RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000404162.2

HOXD12-201, Transcript of homeobox D12, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD12, Length 841 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12-201ENST00000404162 SMARCA1P28370 1054 aa22.03■■□□□ 1.12
HOXD12-201ENST00000404162 MTHFRP42898 656 aa22.03■■□□□ 1.12
HOXD12-201ENST00000404162 KRT17Q04695 432 aa22.03■■□□□ 1.12
HOXD12-201ENST00000404162 SART3Q15020 963 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
HOXD12-201ENST00000404162 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa22.03■■□□□ 1.12
HOXD12-201ENST00000404162 FLCNQ8NFG4 579 aa22.03■■□□□ 1.12
HOXD12-201ENST00000404162 NCOA7Q8NI08 942 aa22.03■■□□□ 1.12
HOXD12-201ENST00000404162 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
HOXD12-201ENST00000404162 MAP3K14Q99558 947 aa22.03■■□□□ 1.12
HOXD12-201ENST00000404162 OSMRQ99650 979 aa22.03■■□□□ 1.12
HOXD12-201ENST00000404162 SDF4Q9BRK5 362 aa22.03■■□□□ 1.12
HOXD12-201ENST00000404162 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
HOXD12-201ENST00000404162 NFASCO94856 1347 aa22.03■■□□□ 1.12
HOXD12-201ENST00000404162 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa22.02■■□□□ 1.12
HOXD12-201ENST00000404162 HBP1O60381 514 aa22.02■■□□□ 1.12
HOXD12-201ENST00000404162 PTH1RQ03431 593 aa22.02■■□□□ 1.12
HOXD12-201ENST00000404162 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
HOXD12-201ENST00000404162 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
HOXD12-201ENST00000404162 KIZQ2M2Z5 673 aa22.02■■□□□ 1.12
HOXD12-201ENST00000404162 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF654Q8IZM8 581 aa22.02■■□□□ 1.12
HOXD12-201ENST00000404162 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
HOXD12-201ENST00000404162 SPG21Q9NZD8 308 aa22.02■■□□□ 1.12
HOXD12-201ENST00000404162 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa22.01■■□□□ 1.11
HOXD12-201ENST00000404162 NPR3P17342 541 aa22.01■■□□□ 1.11
HOXD12-201ENST00000404162 KIF5BP33176 963 aa22.01■■□□□ 1.11
HOXD12-201ENST00000404162 PPM1AP35813 382 aa22.01■■□□□ 1.11
HOXD12-201ENST00000404162 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
HOXD12-201ENST00000404162 FEZF2Q8TBJ5 459 aa22.01■■□□□ 1.11
HOXD12-201ENST00000404162 SLC26A2P50443 739 aa22■■□□□ 1.11
HOXD12-201ENST00000404162 KIAA1841Q6NSI8 718 aa22■■□□□ 1.11
HOXD12-201ENST00000404162 SLC39A11Q8N1S5 342 aa22■■□□□ 1.11
HOXD12-201ENST00000404162 PLCD3Q8N3E9 789 aa22■■□□□ 1.11
HOXD12-201ENST00000404162 LY9Q9HBG7 655 aa22■■□□□ 1.11
HOXD12-201ENST00000404162 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
HOXD12-201ENST00000404162 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
HOXD12-201ENST00000404162 ZBTB42B2RXF5 422 aa21.99■■□□□ 1.11
HOXD12-201ENST00000404162 DDAH1O94760 285 aa21.99■■□□□ 1.11
HOXD12-201ENST00000404162 CXCL14O95715 111 aa21.99■■□□□ 1.11
HOXD12-201ENST00000404162 VTNP04004 478 aa21.99■■□□□ 1.11
HOXD12-201ENST00000404162 AOC1P19801 751 aa21.99■■□□□ 1.11
HOXD12-201ENST00000404162 CA8P35219 290 aa21.99■■□□□ 1.11
HOXD12-201ENST00000404162 NUCB1Q02818 461 aa21.99■■□□□ 1.11
HOXD12-201ENST00000404162 ANGPT1Q15389 498 aa21.99■■□□□ 1.11
HOXD12-201ENST00000404162 ATAT1Q5SQI0 421 aa21.99■■□□□ 1.11
HOXD12-201ENST00000404162 LRRC43Q8N309 656 aa21.99■■□□□ 1.11
HOXD12-201ENST00000404162 LZTS2Q9BRK4 669 aa21.99■■□□□ 1.11
HOXD12-201ENST00000404162 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
HOXD12-201ENST00000404162 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa21.98■■□□□ 1.11
