RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568443.2

CLN3-232, Transcript of CLN3, battenin, humanhuman

TSL 3

Gene CLN3, Length 969 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3-232ENST00000568443 SCRN1Q12765 414 aa25.4■■□□□ 1.66
CLN3-232ENST00000568443 GPM6BQ13491 265 aa25.4■■□□□ 1.66
CLN3-232ENST00000568443 PTPROQ16827 1216 aa25.4■■□□□ 1.66
CLN3-232ENST00000568443 LRCH2Q5VUJ6 765 aa25.4■■□□□ 1.66
CLN3-232ENST00000568443 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP25.4■■□□□ 1.66
CLN3-232ENST00000568443 METTL13Q8N6R0 699 aa25.4■■□□□ 1.66
CLN3-232ENST00000568443 SLC5A5Q92911 643 aa25.4■■□□□ 1.66
CLN3-232ENST00000568443 FAM167AQ96KS9 214 aa25.4■■□□□ 1.66
CLN3-232ENST00000568443 TEKT3Q9BXF9 490 aa25.4■■□□□ 1.66
CLN3-232ENST00000568443 CEP131Q9UPN4 1083 aa25.4■■□□□ 1.66
CLN3-232ENST00000568443 H3BNC9 293 aa25.39■■□□□ 1.66
CLN3-232ENST00000568443 TNFRSF10AO00220 468 aa25.39■■□□□ 1.66
CLN3-232ENST00000568443 BMP1P13497 986 aa25.39■■□□□ 1.66
CLN3-232ENST00000568443 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.66
CLN3-232ENST00000568443 ANKRD1Q15327 319 aa25.39■■□□□ 1.66
CLN3-232ENST00000568443 Q4G0T1 1027 aa25.39■■□□□ 1.66
CLN3-232ENST00000568443 NRBP2Q9NSY0 501 aa25.39■■□□□ 1.66
CLN3-232ENST00000568443 TPCN1Q9ULQ1 816 aa25.39■■□□□ 1.66
CLN3-232ENST00000568443 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa25.38■■□□□ 1.65
CLN3-232ENST00000568443 M0R2N6 131 aa25.38■■□□□ 1.65
CLN3-232ENST00000568443 CHMP2AO43633 222 aa25.38■■□□□ 1.65
CLN3-232ENST00000568443 PFKFB2O60825 505 aa25.38■■□□□ 1.65
CLN3-232ENST00000568443 C22orf31O95567 290 aa25.38■■□□□ 1.65
CLN3-232ENST00000568443 CYP3A7P24462 503 aa25.38■■□□□ 1.65
CLN3-232ENST00000568443 SFNP31947 248 aa25.38■■□□□ 1.65
CLN3-232ENST00000568443 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP25.38■■□□□ 1.65
CLN3-232ENST00000568443 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP25.38■■□□□ 1.65
CLN3-232ENST00000568443 TMEM266Q2M3C6 531 aa25.38■■□□□ 1.65
CLN3-232ENST00000568443 LINC01599Q8WXQ3 324 aa25.38■■□□□ 1.65
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CLN3-232ENST00000568443 CDHR5Q9HBB8 845 aa25.38■■□□□ 1.65
CLN3-232ENST00000568443 KCNJ14Q9UNX9 436 aa25.38■■□□□ 1.65
CLN3-232ENST00000568443 COL4A6Q14031 1691 aa25.38■■□□□ 1.65
CLN3-232ENST00000568443 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa25.37■■□□□ 1.65
CLN3-232ENST00000568443 MAGEB2O15479 319 aa25.37■■□□□ 1.65
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CLN3-232ENST00000568443 DGKIO75912 1065 aa25.37■■□□□ 1.65
CLN3-232ENST00000568443 TDP2O95551 362 aa25.37■■□□□ 1.65
CLN3-232ENST00000568443 XBP1P17861 261 aa25.37■■□□□ 1.65
CLN3-232ENST00000568443 KCNQ1P51787 676 aa25.37■■□□□ 1.65
CLN3-232ENST00000568443 JAK3P52333 1124 aa25.37■■□□□ 1.65
