RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000060956.12

Trappc1-201, Transcript of Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

TSL 3 BASIC

Gene Trappc1, Length 628 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Aldh5a1Q8BWF0 523 aa6.35□□□□□ -1.39
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Prkd2Q8BZ03 875 aa6.35□□□□□ -1.39
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Kctd12bQ8C7J6 292 aa6.35□□□□□ -1.39
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Nup88Q8CEC0 753 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Fermt2Q8CIB5 680 aa6.35□□□□□ -1.39
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Wipf1Q8K1I7 493 aa6.35□□□□□ -1.39
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Slc26a8Q8R0C3 999 aa6.35□□□□□ -1.39
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Cdpf1Q8R3A2 119 aa6.35□□□□□ -1.39
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Ces1dQ8VCT4 565 aa6.35□□□□□ -1.39
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Krt25Q8VCW2 446 aa6.35□□□□□ -1.39
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Rwdd1Q9CQK7 243 aa6.35□□□□□ -1.39
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Pus3Q9JI38 481 aa6.35□□□□□ -1.39
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Pias4Q9JM05 507 aa6.35□□□□□ -1.39
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Twf2Q9Z0P5 349 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Gria4Q9Z2W8 902 aa6.35□□□□□ -1.39
Trappc1-201ENSMUST00000060956 DmdP11531 3678 aa6.35□□□□□ -1.39
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Abcc4E9Q236 1325 aa6.34□□□□□ -1.39
Trappc1-201ENSMUST00000060956 KprpB2RUR4 657 aa6.34□□□□□ -1.39
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Triml2E9PW10 424 aa6.34□□□□□ -1.39
Trappc1-201ENSMUST00000060956 A430078G23RikE9Q7Y4 484 aa6.34□□□□□ -1.39
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Cops5O35864 334 aa6.34□□□□□ -1.39
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Tph1P17532 447 aa6.34□□□□□ -1.39
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Defa-rs7P50715 91 aa6.34□□□□□ -1.39
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Wdr5P61965 334 aa6.34□□□□□ -1.39
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Larp7Q05CL8 570 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Gspt2Q149F3 632 aa6.34□□□□□ -1.39
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Etaa1Q5SVT3 877 aa6.34□□□□□ -1.39
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Bloc1s3Q5U5M8 195 aa6.34□□□□□ -1.39
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Atp13a3Q5XF89 1219 aa6.34□□□□□ -1.39
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Elf1Q60775 612 aa6.34□□□□□ -1.39
Trappc1-201ENSMUST00000060956 LppQ8BFW7 613 aa6.34□□□□□ -1.39
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Zdhhc15Q8BGJ0 337 aa6.34□□□□□ -1.39
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Golim4Q8BXA1 655 aa6.34□□□□□ -1.39
Trappc1-201ENSMUST00000060956 DnerQ8JZM4 737 aa6.34□□□□□ -1.39
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Fermt3Q8K1B8 665 aa6.34□□□□□ -1.39
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Trim68Q8K243 485 aa6.34□□□□□ -1.39
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Hnrnpul1Q8VDM6 859 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Tbc1d7Q9D0K0 293 aa6.34□□□□□ -1.39
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Vmn1r47Q9EQ51 310 aa6.34□□□□□ -1.39
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Mkrn2Q9ERV1 416 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
Trappc1-201ENSMUST00000060956 MgaA2AWL7 3003 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
Trappc1-201ENSMUST00000060956 AtmQ62388 3066 aa6.33□□□□□ -1.4
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Ripor3A1L3T7 938 aa6.33□□□□□ -1.4
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Gm12800B1AUV4 484 aa6.33□□□□□ -1.4
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Ppp2r3aB2RXC8 1150 aa6.33□□□□□ -1.4
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Jakmip2D3YXK0 820 aa6.33□□□□□ -1.4
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Prr22F6TNE3 422 aa6.33□□□□□ -1.4
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Gm12794L7MTS5 483 aa6.33□□□□□ -1.4
