RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000359315.6

TPGS1-201, Transcript of tubulin polyglutamylase complex subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TPGS1, Length 1,114 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPGS1-201ENST00000359315 PTGDRQ13258 359 aa30.22■■■□□ 2.43
TPGS1-201ENST00000359315 FAM117BQ6P1L5 589 aa30.22■■■□□ 2.43
TPGS1-201ENST00000359315 MYOCDQ8IZQ8 938 aa30.22■■■□□ 2.43
TPGS1-201ENST00000359315 APBB2Q92870 758 aa30.22■■■□□ 2.43
TPGS1-201ENST00000359315 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP30.22■■■□□ 2.43
TPGS1-201ENST00000359315 MSRAQ9UJ68 235 aa30.22■■■□□ 2.43
TPGS1-201ENST00000359315 AKT3Q9Y243 479 aa30.22■■■□□ 2.43
TPGS1-201ENST00000359315 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP30.22■■■□□ 2.43
TPGS1-201ENST00000359315 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa30.22■■■□□ 2.43
TPGS1-201ENST00000359315 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP30.21■■■□□ 2.43
TPGS1-201ENST00000359315 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP30.21■■■□□ 2.43
TPGS1-201ENST00000359315 EFCAB14O75071 495 aa30.21■■■□□ 2.43
TPGS1-201ENST00000359315 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP30.21■■■□□ 2.43
TPGS1-201ENST00000359315 CEP170P1Q96L14 293 aa30.21■■■□□ 2.43
TPGS1-201ENST00000359315 MAP7D2Q96T17 732 aa30.21■■■□□ 2.43
TPGS1-201ENST00000359315 ADAMTS10Q9H324 1103 aa30.21■■■□□ 2.43
TPGS1-201ENST00000359315 ZNF576Q9H609 170 aa30.21■■■□□ 2.43
TPGS1-201ENST00000359315 PADI3Q9ULW8 664 aa30.21■■■□□ 2.43
TPGS1-201ENST00000359315 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP30.21■■■□□ 2.43
TPGS1-201ENST00000359315 PTPRSQ13332 1948 aa30.2■■■□□ 2.43
TPGS1-201ENST00000359315 WDR81Q562E7 1941 aa30.2■■■□□ 2.43
TPGS1-201ENST00000359315 LCHNA4D1U4 455 aa30.2■■■□□ 2.43
TPGS1-201ENST00000359315 MAFO75444 373 aaPredicted RBP30.2■■■□□ 2.43
TPGS1-201ENST00000359315 MED24O75448 989 aa30.2■■■□□ 2.43
TPGS1-201ENST00000359315 CA3P07451 260 aa30.2■■■□□ 2.43
TPGS1-201ENST00000359315 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa30.2■■■□□ 2.43
TPGS1-201ENST00000359315 FERMT3Q86UX7 667 aa30.2■■■□□ 2.43
TPGS1-201ENST00000359315 NEK9Q8TD19 979 aa30.2■■■□□ 2.43
TPGS1-201ENST00000359315 TMEM265A0A087WTH1 108 aa30.19■■■□□ 2.42
TPGS1-201ENST00000359315 GJB5O95377 273 aa30.19■■■□□ 2.42
TPGS1-201ENST00000359315 TMOD1P28289 359 aa30.19■■■□□ 2.42
TPGS1-201ENST00000359315 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP30.19■■■□□ 2.42
TPGS1-201ENST00000359315 GRIN2CQ14957 1233 aa30.19■■■□□ 2.42
TPGS1-201ENST00000359315 IL17AQ16552 155 aa30.19■■■□□ 2.42
TPGS1-201ENST00000359315 RILPL1Q5EBL4 403 aa30.19■■■□□ 2.42
TPGS1-201ENST00000359315 SPRED2Q7Z698 418 aa30.19■■■□□ 2.42
TPGS1-201ENST00000359315 TMX1Q9H3N1 280 aa30.19■■■□□ 2.42
TPGS1-201ENST00000359315 ERVK-5Q9HDB9 667 aa30.19■■■□□ 2.42
TPGS1-201ENST00000359315 SQORQ9Y6N5 450 aa30.19■■■□□ 2.42
TPGS1-201ENST00000359315 LYPLA2O95372 231 aa30.18■■■□□ 2.42
TPGS1-201ENST00000359315 AMHP03971 560 aa30.18■■■□□ 2.42
TPGS1-201ENST00000359315 SYT1P21579 422 aa30.18■■■□□ 2.42
TPGS1-201ENST00000359315 GPC3P51654 580 aa30.18■■■□□ 2.42
TPGS1-201ENST00000359315 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP30.18■■■□□ 2.42
TPGS1-201ENST00000359315 PAK2Q13177 524 aa30.18■■■□□ 2.42
TPGS1-201ENST00000359315 XKR9Q5GH70 373 aa30.18■■■□□ 2.42
TPGS1-201ENST00000359315 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP30.18■■■□□ 2.42
TPGS1-201ENST00000359315 FAM228AQ86W67 206 aa30.18■■■□□ 2.42
