RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000253754.7

PDLIM4-201, Transcript of PDZ and LIM domain 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDLIM4, Length 2,282 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM4-201ENST00000253754 EHD2Q9NZN4 543 aa20.5■□□□□ 0.87
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PDLIM4-201ENST00000253754 FLOT1O75955 427 aa20.5■□□□□ 0.87
PDLIM4-201ENST00000253754 GAP43P17677 238 aa20.5■□□□□ 0.87
PDLIM4-201ENST00000253754 HSD17B4P51659 736 aa20.5■□□□□ 0.87
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PDLIM4-201ENST00000253754 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
PDLIM4-201ENST00000253754 ASIC2Q16515 512 aa20.5■□□□□ 0.87
PDLIM4-201ENST00000253754 EXOC3L4Q17RC7 722 aa20.5■□□□□ 0.87
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PDLIM4-201ENST00000253754 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
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PDLIM4-201ENST00000253754 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
PDLIM4-201ENST00000253754 CASP8Q14790 479 aa20.45■□□□□ 0.86
PDLIM4-201ENST00000253754 KIAA0753Q2KHM9 967 aa20.45■□□□□ 0.86
PDLIM4-201ENST00000253754 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
PDLIM4-201ENST00000253754 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa20.45■□□□□ 0.86
PDLIM4-201ENST00000253754 HYOU1Q9Y4L1 999 aa20.45■□□□□ 0.86
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PDLIM4-201ENST00000253754 C19orf81C9J6K1 198 aa20.44■□□□□ 0.86
PDLIM4-201ENST00000253754 DHX15O43143 795 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
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