RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299339.2

CLDN10-201, Transcript of claudin 10, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLDN10, Length 949 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN10-201ENST00000299339 ZDHHC9Q9Y397 364 aa7.55□□□□□ -1.2
CLDN10-201ENST00000299339 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa7.55□□□□□ -1.2
CLDN10-201ENST00000299339 GPR179Q6PRD1 2367 aa7.54□□□□□ -1.2
CLDN10-201ENST00000299339 FSD2A1L4K1 749 aa7.54□□□□□ -1.2
CLDN10-201ENST00000299339 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
CLDN10-201ENST00000299339 H3BNC9 293 aa7.54□□□□□ -1.2
CLDN10-201ENST00000299339 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
CLDN10-201ENST00000299339 GNB5O14775 395 aa7.54□□□□□ -1.2
CLDN10-201ENST00000299339 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
CLDN10-201ENST00000299339 STX6O43752 255 aa7.54□□□□□ -1.2
CLDN10-201ENST00000299339 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
CLDN10-201ENST00000299339 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
CLDN10-201ENST00000299339 PCP11498 1178 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
CLDN10-201ENST00000299339 NCLP19338 710 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
CLDN10-201ENST00000299339 CHRNA4P43681 627 aa7.54□□□□□ -1.2
CLDN10-201ENST00000299339 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
CLDN10-201ENST00000299339 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
CLDN10-201ENST00000299339 GPM6BQ13491 265 aa7.54□□□□□ -1.2
CLDN10-201ENST00000299339 BFSP2Q13515 415 aa7.54□□□□□ -1.2
CLDN10-201ENST00000299339 ME3Q16798 604 aa7.54□□□□□ -1.2
CLDN10-201ENST00000299339 ATL3Q6DD88 541 aa7.54□□□□□ -1.2
CLDN10-201ENST00000299339 CNKSR3Q6P9H4 555 aa7.54□□□□□ -1.2
CLDN10-201ENST00000299339 ANKMY2Q8IV38 441 aa7.54□□□□□ -1.2
CLDN10-201ENST00000299339 SLC9A9Q8IVB4 645 aa7.54□□□□□ -1.2
CLDN10-201ENST00000299339 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa7.54□□□□□ -1.2
CLDN10-201ENST00000299339 KIAA2013Q8IYS2 634 aa7.54□□□□□ -1.2
CLDN10-201ENST00000299339 PGBD3Q8N328 593 aa7.54□□□□□ -1.2
CLDN10-201ENST00000299339 TMEM105Q8N8V8 129 aa7.54□□□□□ -1.2
CLDN10-201ENST00000299339 BTBD6Q96KE9 485 aa7.54□□□□□ -1.2
CLDN10-201ENST00000299339 SAMD11Q96NU1 681 aa7.54□□□□□ -1.2
CLDN10-201ENST00000299339 CRISPLD1Q9H336 500 aa7.54□□□□□ -1.2
CLDN10-201ENST00000299339 VCPKMTQ9H867 229 aa7.54□□□□□ -1.2
CLDN10-201ENST00000299339 LMBRD1Q9NUN5 540 aa7.54□□□□□ -1.2
CLDN10-201ENST00000299339 DLL3Q9NYJ7 618 aa7.54□□□□□ -1.2
CLDN10-201ENST00000299339 CD207Q9UJ71 328 aa7.54□□□□□ -1.2
CLDN10-201ENST00000299339 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
CLDN10-201ENST00000299339 INSL6Q9Y581 213 aa7.54□□□□□ -1.2
CLDN10-201ENST00000299339 USP3Q9Y6I4 520 aa7.54□□□□□ -1.2
CLDN10-201ENST00000299339 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa7.53□□□□□ -1.2
CLDN10-201ENST00000299339 E7EWF7 191 aa7.53□□□□□ -1.2
CLDN10-201ENST00000299339 ZNF213O14771 459 aa7.53□□□□□ -1.2
CLDN10-201ENST00000299339 GPAA1O43292 621 aa7.53□□□□□ -1.2
CLDN10-201ENST00000299339 PFKFB2O60825 505 aa7.53□□□□□ -1.2
CLDN10-201ENST00000299339 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
CLDN10-201ENST00000299339 FGAP02671 866 aa7.53□□□□□ -1.2
CLDN10-201ENST00000299339 BMP4P12644 408 aa7.53□□□□□ -1.2
CLDN10-201ENST00000299339 SYT1P21579 422 aa7.53□□□□□ -1.2
CLDN10-201ENST00000299339 MCM5P33992 734 aa7.53□□□□□ -1.2
CLDN10-201ENST00000299339 USP5P45974 858 aa7.53□□□□□ -1.2
