RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564630.5

CCNDBP1-205, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene CCNDBP1, Length 2,079 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-205ENST00000564630 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
CCNDBP1-205ENST00000564630 FKBP1CQ5VVH2 108 aa22.26■■□□□ 1.15
CCNDBP1-205ENST00000564630 SLFN13Q68D06 897 aa22.26■■□□□ 1.15
CCNDBP1-205ENST00000564630 FAM83AQ86UY5 434 aa22.26■■□□□ 1.15
CCNDBP1-205ENST00000564630 TRIM59Q8IWR1 403 aa22.26■■□□□ 1.15
CCNDBP1-205ENST00000564630 SCFD1Q8WVM8 642 aa22.26■■□□□ 1.15
CCNDBP1-205ENST00000564630 OSBPL9Q96SU4 736 aa22.26■■□□□ 1.15
CCNDBP1-205ENST00000564630 IDI2Q9BXS1 227 aa22.26■■□□□ 1.15
CCNDBP1-205ENST00000564630 KANSL2Q9H9L4 492 aa22.26■■□□□ 1.15
CCNDBP1-205ENST00000564630 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
CCNDBP1-205ENST00000564630 HYOU1Q9Y4L1 999 aa22.26■■□□□ 1.15
CCNDBP1-205ENST00000564630 FRMD3A2A2Y4 597 aa22.26■■□□□ 1.15
CCNDBP1-205ENST00000564630 MED24O75448 989 aa22.26■■□□□ 1.15
CCNDBP1-205ENST00000564630 TCP1P17987 556 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
CCNDBP1-205ENST00000564630 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
CCNDBP1-205ENST00000564630 AP3B2Q13367 1082 aa22.26■■□□□ 1.15
CCNDBP1-205ENST00000564630 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa22.26■■□□□ 1.15
CCNDBP1-205ENST00000564630 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
CCNDBP1-205ENST00000564630 FAM83BQ5T0W9 1011 aa22.26■■□□□ 1.15
CCNDBP1-205ENST00000564630 SFMBT2Q5VUG0 894 aa22.26■■□□□ 1.15
CCNDBP1-205ENST00000564630 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
CCNDBP1-205ENST00000564630 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
CCNDBP1-205ENST00000564630 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
CCNDBP1-205ENST00000564630 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
CCNDBP1-205ENST00000564630 CREBZFQ9NS37 354 aa22.26■■□□□ 1.15
CCNDBP1-205ENST00000564630 EMILIN3Q9NT22 766 aa22.26■■□□□ 1.15
CCNDBP1-205ENST00000564630 FAM196BA6NMK8 535 aa22.25■■□□□ 1.15
CCNDBP1-205ENST00000564630 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
CCNDBP1-205ENST00000564630 MEIS2O14770 477 aa22.25■■□□□ 1.15
CCNDBP1-205ENST00000564630 ZMYND10O75800 440 aa22.25■■□□□ 1.15
CCNDBP1-205ENST00000564630 STAT3P40763 770 aa22.25■■□□□ 1.15
CCNDBP1-205ENST00000564630 SLC12A3P55017 1021 aa22.25■■□□□ 1.15
CCNDBP1-205ENST00000564630 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
CCNDBP1-205ENST00000564630 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
CCNDBP1-205ENST00000564630 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
CCNDBP1-205ENST00000564630 FAM151AQ8WW52 585 aa22.25■■□□□ 1.15
CCNDBP1-205ENST00000564630 CRYGNQ8WXF5 182 aa22.25■■□□□ 1.15
CCNDBP1-205ENST00000564630 SALL4Q9UJQ4 1053 aa22.25■■□□□ 1.15
CCNDBP1-205ENST00000564630 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP22.25■■□□□ 1.15
CCNDBP1-205ENST00000564630 SERPING1P05155 500 aa22.24■■□□□ 1.15
CCNDBP1-205ENST00000564630 CCT5P48643 541 aa22.24■■□□□ 1.15
CCNDBP1-205ENST00000564630 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
CCNDBP1-205ENST00000564630 ARSHQ5FYA8 562 aa22.24■■□□□ 1.15
CCNDBP1-205ENST00000564630 NFRKBQ6P4R8 1299 aa22.24■■□□□ 1.15
CCNDBP1-205ENST00000564630 TLR2O60603 784 aa22.24■■□□□ 1.15
CCNDBP1-205ENST00000564630 NF2P35240 595 aa22.24■■□□□ 1.15
CCNDBP1-205ENST00000564630 USP8P40818 1118 aa22.24■■□□□ 1.15
CCNDBP1-205ENST00000564630 HAUS3Q68CZ6 603 aa22.24■■□□□ 1.15
CCNDBP1-205ENST00000564630 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa22.24■■□□□ 1.15
