RNA–Protein interactions for RNA: YOR063W

RPL3, Transcript of Ribosomal 60S subunit protein L3, yeast

Gene RPL3, Length 1,164 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RPL3	YOR063W	EXO1	P39875	702 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPL3	YOR063W	HPM1	P40481	377 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPL3	YOR063W	CAK1	P43568	368 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RPL3	YOR063W	TIS11	P47977	285 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPL3	YOR063W	VPS73	P53142	486 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RPL3	YOR063W	NOP19	P53317	196 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RPL3	YOR063W	IBD2	P53892	351 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPL3	YOR063W	PRO2	P54885	456 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RPL3	YOR063W	NHP10	Q03435	203 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPL3	YOR063W	RAD33	Q04231	177 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPL3	YOR063W	RSF1	Q05043	376 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPL3	YOR063W	YPR114W	Q06107	315 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPL3	YOR063W	YLR456W	Q06199	204 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPL3	YOR063W	YOL019W	Q08157	551 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPL3	YOR063W	YOL073C	Q08232	322 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPL3	YOR063W	LEU9	Q12166	604 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RPL3	YOR063W	YBR056W-A	I2HB52	66 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPL3	YOR063W	GAL4	P04386	881 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPL3	YOR063W	HEM2	P05373	342 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPL3	YOR063W	ZIP1	P31111	875 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPL3	YOR063W	HCS1	P34243	683 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPL3	YOR063W	SNU114	P36048	1008 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RPL3	YOR063W	ARN1	P38731	627 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPL3	YOR063W	ERV46	P39727	415 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPL3	YOR063W	HEM14	P40012	539 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPL3	YOR063W	ERG10	P41338	398 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RPL3	YOR063W	YRB1	P41920	201 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RPL3	YOR063W	CCT7	P42943	550 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RPL3	YOR063W	GCD14	P46959	383 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RPL3	YOR063W	AIM23	P47015	356 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPL3	YOR063W	GPI8	P49018	411 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPL3	YOR063W	VEL1	P53058	206 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPL3	YOR063W	EMC4	P53073	190 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPL3	YOR063W	EFM5	P53200	248 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RPL3	YOR063W	CLD1	P53264	445 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPL3	YOR063W	GTR2	P53290	341 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPL3	YOR063W	COS6	P53344	381 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPL3	YOR063W	FRE4	P53746	719 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPL3	YOR063W	GAS3	Q03655	524 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPL3	YOR063W	TRM12	Q04235	462 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPL3	YOR063W	DPB4	Q04603	196 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RPL3	YOR063W	RBS1	Q05672	457 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RPL3	YOR063W	ASA1	Q06822	443 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPL3	YOR063W	AHA1	Q12449	350 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RPL3	YOR063W	POL2	P21951	2222 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RPL3	YOR063W	STF1	P01098	86 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPL3	YOR063W	MSF1	P08425	469 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPL3	YOR063W	IMG1	P25626	169 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPL3	YOR063W	BUB2	P26448	306 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RPL3	YOR063W	SWH1	P35845	1188 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPL3	YOR063W	TIM17	P39515	158 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPL3	YOR063W	DHH1	P39517	506 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RPL3	YOR063W	ELO1	P39540	310 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPL3	YOR063W	HOS2	P53096	452 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RPL3	YOR063W	NRM1	P53718	249 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPL3	YOR063W	CPR8	P53728	308 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPL3	YOR063W	YPL107W	Q02873	248 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPL3	YOR063W	ATG26	Q06321	1198 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPL3	YOR063W	SGT1	Q08446	395 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPL3	YOR063W	SLF1	Q12034	447 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RPL3	YOR063W	YLR049C	Q12110	428 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPL3	YOR063W	PER33	Q12144	273 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPL3	YOR063W	RPN5	Q12250	445 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RPL3	YOR063W	TAF3	Q12297	353 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPL3	YOR063W	TPK2	P06245	380 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPL3	YOR063W	COS2	P0CX12	379 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPL3	YOR063W	COS3	P0CX13	379 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPL3	YOR063W	YAK1	P14680	807 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPL3	YOR063W	SEC63	P14906	663 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPL3	YOR063W	CCA1	P21269	546 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPL3	YOR063W	DBR1	P24309	405 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RPL3	YOR063W	PTC6	P25646	442 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPL3	YOR063W	DPH5	P32469	300 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RPL3	YOR063W	GSH1	P32477	678 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPL3	YOR063W	RML2	P32611	393 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPL3	YOR063W	YME2	P32843	850 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPL3	YOR063W	UGP1	P32861	499 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RPL3	YOR063W	PRP18	P33411	251 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RPL3	YOR063W	PDX3	P38075	228 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RPL3	YOR063W	YHR045W	P38775	560 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPL3	YOR063W	MIT1	P40002	666 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPL3	YOR063W	YIL001W	P40560	513 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPL3	YOR063W	COS4	P43542	379 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPL3	YOR063W	YFR020W	P43600	232 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPL3	YOR063W	PTR3	P43606	678 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPL3	YOR063W	STB2	P46679	850 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPL3	YOR063W	YGL117W	P53133	265 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPL3	YOR063W	PRM1	P53835	661 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPL3	YOR063W	RPM2	Q02773	1202 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPL3	YOR063W	DYN3	Q04949	312 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPL3	YOR063W	YLL032C	Q07834	825 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.94	□□□□□ -1.62	not detected
RPL3	YOR063W	RUP1	Q12242	671 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPL3	YOR063W	ATG34	Q12292	412 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPL3	YOR063W	ADF1	Q2V2Q1	113 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPL3	YOR063W	SUC2	P00724	532 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPL3	YOR063W	GCD2	P12754	651 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RPL3	YOR063W	AST1	P35183	429 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPL3	YOR063W	ICS2	P38284	255 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPL3	YOR063W	IAH1	P41734	238 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPL3	YOR063W	DIM1	P41819	318 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 19.3 ms