RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578916.2

PTPRM-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 604 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-210ENST00000578916 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP10.46□□□□□ -0.73
PTPRM-210ENST00000578916 C1orf112Q9NSG2 853 aa10.46□□□□□ -0.73
PTPRM-210ENST00000578916 GINS2Q9Y248 185 aa10.46□□□□□ -0.73
PTPRM-210ENST00000578916 LZTS1Q9Y250 596 aa10.46□□□□□ -0.73
PTPRM-210ENST00000578916 CACNA1HO95180 2353 aa10.46□□□□□ -0.74
PTPRM-210ENST00000578916 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP10.45□□□□□ -0.74
PTPRM-210ENST00000578916 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa10.45□□□□□ -0.74
PTPRM-210ENST00000578916 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa10.45□□□□□ -0.74
PTPRM-210ENST00000578916 HIDE1A8MVS5 230 aa10.45□□□□□ -0.74
PTPRM-210ENST00000578916 C2CD4DB7Z1M9 353 aa10.45□□□□□ -0.74
PTPRM-210ENST00000578916 PIK3CDO00329 1044 aa10.45□□□□□ -0.74
PTPRM-210ENST00000578916 MEIS2O14770 477 aa10.45□□□□□ -0.74
PTPRM-210ENST00000578916 MGEA5O60502 916 aa10.45□□□□□ -0.74
PTPRM-210ENST00000578916 RPS6KA5O75582 802 aa10.45□□□□□ -0.74
PTPRM-210ENST00000578916 ITGB5P18084 799 aa10.45□□□□□ -0.74
PTPRM-210ENST00000578916 CLCN5P51795 746 aa10.45□□□□□ -0.74
PTPRM-210ENST00000578916 PLCB3Q01970 1234 aa10.45□□□□□ -0.74
PTPRM-210ENST00000578916 SLC24A5Q71RS6 500 aa10.45□□□□□ -0.74
PTPRM-210ENST00000578916 TMC7Q7Z402 723 aa10.45□□□□□ -0.74
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PTPRM-210ENST00000578916 ADAM7Q9H2U9 754 aa10.45□□□□□ -0.74
PTPRM-210ENST00000578916 POMKQ9H5K3 350 aa10.45□□□□□ -0.74
PTPRM-210ENST00000578916 CWH43Q9H720 699 aa10.45□□□□□ -0.74
PTPRM-210ENST00000578916 ERVK-5Q9HDB9 667 aa10.45□□□□□ -0.74
PTPRM-210ENST00000578916 RGS18Q9NS28 235 aa10.45□□□□□ -0.74
PTPRM-210ENST00000578916 HCSTQ9UBK5 93 aa10.45□□□□□ -0.74
PTPRM-210ENST00000578916 PLXNA3P51805 1871 aa10.44□□□□□ -0.74
PTPRM-210ENST00000578916 C9IYK1 514 aa10.44□□□□□ -0.74
PTPRM-210ENST00000578916 GPR182O15218 404 aa10.44□□□□□ -0.74
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PTPRM-210ENST00000578916 MTHFRP42898 656 aa10.44□□□□□ -0.74
PTPRM-210ENST00000578916 KRT17Q04695 432 aa10.44□□□□□ -0.74
PTPRM-210ENST00000578916 ITIH3Q06033 890 aa10.44□□□□□ -0.74
PTPRM-210ENST00000578916 TROAPQ12815 778 aa10.44□□□□□ -0.74
PTPRM-210ENST00000578916 WTAPQ15007 396 aa10.44□□□□□ -0.74
PTPRM-210ENST00000578916 SART3Q15020 963 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
PTPRM-210ENST00000578916 PLCB4Q15147 1175 aa10.44□□□□□ -0.74
PTPRM-210ENST00000578916 MTHFD1LQ6UB35 978 aa10.44□□□□□ -0.74
PTPRM-210ENST00000578916 CATIPQ7Z7H3 387 aa10.44□□□□□ -0.74
PTPRM-210ENST00000578916 SMOC2Q9H3U7 446 aa10.44□□□□□ -0.74
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PTPRM-210ENST00000578916 SENP2Q9HC62 589 aa10.44□□□□□ -0.74
PTPRM-210ENST00000578916 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP10.44□□□□□ -0.74
PTPRM-210ENST00000578916 JADE2Q9NQC1 790 aa10.44□□□□□ -0.74
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PTPRM-210ENST00000578916 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
