RNA–Protein interactions for RNA: YLR224W

YLR224W, Transcript of F-box protein and component of SCF ubiquitin ligase complexes, yeast

Gene YLR224W, Length 1,110 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YLR224W	YLR224W	DOA1	P36037	715 aa		2.4	□□□□□ -2.03
YLR224W	YLR224W	MCR1	P36060	302 aa	Known RBP	2.4	□□□□□ -2.03
YLR224W	YLR224W	LRP1	P38801	184 aa	Known RBP	2.4	□□□□□ -2.03
YLR224W	YLR224W	BAT1	P38891	393 aa	Known RBP	2.4	□□□□□ -2.03
YLR224W	YLR224W	TOS2	P50078	622 aa		2.4	□□□□□ -2.03
YLR224W	YLR224W	TRM112	P53738	135 aa	Predicted RBP	2.4	□□□□□ -2.03
YLR224W	YLR224W	URC2	Q04411	772 aa		2.4	□□□□□ -2.03
YLR224W	YLR224W	LIP2	Q06005	328 aa		2.4	□□□□□ -2.03
YLR224W	YLR224W	YDL114W	Q07530	308 aa		2.4	□□□□□ -2.03
YLR224W	YLR224W	AAD15	Q08361	143 aa		2.4	□□□□□ -2.03
YLR224W	YLR224W	SAC3	P46674	1301 aa		2.4	□□□□□ -2.03
YLR224W	YLR224W	STF1	P01098	86 aa		2.39	□□□□□ -2.03
YLR224W	YLR224W	OPI3	P05375	206 aa		2.39	□□□□□ -2.03
YLR224W	YLR224W	ANR2	P36090	516 aa	Predicted RBP	2.39	□□□□□ -2.03
YLR224W	YLR224W	MRP21	P38175	177 aa		2.39	□□□□□ -2.03
YLR224W	YLR224W	EFM4	P40516	257 aa		2.39	□□□□□ -2.03
YLR224W	YLR224W	PMT5	P52867	743 aa		2.39	□□□□□ -2.03
YLR224W	YLR224W	YGR016W	P53209	190 aa		2.39	□□□□□ -2.03
YLR224W	YLR224W	CRH1	P53301	507 aa		2.39	□□□□□ -2.03
YLR224W	YLR224W	RTT102	P53330	157 aa		2.39	□□□□□ -2.03
YLR224W	YLR224W	RRN9	P53437	365 aa		2.39	□□□□□ -2.03
YLR224W	YLR224W	RCF1	Q03713	159 aa		2.39	□□□□□ -2.03
YLR224W	YLR224W	YET2	Q04210	160 aa		2.39	□□□□□ -2.03
YLR224W	YLR224W	ECM7	Q06200	448 aa		2.39	□□□□□ -2.03
YLR224W	YLR224W	YPR172W	Q06608	200 aa		2.39	□□□□□ -2.03
YLR224W	YLR224W	ASA1	Q06822	443 aa		2.39	□□□□□ -2.03
YLR224W	YLR224W	YPR091C	Q06833	770 aa		2.39	□□□□□ -2.03
YLR224W	YLR224W	MFG1	Q07684	458 aa		2.39	□□□□□ -2.03
YLR224W	YLR224W	PAR32	Q12515	295 aa	Known RBP	2.39	□□□□□ -2.03
YLR224W	YLR224W	NAG1	Q8TGN9	163 aa		2.39	□□□□□ -2.03
YLR224W	YLR224W	RKR1	Q04781	1562 aa		2.39	□□□□□ -2.03
YLR224W	YLR224W	SPT6	P23615	1451 aa	Known RBP	2.39	□□□□□ -2.03
YLR224W	YLR224W	MNE1	P24720	663 aa		2.38	□□□□□ -2.03
YLR224W	YLR224W	FUN26	P31381	517 aa		2.38	□□□□□ -2.03
YLR224W	YLR224W	GPX2	P38143	162 aa		2.38	□□□□□ -2.03
YLR224W	YLR224W	KAP104	P38217	918 aa	Known RBP	2.38	□□□□□ -2.03
YLR224W	YLR224W	OM14	P38325	134 aa		2.38	□□□□□ -2.03
YLR224W	YLR224W	MLH1	P38920	769 aa		2.38	□□□□□ -2.03
YLR224W	YLR224W	CAJ1	P39101	391 aa		2.38	□□□□□ -2.03
YLR224W	YLR224W	YER186C	P40101	306 aa		2.38	□□□□□ -2.03
YLR224W	YLR224W	YNL208W	P40159	199 aa	Known RBP	2.38	□□□□□ -2.03
YLR224W	YLR224W	SEC27	P41811	889 aa	Known RBP	2.38	□□□□□ -2.03
YLR224W	YLR224W	ASN2	P49090	572 aa	Known RBP	2.38	□□□□□ -2.03
YLR224W	YLR224W	YMR111C	Q04461	462 aa	Predicted RBP	2.38	□□□□□ -2.03
YLR224W	YLR224W	YDR286C	Q05530	114 aa		2.38	□□□□□ -2.03
YLR224W	YLR224W	FCY22	Q12119	530 aa		2.38	□□□□□ -2.03
YLR224W	YLR224W	PCL9	Q12477	304 aa		2.38	□□□□□ -2.03
YLR224W	YLR224W	SRN2	Q99176	213 aa		2.38	□□□□□ -2.03
YLR224W	YLR224W	RAD51	P25454	400 aa		2.37	□□□□□ -2.03
