RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580170.5

PTPRM-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 5,941 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-211ENST00000580170 BAG6P46379 1132 aa22.91■■□□□ 1.26
PTPRM-211ENST00000580170 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa22.91■■□□□ 1.26
PTPRM-211ENST00000580170 TTLL11Q8NHH1 800 aa22.91■■□□□ 1.26
PTPRM-211ENST00000580170 NUDCD1Q96RS6 583 aa22.91■■□□□ 1.26
PTPRM-211ENST00000580170 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP22.91■■□□□ 1.26
PTPRM-211ENST00000580170 CEP170Q5SW79 1584 aa22.91■■□□□ 1.26
PTPRM-211ENST00000580170 ERICH1Q86X53 443 aa22.9■■□□□ 1.26
PTPRM-211ENST00000580170 SNX24Q9Y343 169 aa22.9■■□□□ 1.26
PTPRM-211ENST00000580170 PSMA2P25787 234 aa22.9■■□□□ 1.26
PTPRM-211ENST00000580170 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa22.9■■□□□ 1.26
PTPRM-211ENST00000580170 CCDC138Q96M89 665 aa22.9■■□□□ 1.26
PTPRM-211ENST00000580170 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
PTPRM-211ENST00000580170 SUSD4Q5VX71 490 aa22.9■■□□□ 1.26
PTPRM-211ENST00000580170 FAM196AQ6ZSG2 479 aa22.9■■□□□ 1.26
PTPRM-211ENST00000580170 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
PTPRM-211ENST00000580170 CHMP6Q96FZ7 201 aa22.9■■□□□ 1.26
PTPRM-211ENST00000580170 SURF1Q15526 300 aa22.9■■□□□ 1.26
PTPRM-211ENST00000580170 Q3C1V9 767 aa22.9■■□□□ 1.26
PTPRM-211ENST00000580170 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
PTPRM-211ENST00000580170 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
PTPRM-211ENST00000580170 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
PTPRM-211ENST00000580170 RANBP1P43487 201 aa22.9■■□□□ 1.26
PTPRM-211ENST00000580170 PEX3P56589 373 aa22.9■■□□□ 1.26
PTPRM-211ENST00000580170 FAF2Q96CS3 445 aa22.9■■□□□ 1.26
PTPRM-211ENST00000580170 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
PTPRM-211ENST00000580170 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.26
PTPRM-211ENST00000580170 TJP3O95049 919 aa22.89■■□□□ 1.26
PTPRM-211ENST00000580170 PRCPP42785 496 aa22.89■■□□□ 1.26
PTPRM-211ENST00000580170 CCNA1P78396 465 aa22.89■■□□□ 1.26
PTPRM-211ENST00000580170 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.26
PTPRM-211ENST00000580170 CDO1Q16878 200 aa22.89■■□□□ 1.26
PTPRM-211ENST00000580170 DGKHQ86XP1 1220 aa22.89■■□□□ 1.26
PTPRM-211ENST00000580170 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.26
PTPRM-211ENST00000580170 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.26
PTPRM-211ENST00000580170 PITPNM3Q9BZ71 974 aa22.89■■□□□ 1.26
PTPRM-211ENST00000580170 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.26
PTPRM-211ENST00000580170 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa22.89■■□□□ 1.26
PTPRM-211ENST00000580170 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.26
PTPRM-211ENST00000580170 NVLO15381 856 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.26
PTPRM-211ENST00000580170 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.26
PTPRM-211ENST00000580170 DPY19L2Q6NUT2 758 aa22.89■■□□□ 1.26
PTPRM-211ENST00000580170 PIGOQ8TEQ8 1089 aa22.89■■□□□ 1.26
PTPRM-211ENST00000580170 TRAIPQ9BWF2 469 aa22.89■■□□□ 1.26
PTPRM-211ENST00000580170 KIF22Q14807 665 aa22.89■■□□□ 1.25
PTPRM-211ENST00000580170 RAD54LQ92698 747 aa22.89■■□□□ 1.25
PTPRM-211ENST00000580170 SERPINI1Q99574 410 aa22.89■■□□□ 1.25
PTPRM-211ENST00000580170 FAM160B2Q86V87 743 aa22.89■■□□□ 1.25
PTPRM-211ENST00000580170 OXER1Q8TDS5 423 aa22.89■■□□□ 1.25
