RNA–Protein interactions for RNA: YKR047W

YKR047W, Transcript of Dubious open reading frame, yeastyeast

Gene YKR047W, Length 306 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YKR047WYKR047W SAR1P20606 190 aaKnown RBP4.14□□□□□ -1.75
YKR047WYKR047W ZUO1P32527 433 aaKnown RBP4.14□□□□□ -1.75
YKR047WYKR047W BUD2P33314 1104 aa4.14□□□□□ -1.75
YKR047WYKR047W MRPS5P33759 307 aa4.14□□□□□ -1.75
YKR047WYKR047W YHK8P38776 514 aa4.14□□□□□ -1.75
YKR047WYKR047W YHR131CP38835 850 aa4.14□□□□□ -1.75
YKR047WYKR047W GCD14P46959 383 aaPredicted RBP4.14□□□□□ -1.75
YKR047WYKR047W VAC14Q06708 880 aa4.14□□□□□ -1.75
YKR047WYKR047W DCP1Q12517 231 aaPredicted RBP4.14□□□□□ -1.75
YKR047WYKR047W STE2D6VTK4 431 aa4.13□□□□□ -1.75
YKR047WYKR047W GDH1P07262 454 aaKnown RBP4.13□□□□□ -1.75
YKR047WYKR047W HEM15P16622 393 aa4.13□□□□□ -1.75
YKR047WYKR047W PHA2P32452 334 aa4.13□□□□□ -1.75
YKR047WYKR047W SBE22P38814 852 aa4.13□□□□□ -1.75
YKR047WYKR047W CCT4P39078 528 aaKnown RBP4.13□□□□□ -1.75
YKR047WYKR047W BTT1P40314 149 aaPredicted RBP4.13□□□□□ -1.75
YKR047WYKR047W SEC27P41811 889 aaKnown RBP4.13□□□□□ -1.75
YKR047WYKR047W WWM1P43582 211 aaKnown RBP4.13□□□□□ -1.75
YKR047WYKR047W COS1P53822 381 aa4.13□□□□□ -1.75
YKR047WYKR047W SPO19Q03029 223 aa4.13□□□□□ -1.75
YKR047WYKR047W RTT103Q05543 409 aa4.13□□□□□ -1.75
YKR047WYKR047W GRS2Q06817 618 aa4.13□□□□□ -1.75
YKR047WYKR047W MDM36Q06820 579 aa4.13□□□□□ -1.75
YKR047WYKR047W GAT3Q07928 141 aa4.13□□□□□ -1.75
YKR047WYKR047W YLR108CQ12259 485 aa4.13□□□□□ -1.75
YKR047WYKR047W CAR2P07991 424 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
YKR047WYKR047W MYO3P36006 1272 aa4.12□□□□□ -1.75
YKR047WYKR047W ATG7P38862 630 aa4.12□□□□□ -1.75
YKR047WYKR047W YHR182WP38870 785 aa4.12□□□□□ -1.75
YKR047WYKR047W YIL029CP40538 142 aa4.12□□□□□ -1.75
YKR047WYKR047W LSC1P53598 329 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
YKR047WYKR047W YRM1Q12340 786 aa4.12□□□□□ -1.75
YKR047WYKR047W PAA1Q12447 191 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
YKR047WYKR047W SUP35P05453 685 aaKnown RBP4.11□□□□□ -1.75
YKR047WYKR047W ARF2P19146 181 aaKnown RBP4.11□□□□□ -1.75
YKR047WYKR047W FAR1P21268 830 aa4.11□□□□□ -1.75
YKR047WYKR047W UTR1P21373 530 aa4.11□□□□□ -1.75
YKR047WYKR047W PRO3P32263 286 aaKnown RBP4.11□□□□□ -1.75
YKR047WYKR047W AGA1P32323 725 aa4.11□□□□□ -1.75
YKR047WYKR047W DPH5P32469 300 aaPredicted RBP4.11□□□□□ -1.75
YKR047WYKR047W RAD23P32628 398 aaKnown RBP4.11□□□□□ -1.75
YKR047WYKR047W PEX32P38292 413 aa4.11□□□□□ -1.75
YKR047WYKR047W YHR218WP38899 603 aa4.11□□□□□ -1.75
YKR047WYKR047W FET3P38993 636 aa4.11□□□□□ -1.75
YKR047WYKR047W UTP25P40498 721 aaKnown RBP4.11□□□□□ -1.75
YKR047WYKR047W LOH1P47055 219 aa4.11□□□□□ -1.75
YKR047WYKR047W YGL185CP53100 379 aa4.11□□□□□ -1.75
YKR047WYKR047W MRM2P53123 320 aa4.11□□□□□ -1.75
