RNA–Protein interactions for RNA: YMR228W

MTF1, Transcript of Mitochondrial RNA polymerase specificity factor, yeast

Gene MTF1, Length 1,026 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MTF1	YMR228W	DBP6	P53734	629 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MTF1	YMR228W	MRP51	Q02950	344 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MTF1	YMR228W	CWC21	Q03375	135 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MTF1	YMR228W	BET5	Q03630	159 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MTF1	YMR228W	APC4	Q04601	652 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MTF1	YMR228W	LDS2	Q08218	356 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MTF1	YMR228W	OSW1	Q08692	278 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MTF1	YMR228W	YDL009C	Q12210	107 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MTF1	YMR228W	YDR262W	Q12331	272 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MTF1	YMR228W	ORT1	Q12375	292 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MTF1	YMR228W	RGS2	Q99188	309 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MTF1	YMR228W	FSH3	Q99369	266 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MTF1	YMR228W	TDH1	P00360	332 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MTF1	YMR228W	SSA3	P09435	649 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MTF1	YMR228W	CLN3	P13365	580 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MTF1	YMR228W	PAD1	P33751	242 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.96	□□□□□ -1.62	not detected
MTF1	YMR228W	YKL070W	P36087	169 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MTF1	YMR228W	RTC2	P38279	296 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MTF1	YMR228W	LYS12	P40495	371 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MTF1	YMR228W	PHB2	P50085	310 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MTF1	YMR228W	YGR266W	P53326	701 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MTF1	YMR228W	FRE4	P53746	719 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MTF1	YMR228W	TDA7	P53882	636 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MTF1	YMR228W	YOL075C	Q08234	1294 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MTF1	YMR228W	RUD3	Q12234	484 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MTF1	YMR228W	PKH2	Q12236	1081 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MTF1	YMR228W	CRC1	Q12289	327 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MTF1	YMR228W	RNA1	P11745	407 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
MTF1	YMR228W	AMD1	P15274	810 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
MTF1	YMR228W	MBR1	P23493	339 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MTF1	YMR228W	YCR100C	P25606	316 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MTF1	YMR228W	YPS1	P32329	569 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MTF1	YMR228W	MNS1	P32906	549 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MTF1	YMR228W	SKT5	P34226	696 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MTF1	YMR228W	BFR1	P38934	470 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.95	□□□□□ -1.62	RIP-Chip
MTF1	YMR228W	PET100	P38958	111 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MTF1	YMR228W	LCP5	P40079	357 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
MTF1	YMR228W	YMR134W	P40207	237 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MTF1	YMR228W	YIL024C	P40543	189 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MTF1	YMR228W	GCD10	P41814	478 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MTF1	YMR228W	LIA1	P47120	325 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
MTF1	YMR228W	STE24	P47154	453 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MTF1	YMR228W	SSN8	P47821	323 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MTF1	YMR228W	MND1	P53102	219 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MTF1	YMR228W	YPL068C	Q02749	293 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MTF1	YMR228W	ATC1	Q04005	294 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MTF1	YMR228W	AIM33	Q04516	312 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MTF1	YMR228W	ASA1	Q06822	443 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MTF1	YMR228W	YEH2	Q07950	538 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MTF1	YMR228W	SRL2	Q12020	392 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MTF1	YMR228W	BSC1	Q12140	328 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MTF1	YMR228W	TY3A-G	Q12173	290 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MTF1	YMR228W	AIM45	Q12480	344 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
MTF1	YMR228W	TY3A-I	Q99219	290 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MTF1	YMR228W	ECM29	P38737	1868 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MTF1	YMR228W	TPK3	P05986	398 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MTF1	YMR228W	ATP1	P07251	545 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
MTF1	YMR228W	TUB1	P09733	447 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
MTF1	YMR228W	MAS2	P11914	482 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MTF1	YMR228W	MSS116	P15424	664 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
MTF1	YMR228W	SPO12	P17123	173 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MTF1	YMR228W	YAP1	P19880	650 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
MTF1	YMR228W	PEX2	P32800	271 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MTF1	YMR228W	CUE2	P36075	443 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
MTF1	YMR228W	GAT1	P43574	510 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MTF1	YMR228W	YDL186W	P48568	277 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MTF1	YMR228W	YNR048W	P53740	393 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MTF1	YMR228W	ODC1	Q03028	310 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MTF1	YMR228W	SEG1	Q04279	960 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MTF1	YMR228W	MUM3	Q08750	479 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MTF1	YMR228W	CIN8	P27895	1000 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MTF1	YMR228W	BUD2	P33314	1104 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MTF1	YMR228W	COY1	P34237	679 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MTF1	YMR228W	KKQ8	P36004	724 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MTF1	YMR228W	YMR262W	P38430	313 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MTF1	YMR228W	FLO5	P38894	1075 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MTF1	YMR228W	VPS52	P39904	641 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MTF1	YMR228W	VAB2	P40003	282 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MTF1	YMR228W	PCL6	P40038	420 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MTF1	YMR228W	YJL070C	P40361	888 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MTF1	YMR228W	TOS3	P43637	560 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MTF1	YMR228W	LSC1	P53598	329 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
MTF1	YMR228W	YDR415C	Q04033	374 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
MTF1	YMR228W	ATX2	Q12067	313 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MTF1	YMR228W	YPR022C	Q12139	1133 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MTF1	YMR228W	LDB17	Q12342	491 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MTF1	YMR228W	AHC1	Q12433	566 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MTF1	YMR228W	TEF1	P02994	458 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
MTF1	YMR228W	RPS19A	P07280	144 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
MTF1	YMR228W	RPS19B	P07281	144 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
MTF1	YMR228W	MRPL8	P22353	238 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MTF1	YMR228W	ERG1	P32476	496 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
MTF1	YMR228W	COT1	P32798	439 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MTF1	YMR228W	RPC25	P35718	212 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MTF1	YMR228W	TPO5	P36029	618 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MTF1	YMR228W	HSM3	P38348	480 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MTF1	YMR228W	SEC9	P40357	651 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MTF1	YMR228W	CDC40	P40968	455 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
MTF1	YMR228W	LAM5	P43560	674 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MTF1	YMR228W	GUF1	P46943	645 aa		4.92	□□□□□ -1.62

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