RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580784.5

CSNK1D-215, Transcript of casein kinase 1 delta, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CSNK1D, Length 1,081 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1D-215ENST00000580784 TMEM266Q2M3C6 531 aa24.08■■□□□ 1.45
CSNK1D-215ENST00000580784 FIBCD1Q8N539 461 aa24.08■■□□□ 1.45
CSNK1D-215ENST00000580784 DAGLBQ8NCG7 672 aa24.08■■□□□ 1.45
CSNK1D-215ENST00000580784 IL27Q8NEV9 243 aa24.08■■□□□ 1.45
CSNK1D-215ENST00000580784 SLC5A5Q92911 643 aa24.08■■□□□ 1.45
CSNK1D-215ENST00000580784 HLA-CQ95604 372 aa24.08■■□□□ 1.45
CSNK1D-215ENST00000580784 RIT2Q99578 217 aa24.08■■□□□ 1.45
CSNK1D-215ENST00000580784 C22orf23Q9BZE7 217 aa24.08■■□□□ 1.45
CSNK1D-215ENST00000580784 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.45
CSNK1D-215ENST00000580784 DISC1Q9NRI5 854 aa24.08■■□□□ 1.45
CSNK1D-215ENST00000580784 KCNJ14Q9UNX9 436 aa24.08■■□□□ 1.45
CSNK1D-215ENST00000580784 COG5Q9UP83 839 aa24.08■■□□□ 1.45
CSNK1D-215ENST00000580784 GINS2Q9Y248 185 aa24.08■■□□□ 1.45
CSNK1D-215ENST00000580784 WDR64B1ANS9 1081 aa24.07■■□□□ 1.44
CSNK1D-215ENST00000580784 TDP2O95551 362 aa24.07■■□□□ 1.44
CSNK1D-215ENST00000580784 C22orf31O95567 290 aa24.07■■□□□ 1.44
CSNK1D-215ENST00000580784 ANAPC15P60006 121 aa24.07■■□□□ 1.44
CSNK1D-215ENST00000580784 PAK2Q13177 524 aa24.07■■□□□ 1.44
CSNK1D-215ENST00000580784 AAK1Q2M2I8 961 aa24.07■■□□□ 1.44
CSNK1D-215ENST00000580784 FTHL17Q9BXU8 183 aa24.07■■□□□ 1.44
CSNK1D-215ENST00000580784 H3BNC9 293 aa24.06■■□□□ 1.44
CSNK1D-215ENST00000580784 CHMP2AO43633 222 aa24.06■■□□□ 1.44
CSNK1D-215ENST00000580784 PFKFB2O60825 505 aa24.06■■□□□ 1.44
CSNK1D-215ENST00000580784 GAS7O60861 476 aa24.06■■□□□ 1.44
CSNK1D-215ENST00000580784 GPM6BQ13491 265 aa24.06■■□□□ 1.44
CSNK1D-215ENST00000580784 Q4G0T1 1027 aa24.06■■□□□ 1.44
CSNK1D-215ENST00000580784 LRCH2Q5VUJ6 765 aa24.06■■□□□ 1.44
CSNK1D-215ENST00000580784 GALNT17Q6IS24 598 aa24.06■■□□□ 1.44
CSNK1D-215ENST00000580784 CRIPAKQ8N1N5 446 aa24.06■■□□□ 1.44
CSNK1D-215ENST00000580784 TEKT3Q9BXF9 490 aa24.06■■□□□ 1.44
CSNK1D-215ENST00000580784 TMX1Q9H3N1 280 aa24.06■■□□□ 1.44
CSNK1D-215ENST00000580784 UNC45AQ9H3U1 944 aa24.06■■□□□ 1.44
CSNK1D-215ENST00000580784 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
CSNK1D-215ENST00000580784 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
CSNK1D-215ENST00000580784 MYO7AQ13402 2215 aa24.06■■□□□ 1.44
CSNK1D-215ENST00000580784 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa24.05■■□□□ 1.44
CSNK1D-215ENST00000580784 ZNF862O60290 1169 aa24.05■■□□□ 1.44
CSNK1D-215ENST00000580784 DGKIO75912 1065 aa24.05■■□□□ 1.44
CSNK1D-215ENST00000580784 CDKL5O76039 1030 aa24.05■■□□□ 1.44
CSNK1D-215ENST00000580784 CYP3A7P24462 503 aa24.05■■□□□ 1.44
CSNK1D-215ENST00000580784 AK2P54819 239 aa24.05■■□□□ 1.44
CSNK1D-215ENST00000580784 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
CSNK1D-215ENST00000580784 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP24.05■■□□□ 1.44
CSNK1D-215ENST00000580784 METTL13Q8N6R0 699 aa24.05■■□□□ 1.44
CSNK1D-215ENST00000580784 TMEM40Q8WWA1 233 aa24.05■■□□□ 1.44
CSNK1D-215ENST00000580784 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP24.05■■□□□ 1.44
CSNK1D-215ENST00000580784 PPP1R16BQ96T49 567 aa24.05■■□□□ 1.44
CSNK1D-215ENST00000580784 BDP1A6H8Y1 2624 aa24.05■■□□□ 1.44
CSNK1D-215ENST00000580784 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa24.05■■□□□ 1.44
CSNK1D-215ENST00000580784 TNFRSF10AO00220 468 aa24.04■■□□□ 1.44
