RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000291892.10

RDH13-201, Transcript of retinol dehydrogenase 13, humanhuman

TSL 2

Gene RDH13, Length 3,022 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH13-201ENST00000291892 CNNM4Q6P4Q7 775 aa14.68□□□□□ -0.06
RDH13-201ENST00000291892 RTL9Q8NET4 1388 aa14.68□□□□□ -0.06
RDH13-201ENST00000291892 OR52E8Q6IFG1 317 aa14.68□□□□□ -0.06
RDH13-201ENST00000291892 BLIDQ8IZY5 108 aa14.68□□□□□ -0.06
RDH13-201ENST00000291892 PGM2Q96G03 612 aa14.68□□□□□ -0.06
RDH13-201ENST00000291892 OSGEPQ9NPF4 335 aa14.68□□□□□ -0.06
RDH13-201ENST00000291892 TMOD4Q9NZQ9 345 aa14.68□□□□□ -0.06
RDH13-201ENST00000291892 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa14.68□□□□□ -0.06
RDH13-201ENST00000291892 CCDC188H7C350 402 aa14.68□□□□□ -0.06
RDH13-201ENST00000291892 AUHQ13825 339 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
RDH13-201ENST00000291892 DIXDC1Q155Q3 683 aa14.68□□□□□ -0.06
RDH13-201ENST00000291892 C6orf118Q5T5N4 469 aa14.68□□□□□ -0.06
RDH13-201ENST00000291892 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
RDH13-201ENST00000291892 TMTC3Q6ZXV5 915 aa14.68□□□□□ -0.06
RDH13-201ENST00000291892 TAOK1Q7L7X3 1001 aa14.68□□□□□ -0.06
RDH13-201ENST00000291892 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
RDH13-201ENST00000291892 NCAPG2Q86XI2 1143 aa14.68□□□□□ -0.06
RDH13-201ENST00000291892 ZFAND2BQ8WV99 257 aa14.68□□□□□ -0.06
RDH13-201ENST00000291892 C18orf8Q96DM3 657 aa14.68□□□□□ -0.06
RDH13-201ENST00000291892 DYDC2Q96IM9 177 aa14.68□□□□□ -0.06
RDH13-201ENST00000291892 CRAMP1Q96RY5 1269 aa14.68□□□□□ -0.06
RDH13-201ENST00000291892 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa14.68□□□□□ -0.06
RDH13-201ENST00000291892 CUEDC2Q9H467 287 aa14.68□□□□□ -0.06
RDH13-201ENST00000291892 CEP72Q9P209 647 aa14.68□□□□□ -0.06
RDH13-201ENST00000291892 LRP2BPQ9P2M1 347 aa14.68□□□□□ -0.06
RDH13-201ENST00000291892 OAS1P00973 400 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
RDH13-201ENST00000291892 AGTP01019 485 aa14.67□□□□□ -0.06
RDH13-201ENST00000291892 CABP4P57796 275 aa14.67□□□□□ -0.06
RDH13-201ENST00000291892 TBC1D16Q8TBP0 767 aa14.67□□□□□ -0.06
RDH13-201ENST00000291892 LRRC8CQ8TDW0 803 aa14.67□□□□□ -0.06
RDH13-201ENST00000291892 C5P01031 1676 aa14.67□□□□□ -0.06
RDH13-201ENST00000291892 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
RDH13-201ENST00000291892 AFPP02771 609 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
RDH13-201ENST00000291892 MYL1P05976 194 aa14.67□□□□□ -0.06
RDH13-201ENST00000291892 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
RDH13-201ENST00000291892 LBRQ14739 615 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
RDH13-201ENST00000291892 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
RDH13-201ENST00000291892 RFWD3Q6PCD5 774 aa14.67□□□□□ -0.06
RDH13-201ENST00000291892 TPCN2Q8NHX9 752 aa14.67□□□□□ -0.06
RDH13-201ENST00000291892 ASAP3Q8TDY4 903 aa14.67□□□□□ -0.06
RDH13-201ENST00000291892 SPOCK2Q92563 424 aa14.67□□□□□ -0.06
RDH13-201ENST00000291892 ERP44Q9BS26 406 aa14.67□□□□□ -0.06
RDH13-201ENST00000291892 TBC1D10AQ9BXI6 508 aa14.67□□□□□ -0.06
RDH13-201ENST00000291892 ADAM33Q9BZ11 813 aa14.67□□□□□ -0.06
RDH13-201ENST00000291892 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
RDH13-201ENST00000291892 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa14.67□□□□□ -0.06
RDH13-201ENST00000291892 DENND2DQ9H6A0 471 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
RDH13-201ENST00000291892 CHD4Q14839 1912 aa14.67□□□□□ -0.06
RDH13-201ENST00000291892 RPTORQ8N122 1335 aa14.67□□□□□ -0.06
