RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000265340.11

PITX1-201, Transcript of paired like homeodomain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PITX1, Length 2,406 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1-201ENST00000265340 C16orf86Q6ZW13 317 aa23.79■■□□□ 1.4
PITX1-201ENST00000265340 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa23.79■■□□□ 1.4
PITX1-201ENST00000265340 RPS6KC1Q96S38 1066 aa23.79■■□□□ 1.4
PITX1-201ENST00000265340 HIP1RO75146 1068 aa23.78■■□□□ 1.4
PITX1-201ENST00000265340 PLCG2P16885 1265 aa23.78■■□□□ 1.4
PITX1-201ENST00000265340 SLC35G1Q2M3R5 365 aa23.78■■□□□ 1.4
PITX1-201ENST00000265340 Q4G0T1 1027 aa23.78■■□□□ 1.4
PITX1-201ENST00000265340 PREBQ9HCU5 417 aa23.78■■□□□ 1.4
PITX1-201ENST00000265340 ARHGEF3Q9NR81 526 aa23.78■■□□□ 1.4
PITX1-201ENST00000265340 CAPN11Q9UMQ6 739 aa23.78■■□□□ 1.4
PITX1-201ENST00000265340 DUSP10Q9Y6W6 482 aa23.78■■□□□ 1.4
PITX1-201ENST00000265340 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa23.78■■□□□ 1.4
PITX1-201ENST00000265340 ECE2O60344 883 aa23.78■■□□□ 1.4
PITX1-201ENST00000265340 ACADSP16219 412 aa23.78■■□□□ 1.4
PITX1-201ENST00000265340 XBP1P17861 261 aa23.78■■□□□ 1.4
PITX1-201ENST00000265340 RPL13P26373 211 aaKnown RBP23.78■■□□□ 1.4
PITX1-201ENST00000265340 KRT2P35908 639 aa23.78■■□□□ 1.4
PITX1-201ENST00000265340 HSD17B3P37058 310 aa23.78■■□□□ 1.4
PITX1-201ENST00000265340 RNF220Q5VTB9 566 aa23.78■■□□□ 1.4
PITX1-201ENST00000265340 SLF2Q8IX21 1173 aa23.78■■□□□ 1.4
PITX1-201ENST00000265340 KCNV2Q8TDN2 545 aa23.78■■□□□ 1.4
PITX1-201ENST00000265340 ECT2Q9H8V3 914 aa23.78■■□□□ 1.4
PITX1-201ENST00000265340 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa23.78■■□□□ 1.4
PITX1-201ENST00000265340 RNF14Q9UBS8 474 aa23.78■■□□□ 1.4
PITX1-201ENST00000265340 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP23.78■■□□□ 1.4
PITX1-201ENST00000265340 MTMR7Q9Y216 660 aa23.78■■□□□ 1.4
PITX1-201ENST00000265340 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa23.77■■□□□ 1.4
PITX1-201ENST00000265340 KRT16P08779 473 aa23.77■■□□□ 1.4
PITX1-201ENST00000265340 GBP7Q8N8V2 638 aaPredicted RBP23.77■■□□□ 1.4
PITX1-201ENST00000265340 TNFRSF25Q93038 417 aa23.77■■□□□ 1.4
PITX1-201ENST00000265340 STX8Q9UNK0 236 aa23.77■■□□□ 1.4
PITX1-201ENST00000265340 ESYT3A0FGR9 886 aa23.76■■□□□ 1.39
PITX1-201ENST00000265340 A8MUI8 341 aa23.76■■□□□ 1.39
PITX1-201ENST00000265340 GBP1P32455 592 aa23.76■■□□□ 1.39
PITX1-201ENST00000265340 SCNN1DP51172 638 aa23.76■■□□□ 1.39
PITX1-201ENST00000265340 NFRKBQ6P4R8 1299 aa23.76■■□□□ 1.39
PITX1-201ENST00000265340 LZICQ8WZA0 190 aa23.76■■□□□ 1.39
PITX1-201ENST00000265340 IFT74Q96LB3 600 aa23.76■■□□□ 1.39
PITX1-201ENST00000265340 TMEM47Q9BQJ4 181 aa23.76■■□□□ 1.39
PITX1-201ENST00000265340 MAD2L2Q9UI95 211 aa23.76■■□□□ 1.39
PITX1-201ENST00000265340 PDHA1P08559 390 aa23.76■■□□□ 1.39
PITX1-201ENST00000265340 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP23.76■■□□□ 1.39
PITX1-201ENST00000265340 SCG2P13521 617 aa23.76■■□□□ 1.39
PITX1-201ENST00000265340 PICALMQ13492 652 aa23.76■■□□□ 1.39
PITX1-201ENST00000265340 GALNTL6Q49A17 601 aa23.76■■□□□ 1.39
PITX1-201ENST00000265340 SUPT20HQ8NEM7 779 aa23.76■■□□□ 1.39
PITX1-201ENST00000265340 FBF1Q8TES7 1133 aa23.76■■□□□ 1.39
PITX1-201ENST00000265340 RAB17Q9H0T7 212 aa23.76■■□□□ 1.39
PITX1-201ENST00000265340 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP23.76■■□□□ 1.39
PITX1-201ENST00000265340 TAB2Q9NYJ8 693 aa23.76■■□□□ 1.39