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Dhx15O35286 795 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Znf143O70230 638 aa6.33□□□□□ -1.4
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Lnx1O70263 728 aa6.33□□□□□ -1.4
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Abl1P00520 1123 aa6.33□□□□□ -1.4
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Cyp21P03940 487 aa6.33□□□□□ -1.4
Trappc1-201ENSMUST00000060956 GlulP15105 373 aa6.33□□□□□ -1.4
Trappc1-201ENSMUST00000060956 FasP25446 327 aa6.33□□□□□ -1.4
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Cd19P25918 547 aa6.33□□□□□ -1.4
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Fmr1P35922 614 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
Trappc1-201ENSMUST00000060956 GaaP70699 953 aa6.33□□□□□ -1.4
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Ttc9Q3V038 219 aa6.33□□□□□ -1.4
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Tmem199Q5SYH2 208 aa6.33□□□□□ -1.4
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Ccdc82Q6PG04 518 aa6.33□□□□□ -1.4
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Igsf3Q6ZQA6 1194 aa6.33□□□□□ -1.4
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Lrfn3Q8BLY3 626 aa6.33□□□□□ -1.4
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Scfd1Q8BRF7 639 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Crispld2Q8BZQ2 495 aa6.33□□□□□ -1.4
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Zhx2Q8C0C0 836 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Dctn4Q8CBY8 467 aa6.33□□□□□ -1.4
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Gas2l1Q8JZP9 678 aa6.33□□□□□ -1.4
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Fgd4Q91ZT5 766 aa6.33□□□□□ -1.4
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Me2Q99KE1 589 aa6.33□□□□□ -1.4
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Slc10a6Q9CXB2 373 aa6.33□□□□□ -1.4
Trappc1-201ENSMUST00000060956 4933402E13RikQ9D4D2 429 aa6.33□□□□□ -1.4
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Jam2Q9JI59 298 aa6.33□□□□□ -1.4
Trappc1-201ENSMUST00000060956 DgkeQ9R1C6 564 aa6.33□□□□□ -1.4
Trappc1-201ENSMUST00000060956 KalrnA2CG49 2964 aa6.32□□□□□ -1.4
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Tbkbp1A2A9T0 611 aa6.32□□□□□ -1.4
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Frmd7A2AD83 703 aa6.32□□□□□ -1.4
Trappc1-201ENSMUST00000060956 MipepA6H611 711 aa6.32□□□□□ -1.4
Trappc1-201ENSMUST00000060956 3110082J24RikF6Z6Z2 108 aa6.32□□□□□ -1.4
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Stra6O70491 670 aa6.32□□□□□ -1.4
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Smpd2O70572 419 aa6.32□□□□□ -1.4
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Il13ra2O88786 383 aa6.32□□□□□ -1.4
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Ighmbp2P40694 993 aa6.32□□□□□ -1.4
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Nkx1-2P42580 305 aa6.32□□□□□ -1.4
Trappc1-201ENSMUST00000060956 PfkmP47857 780 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Adamts10P58459 1104 aa6.32□□□□□ -1.4
Trappc1-201ENSMUST00000060956 UtyP79457 1212 aa6.32□□□□□ -1.4
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Znf667Q2TL60 609 aa6.32□□□□□ -1.4
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Ap5z1Q3U829 807 aa6.32□□□□□ -1.4
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Plcl1Q3USB7 1096 aa6.32□□□□□ -1.4
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Glra4Q61603 456 aa6.32□□□□□ -1.4
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Fam170aQ66LM6 333 aa6.32□□□□□ -1.4
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Ablim3Q69ZX8 682 aa6.32□□□□□ -1.4
Trappc1-201ENSMUST00000060956 BC048507Q80ZS7 89 aa6.32□□□□□ -1.4
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Aldh8a1Q8BH00 487 aa6.32□□□□□ -1.4
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Kdm4aQ8BW72 1064 aa6.32□□□□□ -1.4
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Stac3Q8BZ71 360 aa6.32□□□□□ -1.4
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Dnai1Q8C0M8 701 aa6.32□□□□□ -1.4
Trappc1-201ENSMUST00000060956 N4bp3Q8C7U1 537 aa6.32□□□□□ -1.4
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Agbl3Q8CDP0 1006 aa6.32□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 47.4 ms