RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000249504.6

HOXD11-201, Transcript of homeobox D11, humanhuman

APPRIS P1 TSL 3 BASIC

Gene HOXD11, Length 1,533 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11-201ENST00000249504 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP21.69■■□□□ 1.06
HOXD11-201ENST00000249504 ANKEF1Q9NU02 776 aa21.69■■□□□ 1.06
HOXD11-201ENST00000249504 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP21.69■■□□□ 1.06
HOXD11-201ENST00000249504 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP21.69■■□□□ 1.06
HOXD11-201ENST00000249504 EVPLQ92817 2033 aa21.68■■□□□ 1.06
HOXD11-201ENST00000249504 ADAM17P78536 824 aa21.68■■□□□ 1.06
HOXD11-201ENST00000249504 PTK7Q13308 1070 aa21.68■■□□□ 1.06
HOXD11-201ENST00000249504 MTERF2Q49AM1 385 aa21.68■■□□□ 1.06
HOXD11-201ENST00000249504 ANO5Q75V66 913 aa21.68■■□□□ 1.06
HOXD11-201ENST00000249504 OTUD6AQ7L8S5 288 aa21.68■■□□□ 1.06
HOXD11-201ENST00000249504 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa21.68■■□□□ 1.06
HOXD11-201ENST00000249504 CCDC155Q8N6L0 562 aa21.68■■□□□ 1.06
HOXD11-201ENST00000249504 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP21.68■■□□□ 1.06
HOXD11-201ENST00000249504 MAGEF1Q9HAY2 307 aa21.68■■□□□ 1.06
HOXD11-201ENST00000249504 TBX21Q9UL17 535 aa21.68■■□□□ 1.06
HOXD11-201ENST00000249504 TMEM150BA6NC51 233 aa21.67■■□□□ 1.06
HOXD11-201ENST00000249504 KINO60870 393 aaKnown RBP21.67■■□□□ 1.06
HOXD11-201ENST00000249504 PLA2G4FQ68DD2 849 aa21.67■■□□□ 1.06
HOXD11-201ENST00000249504 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP21.67■■□□□ 1.06
HOXD11-201ENST00000249504 SERINC5Q86VE9 423 aa21.67■■□□□ 1.06
HOXD11-201ENST00000249504 CEP57L1Q8IYX8 460 aa21.67■■□□□ 1.06
HOXD11-201ENST00000249504 CNNM3Q8NE01 707 aa21.67■■□□□ 1.06
HOXD11-201ENST00000249504 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP21.67■■□□□ 1.06
HOXD11-201ENST00000249504 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa21.67■■□□□ 1.06
HOXD11-201ENST00000249504 HIPK3Q9H422 1215 aa21.67■■□□□ 1.06
HOXD11-201ENST00000249504 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP21.66■■□□□ 1.06
HOXD11-201ENST00000249504 PLA2G4BP0C869 781 aa21.66■■□□□ 1.06
HOXD11-201ENST00000249504 RAG1P15918 1043 aa21.66■■□□□ 1.06
HOXD11-201ENST00000249504 SYN1P17600 705 aa21.66■■□□□ 1.06
HOXD11-201ENST00000249504 RARRES1P49788 294 aa21.66■■□□□ 1.06
HOXD11-201ENST00000249504 BFSP2Q13515 415 aa21.66■■□□□ 1.06
HOXD11-201ENST00000249504 MCM6Q14566 821 aa21.66■■□□□ 1.06
HOXD11-201ENST00000249504 MARCH8Q5T0T0 291 aa21.66■■□□□ 1.06
HOXD11-201ENST00000249504 MTHFD1LQ6UB35 978 aa21.66■■□□□ 1.06
HOXD11-201ENST00000249504 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP21.66■■□□□ 1.06
HOXD11-201ENST00000249504 CTAGE1Q96RT6 745 aa21.66■■□□□ 1.06
HOXD11-201ENST00000249504 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP21.66■■□□□ 1.06
HOXD11-201ENST00000249504 BHMT2Q9H2M3 363 aa21.66■■□□□ 1.06
HOXD11-201ENST00000249504 KBTBD4Q9NVX7 518 aa21.66■■□□□ 1.06
HOXD11-201ENST00000249504 MYH11P35749 1972 aa21.65■■□□□ 1.06
HOXD11-201ENST00000249504 TRIM43BA6NCK2 446 aa21.65■■□□□ 1.06
HOXD11-201ENST00000249504 ZBTB42B2RXF5 422 aa21.65■■□□□ 1.06
HOXD11-201ENST00000249504 KIAA0355O15063 1070 aa21.65■■□□□ 1.06
HOXD11-201ENST00000249504 KLRC1P26715 233 aa21.65■■□□□ 1.06
HOXD11-201ENST00000249504 SLC12A3P55017 1021 aa21.65■■□□□ 1.06
HOXD11-201ENST00000249504 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa21.65■■□□□ 1.06
HOXD11-201ENST00000249504 XKR9Q5GH70 373 aa21.65■■□□□ 1.06
HOXD11-201ENST00000249504 TAF2Q6P1X5 1199 aa21.65■■□□□ 1.06
HOXD11-201ENST00000249504 CAGE1Q8TC20 777 aa21.65■■□□□ 1.06
