RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000418601.1

GTPBP1-202, Transcript of GTP binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene GTPBP1, Length 810 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTPBP1-202ENST00000418601 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
GTPBP1-202ENST00000418601 ABI1Q8IZP0 508 aa22.03■■□□□ 1.12
GTPBP1-202ENST00000418601 SLC39A11Q8N1S5 342 aa22.03■■□□□ 1.12
GTPBP1-202ENST00000418601 NME8Q8N427 588 aa22.03■■□□□ 1.12
GTPBP1-202ENST00000418601 SUMF1Q8NBK3 374 aa22.03■■□□□ 1.12
GTPBP1-202ENST00000418601 CDHR1Q96JP9 859 aa22.03■■□□□ 1.12
GTPBP1-202ENST00000418601 PCYT2Q99447 389 aa22.03■■□□□ 1.12
GTPBP1-202ENST00000418601 AZI2Q9H6S1 392 aa22.03■■□□□ 1.12
GTPBP1-202ENST00000418601 CDHR5Q9HBB8 845 aa22.03■■□□□ 1.12
GTPBP1-202ENST00000418601 WNT16Q9UBV4 365 aa22.03■■□□□ 1.12
GTPBP1-202ENST00000418601 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
GTPBP1-202ENST00000418601 SPDYE4A6NLX3 237 aa22.02■■□□□ 1.12
GTPBP1-202ENST00000418601 HOXA2O43364 376 aa22.02■■□□□ 1.12
GTPBP1-202ENST00000418601 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
GTPBP1-202ENST00000418601 CABP7Q86V35 215 aa22.02■■□□□ 1.12
GTPBP1-202ENST00000418601 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
GTPBP1-202ENST00000418601 RNF19AQ9NV58 838 aa22.02■■□□□ 1.12
GTPBP1-202ENST00000418601 ZSWIM5Q9P217 1185 aa22.02■■□□□ 1.12
GTPBP1-202ENST00000418601 SALL3Q9BXA9 1300 aa22.02■■□□□ 1.12
GTPBP1-202ENST00000418601 C2orf16Q68DN1 1984 aa22.01■■□□□ 1.11
GTPBP1-202ENST00000418601 BAHCC1Q9P281 2608 aa22.01■■□□□ 1.11
GTPBP1-202ENST00000418601 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
GTPBP1-202ENST00000418601 GPR182O15218 404 aa22.01■■□□□ 1.11
GTPBP1-202ENST00000418601 CXCL14O95715 111 aa22.01■■□□□ 1.11
GTPBP1-202ENST00000418601 MTHFD1LQ6UB35 978 aa22.01■■□□□ 1.11
GTPBP1-202ENST00000418601 AUTS2Q8WXX7 1259 aa22.01■■□□□ 1.11
GTPBP1-202ENST00000418601 PPP1R16BQ96T49 567 aa22.01■■□□□ 1.11
GTPBP1-202ENST00000418601 SFXN1Q9H9B4 322 aa22.01■■□□□ 1.11
GTPBP1-202ENST00000418601 IGSF9Q9P2J2 1179 aa22.01■■□□□ 1.11
GTPBP1-202ENST00000418601 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa22■■□□□ 1.11
GTPBP1-202ENST00000418601 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP22■■□□□ 1.11
GTPBP1-202ENST00000418601 C20orf194Q5TEA3 1177 aa22■■□□□ 1.11
GTPBP1-202ENST00000418601 USP17L6PQ6QN14 398 aa22■■□□□ 1.11
GTPBP1-202ENST00000418601 GPR149Q86SP6 731 aa22■■□□□ 1.11
GTPBP1-202ENST00000418601 FAM228AQ86W67 206 aa22■■□□□ 1.11
GTPBP1-202ENST00000418601 C1orf210Q8IVY1 113 aa22■■□□□ 1.11
GTPBP1-202ENST00000418601 CUL5Q93034 780 aa22■■□□□ 1.11
GTPBP1-202ENST00000418601 RIOX1Q9H6W3 641 aa22■■□□□ 1.11
GTPBP1-202ENST00000418601 USP24Q9UPU5 2620 aa21.99■■□□□ 1.11
GTPBP1-202ENST00000418601 ADRB1P08588 477 aa21.99■■□□□ 1.11
GTPBP1-202ENST00000418601 FAM189BP81408 668 aa21.99■■□□□ 1.11
GTPBP1-202ENST00000418601 MTMR1Q13613 665 aa21.99■■□□□ 1.11
GTPBP1-202ENST00000418601 RSAD2Q8WXG1 361 aa21.99■■□□□ 1.11
GTPBP1-202ENST00000418601 CHAMP1Q96JM3 812 aa21.99■■□□□ 1.11
GTPBP1-202ENST00000418601 ZBP1Q9H171 429 aa21.99■■□□□ 1.11
GTPBP1-202ENST00000418601 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa21.99■■□□□ 1.11
GTPBP1-202ENST00000418601 RALYQ9UKM9 306 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
GTPBP1-202ENST00000418601 DCDC2BA2VCK2 349 aa21.98■■□□□ 1.11
GTPBP1-202ENST00000418601 POTEMA6NI47 508 aa21.98■■□□□ 1.11
GTPBP1-202ENST00000418601 CYTH3O43739 400 aa21.98■■□□□ 1.11
