RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000640499.1

VEGFA-231, Transcript of vascular endothelial growth factor A, human

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene VEGFA, Length 1,188 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
VEGFA-231	ENST00000640499	SH2D3A	Q9BRG2	576 aa		29.98	■■■□□ 2.39
VEGFA-231	ENST00000640499	PARN	O95453	639 aa	Known RBP	29.97	■■■□□ 2.39
VEGFA-231	ENST00000640499	TEC	P42680	631 aa		29.97	■■■□□ 2.39
VEGFA-231	ENST00000640499	CTTN	Q14247	550 aa	Known RBP	29.97	■■■□□ 2.39
VEGFA-231	ENST00000640499	IL17A	Q16552	155 aa		29.97	■■■□□ 2.39
VEGFA-231	ENST00000640499	FAM109B	Q6ICB4	259 aa	Predicted RBP	29.97	■■■□□ 2.39
VEGFA-231	ENST00000640499	ZBTB39	O15060	712 aa		29.96	■■■□□ 2.39
VEGFA-231	ENST00000640499	PDC	P20941	246 aa		29.96	■■■□□ 2.39
VEGFA-231	ENST00000640499	CYP4A11	Q02928	519 aa		29.96	■■■□□ 2.39
VEGFA-231	ENST00000640499	RILPL1	Q5EBL4	403 aa		29.96	■■■□□ 2.39
VEGFA-231	ENST00000640499	FERMT3	Q86UX7	667 aa		29.96	■■■□□ 2.39
VEGFA-231	ENST00000640499	ZNF579	Q8NAF0	562 aa	Known RBP	29.96	■■■□□ 2.39
VEGFA-231	ENST00000640499	LXN	Q9BS40	222 aa		29.96	■■■□□ 2.39
VEGFA-231	ENST00000640499	FTO	Q9C0B1	505 aa	Known RBP eCLIP	29.96	■■■□□ 2.39	5e-19	■□□□□ 10.1
VEGFA-231	ENST00000640499	MTMR6	Q9Y217	621 aa		29.96	■■■□□ 2.39
VEGFA-231	ENST00000640499	SZT2	Q5T011	3432 aa		29.96	■■■□□ 2.39
VEGFA-231	ENST00000640499	VPS37C	A5D8V6	355 aa	Predicted RBP	29.95	■■■□□ 2.39
VEGFA-231	ENST00000640499	DDX11L8	A8MPP1	907 aa		29.95	■■■□□ 2.39
VEGFA-231	ENST00000640499	TMEM62	Q0P6H9	643 aa		29.95	■■■□□ 2.39
VEGFA-231	ENST00000640499	PLA2G4F	Q68DD2	849 aa		29.95	■■■□□ 2.39
VEGFA-231	ENST00000640499	C4orf19	Q8IY42	314 aa		29.95	■■■□□ 2.39
VEGFA-231	ENST00000640499	SEPT9	Q9UHD8	586 aa	Predicted RBP	29.95	■■■□□ 2.39
VEGFA-231	ENST00000640499	CEP131	Q9UPN4	1083 aa		29.95	■■■□□ 2.39
VEGFA-231	ENST00000640499	CDY2A	Q9Y6F7	541 aa		29.95	■■■□□ 2.39
VEGFA-231	ENST00000640499	SPATA31C1	P0DKV0	1188 aa		29.94	■■■□□ 2.38
VEGFA-231	ENST00000640499	MRPS6	P82932	125 aa	Known RBP	29.94	■■■□□ 2.38
VEGFA-231	ENST00000640499	MKRN4P	Q13434	485 aa	Predicted RBP	29.94	■■■□□ 2.38
VEGFA-231	ENST00000640499	GRXCR1	A8MXD5	290 aa		29.93	■■■□□ 2.38
VEGFA-231	ENST00000640499	NPEPPS	P55786	919 aa		29.93	■■■□□ 2.38
VEGFA-231	ENST00000640499	REST	Q13127	1097 aa		29.93	■■■□□ 2.38
VEGFA-231	ENST00000640499	MTERF2	Q49AM1	385 aa		29.93	■■■□□ 2.38