HOXD11-201ENST00000249504 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP21.65■■□□□ 1.06
HOXD11-201ENST00000249504 CEP170P1Q96L14 293 aa21.65■■□□□ 1.06
HOXD11-201ENST00000249504 SH2D3AQ9BRG2 576 aa21.65■■□□□ 1.06
HOXD11-201ENST00000249504 TNMDQ9H2S6 317 aa21.65■■□□□ 1.06
HOXD11-201ENST00000249504 CYP26B1Q9NR63 512 aa21.65■■□□□ 1.06
HOXD11-201ENST00000249504 MAGEB2O15479 319 aa21.65■■□□□ 1.06
HOXD11-201ENST00000249504 NPEPPSP55786 919 aa21.65■■□□□ 1.06
HOXD11-201ENST00000249504 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP21.65■■□□□ 1.06
HOXD11-201ENST00000249504 KANK3Q6NY19 840 aa21.65■■□□□ 1.06
HOXD11-201ENST00000249504 RUFY4Q6ZNE9 571 aa21.65■■□□□ 1.06
HOXD11-201ENST00000249504 SV2BQ7L1I2 683 aa21.65■■□□□ 1.06
HOXD11-201ENST00000249504 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP21.65■■□□□ 1.06
HOXD11-201ENST00000249504 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP21.65■■□□□ 1.06
HOXD11-201ENST00000249504 ZBTB10Q96DT7 871 aa21.65■■□□□ 1.06
HOXD11-201ENST00000249504 MTRQ99707 1265 aa21.65■■□□□ 1.06
HOXD11-201ENST00000249504 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP21.65■■□□□ 1.06
HOXD11-201ENST00000249504 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa21.65■■□□□ 1.06
HOXD11-201ENST00000249504 ARHGEF35A5YM69 484 aa21.64■■□□□ 1.05
HOXD11-201ENST00000249504 C22orf31O95567 290 aa21.64■■□□□ 1.05
HOXD11-201ENST00000249504 GSE1Q14687 1217 aa21.64■■□□□ 1.05
HOXD11-201ENST00000249504 RSPH3Q86UC2 560 aa21.64■■□□□ 1.05
HOXD11-201ENST00000249504 RETREG2Q8NC44 543 aa21.64■■□□□ 1.05
HOXD11-201ENST00000249504 PAGE5Q96GU1 130 aa21.64■■□□□ 1.05
HOXD11-201ENST00000249504 PPME1Q9Y570 386 aa21.64■■□□□ 1.05
HOXD11-201ENST00000249504 LTBP2Q14767 1821 aa21.63■■□□□ 1.05
HOXD11-201ENST00000249504 TIMP1P01033 207 aa21.63■■□□□ 1.05
HOXD11-201ENST00000249504 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP21.63■■□□□ 1.05
HOXD11-201ENST00000249504 THPOP40225 353 aa21.63■■□□□ 1.05
HOXD11-201ENST00000249504 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP21.63■■□□□ 1.05
HOXD11-201ENST00000249504 METTL13Q8N6R0 699 aa21.63■■□□□ 1.05
HOXD11-201ENST00000249504 STAMQ92783 540 aa21.63■■□□□ 1.05
HOXD11-201ENST00000249504 WNT8BQ93098 351 aa21.63■■□□□ 1.05
HOXD11-201ENST00000249504 CCDC34Q96HJ3 373 aa21.63■■□□□ 1.05
HOXD11-201ENST00000249504 CEP89Q96ST8 783 aa21.63■■□□□ 1.05
HOXD11-201ENST00000249504 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP21.63■■□□□ 1.05
HOXD11-201ENST00000249504 CLSTN2Q9H4D0 955 aa21.63■■□□□ 1.05
HOXD11-201ENST00000249504 TANC1Q9C0D5 1861 aa21.63■■□□□ 1.05
HOXD11-201ENST00000249504 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa21.62■■□□□ 1.05
HOXD11-201ENST00000249504 PITPNM1O00562 1244 aa21.62■■□□□ 1.05
HOXD11-201ENST00000249504 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
HOXD11-201ENST00000249504 CYP2C18P33260 490 aa21.62■■□□□ 1.05
HOXD11-201ENST00000249504 AFMP43652 599 aa21.62■■□□□ 1.05
HOXD11-201ENST00000249504 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
HOXD11-201ENST00000249504 RINT1Q6NUQ1 792 aa21.62■■□□□ 1.05
HOXD11-201ENST00000249504 PADI6Q6TGC4 694 aa21.62■■□□□ 1.05
HOXD11-201ENST00000249504 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa21.62■■□□□ 1.05
HOXD11-201ENST00000249504 DNAJB3Q8WWF6 145 aa21.62■■□□□ 1.05
HOXD11-201ENST00000249504 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
HOXD11-201ENST00000249504 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
HOXD11-201ENST00000249504 LRRC27Q9C0I9 530 aa21.62■■□□□ 1.05
HOXD11-201ENST00000249504 UMODL1Q5DID0 1318 aa21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.1 ms