RNA–Protein interactions for RNA: YOR033C

EXO1, Transcript of 5'-3' exonuclease and flap-endonuclease, yeast

Gene EXO1, Length 2,109 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
EXO1	YOR033C	CPR8	P53728	308 aa		4.91	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	YNR066C	P53752	436 aa		4.91	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	TGL2	P54857	326 aa		4.91	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	YMR209C	Q03648	457 aa		4.91	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	BER1	Q06688	274 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	PML1	Q07930	204 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	YOL075C	Q08234	1294 aa		4.91	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	YLR053C	Q12026	108 aa		4.91	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	RRG1	Q12167	365 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	BI2	P03873	423 aa		4.9	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	SWI5	P08153	709 aa		4.9	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	RAD18	P10862	487 aa		4.9	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	GUK1	P15454	187 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	SPO7	P18410	259 aa		4.9	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	COQ1	P18900	473 aa		4.9	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	AFG1	P32317	509 aa		4.9	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	YPT7	P32939	208 aa		4.9	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	YKR075C	P36155	307 aa		4.9	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	TVP38	P36164	337 aa		4.9	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	FMP52	P40008	231 aa		4.9	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	PGD1	P40356	397 aa		4.9	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	RGD2	P43556	714 aa		4.9	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	MRH4	P53166	561 aa		4.9	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	CTL1	Q03220	320 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	SSK1	Q07084	712 aa		4.9	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	HRD1	Q08109	551 aa		4.9	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	PET20	Q99373	253 aa		4.9	□□□□□ -1.62
EXO1	YOR033C	AAC1	P04710	309 aa		4.9	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	RPL9A	P05738	191 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	ERG20	P08524	352 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	SRD1	P09007	221 aa		4.9	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	RPL31A	P0C2H8	113 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	RPL31B	P0C2H9	113 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	SEC12	P11655	471 aa		4.9	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	SCH9	P11792	824 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	BOS1	P25385	244 aa		4.9	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	PEX4	P29340	183 aa		4.9	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	FAA3	P39002	694 aa		4.9	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	RRD1	P40454	393 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	SSU1	P41930	458 aa		4.9	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	AIM22	P47051	409 aa		4.9	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	NUP192	P47054	1683 aa		4.9	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	RPL9B	P51401	191 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	TAD1	P53065	400 aa		4.9	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	BUD32	P53323	261 aa		4.9	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	YSA1	Q01976	231 aa		4.9	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	TDA1	Q03533	586 aa		4.9	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	IZH3	Q07959	543 aa		4.9	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	SUL2	Q12325	893 aa		4.9	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	YER152C	P10356	443 aa		4.89	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	IMG2	P25642	146 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	SPR1	P32603	445 aa		4.89	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	YSC84	P32793	468 aa		4.89	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	MDL1	P33310	695 aa		4.89	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	MRPL36	P36531	177 aa		4.89	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	FAT1	P38225	669 aa		4.89	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	VHC1	P38329	1120 aa		4.89	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	PCM1	P38628	557 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	HIS2	P38635	335 aa		4.89	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	FSH1	P38777	243 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	YHR122W	P38829	231 aa		4.89	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	AFG3	P39925	761 aa		4.89	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	PAN6	P40459	309 aa		4.89	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	YJL045W	P47052	634 aa		4.89	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	YJR011C	P47086	261 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	YPR003C	P53394	754 aa		4.89	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	NRK1	P53915	240 aa		4.89	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	RKM2	Q03942	479 aa		4.89	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	YDR391C	Q04170	232 aa		4.89	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	GMC1	Q04399	608 aa		4.89	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	YPR078C	Q06813	372 aa		4.89	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	SYT1	Q06836	1226 aa		4.89	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	AIM6	Q07716	390 aa		4.89	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	FDH1	Q08911	376 aa		4.89	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	YPL199C	Q08954	240 aa		4.89	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	PKH2	Q12236	1081 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	SNF8	Q12483	233 aa		4.89	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	HSH49	Q99181	213 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	SEC7	P11075	2009 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	HAP2	P06774	265 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	CKA1	P15790	372 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	ZRC1	P20107	442 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	MNE1	P24720	663 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	VAC17	P25591	423 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	CSM1	P25651	190 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	COQ3	P27680	312 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	HIS7	P33734	552 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	APE3	P37302	537 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	PRS3	P38689	320 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	WSS1	P38838	269 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	NIT1	P40447	199 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	YIL108W	P40483	696 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	HIS6	P40545	261 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	GDS1	P41913	522 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	OTU1	P43558	301 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	FAR3	P46671	204 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	ASG7	P46993	209 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	DUO1	P53168	247 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	NQM1	P53228	333 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	YAT1	P80235	687 aa		4.88	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 23.8 ms