PITX1-201ENST00000265340 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa23.76■■□□□ 1.39
PITX1-201ENST00000265340 SAMD15Q9P1V8 674 aa23.76■■□□□ 1.39
PITX1-201ENST00000265340 FOCADQ5VW36 1801 aa23.76■■□□□ 1.39
PITX1-201ENST00000265340 NFKBIEO00221 500 aa23.75■■□□□ 1.39
PITX1-201ENST00000265340 PTPREP23469 700 aa23.75■■□□□ 1.39
PITX1-201ENST00000265340 RFC5P40937 340 aa23.75■■□□□ 1.39
PITX1-201ENST00000265340 RASSF7Q02833 373 aa23.75■■□□□ 1.39
PITX1-201ENST00000265340 MPP3Q13368 585 aa23.75■■□□□ 1.39
PITX1-201ENST00000265340 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP23.75■■□□□ 1.39
PITX1-201ENST00000265340 SOGA3Q5TF21 947 aa23.75■■□□□ 1.39
PITX1-201ENST00000265340 MAEAQ7L5Y9 396 aa23.75■■□□□ 1.39
PITX1-201ENST00000265340 LARGE2Q8N3Y3 721 aa23.75■■□□□ 1.39
PITX1-201ENST00000265340 LRRC45Q96CN5 670 aa23.75■■□□□ 1.39
PITX1-201ENST00000265340 KLHL29Q96CT2 875 aa23.75■■□□□ 1.39
PITX1-201ENST00000265340 OCEL1Q9H607 264 aa23.75■■□□□ 1.39
PITX1-201ENST00000265340 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP23.75■■□□□ 1.39
PITX1-201ENST00000265340 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP23.75■■□□□ 1.39
PITX1-201ENST00000265340 UBOX5O94941 541 aa23.75■■□□□ 1.39
PITX1-201ENST00000265340 GRM4Q14833 912 aa23.75■■□□□ 1.39
PITX1-201ENST00000265340 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP23.75■■□□□ 1.39
PITX1-201ENST00000265340 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa23.75■■□□□ 1.39
PITX1-201ENST00000265340 IRGCQ6NXR0 463 aa23.74■■□□□ 1.39
PITX1-201ENST00000265340 TAOK3Q9H2K8 898 aa23.74■■□□□ 1.39
PITX1-201ENST00000265340 VCX3BQ9H321 246 aa23.74■■□□□ 1.39
PITX1-201ENST00000265340 VCX3AQ9NNX9 186 aa23.74■■□□□ 1.39
PITX1-201ENST00000265340 EHD2Q9NZN4 543 aa23.74■■□□□ 1.39
PITX1-201ENST00000265340 SUN2Q9UH99 717 aa23.74■■□□□ 1.39
PITX1-201ENST00000265340 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa23.74■■□□□ 1.39
PITX1-201ENST00000265340 COL4A5P29400 1685 aa23.74■■□□□ 1.39
PITX1-201ENST00000265340 SCN9AQ15858 1988 aa23.74■■□□□ 1.39
PITX1-201ENST00000265340 A0A1W2PQC6 194 aa23.74■■□□□ 1.39
PITX1-201ENST00000265340 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP23.74■■□□□ 1.39
PITX1-201ENST00000265340 UBXN1Q04323 297 aa23.74■■□□□ 1.39
PITX1-201ENST00000265340 CFAP221Q4G0U5 840 aa23.74■■□□□ 1.39
PITX1-201ENST00000265340 TCP11X2Q5H9J9 407 aa23.74■■□□□ 1.39
PITX1-201ENST00000265340 IWS1Q96ST2 819 aa23.74■■□□□ 1.39
PITX1-201ENST00000265340 ABCF3Q9NUQ8 709 aa23.74■■□□□ 1.39
PITX1-201ENST00000265340 CYTH3O43739 400 aa23.73■■□□□ 1.39
PITX1-201ENST00000265340 USO1O60763 962 aaKnown RBP23.73■■□□□ 1.39
PITX1-201ENST00000265340 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP23.73■■□□□ 1.39
PITX1-201ENST00000265340 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP23.73■■□□□ 1.39
PITX1-201ENST00000265340 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP23.73■■□□□ 1.39
PITX1-201ENST00000265340 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP23.73■■□□□ 1.39
PITX1-201ENST00000265340 FAM192AQ9GZU8 254 aa23.73■■□□□ 1.39
PITX1-201ENST00000265340 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP23.73■■□□□ 1.39
PITX1-201ENST00000265340 YDJCA8MPS7 323 aa23.73■■□□□ 1.39
PITX1-201ENST00000265340 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP23.73■■□□□ 1.39
PITX1-201ENST00000265340 NT5C2P49902 561 aa23.73■■□□□ 1.39
PITX1-201ENST00000265340 TMEM62Q0P6H9 643 aa23.73■■□□□ 1.39
PITX1-201ENST00000265340 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.3 ms