RDH13-201ENST00000291892 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa14.66□□□□□ -0.06
RDH13-201ENST00000291892 COQ9O75208 318 aa14.66□□□□□ -0.06
RDH13-201ENST00000291892 SPATA31D3P0C874 917 aa14.66□□□□□ -0.06
RDH13-201ENST00000291892 CCNFP41002 786 aa14.66□□□□□ -0.06
RDH13-201ENST00000291892 CCNG1P51959 295 aa14.66□□□□□ -0.06
RDH13-201ENST00000291892 MCL1Q07820 350 aa14.66□□□□□ -0.06
RDH13-201ENST00000291892 TROAPQ12815 778 aa14.66□□□□□ -0.06
RDH13-201ENST00000291892 RASGRF1Q13972 1273 aa14.66□□□□□ -0.06
RDH13-201ENST00000291892 MYBPC3Q14896 1274 aa14.66□□□□□ -0.06
RDH13-201ENST00000291892 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa14.66□□□□□ -0.06
RDH13-201ENST00000291892 CENPPQ6IPU0 288 aa14.66□□□□□ -0.06
RDH13-201ENST00000291892 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa14.66□□□□□ -0.06
RDH13-201ENST00000291892 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa14.66□□□□□ -0.06
RDH13-201ENST00000291892 SPATA5Q8NB90 893 aa14.66□□□□□ -0.06
RDH13-201ENST00000291892 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
RDH13-201ENST00000291892 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
RDH13-201ENST00000291892 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa14.66□□□□□ -0.06
RDH13-201ENST00000291892 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
RDH13-201ENST00000291892 CYP27B1O15528 508 aa14.66□□□□□ -0.06
RDH13-201ENST00000291892 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
RDH13-201ENST00000291892 CGB2Q6NT52 195 aa14.66□□□□□ -0.06
RDH13-201ENST00000291892 CADPS2Q86UW7 1296 aa14.66□□□□□ -0.06
RDH13-201ENST00000291892 JAMLQ86YT9 394 aa14.66□□□□□ -0.06
RDH13-201ENST00000291892 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa14.66□□□□□ -0.06
RDH13-201ENST00000291892 ZHX3Q9H4I2 956 aa14.66□□□□□ -0.06
RDH13-201ENST00000291892 ZNF232Q9UNY5 417 aa14.66□□□□□ -0.06
RDH13-201ENST00000291892 DISP2A7MBM2 1401 aa14.66□□□□□ -0.06
RDH13-201ENST00000291892 MYMKA6NI61 221 aa14.66□□□□□ -0.06
RDH13-201ENST00000291892 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa14.66□□□□□ -0.06
RDH13-201ENST00000291892 PFDN1O60925 122 aa14.66□□□□□ -0.06
RDH13-201ENST00000291892 TXKP42681 527 aa14.66□□□□□ -0.06
RDH13-201ENST00000291892 MPP2Q14168 576 aa14.66□□□□□ -0.06
RDH13-201ENST00000291892 SETDB1Q15047 1291 aa14.66□□□□□ -0.06
RDH13-201ENST00000291892 RCN1Q15293 331 aa14.66□□□□□ -0.06
RDH13-201ENST00000291892 ALX1Q15699 326 aa14.66□□□□□ -0.06
RDH13-201ENST00000291892 EXOC3L4Q17RC7 722 aa14.66□□□□□ -0.06
RDH13-201ENST00000291892 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
RDH13-201ENST00000291892 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
RDH13-201ENST00000291892 OPTNQ96CV9 577 aa14.66□□□□□ -0.06
RDH13-201ENST00000291892 PITPNM3Q9BZ71 974 aa14.66□□□□□ -0.06
RDH13-201ENST00000291892 CPVLQ9H3G5 476 aa14.66□□□□□ -0.06
RDH13-201ENST00000291892 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa14.66□□□□□ -0.06
RDH13-201ENST00000291892 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP14.66□□□□□ -0.06
RDH13-201ENST00000291892 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP14.66□□□□□ -0.06
RDH13-201ENST00000291892 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa14.65□□□□□ -0.06
RDH13-201ENST00000291892 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
RDH13-201ENST00000291892 BRAFP15056 766 aa14.65□□□□□ -0.06
RDH13-201ENST00000291892 KLRC3Q07444 240 aa14.65□□□□□ -0.06
RDH13-201ENST00000291892 UBE4AQ14139 1066 aa14.65□□□□□ -0.06
RDH13-201ENST00000291892 DBN1Q16643 649 aa14.65□□□□□ -0.06
RDH13-201ENST00000291892 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.1 ms