RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000640094.1

HLA-B-257, Transcript of major histocompatibility complex, class I, B, humanhuman

BASIC

Gene HLA-B, Length 147 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-B-257ENST00000640094 ADAM7Q9H2U9 754 aa9.91□□□□□ -0.82
HLA-B-257ENST00000640094 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa9.91□□□□□ -0.82
HLA-B-257ENST00000640094 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
HLA-B-257ENST00000640094 TMEM161AQ9NX61 479 aa9.91□□□□□ -0.82
HLA-B-257ENST00000640094 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
HLA-B-257ENST00000640094 USTQ9Y2C2 406 aa9.91□□□□□ -0.82
HLA-B-257ENST00000640094 ZNF292O60281 2723 aa9.91□□□□□ -0.82
HLA-B-257ENST00000640094 FANCMQ8IYD8 2048 aa9.9□□□□□ -0.82
HLA-B-257ENST00000640094 EVPLQ92817 2033 aa9.9□□□□□ -0.82
HLA-B-257ENST00000640094 CACNA1BQ00975 2339 aa9.9□□□□□ -0.82
HLA-B-257ENST00000640094 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
HLA-B-257ENST00000640094 C2orf16Q68DN1 1984 aa9.9□□□□□ -0.82
HLA-B-257ENST00000640094 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa9.9□□□□□ -0.82
HLA-B-257ENST00000640094 AOC1P19801 751 aa9.9□□□□□ -0.82
HLA-B-257ENST00000640094 PDE4AP27815 886 aa9.9□□□□□ -0.82
HLA-B-257ENST00000640094 SEC23AQ15436 765 aa9.9□□□□□ -0.82
HLA-B-257ENST00000640094 TMEM266Q2M3C6 531 aa9.9□□□□□ -0.82
HLA-B-257ENST00000640094 ANKRD45Q5TZF3 282 aa9.9□□□□□ -0.82
HLA-B-257ENST00000640094 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
HLA-B-257ENST00000640094 KIAA1841Q6NSI8 718 aa9.9□□□□□ -0.82
HLA-B-257ENST00000640094 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
HLA-B-257ENST00000640094 TMC7Q7Z402 723 aa9.9□□□□□ -0.82
HLA-B-257ENST00000640094 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
HLA-B-257ENST00000640094 FLCNQ8NFG4 579 aa9.9□□□□□ -0.82
HLA-B-257ENST00000640094 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
HLA-B-257ENST00000640094 ADAM2Q99965 735 aa9.9□□□□□ -0.82
HLA-B-257ENST00000640094 ERVK-5Q9HDB9 667 aa9.9□□□□□ -0.82
HLA-B-257ENST00000640094 RGS18Q9NS28 235 aa9.9□□□□□ -0.82
HLA-B-257ENST00000640094 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
HLA-B-257ENST00000640094 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
HLA-B-257ENST00000640094 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa9.9□□□□□ -0.82
HLA-B-257ENST00000640094 COL1A2P08123 1366 aa9.89□□□□□ -0.83
HLA-B-257ENST00000640094 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa9.89□□□□□ -0.83
HLA-B-257ENST00000640094 CARNS1A5YM72 827 aa9.89□□□□□ -0.83
HLA-B-257ENST00000640094 SPDYE3A6NKU9 549 aa9.89□□□□□ -0.83
HLA-B-257ENST00000640094 HIDE1A8MVS5 230 aa9.89□□□□□ -0.83
HLA-B-257ENST00000640094 GPR182O15218 404 aa9.89□□□□□ -0.83
HLA-B-257ENST00000640094 MAFGO15525 162 aa9.89□□□□□ -0.83
HLA-B-257ENST00000640094 LMNAP02545 664 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
HLA-B-257ENST00000640094 ASGR2P07307 311 aa9.89□□□□□ -0.83
HLA-B-257ENST00000640094 SDSP20132 328 aa9.89□□□□□ -0.83
HLA-B-257ENST00000640094 RFX1P22670 979 aa9.89□□□□□ -0.83
HLA-B-257ENST00000640094 CA8P35219 290 aa9.89□□□□□ -0.83
HLA-B-257ENST00000640094 SLC26A2P50443 739 aa9.89□□□□□ -0.83
HLA-B-257ENST00000640094 APOBRQ0VD83 1088 aa9.89□□□□□ -0.83
HLA-B-257ENST00000640094 ANGPT1Q15389 498 aa9.89□□□□□ -0.83
HLA-B-257ENST00000640094 TMEM87AQ8NBN3 555 aa9.89□□□□□ -0.83
HLA-B-257ENST00000640094 KCNG4Q8TDN1 519 aa9.89□□□□□ -0.83