TPGS1-201ENST00000359315 CATSPER3Q86XQ3 398 aa30.18■■■□□ 2.42
TPGS1-201ENST00000359315 TLL1O43897 1013 aa30.17■■■□□ 2.42
TPGS1-201ENST00000359315 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP30.17■■■□□ 2.42
TPGS1-201ENST00000359315 USP38Q8NB14 1042 aa30.17■■■□□ 2.42
TPGS1-201ENST00000359315 PIGOQ8TEQ8 1089 aa30.17■■■□□ 2.42
TPGS1-201ENST00000359315 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP30.17■■■□□ 2.42
TPGS1-201ENST00000359315 ENPP3O14638 875 aa30.16■■■□□ 2.42
TPGS1-201ENST00000359315 RPS6KA5O75582 802 aa30.16■■■□□ 2.42
TPGS1-201ENST00000359315 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP30.16■■■□□ 2.42
TPGS1-201ENST00000359315 PPP2R2DQ66LE6 453 aa30.16■■■□□ 2.42
TPGS1-201ENST00000359315 HSCBQ8IWL3 235 aa30.16■■■□□ 2.42
TPGS1-201ENST00000359315 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP30.16■■■□□ 2.42
TPGS1-201ENST00000359315 ZBED2Q9BTP6 218 aa30.16■■■□□ 2.42
TPGS1-201ENST00000359315 SLC28A3Q9HAS3 691 aa30.16■■■□□ 2.42
TPGS1-201ENST00000359315 PP2D1A8MPX8 630 aa30.15■■■□□ 2.42
TPGS1-201ENST00000359315 MGEA5O60502 916 aa30.15■■■□□ 2.42
TPGS1-201ENST00000359315 UPP2O95045 317 aa30.15■■■□□ 2.42
TPGS1-201ENST00000359315 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP30.15■■■□□ 2.42
TPGS1-201ENST00000359315 POTEGQ6S5H5 508 aa30.15■■■□□ 2.42
TPGS1-201ENST00000359315 KSR1Q8IVT5 923 aa30.15■■■□□ 2.42
TPGS1-201ENST00000359315 MYLIPQ8WY64 445 aa30.15■■■□□ 2.42
TPGS1-201ENST00000359315 TMEM143Q96AN5 459 aa30.15■■■□□ 2.42
TPGS1-201ENST00000359315 TUFT1Q9NNX1 390 aa30.15■■■□□ 2.42
TPGS1-201ENST00000359315 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa30.15■■■□□ 2.42
TPGS1-201ENST00000359315 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP30.15■■■□□ 2.42
TPGS1-201ENST00000359315 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa30.15■■■□□ 2.42
TPGS1-201ENST00000359315 GBF1Q92538 1859 aa30.14■■■□□ 2.42
TPGS1-201ENST00000359315 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP30.14■■■□□ 2.42
TPGS1-201ENST00000359315 EMC2Q15006 297 aa30.14■■■□□ 2.42
TPGS1-201ENST00000359315 ECM1Q16610 540 aa30.14■■■□□ 2.42
TPGS1-201ENST00000359315 OTUD6AQ7L8S5 288 aa30.14■■■□□ 2.42
TPGS1-201ENST00000359315 SLC7A3Q8WY07 619 aa30.14■■■□□ 2.42
TPGS1-201ENST00000359315 TOP1MTQ969P6 601 aa30.14■■■□□ 2.42
TPGS1-201ENST00000359315 MICAL3Q7RTP6 2002 aa30.13■■■□□ 2.41
TPGS1-201ENST00000359315 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP30.13■■■□□ 2.41
TPGS1-201ENST00000359315 PDCP20941 246 aa30.13■■■□□ 2.41
TPGS1-201ENST00000359315 FGFR4P22455 802 aa30.13■■■□□ 2.41
TPGS1-201ENST00000359315 RFC5P40937 340 aa30.13■■■□□ 2.41
TPGS1-201ENST00000359315 RARRES1P49788 294 aa30.13■■■□□ 2.41
TPGS1-201ENST00000359315 TAP1Q03518 808 aa30.13■■■□□ 2.41
TPGS1-201ENST00000359315 RESTQ13127 1097 aa30.13■■■□□ 2.41
TPGS1-201ENST00000359315 IGSF22Q8N9C0 903 aa30.13■■■□□ 2.41
TPGS1-201ENST00000359315 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP30.13■■■□□ 2.41
TPGS1-201ENST00000359315 MTMR6Q9Y217 621 aa30.13■■■□□ 2.41
TPGS1-201ENST00000359315 A0A087WZ62 844 aa30.12■■■□□ 2.41
TPGS1-201ENST00000359315 PRPHP41219 470 aa30.12■■■□□ 2.41
TPGS1-201ENST00000359315 FAM173BQ6P4H8 233 aa30.12■■■□□ 2.41
TPGS1-201ENST00000359315 BRAPQ7Z569 592 aa30.12■■■□□ 2.41
TPGS1-201ENST00000359315 RHPN2Q8IUC4 686 aa30.12■■■□□ 2.41
TPGS1-201ENST00000359315 NLRP7Q8WX94 980 aa30.12■■■□□ 2.41
TPGS1-201ENST00000359315 SCLT1Q96NL6 688 aa30.12■■■□□ 2.41
TPGS1-201ENST00000359315 RAD9AQ99638 391 aa30.12■■■□□ 2.41
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