HOXD12-201ENST00000404162 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
HOXD12-201ENST00000404162 BACH1O14867 736 aa21.98■■□□□ 1.11
HOXD12-201ENST00000404162 HOXA2O43364 376 aa21.98■■□□□ 1.11
HOXD12-201ENST00000404162 GPR32O75388 356 aa21.98■■□□□ 1.11
HOXD12-201ENST00000404162 CCNE2O96020 404 aa21.98■■□□□ 1.11
HOXD12-201ENST00000404162 RXRAP19793 462 aa21.98■■□□□ 1.11
HOXD12-201ENST00000404162 ATP4AP20648 1035 aa21.98■■□□□ 1.11
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF484Q5JVG2 852 aa21.98■■□□□ 1.11
HOXD12-201ENST00000404162 ABHD15Q6UXT9 468 aa21.98■■□□□ 1.11
HOXD12-201ENST00000404162 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
HOXD12-201ENST00000404162 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
HOXD12-201ENST00000404162 CCDC105Q8IYK2 499 aa21.98■■□□□ 1.11
HOXD12-201ENST00000404162 ABI1Q8IZP0 508 aa21.98■■□□□ 1.11
HOXD12-201ENST00000404162 PGBD1Q96JS3 809 aa21.98■■□□□ 1.11
HOXD12-201ENST00000404162 USTQ9Y2C2 406 aa21.98■■□□□ 1.11
HOXD12-201ENST00000404162 COL1A2P08123 1366 aa21.98■■□□□ 1.11
HOXD12-201ENST00000404162 EOMESO95936 686 aa21.97■■□□□ 1.11
HOXD12-201ENST00000404162 EPCAMP16422 314 aa21.97■■□□□ 1.11
HOXD12-201ENST00000404162 GNAQP50148 359 aa21.97■■□□□ 1.11
HOXD12-201ENST00000404162 CLLU1OSQ5K130 101 aa21.97■■□□□ 1.11
HOXD12-201ENST00000404162 ECHDC2Q86YB7 292 aa21.97■■□□□ 1.11
HOXD12-201ENST00000404162 CCDC82Q8N4S0 544 aa21.97■■□□□ 1.11
HOXD12-201ENST00000404162 RMDN1Q96DB5 314 aa21.97■■□□□ 1.11
HOXD12-201ENST00000404162 CYP26B1Q9NR63 512 aa21.97■■□□□ 1.11
HOXD12-201ENST00000404162 C22orf31O95567 290 aa21.96■■□□□ 1.11
HOXD12-201ENST00000404162 IGHDP01880 384 aa21.96■■□□□ 1.11
HOXD12-201ENST00000404162 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP21.96■■□□□ 1.11
HOXD12-201ENST00000404162 FAM160B1Q5W0V3 765 aa21.96■■□□□ 1.11
HOXD12-201ENST00000404162 PDXDC2PQ6P474 469 aa21.96■■□□□ 1.11
HOXD12-201ENST00000404162 DTWD2Q8NBA8 298 aa21.96■■□□□ 1.11
HOXD12-201ENST00000404162 RNF169Q8NCN4 708 aa21.96■■□□□ 1.11
HOXD12-201ENST00000404162 AUTS2Q8WXX7 1259 aa21.96■■□□□ 1.11
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF302Q9NR11 478 aa21.96■■□□□ 1.11
HOXD12-201ENST00000404162 DENND4AQ7Z401 1863 aa21.96■■□□□ 1.11
HOXD12-201ENST00000404162 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa21.96■■□□□ 1.11
HOXD12-201ENST00000404162 CEP55Q53EZ4 464 aa21.95■■□□□ 1.1
HOXD12-201ENST00000404162 SWSAP1Q6NVH7 229 aa21.95■■□□□ 1.1
HOXD12-201ENST00000404162 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa21.95■■□□□ 1.1
HOXD12-201ENST00000404162 METTL13Q8N6R0 699 aa21.95■■□□□ 1.1
HOXD12-201ENST00000404162 SLC22A17Q8WUG5 538 aa21.95■■□□□ 1.1
HOXD12-201ENST00000404162 DZANK1Q9NVP4 752 aa21.95■■□□□ 1.1
HOXD12-201ENST00000404162 DMXL1Q9Y485 3027 aa21.95■■□□□ 1.1
HOXD12-201ENST00000404162 CACNA1AO00555 2505 aa21.94■■□□□ 1.1
HOXD12-201ENST00000404162 MEIS1O00470 390 aa21.94■■□□□ 1.1
HOXD12-201ENST00000404162 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
HOXD12-201ENST00000404162 BCAR1P56945 870 aa21.94■■□□□ 1.1
HOXD12-201ENST00000404162 TMC5Q6UXY8 1006 aa21.94■■□□□ 1.1
HOXD12-201ENST00000404162 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
HOXD12-201ENST00000404162 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa21.94■■□□□ 1.1
HOXD12-201ENST00000404162 VPS52Q8N1B4 723 aa21.94■■□□□ 1.1
HOXD12-201ENST00000404162 HELQQ8TDG4 1101 aa21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37 ms