HLA-B-257ENST00000640094 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
HLA-B-257ENST00000640094 HINFPQ9BQA5 517 aa9.89□□□□□ -0.83
HLA-B-257ENST00000640094 SDF4Q9BRK5 362 aa9.89□□□□□ -0.83
HLA-B-257ENST00000640094 TMEM117Q9H0C3 514 aa9.89□□□□□ -0.83
HLA-B-257ENST00000640094 TMX1Q9H3N1 280 aa9.89□□□□□ -0.83
HLA-B-257ENST00000640094 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
HLA-B-257ENST00000640094 SPG21Q9NZD8 308 aa9.89□□□□□ -0.83
HLA-B-257ENST00000640094 PKD2L1Q9P0L9 805 aa9.89□□□□□ -0.83
HLA-B-257ENST00000640094 SLC9A2Q9UBY0 812 aa9.89□□□□□ -0.83
HLA-B-257ENST00000640094 FBXL21Q9UKT6 434 aa9.89□□□□□ -0.83
HLA-B-257ENST00000640094 GINS2Q9Y248 185 aa9.89□□□□□ -0.83
HLA-B-257ENST00000640094 TELO2Q9Y4R8 837 aa9.89□□□□□ -0.83
HLA-B-257ENST00000640094 MIA3Q5JRA6 1907 aa9.88□□□□□ -0.83
HLA-B-257ENST00000640094 SPDYE4A6NLX3 237 aa9.88□□□□□ -0.83
HLA-B-257ENST00000640094 C9IYK1 514 aa9.88□□□□□ -0.83
HLA-B-257ENST00000640094 CYTH3O43739 400 aa9.88□□□□□ -0.83
HLA-B-257ENST00000640094 EOMESO95936 686 aa9.88□□□□□ -0.83
HLA-B-257ENST00000640094 FGFR1P11362 822 aa9.88□□□□□ -0.83
HLA-B-257ENST00000640094 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP9.88□□□□□ -0.83
HLA-B-257ENST00000640094 WTAPQ15007 396 aa9.88□□□□□ -0.83
HLA-B-257ENST00000640094 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
HLA-B-257ENST00000640094 USP17L6PQ6QN14 398 aa9.88□□□□□ -0.83
HLA-B-257ENST00000640094 MTHFD1LQ6UB35 978 aa9.88□□□□□ -0.83
HLA-B-257ENST00000640094 KCNT2Q6UVM3 1135 aa9.88□□□□□ -0.83
HLA-B-257ENST00000640094 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
HLA-B-257ENST00000640094 CCDC149Q6ZUS6 474 aa9.88□□□□□ -0.83
HLA-B-257ENST00000640094 CATIPQ7Z7H3 387 aa9.88□□□□□ -0.83
HLA-B-257ENST00000640094 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
HLA-B-257ENST00000640094 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa9.88□□□□□ -0.83
HLA-B-257ENST00000640094 RSPH1Q8WYR4 309 aa9.88□□□□□ -0.83
HLA-B-257ENST00000640094 SPZ1Q9BXG8 430 aa9.88□□□□□ -0.83
HLA-B-257ENST00000640094 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
HLA-B-257ENST00000640094 CWH43Q9H720 699 aa9.88□□□□□ -0.83
HLA-B-257ENST00000640094 CYP26B1Q9NR63 512 aa9.88□□□□□ -0.83
HLA-B-257ENST00000640094 HCSTQ9UBK5 93 aa9.88□□□□□ -0.83
HLA-B-257ENST00000640094 DUSP12Q9UNI6 340 aa9.88□□□□□ -0.83
HLA-B-257ENST00000640094 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa9.88□□□□□ -0.83
HLA-B-257ENST00000640094 DMXL1Q9Y485 3027 aa9.88□□□□□ -0.83
HLA-B-257ENST00000640094 NFASCO94856 1347 aa9.87□□□□□ -0.83
HLA-B-257ENST00000640094 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
HLA-B-257ENST00000640094 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
HLA-B-257ENST00000640094 MGEA5O60502 916 aa9.87□□□□□ -0.83
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HLA-B-257ENST00000640094 ITGB5P18084 799 aa9.87□□□□□ -0.83
HLA-B-257ENST00000640094 KIF5BP33176 963 aa9.87□□□□□ -0.83
HLA-B-257ENST00000640094 GIT2Q14161 759 aa9.87□□□□□ -0.83
HLA-B-257ENST00000640094 PLCB4Q15147 1175 aa9.87□□□□□ -0.83
HLA-B-257ENST00000640094 SLC35G1Q2M3R5 365 aa9.87□□□□□ -0.83
HLA-B-257ENST00000640094 ATAT1Q5SQI0 421 aa9.87□□□□□ -0.83
HLA-B-257ENST00000640094 FAM102BQ5T8I3 360 aa9.87□□□□□ -0.83
HLA-B-257ENST00000640094 FAM160B1Q5W0V3 765 aa9.87□□□□□ -0.83
HLA-B-257ENST00000640094 OTOP3Q7RTS5 596 aa9.87□□□□□ -0.83
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