RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411651.6

SUMO3-204, Transcript of small ubiquitin-like modifier 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SUMO3, Length 1,921 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO3-204ENST00000411651 SH3D19Q5HYK7 790 aa22.12■■□□□ 1.13
SUMO3-204ENST00000411651 ARHGEF16Q5VV41 709 aa22.12■■□□□ 1.13
SUMO3-204ENST00000411651 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
SUMO3-204ENST00000411651 TMCO3Q6UWJ1 677 aa22.12■■□□□ 1.13
SUMO3-204ENST00000411651 VSIG10LQ86VR7 867 aa22.12■■□□□ 1.13
SUMO3-204ENST00000411651 FMNL3Q8IVF7 1028 aa22.12■■□□□ 1.13
SUMO3-204ENST00000411651 FAM186BQ8IYM0 893 aa22.12■■□□□ 1.13
SUMO3-204ENST00000411651 NLRC4Q9NPP4 1024 aa22.12■■□□□ 1.13
SUMO3-204ENST00000411651 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa22.12■■□□□ 1.13
SUMO3-204ENST00000411651 LOC285556D6RIA3 1793 aa22.11■■□□□ 1.13
SUMO3-204ENST00000411651 MYH11P35749 1972 aa22.11■■□□□ 1.13
SUMO3-204ENST00000411651 CCDC151A5D8V7 595 aa22.11■■□□□ 1.13
SUMO3-204ENST00000411651 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP22.11■■□□□ 1.136e-6■■■■□ 21
SUMO3-204ENST00000411651 UCHL3P15374 230 aa22.11■■□□□ 1.13
SUMO3-204ENST00000411651 PON1P27169 355 aa22.11■■□□□ 1.13
SUMO3-204ENST00000411651 MAGEA1P43355 309 aa22.11■■□□□ 1.13
SUMO3-204ENST00000411651 KCNA1Q09470 495 aa22.11■■□□□ 1.13
SUMO3-204ENST00000411651 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
SUMO3-204ENST00000411651 BRD3Q15059 726 aa22.11■■□□□ 1.13
SUMO3-204ENST00000411651 SLC18A3Q16572 532 aa22.11■■□□□ 1.13
SUMO3-204ENST00000411651 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
SUMO3-204ENST00000411651 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa22.11■■□□□ 1.13
SUMO3-204ENST00000411651 NLRX1Q86UT6 975 aa22.11■■□□□ 1.13
SUMO3-204ENST00000411651 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
SUMO3-204ENST00000411651 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
SUMO3-204ENST00000411651 ALS2CR12Q96Q35 445 aa22.11■■□□□ 1.13
SUMO3-204ENST00000411651 PRKCIP41743 596 aa22.1■■□□□ 1.13
SUMO3-204ENST00000411651 ASIC2Q16515 512 aa22.1■■□□□ 1.13
SUMO3-204ENST00000411651 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
SUMO3-204ENST00000411651 TRPM4Q8TD43 1214 aa22.1■■□□□ 1.13
SUMO3-204ENST00000411651 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
SUMO3-204ENST00000411651 CDHR1Q96JP9 859 aa22.1■■□□□ 1.13
SUMO3-204ENST00000411651 DRC1Q96MC2 740 aa22.1■■□□□ 1.13
SUMO3-204ENST00000411651 CRACR2AQ9BSW2 395 aa22.1■■□□□ 1.13
SUMO3-204ENST00000411651 TEX13BQ9BXU2 312 aa22.1■■□□□ 1.13
SUMO3-204ENST00000411651 RAB21Q9UL25 225 aa22.1■■□□□ 1.13
SUMO3-204ENST00000411651 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa22.1■■□□□ 1.13
SUMO3-204ENST00000411651 SSC5DA1L4H1 1573 aa22.1■■□□□ 1.13
SUMO3-204ENST00000411651 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
SUMO3-204ENST00000411651 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP22.1■■□□□ 1.134e-6■■■■■ 30.1
SUMO3-204ENST00000411651 PLS3P13797 630 aa22.1■■□□□ 1.13
SUMO3-204ENST00000411651 LMNB1P20700 586 aa22.1■■□□□ 1.13
SUMO3-204ENST00000411651 YWHABP31946 246 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
SUMO3-204ENST00000411651 CASP4P49662 377 aa22.1■■□□□ 1.13
SUMO3-204ENST00000411651 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
SUMO3-204ENST00000411651 IWS1Q96ST2 819 aa22.1■■□□□ 1.13
SUMO3-204ENST00000411651 ZNF446Q9NWS9 450 aa22.1■■□□□ 1.13
SUMO3-204ENST00000411651 GGA3Q9NZ52 723 aa22.1■■□□□ 1.13
