RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560934.1

LINS1-210, Transcript of lines homolog 1, human

TSL 4

Gene LINS1, Length 562 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LINS1-210	ENST00000560934	TSPAN17	Q96FV3	270 aa		5.98	□□□□□ -1.45
LINS1-210	ENST00000560934	POLR3GL	Q9BT43	218 aa		5.98	□□□□□ -1.45
LINS1-210	ENST00000560934	CAAP1	Q9H8G2	361 aa		5.98	□□□□□ -1.45
LINS1-210	ENST00000560934	CNTD2	Q9H8S5	307 aa		5.98	□□□□□ -1.45
LINS1-210	ENST00000560934	CABP5	Q9NP86	173 aa		5.98	□□□□□ -1.45
LINS1-210	ENST00000560934	ASH2L	Q9UBL3	628 aa		5.98	□□□□□ -1.45
LINS1-210	ENST00000560934	MAPRE3	Q9UPY8	281 aa		5.98	□□□□□ -1.45
LINS1-210	ENST00000560934	ZNF652	Q9Y2D9	606 aa		5.98	□□□□□ -1.45
LINS1-210	ENST00000560934	NRXN3	Q9Y4C0	1643 aa		5.98	□□□□□ -1.45
LINS1-210	ENST00000560934	ASXL1	Q8IXJ9	1541 aa		5.98	□□□□□ -1.45
LINS1-210	ENST00000560934	CENPJ	Q9HC77	1338 aa	Predicted RBP	5.98	□□□□□ -1.45
LINS1-210	ENST00000560934	SETBP1	Q9Y6X0	1596 aa		5.97	□□□□□ -1.45
LINS1-210	ENST00000560934	PTPDC1	A2A3K4	754 aa		5.97	□□□□□ -1.45
LINS1-210	ENST00000560934	ZNF891	A8MT65	544 aa	Predicted RBP	5.97	□□□□□ -1.45
LINS1-210	ENST00000560934	PML	P29590	882 aa		5.97	□□□□□ -1.45
LINS1-210	ENST00000560934	STAT3	P40763	770 aa		5.97	□□□□□ -1.45
LINS1-210	ENST00000560934	MECP2	P51608	486 aa	Known RBP	5.97	□□□□□ -1.45
LINS1-210	ENST00000560934	CT47A1	Q5JQC4	288 aa	Predicted RBP	5.97	□□□□□ -1.45
LINS1-210	ENST00000560934	CPZ	Q66K79	652 aa		5.97	□□□□□ -1.45
LINS1-210	ENST00000560934	FSTL4	Q6MZW2	842 aa		5.97	□□□□□ -1.45
LINS1-210	ENST00000560934	DDX46	Q7L014	1031 aa	Known RBP	5.97	□□□□□ -1.45
LINS1-210	ENST00000560934	LDHD	Q86WU2	507 aa		5.97	□□□□□ -1.45
LINS1-210	ENST00000560934	CHST14	Q8NCH0	376 aa		5.97	□□□□□ -1.45
LINS1-210	ENST00000560934	PANK1	Q8TE04	598 aa		5.97	□□□□□ -1.45
LINS1-210	ENST00000560934	FAM126A	Q9BYI3	521 aa	Predicted RBP	5.97	□□□□□ -1.45
LINS1-210	ENST00000560934	SRPK3	Q9UPE1	567 aa		5.97	□□□□□ -1.45
LINS1-210	ENST00000560934	ZNF142	P52746	1687 aa	Predicted RBP	5.97	□□□□□ -1.45
LINS1-210	ENST00000560934	KIF7	Q2M1P5	1343 aa		5.97	□□□□□ -1.45
LINS1-210	ENST00000560934	KIAA1210	Q9ULL0	1709 aa		5.96	□□□□□ -1.45
LINS1-210	ENST00000560934	PIK3R4	Q99570	1358 aa		5.96	□□□□□ -1.45
LINS1-210	ENST00000560934	SLC12A8	A0AV02	714 aa		5.96	□□□□□ -1.46