VEGFA-231	ENST00000640499	PLEKHG4	Q58EX7	1191 aa		29.93	■■■□□ 2.38
VEGFA-231	ENST00000640499	RSPH3	Q86UC2	560 aa		29.93	■■■□□ 2.38
VEGFA-231	ENST00000640499	CDHR5	Q9HBB8	845 aa		29.93	■■■□□ 2.38
VEGFA-231	ENST00000640499	MAGEB2	O15479	319 aa		29.92	■■■□□ 2.38
VEGFA-231	ENST00000640499	FXR2	P51116	673 aa	Known RBP eCLIP	29.92	■■■□□ 2.38	6e-18	■■■□□ 18.2
VEGFA-231	ENST00000640499	CLCN3	P51790	818 aa		29.92	■■■□□ 2.38
VEGFA-231	ENST00000640499	DRP2	Q13474	957 aa		29.92	■■■□□ 2.38
VEGFA-231	ENST00000640499	EFCAB12	Q6NXP0	572 aa		29.92	■■■□□ 2.38
VEGFA-231	ENST00000640499	CNKSR3	Q6P9H4	555 aa		29.92	■■■□□ 2.38
VEGFA-231	ENST00000640499	TPH2	Q8IWU9	490 aa		29.92	■■■□□ 2.38
VEGFA-231	ENST00000640499	NME8	Q8N427	588 aa		29.92	■■■□□ 2.38
VEGFA-231	ENST00000640499	DBF4B	Q8NFT6	615 aa		29.92	■■■□□ 2.38
VEGFA-231	ENST00000640499	ZSWIM4	Q9H7M6	989 aa		29.92	■■■□□ 2.38
VEGFA-231	ENST00000640499	LOXHD1	Q8IVV2	1947 aa		29.91	■■■□□ 2.38
VEGFA-231	ENST00000640499		A0A087WWV3	80 aa		29.91	■■■□□ 2.38
VEGFA-231	ENST00000640499	IGKV6-21	A0A0C4DH24	114 aa		29.91	■■■□□ 2.38
VEGFA-231	ENST00000640499	MED24	O75448	989 aa		29.91	■■■□□ 2.38
VEGFA-231	ENST00000640499	LYPLA2	O95372	231 aa		29.91	■■■□□ 2.38
VEGFA-231	ENST00000640499	LPIN1	Q14693	890 aa		29.91	■■■□□ 2.38
VEGFA-231	ENST00000640499	FBXO47	Q5MNV8	452 aa		29.91	■■■□□ 2.38
VEGFA-231	ENST00000640499	BRAP	Q7Z569	592 aa		29.91	■■■□□ 2.38
VEGFA-231	ENST00000640499	LRRC71	Q8N4P6	559 aa		29.91	■■■□□ 2.38
VEGFA-231	ENST00000640499	ATP2C1	P98194	919 aa	Predicted RBP	29.9	■■■□□ 2.38
VEGFA-231	ENST00000640499	IER5	Q5VY09	327 aa		29.9	■■■□□ 2.38
VEGFA-231	ENST00000640499	FAM173B	Q6P4H8	233 aa		29.9	■■■□□ 2.38
VEGFA-231	ENST00000640499	CATSPER3	Q86XQ3	398 aa		29.9	■■■□□ 2.38
VEGFA-231	ENST00000640499	METTL13	Q8N6R0	699 aa		29.9	■■■□□ 2.38
VEGFA-231	ENST00000640499	CELF4	Q9BZC1	486 aa	Known RBP	29.9	■■■□□ 2.38
VEGFA-231	ENST00000640499	AGO3	Q9H9G7	860 aa	Known RBP	29.9	■■■□□ 2.38
VEGFA-231	ENST00000640499	CYP26B1	Q9NR63	512 aa		29.9	■■■□□ 2.38
VEGFA-231	ENST00000640499	TRPV2	Q9Y5S1	764 aa		29.9	■■■□□ 2.38
VEGFA-231	ENST00000640499	PTPRS	Q13332	1948 aa		29.9	■■■□□ 2.38
VEGFA-231	ENST00000640499	KDM3A	Q9Y4C1	1321 aa		29.9	■■■□□ 2.38
VEGFA-231	ENST00000640499	STX6	O43752	255 aa		29.89	■■■□□ 2.38
VEGFA-231	ENST00000640499	GHR	P10912	638 aa		29.89	■■■□□ 2.38
