RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635865.1

ATRX-220, Transcript of ATRX, chromatin remodeler, humanhuman

TSL 5

Gene ATRX, Length 100 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRX-220ENST00000635865 KIAA1958Q8N8K9 716 aa2.96□□□□□ -1.94
ATRX-220ENST00000635865 ZNF527Q8NB42 609 aa2.96□□□□□ -1.94
ATRX-220ENST00000635865 NPLOC4Q8TAT6 608 aa2.96□□□□□ -1.94
ATRX-220ENST00000635865 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa2.96□□□□□ -1.94
ATRX-220ENST00000635865 NUDT8Q8WV74 236 aa2.96□□□□□ -1.94
ATRX-220ENST00000635865 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP2.96□□□□□ -1.94
ATRX-220ENST00000635865 TP53INP1Q96A56 240 aa2.96□□□□□ -1.94
ATRX-220ENST00000635865 FERMT2Q96AC1 680 aa2.96□□□□□ -1.94
ATRX-220ENST00000635865 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP2.96□□□□□ -1.94
ATRX-220ENST00000635865 FANCD2OSQ96PS1 177 aa2.96□□□□□ -1.94
ATRX-220ENST00000635865 SERINC2Q96SA4 455 aa2.96□□□□□ -1.94
ATRX-220ENST00000635865 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP2.96□□□□□ -1.94
ATRX-220ENST00000635865 B3GNT5Q9BYG0 378 aa2.96□□□□□ -1.94
ATRX-220ENST00000635865 PRDM14Q9GZV8 571 aa2.96□□□□□ -1.94
ATRX-220ENST00000635865 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP2.96□□□□□ -1.94
ATRX-220ENST00000635865 PCIF1Q9H4Z3 704 aa2.96□□□□□ -1.94
ATRX-220ENST00000635865 IPPKQ9H8X2 491 aa2.96□□□□□ -1.94
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ATRX-220ENST00000635865 GPRC5CQ9NQ84 441 aa2.96□□□□□ -1.94
ATRX-220ENST00000635865 STARD7Q9NQZ5 370 aa2.96□□□□□ -1.94
ATRX-220ENST00000635865 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP2.96□□□□□ -1.94
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ATRX-220ENST00000635865 GFOD1Q9NXC2 390 aa2.96□□□□□ -1.94
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ATRX-220ENST00000635865 GJD2Q9UKL4 321 aa2.96□□□□□ -1.94
ATRX-220ENST00000635865 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa2.96□□□□□ -1.94
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ATRX-220ENST00000635865 CRYL1Q9Y2S2 319 aa2.96□□□□□ -1.94
ATRX-220ENST00000635865 SNX13Q9Y5W8 968 aa2.96□□□□□ -1.94
ATRX-220ENST00000635865 BACE2Q9Y5Z0 518 aa2.96□□□□□ -1.94
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ATRX-220ENST00000635865 RRN3P2A6NIE6 340 aa2.95□□□□□ -1.94
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ATRX-220ENST00000635865 FFAR2O15552 330 aa2.95□□□□□ -1.94
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ATRX-220ENST00000635865 THP07101 528 aa2.95□□□□□ -1.94
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ATRX-220ENST00000635865 MYF5P13349 255 aa2.95□□□□□ -1.94
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ATRX-220ENST00000635865 ENPP1P22413 925 aa2.95□□□□□ -1.94
ATRX-220ENST00000635865 ALAS2P22557 587 aa2.95□□□□□ -1.94
ATRX-220ENST00000635865 CD40P25942 277 aa2.95□□□□□ -1.94
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ATRX-220ENST00000635865 KRT9P35527 623 aa2.95□□□□□ -1.94
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ATRX-220ENST00000635865 ARL4CP56559 192 aa2.95□□□□□ -1.94
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ATRX-220ENST00000635865 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP2.95□□□□□ -1.94
ATRX-220ENST00000635865 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP2.95□□□□□ -1.94
ATRX-220ENST00000635865 TOR2AQ5JU69 321 aa2.95□□□□□ -1.94
ATRX-220ENST00000635865 SPATA1Q5VX52 437 aa2.95□□□□□ -1.94
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ATRX-220ENST00000635865 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP2.95□□□□□ -1.94
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ATRX-220ENST00000635865 FAM26EQ8N5C1 309 aa2.95□□□□□ -1.94
ATRX-220ENST00000635865 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP2.95□□□□□ -1.94
ATRX-220ENST00000635865 PPM1NQ8N819 430 aa2.95□□□□□ -1.94
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ATRX-220ENST00000635865 RNF141Q8WVD5 230 aa2.95□□□□□ -1.94
ATRX-220ENST00000635865 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa2.95□□□□□ -1.94
ATRX-220ENST00000635865 BRI3BPQ8WY22 251 aa2.95□□□□□ -1.94
ATRX-220ENST00000635865 KIAA1191Q96A73 305 aa2.95□□□□□ -1.94
ATRX-220ENST00000635865 COA7Q96BR5 231 aa2.95□□□□□ -1.94
ATRX-220ENST00000635865 ZBTB10Q96DT7 871 aa2.95□□□□□ -1.94
ATRX-220ENST00000635865 APIPQ96GX9 242 aa2.95□□□□□ -1.94
ATRX-220ENST00000635865 TMEM41AQ96HV5 264 aa2.95□□□□□ -1.94
ATRX-220ENST00000635865 SLC2A13Q96QE2 648 aa2.95□□□□□ -1.94
ATRX-220ENST00000635865 CARD10Q9BWT7 1032 aa2.95□□□□□ -1.94
ATRX-220ENST00000635865 LRRC27Q9C0I9 530 aa2.95□□□□□ -1.94
ATRX-220ENST00000635865 BTBD1Q9H0C5 482 aa2.95□□□□□ -1.94
ATRX-220ENST00000635865 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP2.95□□□□□ -1.94
ATRX-220ENST00000635865 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP2.95□□□□□ -1.94
ATRX-220ENST00000635865 PIDD1Q9HB75 910 aa2.95□□□□□ -1.94
ATRX-220ENST00000635865 CYP4F12Q9HCS2 524 aa2.95□□□□□ -1.94
ATRX-220ENST00000635865 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP2.95□□□□□ -1.94
ATRX-220ENST00000635865 DMRT3Q9NQL9 472 aa2.95□□□□□ -1.94
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