RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628306.2

CAPNS1-216, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,389 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-216ENST00000628306 FBXL18Q96ME1 805 aa27.36■■□□□ 1.97
CAPNS1-216ENST00000628306 PLVAPQ9BX97 442 aa27.36■■□□□ 1.97
CAPNS1-216ENST00000628306 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP27.36■■□□□ 1.97
CAPNS1-216ENST00000628306 JAK2O60674 1132 aa27.35■■□□□ 1.97
CAPNS1-216ENST00000628306 NHLH1Q02575 133 aa27.35■■□□□ 1.97
CAPNS1-216ENST00000628306 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP27.35■■□□□ 1.97
CAPNS1-216ENST00000628306 CDHR1Q96JP9 859 aa27.35■■□□□ 1.97
CAPNS1-216ENST00000628306 PSTPIP2Q9H939 334 aa27.35■■□□□ 1.97
CAPNS1-216ENST00000628306 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP27.35■■□□□ 1.97
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CAPNS1-216ENST00000628306 INSRRP14616 1297 aa27.35■■□□□ 1.97
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CAPNS1-216ENST00000628306 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP27.35■■□□□ 1.97
CAPNS1-216ENST00000628306 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa27.35■■□□□ 1.97
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CAPNS1-216ENST00000628306 FANCBQ8NB91 859 aa27.35■■□□□ 1.97
CAPNS1-216ENST00000628306 P2RX5Q93086 422 aa27.35■■□□□ 1.97
CAPNS1-216ENST00000628306 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa27.35■■□□□ 1.97
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CAPNS1-216ENST00000628306 PKD2L1Q9P0L9 805 aa27.35■■□□□ 1.97
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CAPNS1-216ENST00000628306 CSPG5O95196 566 aa27.34■■□□□ 1.97
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CAPNS1-216ENST00000628306 RXRAP19793 462 aa27.34■■□□□ 1.97
CAPNS1-216ENST00000628306 KIF5BP33176 963 aa27.34■■□□□ 1.97
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CAPNS1-216ENST00000628306 GLG1Q92896 1179 aa27.34■■□□□ 1.97
CAPNS1-216ENST00000628306 LZTS2Q9BRK4 669 aa27.34■■□□□ 1.97
CAPNS1-216ENST00000628306 CLEC1BQ9P126 229 aa27.34■■□□□ 1.97
CAPNS1-216ENST00000628306 SQORQ9Y6N5 450 aa27.34■■□□□ 1.97
CAPNS1-216ENST00000628306 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa27.33■■□□□ 1.97
CAPNS1-216ENST00000628306 F13A1P00488 732 aa27.33■■□□□ 1.97
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CAPNS1-216ENST00000628306 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP27.33■■□□□ 1.97
CAPNS1-216ENST00000628306 TMX1Q9H3N1 280 aa27.33■■□□□ 1.97
CAPNS1-216ENST00000628306 IGFLR1Q9H665 355 aa27.33■■□□□ 1.97
CAPNS1-216ENST00000628306 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP27.33■■□□□ 1.97
CAPNS1-216ENST00000628306 USP34Q70CQ2 3546 aa27.32■■□□□ 1.96
CAPNS1-216ENST00000628306 EYA4O95677 639 aa27.32■■□□□ 1.96
CAPNS1-216ENST00000628306 FDPSP14324 419 aaKnown RBP27.32■■□□□ 1.96
CAPNS1-216ENST00000628306 ADD1P35611 737 aaKnown RBP27.32■■□□□ 1.96
CAPNS1-216ENST00000628306 MRE11P49959 708 aa27.32■■□□□ 1.96
CAPNS1-216ENST00000628306 RNF135Q8IUD6 432 aa27.32■■□□□ 1.96
CAPNS1-216ENST00000628306 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa27.32■■□□□ 1.96
CAPNS1-216ENST00000628306 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP27.32■■□□□ 1.96
CAPNS1-216ENST00000628306 KCNH6Q9H252 994 aa27.32■■□□□ 1.96
CAPNS1-216ENST00000628306 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP27.32■■□□□ 1.96
CAPNS1-216ENST00000628306 CD207Q9UJ71 328 aa27.32■■□□□ 1.96
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CAPNS1-216ENST00000628306 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa27.32■■□□□ 1.96
CAPNS1-216ENST00000628306 STK36Q9NRP7 1315 aa27.31■■□□□ 1.96
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CAPNS1-216ENST00000628306 CYP2W1Q8TAV3 490 aa27.31■■□□□ 1.96
CAPNS1-216ENST00000628306 PADI3Q9ULW8 664 aa27.31■■□□□ 1.96
CAPNS1-216ENST00000628306 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa27.3■■□□□ 1.96
CAPNS1-216ENST00000628306 RRN3P2A6NIE6 340 aa27.3■■□□□ 1.96
CAPNS1-216ENST00000628306 MAFGO15525 162 aa27.3■■□□□ 1.96
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CAPNS1-216ENST00000628306 TMEM62Q0P6H9 643 aa27.3■■□□□ 1.96
CAPNS1-216ENST00000628306 PLCB4Q15147 1175 aa27.3■■□□□ 1.96
CAPNS1-216ENST00000628306 KLHL23Q8NBE8 558 aa27.3■■□□□ 1.96
CAPNS1-216ENST00000628306 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP27.3■■□□□ 1.96
CAPNS1-216ENST00000628306 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP27.3■■□□□ 1.96
CAPNS1-216ENST00000628306 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa27.3■■□□□ 1.96
CAPNS1-216ENST00000628306 TRPV2Q9Y5S1 764 aa27.3■■□□□ 1.96
CAPNS1-216ENST00000628306 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa27.29■■□□□ 1.96
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CAPNS1-216ENST00000628306 NAALADL2Q58DX5 795 aa27.29■■□□□ 1.96
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CAPNS1-216ENST00000628306 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa27.29■■□□□ 1.96
CAPNS1-216ENST00000628306 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa27.29■■□□□ 1.96
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CAPNS1-216ENST00000628306 TYW1BQ6NUM6 668 aa27.28■■□□□ 1.96
CAPNS1-216ENST00000628306 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa27.28■■□□□ 1.96
CAPNS1-216ENST00000628306 EFHBQ8N7U6 833 aa27.28■■□□□ 1.96
CAPNS1-216ENST00000628306 SMRP1Q8NCR6 262 aa27.28■■□□□ 1.96
CAPNS1-216ENST00000628306 FTHL17Q9BXU8 183 aa27.28■■□□□ 1.96
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC9A2Q9UBY0 812 aa27.28■■□□□ 1.96
CAPNS1-216ENST00000628306 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP27.27■■□□□ 1.96
CAPNS1-216ENST00000628306 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP27.27■■□□□ 1.96
CAPNS1-216ENST00000628306 NBR1Q14596 966 aa27.27■■□□□ 1.96
CAPNS1-216ENST00000628306 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP27.27■■□□□ 1.96
CAPNS1-216ENST00000628306 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP27.27■■□□□ 1.96
CAPNS1-216ENST00000628306 TMTC3Q6ZXV5 915 aa27.27■■□□□ 1.96
CAPNS1-216ENST00000628306 MXRA8Q9BRK3 442 aa27.27■■□□□ 1.96
CAPNS1-216ENST00000628306 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP27.27■■□□□ 1.96
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