RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000076941.11

Ttf2-201, Transcript of Transcription termination factor 2, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ttf2, Length 4,541 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf2-201ENSMUST00000076941 Krt36B1AQ75 473 aa9.16□□□□□ -0.94
Ttf2-201ENSMUST00000076941 Sec24cG3X972 1096 aaKnown RBP9.16□□□□□ -0.94
Ttf2-201ENSMUST00000076941 CaluO35887 315 aa9.16□□□□□ -0.94
Ttf2-201ENSMUST00000076941 Serpina1aP07758 413 aa9.16□□□□□ -0.94
Ttf2-201ENSMUST00000076941 Serpina1bP22599 413 aa9.16□□□□□ -0.94
Ttf2-201ENSMUST00000076941 StamP70297 548 aa9.16□□□□□ -0.94
Ttf2-201ENSMUST00000076941 Serpina1cQ00896 412 aa9.16□□□□□ -0.94
Ttf2-201ENSMUST00000076941 Serpina1dQ00897 413 aa9.16□□□□□ -0.94
Ttf2-201ENSMUST00000076941 Ccdc125Q5U465 500 aa9.16□□□□□ -0.94
Ttf2-201ENSMUST00000076941 Q8CEZ4 452 aa9.16□□□□□ -0.94
Ttf2-201ENSMUST00000076941 Reep2Q8VCD6 254 aa9.16□□□□□ -0.94
Ttf2-201ENSMUST00000076941 Tmem192Q9CXT7 266 aa9.16□□□□□ -0.94
Ttf2-201ENSMUST00000076941 Irx5Q9JKQ4 484 aa9.16□□□□□ -0.94
Ttf2-201ENSMUST00000076941 Mtmr1Q9Z2C4 669 aa9.16□□□□□ -0.94
Ttf2-201ENSMUST00000076941 Bnip3lQ9Z2F7 218 aa9.16□□□□□ -0.94
Ttf2-201ENSMUST00000076941 XdhQ00519 1335 aa9.16□□□□□ -0.94
Ttf2-201ENSMUST00000076941 Usp17ldG5E8G2 545 aa9.16□□□□□ -0.94
Ttf2-201ENSMUST00000076941 Usp17lcG5E8I7 545 aa9.16□□□□□ -0.94
Ttf2-201ENSMUST00000076941 Slc16a2O70324 545 aa9.16□□□□□ -0.94
Ttf2-201ENSMUST00000076941 Fgd3O88842 733 aa9.16□□□□□ -0.94
Ttf2-201ENSMUST00000076941 Mt-CybP00158 381 aa9.16□□□□□ -0.94
Ttf2-201ENSMUST00000076941 Mgat1P27808 447 aa9.16□□□□□ -0.94
Ttf2-201ENSMUST00000076941 Ap1m1P35585 423 aa9.16□□□□□ -0.94
Ttf2-201ENSMUST00000076941 Zscan2Q07230 614 aa9.16□□□□□ -0.94
Ttf2-201ENSMUST00000076941 Tfdp1Q08639 410 aa9.16□□□□□ -0.94
Ttf2-201ENSMUST00000076941 Tsr1Q5SWD9 803 aa9.16□□□□□ -0.94
Ttf2-201ENSMUST00000076941 Cfap100Q80VN0 613 aa9.16□□□□□ -0.94
Ttf2-201ENSMUST00000076941 Tor1aip2Q8BYU6 502 aa9.16□□□□□ -0.94
Ttf2-201ENSMUST00000076941 Ccdc186Q8C9S4 917 aa9.16□□□□□ -0.94
Ttf2-201ENSMUST00000076941 Synpo2Q91YE8 1087 aaKnown RBP9.16□□□□□ -0.94
Ttf2-201ENSMUST00000076941 EpgnQ924X1 152 aa9.16□□□□□ -0.94
Ttf2-201ENSMUST00000076941 Mms19Q9D071 1031 aa9.16□□□□□ -0.94
