RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331222.5

CLN8-201, Transcript of CLN8, transmembrane ER and ERGIC protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLN8, Length 7,169 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8-201ENST00000331222 SLC16A4O15374 487 aa11.31□□□□□ -0.6
CLN8-201ENST00000331222 CTSHP09668 335 aa11.31□□□□□ -0.6
CLN8-201ENST00000331222 MXI1P50539 228 aa11.31□□□□□ -0.6
CLN8-201ENST00000331222 SPZ1Q9BXG8 430 aa11.31□□□□□ -0.6
CLN8-201ENST00000331222 STAT3P40763 770 aa11.3□□□□□ -0.6
CLN8-201ENST00000331222 RAP1GDS1P52306 607 aa11.3□□□□□ -0.6
CLN8-201ENST00000331222 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
CLN8-201ENST00000331222 DDIASQ8IXT1 998 aa11.3□□□□□ -0.6
CLN8-201ENST00000331222 TTLL6Q8N841 843 aa11.3□□□□□ -0.6
CLN8-201ENST00000331222 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
CLN8-201ENST00000331222 TMEM206Q9H813 350 aa11.3□□□□□ -0.6
CLN8-201ENST00000331222 GJB4Q9NTQ9 266 aa11.3□□□□□ -0.6
CLN8-201ENST00000331222 SENP1Q9P0U3 644 aa11.3□□□□□ -0.6
CLN8-201ENST00000331222 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa11.3□□□□□ -0.6
CLN8-201ENST00000331222 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
CLN8-201ENST00000331222 GAP43P17677 238 aa11.3□□□□□ -0.6
CLN8-201ENST00000331222 TCP1P17987 556 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
CLN8-201ENST00000331222 PPP3CCP48454 512 aa11.3□□□□□ -0.6
CLN8-201ENST00000331222 GPC3P51654 580 aa11.3□□□□□ -0.6
CLN8-201ENST00000331222 MFSD4BQ5TF39 518 aa11.3□□□□□ -0.6
CLN8-201ENST00000331222 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
CLN8-201ENST00000331222 TMEM270Q6UE05 265 aa11.3□□□□□ -0.6
CLN8-201ENST00000331222 UNC5CLQ8IV45 518 aa11.3□□□□□ -0.6
CLN8-201ENST00000331222 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
CLN8-201ENST00000331222 NFKBIL1Q9UBC1 381 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
CLN8-201ENST00000331222 ADGRL2O95490 1459 aa11.3□□□□□ -0.6
CLN8-201ENST00000331222 USP17L5A8MUK1 530 aa11.3□□□□□ -0.6
CLN8-201ENST00000331222 CMA1P23946 247 aa11.3□□□□□ -0.6
CLN8-201ENST00000331222 ESRRGP62508 458 aa11.3□□□□□ -0.6
CLN8-201ENST00000331222 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
CLN8-201ENST00000331222 RGS9BPQ6ZS82 235 aa11.3□□□□□ -0.6
CLN8-201ENST00000331222 CCNYL1Q8N7R7 359 aa11.3□□□□□ -0.6
CLN8-201ENST00000331222 EPAS1Q99814 870 aa11.3□□□□□ -0.6
CLN8-201ENST00000331222 ARIH2O95376 493 aa11.3□□□□□ -0.6
CLN8-201ENST00000331222 STXBP2Q15833 593 aa11.3□□□□□ -0.6
CLN8-201ENST00000331222 SPDYAQ5MJ70 313 aa11.3□□□□□ -0.6
CLN8-201ENST00000331222 SWSAP1Q6NVH7 229 aa11.3□□□□□ -0.6
CLN8-201ENST00000331222 CCDC51Q96ER9 411 aa11.3□□□□□ -0.6
CLN8-201ENST00000331222 SH2D3AQ9BRG2 576 aa11.3□□□□□ -0.6
CLN8-201ENST00000331222 BHMT2Q9H2M3 363 aa11.3□□□□□ -0.6
CLN8-201ENST00000331222 KANSL2Q9H9L4 492 aa11.3□□□□□ -0.6
CLN8-201ENST00000331222 ADA2Q9NZK5 511 aa11.3□□□□□ -0.6
CLN8-201ENST00000331222 ATP10BO94823 1461 aa11.3□□□□□ -0.6
CLN8-201ENST00000331222 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
CLN8-201ENST00000331222 HSPA6P17066 643 aa11.3□□□□□ -0.6
CLN8-201ENST00000331222 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
CLN8-201ENST00000331222 PMS1P54277 932 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
CLN8-201ENST00000331222 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
CLN8-201ENST00000331222 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
