Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ51

Vmn1r47, Vomeronasal type-1 receptor 47, mousemouse

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Length 310 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r47Q9EQ51 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC31,28■■■□□ 2,6
Vmn1r47Q9EQ51 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC28,89■■■□□ 2,22
Vmn1r47Q9EQ51 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,52■■■□□ 2,16
Vmn1r47Q9EQ51 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC27,46■■□□□ 1,99
Vmn1r47Q9EQ51 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,31■■□□□ 1,96
Vmn1r47Q9EQ51 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC27,05■■□□□ 1,92
Vmn1r47Q9EQ51 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,79■■□□□ 1,88
Vmn1r47Q9EQ51 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC26,78■■□□□ 1,88
Vmn1r47Q9EQ51 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,65■■□□□ 1,86
Vmn1r47Q9EQ51 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,4■■□□□ 1,82
Vmn1r47Q9EQ51 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,37■■□□□ 1,81
Vmn1r47Q9EQ51 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26,35■■□□□ 1,81
Vmn1r47Q9EQ51 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC26,18■■□□□ 1,78
Vmn1r47Q9EQ51 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1,75
Vmn1r47Q9EQ51 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,8■■□□□ 1,72
Vmn1r47Q9EQ51 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,65■■□□□ 1,7
Vmn1r47Q9EQ51 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,55■■□□□ 1,68
Vmn1r47Q9EQ51 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC25,54■■□□□ 1,68
Vmn1r47Q9EQ51 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC25,52■■□□□ 1,68
Vmn1r47Q9EQ51 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,43■■□□□ 1,66
Vmn1r47Q9EQ51 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,31■■□□□ 1,64
Vmn1r47Q9EQ51 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25,31■■□□□ 1,64
Vmn1r47Q9EQ51 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,24■■□□□ 1,63
Vmn1r47Q9EQ51 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC25,2■■□□□ 1,62
Vmn1r47Q9EQ51 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,17■■□□□ 1,62
Vmn1r47Q9EQ51 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,17■■□□□ 1,62
Vmn1r47Q9EQ51 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,12■■□□□ 1,61
Vmn1r47Q9EQ51 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,11■■□□□ 1,61
Vmn1r47Q9EQ51 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,09■■□□□ 1,61
Vmn1r47Q9EQ51 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC25,05■■□□□ 1,6
Vmn1r47Q9EQ51 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24,97■■□□□ 1,59
Vmn1r47Q9EQ51 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC24,93■■□□□ 1,58
Vmn1r47Q9EQ51 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,88■■□□□ 1,57
Vmn1r47Q9EQ51 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,77■■□□□ 1,56
Vmn1r47Q9EQ51 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,75■■□□□ 1,55
Vmn1r47Q9EQ51 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,71■■□□□ 1,55
Vmn1r47Q9EQ51 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC24,67■■□□□ 1,54
Vmn1r47Q9EQ51 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC24,61■■□□□ 1,53
Vmn1r47Q9EQ51 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC24,56■■□□□ 1,52
Vmn1r47Q9EQ51 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,51■■□□□ 1,51
Vmn1r47Q9EQ51 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,51■■□□□ 1,51
Vmn1r47Q9EQ51 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,43■■□□□ 1,5
Vmn1r47Q9EQ51 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,39■■□□□ 1,49
Vmn1r47Q9EQ51 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,32■■□□□ 1,48
Vmn1r47Q9EQ51 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,25■■□□□ 1,47
Vmn1r47Q9EQ51 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24,18■■□□□ 1,46
Vmn1r47Q9EQ51 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC24,13■■□□□ 1,45
Vmn1r47Q9EQ51 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC24,12■■□□□ 1,45
Vmn1r47Q9EQ51 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,11■■□□□ 1,45
Vmn1r47Q9EQ51 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,06■■□□□ 1,44
Vmn1r47Q9EQ51 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC24,04■■□□□ 1,44
Vmn1r47Q9EQ51 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC24,02■■□□□ 1,44
Vmn1r47Q9EQ51 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,02■■□□□ 1,44
Vmn1r47Q9EQ51 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,99■■□□□ 1,43
Vmn1r47Q9EQ51 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,99■■□□□ 1,43
Vmn1r47Q9EQ51 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,94■■□□□ 1,42
Vmn1r47Q9EQ51 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC23,91■■□□□ 1,42
Vmn1r47Q9EQ51 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC23,88■■□□□ 1,41
Vmn1r47Q9EQ51 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23,85■■□□□ 1,41
Vmn1r47Q9EQ51 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC23,82■■□□□ 1,4
Vmn1r47Q9EQ51 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC23,8■■□□□ 1,4
Vmn1r47Q9EQ51 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23,79■■□□□ 1,4
Vmn1r47Q9EQ51 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,71■■□□□ 1,39
Vmn1r47Q9EQ51 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23,7■■□□□ 1,39
Vmn1r47Q9EQ51 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23,7■■□□□ 1,38
Vmn1r47Q9EQ51 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,69■■□□□ 1,38
Vmn1r47Q9EQ51 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23,61■■□□□ 1,37
Vmn1r47Q9EQ51 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,58■■□□□ 1,37
Vmn1r47Q9EQ51 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC23,57■■□□□ 1,36
Vmn1r47Q9EQ51 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23,56■■□□□ 1,36
Vmn1r47Q9EQ51 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,56■■□□□ 1,36
Vmn1r47Q9EQ51 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC23,53■■□□□ 1,36
Vmn1r47Q9EQ51 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,52■■□□□ 1,36
Vmn1r47Q9EQ51 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,52■■□□□ 1,36
Vmn1r47Q9EQ51 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23,49■■□□□ 1,35
Vmn1r47Q9EQ51 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC23,49■■□□□ 1,35
Vmn1r47Q9EQ51 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,46■■□□□ 1,35
Vmn1r47Q9EQ51 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,43■■□□□ 1,34
Vmn1r47Q9EQ51 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,42■■□□□ 1,34
Vmn1r47Q9EQ51 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,39■■□□□ 1,34
Vmn1r47Q9EQ51 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC23,38■■□□□ 1,33
Vmn1r47Q9EQ51 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,37■■□□□ 1,33
Vmn1r47Q9EQ51 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC23,36■■□□□ 1,33
Vmn1r47Q9EQ51 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,29■■□□□ 1,32
Vmn1r47Q9EQ51 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23,29■■□□□ 1,32
Vmn1r47Q9EQ51 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,24■■□□□ 1,31
Vmn1r47Q9EQ51 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,23■■□□□ 1,31
Vmn1r47Q9EQ51 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23,2■■□□□ 1,3
Vmn1r47Q9EQ51 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,19■■□□□ 1,3
Vmn1r47Q9EQ51 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC23,19■■□□□ 1,3
Vmn1r47Q9EQ51 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC23,18■■□□□ 1,3
Vmn1r47Q9EQ51 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC23,17■■□□□ 1,3
Vmn1r47Q9EQ51 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23,17■■□□□ 1,3
Vmn1r47Q9EQ51 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC23,16■■□□□ 1,3
Vmn1r47Q9EQ51 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC23,1■■□□□ 1,29
Vmn1r47Q9EQ51 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23,1■■□□□ 1,29
Vmn1r47Q9EQ51 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,08■■□□□ 1,28
Vmn1r47Q9EQ51 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,07■■□□□ 1,28
Vmn1r47Q9EQ51 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23,06■■□□□ 1,28
Vmn1r47Q9EQ51 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,04■■□□□ 1,28
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