YLR224W	YLR224W	CDC50	P25656	391 aa		2.37	□□□□□ -2.03
YLR224W	YLR224W	DPH2	P32461	534 aa		2.37	□□□□□ -2.03
YLR224W	YLR224W	TOA2	P32774	122 aa		2.37	□□□□□ -2.03
YLR224W	YLR224W	MDL1	P33310	695 aa		2.37	□□□□□ -2.03
YLR224W	YLR224W	MNL1	P38888	796 aa		2.37	□□□□□ -2.03
YLR224W	YLR224W	GDI1	P39958	451 aa	Known RBP	2.37	□□□□□ -2.03
YLR224W	YLR224W	AIP1	P46680	615 aa	Known RBP	2.37	□□□□□ -2.03
YLR224W	YLR224W	KEL2	P50090	882 aa		2.37	□□□□□ -2.03
YLR224W	YLR224W	SKI8	Q02793	397 aa	Predicted RBP	2.37	□□□□□ -2.03
YLR224W	YLR224W	IPK1	Q06667	281 aa		2.37	□□□□□ -2.03
YLR224W	YLR224W	NOP6	Q07623	225 aa	Known RBP	2.37	□□□□□ -2.03
YLR224W	YLR224W	LDS2	Q08218	356 aa		2.37	□□□□□ -2.03
YLR224W	YLR224W	MEX67	Q99257	599 aa	Known RBP	2.37	□□□□□ -2.03
YLR224W	YLR224W	COX4	P04037	155 aa		2.36	□□□□□ -2.03
YLR224W	YLR224W	RNA1	P11745	407 aa	Known RBP	2.36	□□□□□ -2.03
YLR224W	YLR224W	KRR1	P25586	316 aa	Predicted RBP	2.36	□□□□□ -2.03
YLR224W	YLR224W	IES6	P32617	166 aa		2.36	□□□□□ -2.03
YLR224W	YLR224W	TIR2	P33890	251 aa		2.36	□□□□□ -2.03
YLR224W	YLR224W	MID2	P36027	376 aa		2.36	□□□□□ -2.03
YLR224W	YLR224W	PFF1	P38244	976 aa		2.36	□□□□□ -2.03
YLR224W	YLR224W	GEP4	P38812	185 aa		2.36	□□□□□ -2.03
YLR224W	YLR224W	GRX3	Q03835	250 aa		2.36	□□□□□ -2.03
YLR224W	YLR224W	CHD1	P32657	1468 aa		2.35	□□□□□ -2.03
YLR224W	YLR224W	TRX1	P22217	103 aa	Known RBP	2.35	□□□□□ -2.03
YLR224W	YLR224W	PUP2	P32379	260 aa		2.35	□□□□□ -2.03
YLR224W	YLR224W	SPO23	P33757	523 aa		2.35	□□□□□ -2.03
YLR224W	YLR224W	ECM8	P38246	354 aa		2.35	□□□□□ -2.03
YLR224W	YLR224W	SEC28	P40509	296 aa	Known RBP	2.35	□□□□□ -2.03
YLR224W	YLR224W	MLC1	P53141	149 aa		2.35	□□□□□ -2.03
YLR224W	YLR224W	MRPS16	Q02608	121 aa		2.35	□□□□□ -2.03
YLR224W	YLR224W	DNL4	Q08387	944 aa	Predicted RBP	2.35	□□□□□ -2.03
YLR224W	YLR224W	APC5	Q08683	685 aa		2.35	□□□□□ -2.03
YLR224W	YLR224W	YDL199C	Q12407	687 aa		2.35	□□□□□ -2.03
YLR224W	YLR224W	YPR117W	Q06116	2489 aa		2.35	□□□□□ -2.03
YLR224W	YLR224W	PSK1	P31374	1356 aa		2.35	□□□□□ -2.03
YLR224W	YLR224W	RPC40	P07703	335 aa	Known RBP	2.34	□□□□□ -2.03
YLR224W	YLR224W	PRB1	P09232	635 aa		2.34	□□□□□ -2.03
YLR224W	YLR224W	ZRC1	P20107	442 aa		2.34	□□□□□ -2.03
YLR224W	YLR224W	RRP7	P25368	297 aa	Predicted RBP	2.34	□□□□□ -2.03
YLR224W	YLR224W	DEP1	P31385	405 aa		2.34	□□□□□ -2.03
YLR224W	YLR224W	SPP381	P38282	291 aa	Predicted RBP	2.34	□□□□□ -2.03
YLR224W	YLR224W	LSM12	P38828	187 aa	Known RBP	2.34	□□□□□ -2.03
YLR224W	YLR224W	ALD5	P40047	520 aa	Known RBP	2.34	□□□□□ -2.03
YLR224W	YLR224W	JEM1	P40358	645 aa		2.34	□□□□□ -2.03
YLR224W	YLR224W	ABM1	P47146	123 aa		2.34	□□□□□ -2.03
YLR224W	YLR224W	TRF5	P48561	642 aa	Known RBP	2.34	□□□□□ -2.03
YLR224W	YLR224W	YIP5	P53108	310 aa		2.34	□□□□□ -2.03
YLR224W	YLR224W	YMR010W	Q03687	405 aa		2.34	□□□□□ -2.03
YLR224W	YLR224W	HMS1	Q12398	434 aa		2.34	□□□□□ -2.03
YLR224W	YLR224W	STE7	P06784	515 aa		2.33	□□□□□ -2.04
YLR224W	YLR224W	MRPL8	P22353	238 aa		2.33	□□□□□ -2.04

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 18.3 ms