RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000111980.3

Hoxd4-202, Transcript of Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxd4, Length 1,494 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 LpxnQ99N69 386 aa21.94■■□□□ 1.1
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Trim11Q99PQ2 467 aa21.94■■□□□ 1.1
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Scrn1Q9CZC8 414 aa21.94■■□□□ 1.1
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 PorcnQ9JJJ7 461 aa21.94■■□□□ 1.1
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Dnajb7Q9QYI8 312 aa21.94■■□□□ 1.1
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Kank3Q9Z1P7 791 aa21.94■■□□□ 1.1
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Gm11985A0A1B0GS61 206 aa21.93■■□□□ 1.1
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Dnm2P39054 870 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Setd4P58467 439 aa21.93■■□□□ 1.1
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Bpifa6Q0VGU8 367 aa21.93■■□□□ 1.1
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Ano7Q14AT5 859 aa21.93■■□□□ 1.1
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Uimc1Q5U5Q9 727 aa21.93■■□□□ 1.1
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Tmc3Q7TQ69 1130 aa21.93■■□□□ 1.1
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Usp38Q8BW70 1042 aa21.93■■□□□ 1.1
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Dqx1Q924H9 718 aa21.93■■□□□ 1.1
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Clp1Q99LI9 425 aa21.93■■□□□ 1.1
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Pex3Q9QXY9 372 aa21.93■■□□□ 1.1
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Serpina1aP07758 413 aa21.92■■□□□ 1.1
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Serpina1bP22599 413 aa21.92■■□□□ 1.1
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Aldh2P47738 519 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Zdhhc9P59268 364 aa21.92■■□□□ 1.1
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Serpina1cQ00896 412 aa21.92■■□□□ 1.1
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Serpina1dQ00897 413 aa21.92■■□□□ 1.1
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Sema5bQ60519 1093 aa21.92■■□□□ 1.1
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 PodnQ7TQ62 611 aa21.92■■□□□ 1.1
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 PogkQ80TC5 607 aa21.92■■□□□ 1.1
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 R3hcc1Q8BSI6 488 aa21.92■■□□□ 1.1
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Olfr395Q8VGR3 312 aa21.92■■□□□ 1.1
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Syt17Q920M7 470 aa21.92■■□□□ 1.1
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Krt23Q99PS0 422 aa21.92■■□□□ 1.1
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 PotegA5H0M4 473 aa21.91■■□□□ 1.1
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Yap1P46938 488 aa21.91■■□□□ 1.1
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Dpf3P58269 378 aa21.91■■□□□ 1.1
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Smad3Q8BUN5 425 aa21.91■■□□□ 1.1
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Ccdc113Q8C5T8 377 aa21.91■■□□□ 1.1
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Tbc1d10cQ8C9V1 444 aa21.91■■□□□ 1.1
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Prb1Q91X93 504 aa21.91■■□□□ 1.1
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Vps16Q920Q4 839 aa21.91■■□□□ 1.1
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Krt82Q99M74 516 aa21.91■■□□□ 1.1
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Krt36B1AQ75 473 aa21.9■■□□□ 1.1
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Atp2b1G5E829 1220 aa21.9■■□□□ 1.1
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Nr1i2O54915 431 aa21.9■■□□□ 1.1
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Chrna1P04756 457 aa21.9■■□□□ 1.1
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Ccl5P30882 91 aa21.9■■□□□ 1.1
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 March9Q3TZ87 348 aa21.9■■□□□ 1.1
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 ChpfQ6IQX7 774 aa21.9■■□□□ 1.1
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Znf653Q6YND2 615 aa21.9■■□□□ 1.1
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Ssh1Q76I79 1042 aa21.9■■□□□ 1.1
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Prpf31Q8CCF0 499 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Vwa1Q8R2Z5 415 aa21.9■■□□□ 1.1
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Cabp7Q91ZM8 215 aa21.9■■□□□ 1.1
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Zfp64Q99KE8 643 aa21.9■■□□□ 1.1
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Col4a3bpQ9EQG9 624 aa21.9■■□□□ 1.1
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 PrelpQ9JK53 378 aa21.9■■□□□ 1.1
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Arl6ip4Q9JM93 229 aa21.9■■□□□ 1.1
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Slc16a6B1AT66 607 aa21.9■■□□□ 1.1
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Scp2P32020 547 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Tnni3P48787 211 aa21.9■■□□□ 1.1
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 RabggtbP53612 339 aa21.9■■□□□ 1.1
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Scarf1Q5ND28 820 aa21.9■■□□□ 1.1
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Nudt16Q6P3D0 195 aa21.9■■□□□ 1.1
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Sh3tc2Q80VA5 1289 aa21.9■■□□□ 1.1
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Csrnp2Q8BGQ2 534 aa21.9■■□□□ 1.1
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Thap3Q8BJ25 218 aa21.9■■□□□ 1.1
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Washc1Q8VDD8 475 aa21.9■■□□□ 1.1
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Adcy3Q8VHH7 1145 aa21.9■■□□□ 1.1
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Cwh43Q91YL7 699 aa21.9■■□□□ 1.1
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Phtf1Q9QZ09 761 aa21.9■■□□□ 1.1
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Pramel3A2AHA7 463 aa21.89■■□□□ 1.09
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Gm7903A2AWL1 463 aa21.89■■□□□ 1.09
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Hps5P59438 1126 aa21.89■■□□□ 1.09
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 CiitaP79621 1155 aa21.89■■□□□ 1.09
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 MaeaQ4VC33 396 aa21.89■■□□□ 1.09
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Xkr4Q5GH67 647 aa21.89■■□□□ 1.09
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Exoc3Q6KAR6 755 aa21.89■■□□□ 1.09
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Hdac4Q6NZM9 1076 aa21.89■■□□□ 1.09
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Usp49Q6P9L4 685 aa21.89■■□□□ 1.09
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Gprc5aQ8BHL4 356 aa21.89■■□□□ 1.09
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Stk38Q91VJ4 465 aa21.89■■□□□ 1.09
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Ccdc96Q9CR92 584 aa21.89■■□□□ 1.09
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Ttll8A4Q9F1 832 aa21.88■■□□□ 1.09
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Krt78E9Q0F0 1068 aa21.88■■□□□ 1.09
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Gm4841E9QAA8 417 aa21.88■■□□□ 1.09
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Hexim2Q3TVI4 313 aa21.88■■□□□ 1.09
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Mpzl3Q3V3F6 237 aa21.88■■□□□ 1.09
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 E2f8Q58FA4 860 aa21.88■■□□□ 1.09
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Tmem199Q5SYH2 208 aa21.88■■□□□ 1.09
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Btnl9Q8BJE2 536 aa21.88■■□□□ 1.09
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Zfp120Q8BZW4 436 aa21.88■■□□□ 1.09
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Dnai1Q8C0M8 701 aa21.88■■□□□ 1.09
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Stoml1Q8CI66 399 aa21.88■■□□□ 1.09
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Glis1Q8K1M4 789 aa21.88■■□□□ 1.09
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Fbxo18Q8K2I9 1042 aa21.88■■□□□ 1.09
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Wrap53Q8VC51 532 aa21.88■■□□□ 1.09
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Rab27aQ9ERI2 221 aa21.88■■□□□ 1.09
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Trim54Q9ERP3 366 aa21.88■■□□□ 1.09
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Eya4Q9Z191 616 aa21.88■■□□□ 1.09
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Xpnpep3B7ZMP1 506 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Arhgap6O54834 987 aa21.87■■□□□ 1.09
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Got1P05201 413 aa21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 44.3 ms