GTPBP1-202ENST00000418601 ITGB5P18084 799 aa21.98■■□□□ 1.11
GTPBP1-202ENST00000418601 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
GTPBP1-202ENST00000418601 POTEGQ6S5H5 508 aa21.98■■□□□ 1.11
GTPBP1-202ENST00000418601 VPS52Q8N1B4 723 aa21.98■■□□□ 1.11
GTPBP1-202ENST00000418601 SLC22A17Q8WUG5 538 aa21.98■■□□□ 1.11
GTPBP1-202ENST00000418601 PIBF1Q8WXW3 757 aa21.98■■□□□ 1.11
GTPBP1-202ENST00000418601 TMEM169Q96HH4 297 aa21.98■■□□□ 1.11
GTPBP1-202ENST00000418601 OSMRQ99650 979 aa21.98■■□□□ 1.11
GTPBP1-202ENST00000418601 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
GTPBP1-202ENST00000418601 SIT1Q9Y3P8 196 aa21.98■■□□□ 1.11
GTPBP1-202ENST00000418601 CHD6Q8TD26 2715 aa21.98■■□□□ 1.11
GTPBP1-202ENST00000418601 SPTBN2O15020 2390 aa21.97■■□□□ 1.11
GTPBP1-202ENST00000418601 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa21.97■■□□□ 1.11
GTPBP1-202ENST00000418601 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
GTPBP1-202ENST00000418601 LMNB2Q03252 620 aa21.97■■□□□ 1.11
GTPBP1-202ENST00000418601 DSC3Q14574 896 aa21.97■■□□□ 1.11
GTPBP1-202ENST00000418601 GRM4Q14833 912 aa21.97■■□□□ 1.11
GTPBP1-202ENST00000418601 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
GTPBP1-202ENST00000418601 RNF169Q8NCN4 708 aa21.97■■□□□ 1.11
GTPBP1-202ENST00000418601 SRFP11831 508 aa21.96■■□□□ 1.11
GTPBP1-202ENST00000418601 KLRC1P26715 233 aa21.96■■□□□ 1.11
GTPBP1-202ENST00000418601 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
GTPBP1-202ENST00000418601 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP21.96■■□□□ 1.11
GTPBP1-202ENST00000418601 SEC23AQ15436 765 aa21.96■■□□□ 1.11
GTPBP1-202ENST00000418601 KIZQ2M2Z5 673 aa21.96■■□□□ 1.11
GTPBP1-202ENST00000418601 LETM2Q2VYF4 491 aa21.96■■□□□ 1.11
GTPBP1-202ENST00000418601 CLLU1OSQ5K130 101 aa21.96■■□□□ 1.11
GTPBP1-202ENST00000418601 RTKNQ9BST9 563 aa21.96■■□□□ 1.11
GTPBP1-202ENST00000418601 KRT23Q9C075 422 aa21.96■■□□□ 1.11
GTPBP1-202ENST00000418601 ARHGEF3Q9NR81 526 aa21.96■■□□□ 1.11
GTPBP1-202ENST00000418601 SLC9A2Q9UBY0 812 aa21.96■■□□□ 1.11
GTPBP1-202ENST00000418601 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
GTPBP1-202ENST00000418601 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa21.95■■□□□ 1.1
GTPBP1-202ENST00000418601 SPTLC1O15269 473 aa21.95■■□□□ 1.1
GTPBP1-202ENST00000418601 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
GTPBP1-202ENST00000418601 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
GTPBP1-202ENST00000418601 BCAR1P56945 870 aa21.95■■□□□ 1.1
GTPBP1-202ENST00000418601 ARHGAP8P85298 464 aa21.95■■□□□ 1.1
GTPBP1-202ENST00000418601 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa21.95■■□□□ 1.1
GTPBP1-202ENST00000418601 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa21.95■■□□□ 1.1
GTPBP1-202ENST00000418601 GPR152Q8TDT2 470 aa21.95■■□□□ 1.1
GTPBP1-202ENST00000418601 IRAK3Q9Y616 596 aa21.95■■□□□ 1.1
GTPBP1-202ENST00000418601 MEIS2O14770 477 aa21.94■■□□□ 1.1
GTPBP1-202ENST00000418601 CTSAP10619 480 aa21.94■■□□□ 1.1
GTPBP1-202ENST00000418601 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
GTPBP1-202ENST00000418601 STAT5BP51692 787 aa21.94■■□□□ 1.1
GTPBP1-202ENST00000418601 GIT2Q14161 759 aa21.94■■□□□ 1.1
GTPBP1-202ENST00000418601 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa21.94■■□□□ 1.1
GTPBP1-202ENST00000418601 HELQQ8TDG4 1101 aa21.94■■□□□ 1.1
GTPBP1-202ENST00000418601 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
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