VEGFA-231	ENST00000640499	YWHAB	P31946	246 aa	Known RBP	29.89	■■■□□ 2.38
VEGFA-231	ENST00000640499	IGSF22	Q8N9C0	903 aa		29.89	■■■□□ 2.38
VEGFA-231	ENST00000640499	NEK9	Q8TD19	979 aa		29.89	■■■□□ 2.38
VEGFA-231	ENST00000640499	LAD1	O00515	517 aa		29.88	■■■□□ 2.37
VEGFA-231	ENST00000640499	DKC1	O60832	514 aa	Known RBP eCLIP	29.88	■■■□□ 2.37
VEGFA-231	ENST00000640499	GPR32	O75388	356 aa		29.88	■■■□□ 2.37
VEGFA-231	ENST00000640499	MAF	O75444	373 aa	Predicted RBP	29.88	■■■□□ 2.37
VEGFA-231	ENST00000640499	VTN	P04004	478 aa		29.88	■■■□□ 2.37
VEGFA-231	ENST00000640499	RPLP2	P05387	115 aa	Known RBP	29.88	■■■□□ 2.37
VEGFA-231	ENST00000640499	ACTN1	P12814	892 aa		29.88	■■■□□ 2.37
VEGFA-231	ENST00000640499	PRPH	P41219	470 aa		29.88	■■■□□ 2.37
VEGFA-231	ENST00000640499	TBC1D8B	Q0IIM8	1120 aa		29.88	■■■□□ 2.37
VEGFA-231	ENST00000640499	ECM1	Q16610	540 aa		29.88	■■■□□ 2.37
VEGFA-231	ENST00000640499	SPRYD3	Q8NCJ5	442 aa		29.88	■■■□□ 2.37
VEGFA-231	ENST00000640499	POLR3C	Q9BUI4	534 aa	Predicted RBP	29.88	■■■□□ 2.37
VEGFA-231	ENST00000640499	SUGCT	Q9HAC7	445 aa		29.88	■■■□□ 2.37
VEGFA-231	ENST00000640499	HSFX4	A0A1B0GTS1	333 aa	Predicted RBP	29.87	■■■□□ 2.37
VEGFA-231	ENST00000640499	HSFX3	A0A1B0GWH4	333 aa	Predicted RBP	29.87	■■■□□ 2.37
VEGFA-231	ENST00000640499	ZBBX	A8MT70	800 aa		29.87	■■■□□ 2.37
VEGFA-231	ENST00000640499	BAIAP3	O94812	1187 aa		29.87	■■■□□ 2.37
VEGFA-231	ENST00000640499	SMAD3	P84022	425 aa	Known RBP	29.87	■■■□□ 2.37
VEGFA-231	ENST00000640499	PDIA5	Q14554	519 aa		29.87	■■■□□ 2.37
VEGFA-231	ENST00000640499	TMEM40	Q8WWA1	233 aa		29.87	■■■□□ 2.37
VEGFA-231	ENST00000640499	PPP1R16B	Q96T49	567 aa		29.87	■■■□□ 2.37
VEGFA-231	ENST00000640499	ADAMTS10	Q9H324	1103 aa		29.87	■■■□□ 2.37
VEGFA-231	ENST00000640499	SLC4A7	Q9Y6M7	1214 aa		29.87	■■■□□ 2.37
VEGFA-231	ENST00000640499	ARID2	Q68CP9	1835 aa		29.87	■■■□□ 2.37
VEGFA-231	ENST00000640499	PBX2	P40425	430 aa		29.86	■■■□□ 2.37
VEGFA-231	ENST00000640499	WDR5	P61964	334 aa	Known RBP	29.86	■■■□□ 2.37
VEGFA-231	ENST00000640499	LIN28B	Q6ZN17	250 aa	Known RBP eCLIP	29.86	■■■□□ 2.37	5e-35	■■■□□ 16.9
VEGFA-231	ENST00000640499	CEP170P1	Q96L14	293 aa		29.86	■■■□□ 2.37
VEGFA-231	ENST00000640499	DHX33	Q9H6R0	707 aa	Known RBP	29.86	■■■□□ 2.37
VEGFA-231	ENST00000640499	TUFT1	Q9NNX1	390 aa		29.86	■■■□□ 2.37
VEGFA-231	ENST00000640499	MICAL3	Q7RTP6	2002 aa		29.85	■■■□□ 2.37

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24 ms