YKR047WYKR047W LST7P53237 242 aa4.11□□□□□ -1.75
YKR047WYKR047W YGR168CP53293 376 aa4.11□□□□□ -1.75
YKR047WYKR047W MSO1P53604 210 aaKnown RBP4.11□□□□□ -1.75
YKR047WYKR047W CRZ1P53968 678 aa4.11□□□□□ -1.75
YKR047WYKR047W HER2Q03557 464 aa4.11□□□□□ -1.75
YKR047WYKR047W TIP41Q12199 356 aa4.11□□□□□ -1.75
YKR047WYKR047W YPR1Q12458 312 aa4.11□□□□□ -1.75
YKR047WYKR047W YCR024C-BQ3E7Z8 88 aa4.11□□□□□ -1.75
YKR047WYKR047W MEX67Q99257 599 aaKnown RBP4.11□□□□□ -1.75
YKR047WYKR047W DET1Q99288 334 aaKnown RBP4.11□□□□□ -1.75
YKR047WYKR047W TRP1P00912 224 aa4.1□□□□□ -1.75
YKR047WYKR047W RAD1P06777 1100 aa4.1□□□□□ -1.75
YKR047WYKR047W MSS116P15424 664 aaKnown RBP4.1□□□□□ -1.75
YKR047WYKR047W YUR1P26725 428 aa4.1□□□□□ -1.75
YKR047WYKR047W RAD5P32849 1169 aaPredicted RBP4.1□□□□□ -1.75
YKR047WYKR047W YKL070WP36087 169 aa4.1□□□□□ -1.75
YKR047WYKR047W IST2P38250 946 aa4.1□□□□□ -1.75
YKR047WYKR047W PEX18P38855 283 aa4.1□□□□□ -1.75
YKR047WYKR047W RBG1P39729 369 aa4.1□□□□□ -1.75
YKR047WYKR047W KEG1P43614 200 aa4.1□□□□□ -1.75
YKR047WYKR047W GTO1P48239 356 aa4.1□□□□□ -1.75
YKR047WYKR047W NAS6P50086 228 aa4.1□□□□□ -1.75
YKR047WYKR047W ALF1P53904 254 aa4.1□□□□□ -1.75
YKR047WYKR047W NUP116Q02630 1113 aa4.1□□□□□ -1.75
YKR047WYKR047W ERV41Q04651 352 aa4.1□□□□□ -1.75
YKR047WYKR047W YLH47Q06493 454 aa4.1□□□□□ -1.75
YKR047WYKR047W DNL4Q08387 944 aaPredicted RBP4.1□□□□□ -1.75
YKR047WYKR047W HNT3Q08702 217 aa4.1□□□□□ -1.75
YKR047WYKR047W AFT2Q08957 416 aa4.1□□□□□ -1.75
YKR047WYKR047W EAF3Q12432 401 aa4.1□□□□□ -1.75
YKR047WYKR047W CYC3P06182 269 aa4.09□□□□□ -1.75
YKR047WYKR047W PIS1P06197 220 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.75
YKR047WYKR047W CPR4P25334 318 aa4.09□□□□□ -1.75
YKR047WYKR047W VMA5P31412 392 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.75
YKR047WYKR047W IML3P38265 245 aa4.09□□□□□ -1.75
YKR047WYKR047W PRM5P40476 318 aa4.09□□□□□ -1.75
YKR047WYKR047W IDP2P41939 412 aa4.09□□□□□ -1.75
YKR047WYKR047W MND1P53102 219 aa4.09□□□□□ -1.75
YKR047WYKR047W YMR102CQ03177 834 aa4.09□□□□□ -1.75
YKR047WYKR047W RVB1Q03940 463 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.75
YKR047WYKR047W APC4Q04601 652 aa4.09□□□□□ -1.75
YKR047WYKR047W PRM6Q04705 352 aa4.09□□□□□ -1.75
YKR047WYKR047W KAP95Q06142 861 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.75
YKR047WYKR047W LOT6Q07923 191 aa4.09□□□□□ -1.75
YKR047WYKR047W ESA1Q08649 445 aa4.09□□□□□ -1.75
YKR047WYKR047W MEK1P24719 497 aaPredicted RBP4.08□□□□□ -1.76
YKR047WYKR047W HXT1P32465 570 aa4.08□□□□□ -1.76
YKR047WYKR047W YUH1P35127 236 aa4.08□□□□□ -1.76
YKR047WYKR047W RPC25P35718 212 aa4.08□□□□□ -1.76
YKR047WYKR047W MRPL37P36532 105 aa4.08□□□□□ -1.76
YKR047WYKR047W YIL067CP40514 678 aa4.08□□□□□ -1.76
YKR047WYKR047W CDC40P40968 455 aaPredicted RBP4.08□□□□□ -1.76
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 23.4 ms