CLN3-232ENST00000568443 NPY5RQ15761 445 aa25.37■■□□□ 1.65
CLN3-232ENST00000568443 ODR4Q5SWX8 454 aa25.37■■□□□ 1.65
CLN3-232ENST00000568443 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP25.37■■□□□ 1.65
CLN3-232ENST00000568443 KRT25Q7Z3Z0 450 aa25.37■■□□□ 1.65
CLN3-232ENST00000568443 GJA10Q969M2 543 aa25.37■■□□□ 1.65
CLN3-232ENST00000568443 UNC45AQ9H3U1 944 aa25.37■■□□□ 1.65
CLN3-232ENST00000568443 RWDD3Q9Y3V2 267 aa25.37■■□□□ 1.65
CLN3-232ENST00000568443 NCOR1O75376 2440 aa25.37■■□□□ 1.65
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CLN3-232ENST00000568443 BMPR1AP36894 532 aa25.36■■□□□ 1.65
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CLN3-232ENST00000568443 RB1P06400 928 aa25.35■■□□□ 1.65
CLN3-232ENST00000568443 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP25.35■■□□□ 1.65
CLN3-232ENST00000568443 AK2P54819 239 aa25.35■■□□□ 1.65
CLN3-232ENST00000568443 INF2Q27J81 1249 aa25.35■■□□□ 1.65
CLN3-232ENST00000568443 KIZQ2M2Z5 673 aa25.35■■□□□ 1.65
CLN3-232ENST00000568443 MOXD1Q6UVY6 613 aa25.35■■□□□ 1.65
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CLN3-232ENST00000568443 RDM1Q8NG50 284 aa25.35■■□□□ 1.65
CLN3-232ENST00000568443 PPP1R16BQ96T49 567 aa25.35■■□□□ 1.65
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CLN3-232ENST00000568443 LRFN2Q9ULH4 789 aa25.35■■□□□ 1.65
CLN3-232ENST00000568443 WDR81Q562E7 1941 aa25.35■■□□□ 1.65
CLN3-232ENST00000568443 STK36Q9NRP7 1315 aa25.35■■□□□ 1.65
CLN3-232ENST00000568443 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa25.34■■□□□ 1.65
CLN3-232ENST00000568443 GPR182O15218 404 aa25.34■■□□□ 1.65
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CLN3-232ENST00000568443 MBOAT7Q96N66 472 aa25.34■■□□□ 1.65
CLN3-232ENST00000568443 MAP7D2Q96T17 732 aa25.34■■□□□ 1.65
CLN3-232ENST00000568443 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP25.34■■□□□ 1.65
CLN3-232ENST00000568443 ERVK-5Q9HDB9 667 aa25.34■■□□□ 1.65
CLN3-232ENST00000568443 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP25.34■■□□□ 1.65
CLN3-232ENST00000568443 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa25.34■■□□□ 1.65
CLN3-232ENST00000568443 BRWD1Q9NSI6 2320 aa25.34■■□□□ 1.65
CLN3-232ENST00000568443 DENND3A2RUS2 1198 aa25.33■■□□□ 1.65
CLN3-232ENST00000568443 C5orf67F2Z3F1 127 aa25.33■■□□□ 1.65
CLN3-232ENST00000568443 UGCGQ16739 394 aa25.33■■□□□ 1.65
CLN3-232ENST00000568443 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa25.33■■□□□ 1.65
CLN3-232ENST00000568443 CRIPAKQ8N1N5 446 aa25.33■■□□□ 1.65
CLN3-232ENST00000568443 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP25.33■■□□□ 1.65
CLN3-232ENST00000568443 OSMRQ99650 979 aa25.33■■□□□ 1.65
CLN3-232ENST00000568443 AKT3Q9Y243 479 aa25.33■■□□□ 1.65
CLN3-232ENST00000568443 DTNBO60941 627 aa25.32■■□□□ 1.64
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