CLN8-201ENST00000331222 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
CLN8-201ENST00000331222 SAAL1Q96ER3 474 aa11.3□□□□□ -0.6
CLN8-201ENST00000331222 DYDC2Q96IM9 177 aa11.3□□□□□ -0.6
CLN8-201ENST00000331222 SPATA33Q96N06 139 aa11.3□□□□□ -0.6
CLN8-201ENST00000331222 WDR11Q9BZH6 1224 aa11.3□□□□□ -0.6
CLN8-201ENST00000331222 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
CLN8-201ENST00000331222 DIAPH2O60879 1101 aa11.29□□□□□ -0.6
CLN8-201ENST00000331222 HUS1O60921 280 aa11.29□□□□□ -0.6
CLN8-201ENST00000331222 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
CLN8-201ENST00000331222 RMDN1Q96DB5 314 aa11.29□□□□□ -0.6
CLN8-201ENST00000331222 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa11.29□□□□□ -0.6
CLN8-201ENST00000331222 H0Y3Z8 333 aa11.29□□□□□ -0.6
CLN8-201ENST00000331222 FOSP01100 380 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
CLN8-201ENST00000331222 CRKP46108 304 aa11.29□□□□□ -0.6
CLN8-201ENST00000331222 GCLMP48507 274 aa11.29□□□□□ -0.6
CLN8-201ENST00000331222 GALNT17Q6IS24 598 aa11.29□□□□□ -0.6
CLN8-201ENST00000331222 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
CLN8-201ENST00000331222 VMP1Q96GC9 406 aa11.29□□□□□ -0.6
CLN8-201ENST00000331222 ZBTB18Q99592 522 aa11.29□□□□□ -0.6
CLN8-201ENST00000331222 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa11.29□□□□□ -0.6
CLN8-201ENST00000331222 TMEM260Q9NX78 707 aa11.29□□□□□ -0.6
CLN8-201ENST00000331222 PYCARDQ9ULZ3 195 aa11.29□□□□□ -0.6
CLN8-201ENST00000331222 ARAP3Q8WWN8 1544 aa11.29□□□□□ -0.6
CLN8-201ENST00000331222 AOX1Q06278 1338 aa11.29□□□□□ -0.6
CLN8-201ENST00000331222 RSPH10B2B2RC85 870 aa11.29□□□□□ -0.6
CLN8-201ENST00000331222 BRD1O95696 1058 aa11.29□□□□□ -0.6
CLN8-201ENST00000331222 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
CLN8-201ENST00000331222 RSPH10BP0C881 870 aa11.29□□□□□ -0.6
CLN8-201ENST00000331222 GNAT1P11488 350 aa11.29□□□□□ -0.6
CLN8-201ENST00000331222 TMPRSS15P98073 1019 aa11.29□□□□□ -0.6
CLN8-201ENST00000331222 DR1Q01658 176 aa11.29□□□□□ -0.6
CLN8-201ENST00000331222 MCTP2Q6DN12 878 aa11.29□□□□□ -0.6
CLN8-201ENST00000331222 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP11.29□□□□□ -0.6
CLN8-201ENST00000331222 PCDHA6Q9UN73 950 aa11.29□□□□□ -0.6
CLN8-201ENST00000331222 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
CLN8-201ENST00000331222 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa11.29□□□□□ -0.6
CLN8-201ENST00000331222 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
CLN8-201ENST00000331222 M0QYV0 167 aa11.29□□□□□ -0.6
CLN8-201ENST00000331222 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
CLN8-201ENST00000331222 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
CLN8-201ENST00000331222 TTLL11Q8NHH1 800 aa11.29□□□□□ -0.6
CLN8-201ENST00000331222 ATP9BO43861 1147 aa11.29□□□□□ -0.6
CLN8-201ENST00000331222 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
CLN8-201ENST00000331222 TAC1P20366 129 aa11.29□□□□□ -0.6
CLN8-201ENST00000331222 OR6P1Q8NGX9 317 aa11.29□□□□□ -0.6
CLN8-201ENST00000331222 AGAP3Q96P47 875 aa11.29□□□□□ -0.6
CLN8-201ENST00000331222 EFHD1Q9BUP0 239 aa11.29□□□□□ -0.6
CLN8-201ENST00000331222 MTMR6Q9Y217 621 aa11.29□□□□□ -0.6
CLN8-201ENST00000331222 ARL4DP49703 201 aa11.29□□□□□ -0.6
CLN8-201ENST00000331222 FAM47EQ6ZV65 393 aa11.29□□□□□ -0.6
CLN8-201ENST00000331222 CRLF3Q8IUI8 442 aa11.29□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.3 ms