Ttf2-201ENSMUST00000076941 Slc26a4Q9R155 780 aa9.16□□□□□ -0.94
Ttf2-201ENSMUST00000076941 Gm3127E9Q9P5 263 aa9.16□□□□□ -0.94
Ttf2-201ENSMUST00000076941 Gm3453K7N724 263 aa9.16□□□□□ -0.94
Ttf2-201ENSMUST00000076941 Igfbp4P47879 254 aa9.16□□□□□ -0.94
Ttf2-201ENSMUST00000076941 Rasa2P58069 847 aa9.16□□□□□ -0.94
Ttf2-201ENSMUST00000076941 Tmem232Q5K6N0 675 aa9.16□□□□□ -0.94
Ttf2-201ENSMUST00000076941 Tm4sf1Q64302 202 aa9.16□□□□□ -0.94
Ttf2-201ENSMUST00000076941 Recql4Q75NR7 1216 aaKnown RBP9.16□□□□□ -0.94
Ttf2-201ENSMUST00000076941 Armc6Q8BNU0 468 aa9.16□□□□□ -0.94
Ttf2-201ENSMUST00000076941 Trerf1Q8BXJ2 1205 aa9.16□□□□□ -0.94
Ttf2-201ENSMUST00000076941 Zc3h6Q8BYK8 1177 aa9.16□□□□□ -0.94
Ttf2-201ENSMUST00000076941 DnerQ8JZM4 737 aa9.16□□□□□ -0.94
Ttf2-201ENSMUST00000076941 Olfr397Q8VEZ6 315 aa9.16□□□□□ -0.94
Ttf2-201ENSMUST00000076941 YarsQ91WQ3 528 aaKnown RBP9.16□□□□□ -0.94
Ttf2-201ENSMUST00000076941 Tgm5Q9D7I9 724 aa9.16□□□□□ -0.94
Ttf2-201ENSMUST00000076941 Fam205a1D3YZF6 1314 aa9.16□□□□□ -0.94
Ttf2-201ENSMUST00000076941 Abca15E9PWH4 1668 aa9.16□□□□□ -0.94
Ttf2-201ENSMUST00000076941 Col4a1P02463 1669 aa9.16□□□□□ -0.94
Ttf2-201ENSMUST00000076941 Myh2G3UW82 1942 aa9.16□□□□□ -0.94
Ttf2-201ENSMUST00000076941 Nfx1B1AY10 1114 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.94
Ttf2-201ENSMUST00000076941 Gm14525B1AZA0 212 aa9.15□□□□□ -0.94
Ttf2-201ENSMUST00000076941 Gm2012B1B0R1 212 aa9.15□□□□□ -0.94
Ttf2-201ENSMUST00000076941 Gm3095E9Q058 166 aa9.15□□□□□ -0.94
Ttf2-201ENSMUST00000076941 Lmnb2P21619 596 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.94
Ttf2-201ENSMUST00000076941 Rbm46P86049 533 aa9.15□□□□□ -0.94
Ttf2-201ENSMUST00000076941 Frmd8Q3UFK8 466 aa9.15□□□□□ -0.94
Ttf2-201ENSMUST00000076941 Irak1Q62406 710 aa9.15□□□□□ -0.94
Ttf2-201ENSMUST00000076941 Gm14819Q62478 212 aa9.15□□□□□ -0.94
Ttf2-201ENSMUST00000076941 Pcdhb12Q91Y07 789 aa9.15□□□□□ -0.94
Ttf2-201ENSMUST00000076941 Rrp1bQ91YK2 724 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.94
Ttf2-201ENSMUST00000076941 Krt20Q9D312 431 aa9.15□□□□□ -0.94
Ttf2-201ENSMUST00000076941 Gyg1Q9R062 333 aa9.15□□□□□ -0.94
Ttf2-201ENSMUST00000076941 Ccdc170D3YXL0 722 aa9.15□□□□□ -0.94
Ttf2-201ENSMUST00000076941 SbdsP70122 250 aa9.15□□□□□ -0.94