CLDN10-201ENST00000299339 DGKGP49619 791 aa7.53□□□□□ -1.2
CLDN10-201ENST00000299339 HYAL1Q12794 435 aa7.53□□□□□ -1.2
CLDN10-201ENST00000299339 TRDNQ13061 729 aa7.53□□□□□ -1.2
CLDN10-201ENST00000299339 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
CLDN10-201ENST00000299339 GPNMBQ14956 572 aa7.53□□□□□ -1.2
CLDN10-201ENST00000299339 TCTN1Q2MV58 587 aa7.53□□□□□ -1.2
CLDN10-201ENST00000299339 FAM47CQ5HY64 1035 aa7.53□□□□□ -1.2
CLDN10-201ENST00000299339 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa7.53□□□□□ -1.2
CLDN10-201ENST00000299339 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
CLDN10-201ENST00000299339 GIMAP6Q6P9H5 292 aa7.53□□□□□ -1.2
CLDN10-201ENST00000299339 TTC6Q86TZ1 520 aa7.53□□□□□ -1.2
CLDN10-201ENST00000299339 CLEC10AQ8IUN9 316 aa7.53□□□□□ -1.2
CLDN10-201ENST00000299339 TMTC2Q8N394 836 aa7.53□□□□□ -1.2
CLDN10-201ENST00000299339 NCOA7Q8NI08 942 aa7.53□□□□□ -1.2
CLDN10-201ENST00000299339 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
CLDN10-201ENST00000299339 RIPOR3Q96MK2 946 aa7.53□□□□□ -1.2
CLDN10-201ENST00000299339 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
CLDN10-201ENST00000299339 TEX13BQ9BXU2 312 aa7.53□□□□□ -1.2
CLDN10-201ENST00000299339 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
CLDN10-201ENST00000299339 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa7.53□□□□□ -1.2
CLDN10-201ENST00000299339 TPCN1Q9ULQ1 816 aa7.53□□□□□ -1.2
CLDN10-201ENST00000299339 TMX2Q9Y320 296 aa7.53□□□□□ -1.2
CLDN10-201ENST00000299339 RIPK3Q9Y572 518 aa7.53□□□□□ -1.2
CLDN10-201ENST00000299339 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
CLDN10-201ENST00000299339 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa7.53□□□□□ -1.2
CLDN10-201ENST00000299339 NBEAQ8NFP9 2946 aa7.53□□□□□ -1.2
CLDN10-201ENST00000299339 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa7.52□□□□□ -1.21
CLDN10-201ENST00000299339 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa7.52□□□□□ -1.21
CLDN10-201ENST00000299339 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa7.52□□□□□ -1.21
CLDN10-201ENST00000299339 SFI1A8K8P3 1242 aa7.52□□□□□ -1.21
CLDN10-201ENST00000299339 PIK3R2O00459 728 aa7.52□□□□□ -1.21
CLDN10-201ENST00000299339 LINC01565O15544 149 aa7.52□□□□□ -1.21
CLDN10-201ENST00000299339 EFCAB14O75071 495 aa7.52□□□□□ -1.21
CLDN10-201ENST00000299339 EYA4O95677 639 aa7.52□□□□□ -1.21
CLDN10-201ENST00000299339 EPXP11678 715 aa7.52□□□□□ -1.21
CLDN10-201ENST00000299339 PDE6AP16499 860 aa7.52□□□□□ -1.21
CLDN10-201ENST00000299339 ATP4AP20648 1035 aa7.52□□□□□ -1.21
CLDN10-201ENST00000299339 AMPD1P23109 780 aa7.52□□□□□ -1.21
CLDN10-201ENST00000299339 PLCD1P51178 756 aa7.52□□□□□ -1.21
CLDN10-201ENST00000299339 RCAN1P53805 252 aa7.52□□□□□ -1.21
CLDN10-201ENST00000299339 ZNF445P59923 1031 aa7.52□□□□□ -1.21
CLDN10-201ENST00000299339 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
CLDN10-201ENST00000299339 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
CLDN10-201ENST00000299339 CTBSQ01459 385 aa7.52□□□□□ -1.21
CLDN10-201ENST00000299339 DPYDQ12882 1025 aa7.52□□□□□ -1.21
CLDN10-201ENST00000299339 PPP2R5BQ15173 497 aa7.52□□□□□ -1.21
CLDN10-201ENST00000299339 PTPN21Q16825 1174 aa7.52□□□□□ -1.21
CLDN10-201ENST00000299339 EFHC2Q5JST6 749 aa7.52□□□□□ -1.21
CLDN10-201ENST00000299339 TMEM63BQ5T3F8 832 aa7.52□□□□□ -1.21
CLDN10-201ENST00000299339 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
CLDN10-201ENST00000299339 MCTP1Q6DN14 999 aa7.52□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.1 ms