RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000220888.9

TRPS1-201, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRPS1, Length 5,480 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-201ENST00000220888 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
TRPS1-201ENST00000220888 PADI6Q6TGC4 694 aa11.3□□□□□ -0.6
TRPS1-201ENST00000220888 FAF2Q96CS3 445 aa11.3□□□□□ -0.6
TRPS1-201ENST00000220888 DCUN1D1Q96GG9 259 aa11.3□□□□□ -0.6
TRPS1-201ENST00000220888 TRPV6Q9H1D0 765 aa11.3□□□□□ -0.6
TRPS1-201ENST00000220888 KIAA0556O60303 1618 aa11.3□□□□□ -0.6
TRPS1-201ENST00000220888 RNF123Q5XPI4 1314 aa11.3□□□□□ -0.6
TRPS1-201ENST00000220888 PRRG1O14668 218 aa11.3□□□□□ -0.6
TRPS1-201ENST00000220888 MYO1DO94832 1006 aa11.3□□□□□ -0.6
TRPS1-201ENST00000220888 HMGCS2P54868 508 aa11.3□□□□□ -0.6
TRPS1-201ENST00000220888 ART3Q13508 389 aa11.3□□□□□ -0.6
TRPS1-201ENST00000220888 PI16Q6UXB8 463 aa11.3□□□□□ -0.6
TRPS1-201ENST00000220888 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
TRPS1-201ENST00000220888 CERKQ8TCT0 537 aa11.3□□□□□ -0.6
TRPS1-201ENST00000220888 NEK9Q8TD19 979 aa11.3□□□□□ -0.6
TRPS1-201ENST00000220888 PIGOQ8TEQ8 1089 aa11.3□□□□□ -0.6
TRPS1-201ENST00000220888 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
TRPS1-201ENST00000220888 NCLNQ969V3 563 aa11.3□□□□□ -0.6
TRPS1-201ENST00000220888 GABBR1Q9UBS5 961 aa11.3□□□□□ -0.6
TRPS1-201ENST00000220888 ZNRF3Q9ULT6 936 aa11.3□□□□□ -0.6
TRPS1-201ENST00000220888 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
TRPS1-201ENST00000220888 PTPRKQ15262 1439 aa11.3□□□□□ -0.6
TRPS1-201ENST00000220888 A8MXQ7 604 aa11.3□□□□□ -0.6
TRPS1-201ENST00000220888 RASGRF2O14827 1237 aa11.3□□□□□ -0.6
TRPS1-201ENST00000220888 DDX5P17844 614 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
TRPS1-201ENST00000220888 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
TRPS1-201ENST00000220888 CDC42EP1Q00587 391 aa11.3□□□□□ -0.6
TRPS1-201ENST00000220888 ZNF235Q14590 738 aa11.3□□□□□ -0.6
TRPS1-201ENST00000220888 TAS2R42Q7RTR8 314 aa11.3□□□□□ -0.6
TRPS1-201ENST00000220888 RMDN2Q96LZ7 410 aa11.3□□□□□ -0.6
TRPS1-201ENST00000220888 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
TRPS1-201ENST00000220888 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
TRPS1-201ENST00000220888 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa11.3□□□□□ -0.6
TRPS1-201ENST00000220888 KIF19Q2TAC6 998 aa11.29□□□□□ -0.6
TRPS1-201ENST00000220888 BRIP1Q9BX63 1249 aa11.29□□□□□ -0.6
TRPS1-201ENST00000220888 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
TRPS1-201ENST00000220888 NDFIP2Q9NV92 336 aa11.29□□□□□ -0.6
TRPS1-201ENST00000220888 ADAM22Q9P0K1 906 aa11.29□□□□□ -0.6
TRPS1-201ENST00000220888 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
TRPS1-201ENST00000220888 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
TRPS1-201ENST00000220888 FAM196BA6NMK8 535 aa11.29□□□□□ -0.6
TRPS1-201ENST00000220888 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
TRPS1-201ENST00000220888 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
TRPS1-201ENST00000220888 RARBP10826 455 aa11.29□□□□□ -0.6
TRPS1-201ENST00000220888 PLCG1P19174 1290 aa11.29□□□□□ -0.6
TRPS1-201ENST00000220888 CAPRIN1Q14444 709 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
TRPS1-201ENST00000220888 BRD3Q15059 726 aa11.29□□□□□ -0.6
TRPS1-201ENST00000220888 EFHC2Q5JST6 749 aa11.29□□□□□ -0.6
TRPS1-201ENST00000220888 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
