa26.76■■□□□ 1.87
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SH3BP5-208ENST00000459627 DENND3A2RUS2 1198 aa26.75■■□□□ 1.87
SH3BP5-208ENST00000459627 GPR182O15218 404 aa26.75■■□□□ 1.87
SH3BP5-208ENST00000459627 EPC2Q52LR7 807 aa26.75■■□□□ 1.87
SH3BP5-208ENST00000459627 XKR9Q5GH70 373 aa26.75■■□□□ 1.87
SH3BP5-208ENST00000459627 RHPN2Q8IUC4 686 aa26.75■■□□□ 1.87
SH3BP5-208ENST00000459627 CRIPAKQ8N1N5 446 aa26.75■■□□□ 1.87
SH3BP5-208ENST00000459627 FIBCD1Q8N539 461 aa26.75■■□□□ 1.87
SH3BP5-208ENST00000459627 TMEM143Q96AN5 459 aa26.75■■□□□ 1.87
SH3BP5-208ENST00000459627 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa26.75■■□□□ 1.87
SH3BP5-208ENST00000459627 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP26.75■■□□□ 1.87
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