LINS1-210	ENST00000560934	FAM90A27P	A6NNH2	459 aa		5.96	□□□□□ -1.46
LINS1-210	ENST00000560934	SCD	O00767	359 aa		5.96	□□□□□ -1.46
LINS1-210	ENST00000560934	VIL1	P09327	827 aa	Known RBP	5.96	□□□□□ -1.46
LINS1-210	ENST00000560934	ZBTB48	P10074	688 aa	Predicted RBP	5.96	□□□□□ -1.46
LINS1-210	ENST00000560934	SOX5	P35711	763 aa		5.96	□□□□□ -1.46
LINS1-210	ENST00000560934	STAT5A	P42229	794 aa		5.96	□□□□□ -1.46
LINS1-210	ENST00000560934	CDR1	P51861	262 aa		5.96	□□□□□ -1.46
LINS1-210	ENST00000560934	TMF1	P82094	1093 aa		5.96	□□□□□ -1.46
LINS1-210	ENST00000560934	BTBD8	Q5XKL5	378 aa		5.96	□□□□□ -1.46
LINS1-210	ENST00000560934	OLFML2B	Q68BL8	750 aa		5.96	□□□□□ -1.46
LINS1-210	ENST00000560934	CYP4F22	Q6NT55	531 aa		5.96	□□□□□ -1.46
LINS1-210	ENST00000560934	KCTD1	Q719H9	257 aa		5.96	□□□□□ -1.46
LINS1-210	ENST00000560934	KRT26	Q7Z3Y9	468 aa		5.96	□□□□□ -1.46
LINS1-210	ENST00000560934	PNPLA5	Q7Z6Z6	429 aa	Predicted RBP	5.96	□□□□□ -1.46
LINS1-210	ENST00000560934	PHOSPHO1	Q8TCT1	267 aa		5.96	□□□□□ -1.46
LINS1-210	ENST00000560934	KCNN1	Q92952	543 aa		5.96	□□□□□ -1.46
LINS1-210	ENST00000560934	CDK19	Q9BWU1	502 aa		5.96	□□□□□ -1.46
LINS1-210	ENST00000560934	XPO5	Q9HAV4	1204 aa	Known RBP eCLIP	5.96	□□□□□ -1.46
LINS1-210	ENST00000560934	RIC8B	Q9NVN3	520 aa		5.96	□□□□□ -1.46
LINS1-210	ENST00000560934	B4GALT6	Q9UBX8	382 aa		5.96	□□□□□ -1.46
LINS1-210	ENST00000560934	MBD1	Q9UIS9	605 aa	Predicted RBP	5.96	□□□□□ -1.46
LINS1-210	ENST00000560934	ZKSCAN5	Q9Y2L8	839 aa		5.96	□□□□□ -1.46
LINS1-210	ENST00000560934	ATP23	Q9Y6H3	246 aa		5.96	□□□□□ -1.46
LINS1-210	ENST00000560934	CCDC7	Q96M83	1385 aa		5.95	□□□□□ -1.46
LINS1-210	ENST00000560934	DISP3	Q9P2K9	1392 aa		5.95	□□□□□ -1.46
LINS1-210	ENST00000560934	IQGAP1	P46940	1657 aa		5.95	□□□□□ -1.46
LINS1-210	ENST00000560934	HRK	O00198	91 aa		5.95	□□□□□ -1.46
LINS1-210	ENST00000560934	PEX10	O60683	326 aa		5.95	□□□□□ -1.46
LINS1-210	ENST00000560934	F2	P00734	622 aa		5.95	□□□□□ -1.46
LINS1-210	ENST00000560934	ASGR2	P07307	311 aa		5.95	□□□□□ -1.46
LINS1-210	ENST00000560934	SCNN1B	P51168	640 aa		5.95	□□□□□ -1.46
LINS1-210	ENST00000560934	NFKB2	Q00653	900 aa		5.95	□□□□□ -1.46
LINS1-210	ENST00000560934	STRN3	Q13033	797 aa		5.95	□□□□□ -1.46
LINS1-210	ENST00000560934	SEC23A	Q15436	765 aa		5.95	□□□□□ -1.46
LINS1-210	ENST00000560934	HHIPL2	Q6UWX4	724 aa		5.95	□□□□□ -1.46
