RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613122.4

CTDP1-208, Transcript of CTD phosphatase subunit 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDP1, Length 5,866 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDP1-208ENST00000613122 ATP1A2P50993 1020 aa21.73■■□□□ 1.07
CTDP1-208ENST00000613122 DBN1Q16643 649 aa21.73■■□□□ 1.07
CTDP1-208ENST00000613122 PBKQ96KB5 322 aa21.73■■□□□ 1.07
CTDP1-208ENST00000613122 ZNRF3Q9ULT6 936 aa21.73■■□□□ 1.07
CTDP1-208ENST00000613122 GDAQ9Y2T3 454 aa21.73■■□□□ 1.07
CTDP1-208ENST00000613122 STK36Q9NRP7 1315 aa21.72■■□□□ 1.07
CTDP1-208ENST00000613122 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP21.72■■□□□ 1.07
CTDP1-208ENST00000613122 ZNF699Q32M78 642 aa21.72■■□□□ 1.07
CTDP1-208ENST00000613122 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP21.72■■□□□ 1.07
CTDP1-208ENST00000613122 CYB5R4Q7L1T6 521 aa21.72■■□□□ 1.07
CTDP1-208ENST00000613122 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP21.72■■□□□ 1.07
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CTDP1-208ENST00000613122 GABBR1Q9UBS5 961 aa21.72■■□□□ 1.07
CTDP1-208ENST00000613122 CDC23Q9UJX2 597 aa21.72■■□□□ 1.07
CTDP1-208ENST00000613122 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa21.72■■□□□ 1.07
CTDP1-208ENST00000613122 KRT33BQ14525 404 aa21.72■■□□□ 1.07
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CTDP1-208ENST00000613122 SLC16A4O15374 487 aa21.71■■□□□ 1.07
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CTDP1-208ENST00000613122 A0A0G2JLW4 131 aa21.7■■□□□ 1.06
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CTDP1-208ENST00000613122 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa21.7■■□□□ 1.06
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CTDP1-208ENST00000613122 ALKQ9UM73 1620 aa21.68■■□□□ 1.06
CTDP1-208ENST00000613122 A0A087WWV3 80 aa21.68■■□□□ 1.06
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CTDP1-208ENST00000613122 MTA3Q9BTC8 594 aa21.68■■□□□ 1.06
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CTDP1-208ENST00000613122 RNF14Q9UBS8 474 aa21.68■■□□□ 1.06
CTDP1-208ENST00000613122 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP21.68■■□□□ 1.06
CTDP1-208ENST00000613122 NR3C1P04150 777 aa21.68■■□□□ 1.06
CTDP1-208ENST00000613122 TMEM35BQ8NCS4 154 aa21.68■■□□□ 1.06
CTDP1-208ENST00000613122 DNAJC12Q9UKB3 198 aa21.68■■□□□ 1.06
CTDP1-208ENST00000613122 RHOT2Q8IXI1 618 aa21.68■■□□□ 1.06
CTDP1-208ENST00000613122 MB21D1Q8N884 522 aa21.68■■□□□ 1.06
CTDP1-208ENST00000613122 SPTLC3Q9NUV7 552 aa21.68■■□□□ 1.06
CTDP1-208ENST00000613122 TMED2Q15363 201 aa21.67■■□□□ 1.06
CTDP1-208ENST00000613122 CCDC38Q502W7 563 aa21.67■■□□□ 1.06
CTDP1-208ENST00000613122 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa21.67■■□□□ 1.06
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