CCNDBP1-205ENST00000564630 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
CCNDBP1-205ENST00000564630 ETNPPLQ8TBG4 499 aa22.24■■□□□ 1.15
CCNDBP1-205ENST00000564630 PI4KBQ9UBF8 816 aa22.24■■□□□ 1.15
CCNDBP1-205ENST00000564630 POTEFA5A3E0 1075 aa22.23■■□□□ 1.15
CCNDBP1-205ENST00000564630 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
CCNDBP1-205ENST00000564630 KRT18P05783 430 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
CCNDBP1-205ENST00000564630 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
CCNDBP1-205ENST00000564630 ARHGAP4P98171 946 aa22.23■■□□□ 1.15
CCNDBP1-205ENST00000564630 SPIRE1Q08AE8 756 aa22.23■■□□□ 1.15
CCNDBP1-205ENST00000564630 EDRF1Q3B7T1 1238 aa22.23■■□□□ 1.15
CCNDBP1-205ENST00000564630 POTEGQ6S5H5 508 aa22.23■■□□□ 1.15
CCNDBP1-205ENST00000564630 POTEEQ6S8J3 1075 aa22.23■■□□□ 1.15
CCNDBP1-205ENST00000564630 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa22.23■■□□□ 1.15
CCNDBP1-205ENST00000564630 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa22.23■■□□□ 1.15
CCNDBP1-205ENST00000564630 CNPY4Q8N129 248 aa22.23■■□□□ 1.15
CCNDBP1-205ENST00000564630 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa22.23■■□□□ 1.15
CCNDBP1-205ENST00000564630 SPATA4Q8NEY3 305 aa22.23■■□□□ 1.15
CCNDBP1-205ENST00000564630 NOX5Q96PH1 765 aa22.23■■□□□ 1.15
CCNDBP1-205ENST00000564630 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa22.23■■□□□ 1.15
CCNDBP1-205ENST00000564630 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP22.22■■□□□ 1.15
CCNDBP1-205ENST00000564630 SIAH1Q8IUQ4 282 aa22.22■■□□□ 1.15
CCNDBP1-205ENST00000564630 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
CCNDBP1-205ENST00000564630 MICALL1Q8N3F8 863 aa22.22■■□□□ 1.15
CCNDBP1-205ENST00000564630 C2orf69Q8N8R5 385 aa22.22■■□□□ 1.15
CCNDBP1-205ENST00000564630 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
CCNDBP1-205ENST00000564630 RNF14Q9UBS8 474 aa22.22■■□□□ 1.15
CCNDBP1-205ENST00000564630 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa22.22■■□□□ 1.15
CCNDBP1-205ENST00000564630 TBX3O15119 743 aa22.22■■□□□ 1.15
CCNDBP1-205ENST00000564630 ENTPD3O75355 529 aa22.22■■□□□ 1.15
CCNDBP1-205ENST00000564630 GSCP56915 257 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
CCNDBP1-205ENST00000564630 ADAM9Q13443 819 aa22.22■■□□□ 1.15
CCNDBP1-205ENST00000564630 CATSPER3Q86XQ3 398 aa22.22■■□□□ 1.15
CCNDBP1-205ENST00000564630 MREGQ8N565 214 aa22.22■■□□□ 1.15
CCNDBP1-205ENST00000564630 BCAS4Q8TDM0 211 aa22.22■■□□□ 1.15
CCNDBP1-205ENST00000564630 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
CCNDBP1-205ENST00000564630 GGA2Q9UJY4 613 aa22.22■■□□□ 1.15
CCNDBP1-205ENST00000564630 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa22.21■■□□□ 1.15
CCNDBP1-205ENST00000564630 Q4G0T1 1027 aa22.21■■□□□ 1.15
CCNDBP1-205ENST00000564630 PRR16Q569H4 304 aa22.21■■□□□ 1.15
CCNDBP1-205ENST00000564630 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa22.21■■□□□ 1.15
CCNDBP1-205ENST00000564630 TATDN1Q6P1N9 297 aa22.21■■□□□ 1.15
CCNDBP1-205ENST00000564630 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
CCNDBP1-205ENST00000564630 SAPCD2Q86UD0 394 aa22.21■■□□□ 1.15
CCNDBP1-205ENST00000564630 KAT2BQ92831 832 aa22.21■■□□□ 1.15
CCNDBP1-205ENST00000564630 AMNQ9BXJ7 453 aa22.21■■□□□ 1.15
CCNDBP1-205ENST00000564630 TLR10Q9BXR5 811 aa22.21■■□□□ 1.15
CCNDBP1-205ENST00000564630 STIM2Q9P246 746 aa22.21■■□□□ 1.15
CCNDBP1-205ENST00000564630 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
CCNDBP1-205ENST00000564630 TLL2Q9Y6L7 1015 aa22.21■■□□□ 1.15
CCNDBP1-205ENST00000564630 CETN3O15182 167 aa22.21■■□□□ 1.15
CCNDBP1-205ENST00000564630 NCK2O43639 380 aa22.21■■□□□ 1.15
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