CSNK1D-215ENST00000580784 PSMD10O75832 226 aa24.04■■□□□ 1.44
CSNK1D-215ENST00000580784 LINC00271P0C7V0 271 aa24.04■■□□□ 1.44
CSNK1D-215ENST00000580784 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP24.04■■□□□ 1.449e-7■■■■□ 23.1
CSNK1D-215ENST00000580784 UGCGQ16739 394 aa24.04■■□□□ 1.44
CSNK1D-215ENST00000580784 KIZQ2M2Z5 673 aa24.04■■□□□ 1.44
CSNK1D-215ENST00000580784 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
CSNK1D-215ENST00000580784 FAM167AQ96KS9 214 aa24.04■■□□□ 1.44
CSNK1D-215ENST00000580784 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP24.04■■□□□ 1.44
CSNK1D-215ENST00000580784 PHF20Q9BVI0 1012 aa24.04■■□□□ 1.44
CSNK1D-215ENST00000580784 GJB4Q9NTQ9 266 aa24.04■■□□□ 1.44
CSNK1D-215ENST00000580784 RPS6KA5O75582 802 aa24.03■■□□□ 1.44
CSNK1D-215ENST00000580784 CTDNEP1O95476 244 aa24.03■■□□□ 1.44
CSNK1D-215ENST00000580784 VTNP04004 478 aa24.03■■□□□ 1.44
CSNK1D-215ENST00000580784 SFNP31947 248 aa24.03■■□□□ 1.44
CSNK1D-215ENST00000580784 CTNNB1P35222 781 aa24.03■■□□□ 1.44
CSNK1D-215ENST00000580784 BMPR1AP36894 532 aa24.03■■□□□ 1.44
CSNK1D-215ENST00000580784 JAK3P52333 1124 aa24.03■■□□□ 1.44
CSNK1D-215ENST00000580784 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP24.03■■□□□ 1.44
CSNK1D-215ENST00000580784 INF2Q27J81 1249 aa24.03■■□□□ 1.44
CSNK1D-215ENST00000580784 MBOAT7Q96N66 472 aa24.03■■□□□ 1.44
CSNK1D-215ENST00000580784 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP24.03■■□□□ 1.44
CSNK1D-215ENST00000580784 ERVK-5Q9HDB9 667 aa24.03■■□□□ 1.44
CSNK1D-215ENST00000580784 NRBP2Q9NSY0 501 aa24.03■■□□□ 1.44
CSNK1D-215ENST00000580784 CEP131Q9UPN4 1083 aa24.03■■□□□ 1.44
CSNK1D-215ENST00000580784 MAGEB2O15479 319 aa24.02■■□□□ 1.44
CSNK1D-215ENST00000580784 OATP04181 439 aa24.02■■□□□ 1.44
CSNK1D-215ENST00000580784 PRKCEQ02156 737 aa24.02■■□□□ 1.44
CSNK1D-215ENST00000580784 ANKRD1Q15327 319 aa24.02■■□□□ 1.44
CSNK1D-215ENST00000580784 PTPROQ16827 1216 aa24.02■■□□□ 1.44
CSNK1D-215ENST00000580784 EFCAB12Q6NXP0 572 aa24.02■■□□□ 1.44
CSNK1D-215ENST00000580784 KRT25Q7Z3Z0 450 aa24.02■■□□□ 1.44
CSNK1D-215ENST00000580784 NPAS4Q8IUM7 802 aa24.02■■□□□ 1.44
CSNK1D-215ENST00000580784 OSMRQ99650 979 aa24.02■■□□□ 1.44
CSNK1D-215ENST00000580784 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa24.02■■□□□ 1.44
CSNK1D-215ENST00000580784 STK36Q9NRP7 1315 aa24.02■■□□□ 1.44
CSNK1D-215ENST00000580784 C5orf67F2Z3F1 127 aa24.01■■□□□ 1.43
CSNK1D-215ENST00000580784 MGEA5O60502 916 aa24.01■■□□□ 1.43
CSNK1D-215ENST00000580784 GPR32O75388 356 aa24.01■■□□□ 1.43
CSNK1D-215ENST00000580784 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP24.01■■□□□ 1.43
CSNK1D-215ENST00000580784 CLCN3P51790 818 aa24.01■■□□□ 1.43
CSNK1D-215ENST00000580784 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP24.01■■□□□ 1.43
CSNK1D-215ENST00000580784 MOXD1Q6UVY6 613 aa24.01■■□□□ 1.43
CSNK1D-215ENST00000580784 B3GNT9Q6UX72 402 aa24.01■■□□□ 1.43
CSNK1D-215ENST00000580784 MIER3Q7Z3K6 550 aa24.01■■□□□ 1.43
CSNK1D-215ENST00000580784 LRRC71Q8N4P6 559 aa24.01■■□□□ 1.43
CSNK1D-215ENST00000580784 NECAB1Q8N987 351 aa24.01■■□□□ 1.43
CSNK1D-215ENST00000580784 ETNPPLQ8TBG4 499 aa24.01■■□□□ 1.43
CSNK1D-215ENST00000580784 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP24.01■■□□□ 1.43
CSNK1D-215ENST00000580784 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP24.01■■□□□ 1.43
CSNK1D-215ENST00000580784 GPR182O15218 404 aa24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 102.6 ms