SUMO3-204ENST00000411651 TMOD4Q9NZQ9 345 aa22.1■■□□□ 1.13
SUMO3-204ENST00000411651 MAPK13O15264 365 aa22.09■■□□□ 1.13
SUMO3-204ENST00000411651 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
SUMO3-204ENST00000411651 HMGCS2P54868 508 aa22.09■■□□□ 1.13
SUMO3-204ENST00000411651 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
SUMO3-204ENST00000411651 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa22.09■■□□□ 1.13
SUMO3-204ENST00000411651 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
SUMO3-204ENST00000411651 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
SUMO3-204ENST00000411651 NSMFQ6X4W1 530 aa22.09■■□□□ 1.13
SUMO3-204ENST00000411651 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
SUMO3-204ENST00000411651 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
SUMO3-204ENST00000411651 BCAS3Q9H6U6 928 aa22.09■■□□□ 1.13
SUMO3-204ENST00000411651 HOXC10Q9NYD6 342 aa22.09■■□□□ 1.13
SUMO3-204ENST00000411651 SAMM50Q9Y512 469 aa22.09■■□□□ 1.13
SUMO3-204ENST00000411651 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
SUMO3-204ENST00000411651 NFASCO94856 1347 aa22.08■■□□□ 1.13
SUMO3-204ENST00000411651 BTNL10A8MVZ5 291 aa22.08■■□□□ 1.13
SUMO3-204ENST00000411651 CLIC2O15247 247 aa22.08■■□□□ 1.13
SUMO3-204ENST00000411651 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
SUMO3-204ENST00000411651 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
SUMO3-204ENST00000411651 RAPGEF1Q13905 1077 aa22.08■■□□□ 1.13
SUMO3-204ENST00000411651 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
SUMO3-204ENST00000411651 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP22.08■■□□□ 1.132e-21■■■■■ 37.2
SUMO3-204ENST00000411651 HVCN1Q96D96 273 aa22.08■■□□□ 1.13
SUMO3-204ENST00000411651 PARD6BQ9BYG5 372 aa22.08■■□□□ 1.13
SUMO3-204ENST00000411651 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa22.08■■□□□ 1.13
SUMO3-204ENST00000411651 NR3C2P08235 984 aa22.08■■□□□ 1.12
SUMO3-204ENST00000411651 RFX1P22670 979 aa22.08■■□□□ 1.12
SUMO3-204ENST00000411651 ITIH3Q06033 890 aa22.08■■□□□ 1.12
SUMO3-204ENST00000411651 KLHL30Q0D2K2 578 aa22.08■■□□□ 1.12
SUMO3-204ENST00000411651 SPAG5Q96R06 1193 aa22.08■■□□□ 1.12
SUMO3-204ENST00000411651 ACAD9Q9H845 621 aa22.08■■□□□ 1.12
SUMO3-204ENST00000411651 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.12
SUMO3-204ENST00000411651 TSKSQ9UJT2 592 aa22.08■■□□□ 1.12
SUMO3-204ENST00000411651 RIPK3Q9Y572 518 aa22.08■■□□□ 1.12
SUMO3-204ENST00000411651 MACROD2A1Z1Q3 448 aa22.07■■□□□ 1.12
SUMO3-204ENST00000411651 GFPT2O94808 682 aa22.07■■□□□ 1.12
SUMO3-204ENST00000411651 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
SUMO3-204ENST00000411651 SLC9A1P19634 815 aa22.07■■□□□ 1.12
SUMO3-204ENST00000411651 JAM2P57087 298 aa22.07■■□□□ 1.12
SUMO3-204ENST00000411651 GTF2BQ00403 316 aa22.07■■□□□ 1.12
SUMO3-204ENST00000411651 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
SUMO3-204ENST00000411651 TCERG1LQ5VWI1 586 aa22.07■■□□□ 1.12
SUMO3-204ENST00000411651 IQCEQ6IPM2 695 aa22.07■■□□□ 1.12
SUMO3-204ENST00000411651 WNK4Q96J92 1243 aa22.07■■□□□ 1.12
SUMO3-204ENST00000411651 ACCSQ96QU6 501 aa22.07■■□□□ 1.12
SUMO3-204ENST00000411651 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
SUMO3-204ENST00000411651 SIX2Q9NPC8 291 aa22.07■■□□□ 1.12
SUMO3-204ENST00000411651 GCNT4Q9P109 453 aa22.07■■□□□ 1.12
SUMO3-204ENST00000411651 TFR2Q9UP52 801 aa22.07■■□□□ 1.12
SUMO3-204ENST00000411651 DUSP10Q9Y6W6 482 aa22.07■■□□□ 1.12
SUMO3-204ENST00000411651 K7ENM7 598 aa22.06■■□□□ 1.12
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