Ttf2-201ENSMUST00000076941 Ice2Q3UZ18 988 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.94
Ttf2-201ENSMUST00000076941 Cacna2d2Q6PHS9 1154 aa9.15□□□□□ -0.94
Ttf2-201ENSMUST00000076941 RimklbQ80WS1 387 aa9.15□□□□□ -0.94
Ttf2-201ENSMUST00000076941 6820408C15RikQ8BJX2 354 aa9.15□□□□□ -0.94
Ttf2-201ENSMUST00000076941 Ipo5Q8BKC5 1097 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.94
Ttf2-201ENSMUST00000076941 Tbc1d10cQ8C9V1 444 aa9.15□□□□□ -0.94
Ttf2-201ENSMUST00000076941 Dr1Q91WV0 176 aa9.15□□□□□ -0.94
Ttf2-201ENSMUST00000076941 Tmod3Q9JHJ0 352 aa9.15□□□□□ -0.94
Ttf2-201ENSMUST00000076941 Ripor3A1L3T7 938 aa9.15□□□□□ -0.94
Ttf2-201ENSMUST00000076941 Gm44503E9PYU5 387 aa9.15□□□□□ -0.94
Ttf2-201ENSMUST00000076941 Gm15448F6PZL4 682 aa9.15□□□□□ -0.94
Ttf2-201ENSMUST00000076941 LxnP70202 222 aa9.15□□□□□ -0.94
Ttf2-201ENSMUST00000076941 Meis2P97367 477 aa9.15□□□□□ -0.94
Ttf2-201ENSMUST00000076941 Kndc1Q0KK55 1742 aa9.15□□□□□ -0.94
Ttf2-201ENSMUST00000076941 Tex35Q14BK3 207 aa9.15□□□□□ -0.94
Ttf2-201ENSMUST00000076941 Gbp4Q61107 620 aa9.15□□□□□ -0.94
Ttf2-201ENSMUST00000076941 Dnajc19Q9CQV7 116 aa9.15□□□□□ -0.94
Ttf2-201ENSMUST00000076941 Serpina9Q9D7D2 418 aa9.15□□□□□ -0.94
Ttf2-201ENSMUST00000076941 Lrp6O88572 1613 aa9.15□□□□□ -0.94
Ttf2-201ENSMUST00000076941 Atp8b5A3FIN4 1183 aa9.15□□□□□ -0.95
Ttf2-201ENSMUST00000076941 Gdap1O88741 358 aa9.15□□□□□ -0.95
Ttf2-201ENSMUST00000076941 Mark2Q05512 776 aa9.15□□□□□ -0.95
Ttf2-201ENSMUST00000076941 Ddx49Q4FZF3 480 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.95
Ttf2-201ENSMUST00000076941 Shc3Q61120 474 aa9.15□□□□□ -0.95
Ttf2-201ENSMUST00000076941 Ece2Q80Z60 881 aa9.15□□□□□ -0.95
Ttf2-201ENSMUST00000076941 Cfap36Q8C6E0 343 aa9.15□□□□□ -0.95
Ttf2-201ENSMUST00000076941 Fam20aQ8CID3 541 aa9.15□□□□□ -0.95
Ttf2-201ENSMUST00000076941 Pop1Q8K205 1045 aa9.15□□□□□ -0.95
Ttf2-201ENSMUST00000076941 Shtn1Q8K2Q9 631 aa9.15□□□□□ -0.95
Ttf2-201ENSMUST00000076941 Stxbp5Q8K400 1152 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.95
Ttf2-201ENSMUST00000076941 Rhobtb2Q91V93 728 aa9.15□□□□□ -0.95
Ttf2-201ENSMUST00000076941 Ube2sQ921J4 223 aa9.15□□□□□ -0.95
Ttf2-201ENSMUST00000076941 Six6os1Q9CTN5 574 aa9.15□□□□□ -0.95
Ttf2-201ENSMUST00000076941 Mcur1Q9CXD6 340 aa9.15□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 25.2 ms