PTPRM-210ENST00000578916 CDH22Q9UJ99 828 aa10.44□□□□□ -0.74
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PTPRM-210ENST00000578916 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa10.44□□□□□ -0.74
PTPRM-210ENST00000578916 KIAA1671Q9BY89 1806 aa10.43□□□□□ -0.74
PTPRM-210ENST00000578916 ASGR2P07307 311 aa10.43□□□□□ -0.74
PTPRM-210ENST00000578916 FGFR1P11362 822 aa10.43□□□□□ -0.74
PTPRM-210ENST00000578916 KLRC1P26715 233 aa10.43□□□□□ -0.74
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PTPRM-210ENST00000578916 CA8P35219 290 aa10.43□□□□□ -0.74
PTPRM-210ENST00000578916 PPM1AP35813 382 aa10.43□□□□□ -0.74
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PTPRM-210ENST00000578916 KCNT2Q6UVM3 1135 aa10.43□□□□□ -0.74
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PTPRM-210ENST00000578916 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa10.43□□□□□ -0.74
PTPRM-210ENST00000578916 PLCD3Q8N3E9 789 aa10.43□□□□□ -0.74
PTPRM-210ENST00000578916 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
PTPRM-210ENST00000578916 FLCNQ8NFG4 579 aa10.43□□□□□ -0.74
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PTPRM-210ENST00000578916 SPZ1Q9BXG8 430 aa10.43□□□□□ -0.74
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PTPRM-210ENST00000578916 TMEM161AQ9NX61 479 aa10.43□□□□□ -0.74
PTPRM-210ENST00000578916 LIMD1Q9UGP4 676 aa10.43□□□□□ -0.74
PTPRM-210ENST00000578916 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa10.43□□□□□ -0.74
PTPRM-210ENST00000578916 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa10.43□□□□□ -0.74
PTPRM-210ENST00000578916 SPTBN4Q9H254 2564 aa10.43□□□□□ -0.74
PTPRM-210ENST00000578916 DOCK5Q9H7D0 1870 aa10.42□□□□□ -0.74
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PTPRM-210ENST00000578916 KAT6AQ92794 2004 aa10.42□□□□□ -0.74
PTPRM-210ENST00000578916 SPDYE3A6NKU9 549 aa10.42□□□□□ -0.74
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PTPRM-210ENST00000578916 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP10.42□□□□□ -0.74
PTPRM-210ENST00000578916 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa10.42□□□□□ -0.74
PTPRM-210ENST00000578916 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP10.42□□□□□ -0.74
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PTPRM-210ENST00000578916 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP10.42□□□□□ -0.74
PTPRM-210ENST00000578916 TMEM87AQ8NBN3 555 aa10.42□□□□□ -0.74
PTPRM-210ENST00000578916 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP10.42□□□□□ -0.74
PTPRM-210ENST00000578916 KCNG4Q8TDN1 519 aa10.42□□□□□ -0.74
PTPRM-210ENST00000578916 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP10.42□□□□□ -0.74
PTPRM-210ENST00000578916 CDHR5Q9HBB8 845 aa10.42□□□□□ -0.74
PTPRM-210ENST00000578916 SPG21Q9NZD8 308 aa10.42□□□□□ -0.74
PTPRM-210ENST00000578916 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP10.42□□□□□ -0.74
PTPRM-210ENST00000578916 HBP1O60381 514 aa10.41□□□□□ -0.74
PTPRM-210ENST00000578916 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP10.41□□□□□ -0.74
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