PTPRM-211ENST00000580170 KIF1BO60333 1816 aa22.88■■□□□ 1.25
PTPRM-211ENST00000580170 POTEMA6NI47 508 aa22.88■■□□□ 1.25
PTPRM-211ENST00000580170 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
PTPRM-211ENST00000580170 EEPD1Q7L9B9 569 aa22.88■■□□□ 1.25
PTPRM-211ENST00000580170 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa22.88■■□□□ 1.25
PTPRM-211ENST00000580170 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa22.88■■□□□ 1.25
PTPRM-211ENST00000580170 KCNQ4P56696 695 aa22.88■■□□□ 1.25
PTPRM-211ENST00000580170 MIGA2Q7L4E1 593 aa22.88■■□□□ 1.25
PTPRM-211ENST00000580170 DCTN3O75935 186 aa22.88■■□□□ 1.25
PTPRM-211ENST00000580170 CYP2D6P10635 497 aa22.88■■□□□ 1.25
PTPRM-211ENST00000580170 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
PTPRM-211ENST00000580170 PDXDC2PQ6P474 469 aa22.88■■□□□ 1.25
PTPRM-211ENST00000580170 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
PTPRM-211ENST00000580170 TADA3O75528 432 aa22.88■■□□□ 1.25
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF18P17022 549 aa22.88■■□□□ 1.25
PTPRM-211ENST00000580170 CCDC144BQ3MJ40 725 aa22.88■■□□□ 1.25
PTPRM-211ENST00000580170 GRAMD4Q6IC98 578 aa22.88■■□□□ 1.25
PTPRM-211ENST00000580170 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
PTPRM-211ENST00000580170 MID2Q9UJV3 735 aa22.88■■□□□ 1.25
PTPRM-211ENST00000580170 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
PTPRM-211ENST00000580170 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
PTPRM-211ENST00000580170 ROBO2Q9HCK4 1378 aa22.88■■□□□ 1.25
PTPRM-211ENST00000580170 USP17L5A8MUK1 530 aa22.87■■□□□ 1.25
PTPRM-211ENST00000580170 SPARCL1Q14515 664 aa22.87■■□□□ 1.25
PTPRM-211ENST00000580170 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
PTPRM-211ENST00000580170 TRIML2Q8N7C3 387 aa22.87■■□□□ 1.25
PTPRM-211ENST00000580170 ANAPC7Q9UJX3 599 aa22.87■■□□□ 1.25
PTPRM-211ENST00000580170 UBN2Q6ZU65 1347 aa22.87■■□□□ 1.25
PTPRM-211ENST00000580170 A0A0G2JND7 137 aa22.87■■□□□ 1.25
PTPRM-211ENST00000580170 ATICP31939 592 aa22.87■■□□□ 1.25
PTPRM-211ENST00000580170 NBPF9Q3BBW0 867 aa22.87■■□□□ 1.25
PTPRM-211ENST00000580170 SFR1Q86XK3 245 aa22.87■■□□□ 1.25
PTPRM-211ENST00000580170 ABI1Q8IZP0 508 aa22.87■■□□□ 1.25
PTPRM-211ENST00000580170 AP3B2Q13367 1082 aa22.87■■□□□ 1.25
PTPRM-211ENST00000580170 AP5M1Q9H0R1 490 aa22.87■■□□□ 1.25
PTPRM-211ENST00000580170 KIF9Q9HAQ2 790 aa22.87■■□□□ 1.25
PTPRM-211ENST00000580170 UBN1Q9NPG3 1134 aa22.87■■□□□ 1.25
PTPRM-211ENST00000580170 PCDHA6Q9UN73 950 aa22.87■■□□□ 1.25
PTPRM-211ENST00000580170 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa22.87■■□□□ 1.25
PTPRM-211ENST00000580170 XPAP23025 273 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
PTPRM-211ENST00000580170 SLFN12LQ6IEE8 588 aa22.87■■□□□ 1.25
PTPRM-211ENST00000580170 CRLF3Q8IUI8 442 aa22.87■■□□□ 1.25
PTPRM-211ENST00000580170 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
PTPRM-211ENST00000580170 TTC17Q96AE7 1141 aa22.87■■□□□ 1.25
PTPRM-211ENST00000580170 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
PTPRM-211ENST00000580170 ANO9A1A5B4 782 aa22.86■■□□□ 1.25
PTPRM-211ENST00000580170 GRAPQ13588 217 aa22.86■■□□□ 1.25
PTPRM-211ENST00000580170 PROM2Q8N271 834 aa22.86■■□□□ 1.25
PTPRM-211ENST00000580170 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
PTPRM-211ENST00000580170 ERBB3P21860 1342 aa22.86■■□□□ 1.25
PTPRM-211ENST00000580170 USP27XA6NNY8 438 aa22.86■■□□□ 1.25
PTPRM-211ENST00000580170 NR3C1P04150 777 aa22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.4 ms