TRPS1-201ENST00000220888 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP11.29□□□□□ -0.6
TRPS1-201ENST00000220888 EHD2Q9NZN4 543 aa11.29□□□□□ -0.6
TRPS1-201ENST00000220888 ABCC4O15439 1325 aa11.29□□□□□ -0.6
TRPS1-201ENST00000220888 SFI1A8K8P3 1242 aa11.29□□□□□ -0.6
TRPS1-201ENST00000220888 M0QYV0 167 aa11.29□□□□□ -0.6
TRPS1-201ENST00000220888 MMP1P03956 469 aa11.29□□□□□ -0.6
TRPS1-201ENST00000220888 ADORA2BP29275 332 aa11.29□□□□□ -0.6
TRPS1-201ENST00000220888 CCDC157Q569K6 752 aa11.29□□□□□ -0.6
TRPS1-201ENST00000220888 TTLL11Q8NHH1 800 aa11.29□□□□□ -0.6
TRPS1-201ENST00000220888 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
TRPS1-201ENST00000220888 DPF3Q92784 378 aa11.29□□□□□ -0.6
TRPS1-201ENST00000220888 LCMT1Q9UIC8 334 aa11.29□□□□□ -0.6
TRPS1-201ENST00000220888 UBE4BO95155 1302 aa11.29□□□□□ -0.6
TRPS1-201ENST00000220888 COL15A1P39059 1388 aa11.29□□□□□ -0.6
TRPS1-201ENST00000220888 FAM135BQ49AJ0 1406 aa11.29□□□□□ -0.6
TRPS1-201ENST00000220888 UGGT1Q9NYU2 1555 aa11.29□□□□□ -0.6
TRPS1-201ENST00000220888 CTSHP09668 335 aa11.29□□□□□ -0.6
TRPS1-201ENST00000220888 GRIK1P39086 918 aa11.29□□□□□ -0.6
TRPS1-201ENST00000220888 PLTPP55058 493 aa11.29□□□□□ -0.6
TRPS1-201ENST00000220888 GNGT1P63211 74 aa11.29□□□□□ -0.6
TRPS1-201ENST00000220888 C10orf76Q5T2E6 689 aa11.29□□□□□ -0.6
TRPS1-201ENST00000220888 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
TRPS1-201ENST00000220888 FAM213AQ9BRX8 229 aa11.29□□□□□ -0.6
TRPS1-201ENST00000220888 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP11.29□□□□□ -0.6
TRPS1-201ENST00000220888 APBA1Q02410 837 aa11.29□□□□□ -0.6
TRPS1-201ENST00000220888 CCDC15Q0P6D6 951 aa11.29□□□□□ -0.6
TRPS1-201ENST00000220888 CXorf38Q8TB03 319 aa11.29□□□□□ -0.6
TRPS1-201ENST00000220888 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
TRPS1-201ENST00000220888 KIF12Q96FN5 646 aa11.29□□□□□ -0.6
TRPS1-201ENST00000220888 TRAIPQ9BWF2 469 aa11.29□□□□□ -0.6
TRPS1-201ENST00000220888 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
TRPS1-201ENST00000220888 AAASQ9NRG9 546 aa11.29□□□□□ -0.6
TRPS1-201ENST00000220888 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
TRPS1-201ENST00000220888 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa11.29□□□□□ -0.6
TRPS1-201ENST00000220888 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa11.29□□□□□ -0.6
TRPS1-201ENST00000220888 PLXNC1O60486 1568 aa11.28□□□□□ -0.6
TRPS1-201ENST00000220888 A0A1W2PQ27 194 aa11.28□□□□□ -0.6
TRPS1-201ENST00000220888 A0A1W2PQ64 194 aa11.28□□□□□ -0.6
TRPS1-201ENST00000220888 A0A1W2PQD8 194 aa11.28□□□□□ -0.6
TRPS1-201ENST00000220888 CCDC151A5D8V7 595 aa11.28□□□□□ -0.6
TRPS1-201ENST00000220888 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP11.28□□□□□ -0.6
TRPS1-201ENST00000220888 TJP3O95049 919 aa11.28□□□□□ -0.6
TRPS1-201ENST00000220888 SEC24BO95487 1268 aa11.28□□□□□ -0.6
TRPS1-201ENST00000220888 KRT17Q04695 432 aa11.28□□□□□ -0.6
TRPS1-201ENST00000220888 IER5Q5VY09 327 aa11.28□□□□□ -0.6
TRPS1-201ENST00000220888 HAUS6Q7Z4H7 955 aa11.28□□□□□ -0.6
TRPS1-201ENST00000220888 XXYLT1Q8NBI6 393 aa11.28□□□□□ -0.6
TRPS1-201ENST00000220888 SIK2Q9H0K1 926 aa11.28□□□□□ -0.6
TRPS1-201ENST00000220888 GINM1Q9NU53 330 aa11.28□□□□□ -0.6
TRPS1-201ENST00000220888 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
TRPS1-201ENST00000220888 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
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