RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000565236.1

CLN3-215, Transcript of CLN3, battenin, humanhuman

TSL 3

Gene CLN3, Length 582 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3-215ENST00000565236 SCRN1Q12765 414 aa25.4■■□□□ 1.66
CLN3-215ENST00000565236 GPM6BQ13491 265 aa25.4■■□□□ 1.66
CLN3-215ENST00000565236 PTPROQ16827 1216 aa25.4■■□□□ 1.66
CLN3-215ENST00000565236 LRCH2Q5VUJ6 765 aa25.4■■□□□ 1.66
CLN3-215ENST00000565236 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP25.4■■□□□ 1.66
CLN3-215ENST00000565236 METTL13Q8N6R0 699 aa25.4■■□□□ 1.66
CLN3-215ENST00000565236 SLC5A5Q92911 643 aa25.4■■□□□ 1.66
CLN3-215ENST00000565236 FAM167AQ96KS9 214 aa25.4■■□□□ 1.66
CLN3-215ENST00000565236 TEKT3Q9BXF9 490 aa25.4■■□□□ 1.66
CLN3-215ENST00000565236 CEP131Q9UPN4 1083 aa25.4■■□□□ 1.66
CLN3-215ENST00000565236 H3BNC9 293 aa25.39■■□□□ 1.66
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CLN3-215ENST00000565236 ANKRD1Q15327 319 aa25.39■■□□□ 1.66
CLN3-215ENST00000565236 Q4G0T1 1027 aa25.39■■□□□ 1.66
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CLN3-215ENST00000565236 TPCN1Q9ULQ1 816 aa25.39■■□□□ 1.66
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CLN3-215ENST00000565236 C22orf31O95567 290 aa25.38■■□□□ 1.65
CLN3-215ENST00000565236 CYP3A7P24462 503 aa25.38■■□□□ 1.65
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CLN3-215ENST00000565236 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP25.38■■□□□ 1.65
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CLN3-215ENST00000565236 TMEM266Q2M3C6 531 aa25.38■■□□□ 1.65
CLN3-215ENST00000565236 LINC01599Q8WXQ3 324 aa25.38■■□□□ 1.65
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CLN3-215ENST00000565236 KCNJ14Q9UNX9 436 aa25.38■■□□□ 1.65
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CLN3-215ENST00000565236 TDP2O95551 362 aa25.37■■□□□ 1.65
CLN3-215ENST00000565236 XBP1P17861 261 aa25.37■■□□□ 1.65
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CLN3-215ENST00000565236 KRT25Q7Z3Z0 450 aa25.37■■□□□ 1.65
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CLN3-215ENST00000565236 RWDD3Q9Y3V2 267 aa25.37■■□□□ 1.65
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CLN3-215ENST00000565236 DENND3A2RUS2 1198 aa25.33■■□□□ 1.65
CLN3-215ENST00000565236 C5orf67F2Z3F1 127 aa25.33■■□□□ 1.65
CLN3-215ENST00000565236 UGCGQ16739 394 aa25.33■■□□□ 1.65
CLN3-215ENST00000565236 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa25.33■■□□□ 1.65
CLN3-215ENST00000565236 CRIPAKQ8N1N5 446 aa25.33■■□□□ 1.65
CLN3-215ENST00000565236 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP25.33■■□□□ 1.65
CLN3-215ENST00000565236 OSMRQ99650 979 aa25.33■■□□□ 1.65
CLN3-215ENST00000565236 AKT3Q9Y243 479 aa25.33■■□□□ 1.65
CLN3-215ENST00000565236 DTNBO60941 627 aa25.32■■□□□ 1.64
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