LINS1-210	ENST00000560934	TRIM48	Q8IWZ4	208 aa		5.95	□□□□□ -1.46
LINS1-210	ENST00000560934	NLGN4X	Q8N0W4	816 aa		5.95	□□□□□ -1.46
LINS1-210	ENST00000560934	FAM26E	Q8N5C1	309 aa		5.95	□□□□□ -1.46
LINS1-210	ENST00000560934	FBXO15	Q8NCQ5	510 aa	Predicted RBP	5.95	□□□□□ -1.46
LINS1-210	ENST00000560934	GPR101	Q96P66	508 aa	Predicted RBP	5.95	□□□□□ -1.46
LINS1-210	ENST00000560934	SYT3	Q9BQG1	590 aa		5.95	□□□□□ -1.46
LINS1-210	ENST00000560934	YIPF4	Q9BSR8	244 aa		5.95	□□□□□ -1.46
LINS1-210	ENST00000560934	NUB1	Q9Y5A7	615 aa		5.95	□□□□□ -1.46
LINS1-210	ENST00000560934	ZNF335	Q9H4Z2	1342 aa	Predicted RBP	5.95	□□□□□ -1.46
LINS1-210	ENST00000560934	EIF3A	Q14152	1382 aa	Known RBP	5.94	□□□□□ -1.46
LINS1-210	ENST00000560934	SETD1A	O15047	1707 aa	Known RBP	5.94	□□□□□ -1.46
LINS1-210	ENST00000560934	TECPR2	O15040	1411 aa		5.94	□□□□□ -1.46
LINS1-210	ENST00000560934	FAM135B	Q49AJ0	1406 aa		5.94	□□□□□ -1.46
LINS1-210	ENST00000560934	STRC	Q7RTU9	1775 aa		5.94	□□□□□ -1.46
LINS1-210	ENST00000560934	TEX51	A0A1B0GUA7	166 aa		5.94	□□□□□ -1.46
LINS1-210	ENST00000560934	ACOT7	O00154	380 aa		5.94	□□□□□ -1.46
LINS1-210	ENST00000560934	GAS7	O60861	476 aa		5.94	□□□□□ -1.46
LINS1-210	ENST00000560934	ATF2	P15336	505 aa		5.94	□□□□□ -1.46
LINS1-210	ENST00000560934	ATP2A2	P16615	1042 aa	Known RBP	5.94	□□□□□ -1.46
LINS1-210	ENST00000560934	PTPN1	P18031	435 aa	Known RBP	5.94	□□□□□ -1.46
LINS1-210	ENST00000560934	MC3R	P41968	323 aa		5.94	□□□□□ -1.46
LINS1-210	ENST00000560934	EPHB3	P54753	998 aa		5.94	□□□□□ -1.46
LINS1-210	ENST00000560934	EPHA5	P54756	1037 aa		5.94	□□□□□ -1.46
LINS1-210	ENST00000560934	IRF9	Q00978	393 aa		5.94	□□□□□ -1.46
LINS1-210	ENST00000560934	ARHGAP44	Q17R89	818 aa		5.94	□□□□□ -1.46
LINS1-210	ENST00000560934	PAN2	Q504Q3	1202 aa	Known RBP	5.94	□□□□□ -1.46
LINS1-210	ENST00000560934	CD300LD	Q6UXZ3	194 aa		5.94	□□□□□ -1.46
LINS1-210	ENST00000560934	OTOP1	Q7RTM1	612 aa		5.94	□□□□□ -1.46
LINS1-210	ENST00000560934	AMIGO3	Q86WK7	504 aa		5.94	□□□□□ -1.46
LINS1-210	ENST00000560934	KIF18B	Q86Y91	864 aa		5.94	□□□□□ -1.46
LINS1-210	ENST00000560934	NOSTRIN	Q8IVI9	506 aa		5.94	□□□□□ -1.46
LINS1-210	ENST00000560934	OR2W6P	Q8NHA6	318 aa		5.94	□□□□□ -1.46
LINS1-210	ENST00000560934	CHTF18	Q8WVB6	975 aa		5.94	□□□□□ -1.46
LINS1-210	ENST00000560934	GPATCH3	Q96I76	525 aa		5.94	□□□□□ -1.46

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