RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560557.1

FAM227B-211, Transcript of family with sequence similarity 227 member B, humanhuman

TSL 3

Gene FAM227B, Length 438 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM227B-211ENST00000560557 CD276Q5ZPR3 534 aa4.48□□□□□ -1.69
FAM227B-211ENST00000560557 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa4.48□□□□□ -1.69
FAM227B-211ENST00000560557 SPATC1Q76KD6 591 aa4.48□□□□□ -1.69
FAM227B-211ENST00000560557 PNPLA5Q7Z6Z6 429 aaPredicted RBP4.48□□□□□ -1.69
FAM227B-211ENST00000560557 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP4.48□□□□□ -1.69
FAM227B-211ENST00000560557 STPG3Q8N7X2 389 aa4.48□□□□□ -1.69
FAM227B-211ENST00000560557 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP4.48□□□□□ -1.69
FAM227B-211ENST00000560557 TRIM55Q9BYV6 548 aa4.48□□□□□ -1.69
FAM227B-211ENST00000560557 CD244Q9BZW8 370 aa4.48□□□□□ -1.69
FAM227B-211ENST00000560557 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP4.48□□□□□ -1.69
FAM227B-211ENST00000560557 PLA2G3Q9NZ20 509 aa4.48□□□□□ -1.69
FAM227B-211ENST00000560557 PACSIN3Q9UKS6 424 aa4.48□□□□□ -1.69
FAM227B-211ENST00000560557 DSEQ9UL01 958 aa4.48□□□□□ -1.69
FAM227B-211ENST00000560557 TRAF6Q9Y4K3 522 aa4.48□□□□□ -1.69
FAM227B-211ENST00000560557 ACOT7O00154 380 aa4.47□□□□□ -1.69
FAM227B-211ENST00000560557 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP4.47□□□□□ -1.69
FAM227B-211ENST00000560557 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP4.47□□□□□ -1.69
FAM227B-211ENST00000560557 KCTD1Q719H9 257 aa4.47□□□□□ -1.69
FAM227B-211ENST00000560557 MRGPREQ86SM8 312 aa4.47□□□□□ -1.69
FAM227B-211ENST00000560557 SGMS1Q86VZ5 419 aa4.47□□□□□ -1.69
FAM227B-211ENST00000560557 SH3RF2Q8TEC5 729 aa4.47□□□□□ -1.69
FAM227B-211ENST00000560557 SPATA9Q9BWV2 254 aa4.47□□□□□ -1.69
FAM227B-211ENST00000560557 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP4.47□□□□□ -1.69
FAM227B-211ENST00000560557 IGSF5Q9NSI5 407 aa4.47□□□□□ -1.69
FAM227B-211ENST00000560557 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa4.47□□□□□ -1.69
FAM227B-211ENST00000560557 NR2E1Q9Y466 385 aa4.47□□□□□ -1.69
FAM227B-211ENST00000560557 NUB1Q9Y5A7 615 aa4.47□□□□□ -1.69
FAM227B-211ENST00000560557 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa4.46□□□□□ -1.7
FAM227B-211ENST00000560557 ZNF839A8K0R7 811 aa4.46□□□□□ -1.7
FAM227B-211ENST00000560557 IL18BPO95998 194 aa4.46□□□□□ -1.7
FAM227B-211ENST00000560557 EPHA5P54756 1037 aa4.46□□□□□ -1.7
FAM227B-211ENST00000560557 GRM7Q14831 915 aa4.46□□□□□ -1.7
FAM227B-211ENST00000560557 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP4.46□□□□□ -1.7
FAM227B-211ENST00000560557 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP4.46□□□□□ -1.7
FAM227B-211ENST00000560557 ALG1Q9BT22 464 aa4.46□□□□□ -1.7
FAM227B-211ENST00000560557 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa4.46□□□□□ -1.7
FAM227B-211ENST00000560557 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa4.46□□□□□ -1.7
FAM227B-211ENST00000560557 SLC39A2Q9NP94 309 aa4.46□□□□□ -1.7
FAM227B-211ENST00000560557 ADCY3O60266 1144 aa4.45□□□□□ -1.7
FAM227B-211ENST00000560557 STK10O94804 968 aaKnown RBP4.45□□□□□ -1.7
FAM227B-211ENST00000560557 RRADP55042 308 aa4.45□□□□□ -1.7
FAM227B-211ENST00000560557 HHEXQ03014 270 aa4.45□□□□□ -1.7
FAM227B-211ENST00000560557 ZMAT1Q5H9K5 638 aa4.45□□□□□ -1.7
FAM227B-211ENST00000560557 FOXB2Q5VYV0 432 aa4.45□□□□□ -1.7
FAM227B-211ENST00000560557 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP4.45□□□□□ -1.7
FAM227B-211ENST00000560557 VRK3Q8IV63 474 aa4.45□□□□□ -1.7
FAM227B-211ENST00000560557 CKAP2LQ8IYA6 745 aa4.45□□□□□ -1.7
FAM227B-211ENST00000560557 C9orf106Q8NAJ2 232 aa4.45□□□□□ -1.7
FAM227B-211ENST00000560557 CFHR4Q92496 578 aa4.45□□□□□ -1.7
FAM227B-211ENST00000560557 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP4.45□□□□□ -1.7
FAM227B-211ENST00000560557 SYNPO2LQ9H987 977 aa4.45□□□□□ -1.7
FAM227B-211ENST00000560557 PFDN2Q9UHV9 154 aa4.45□□□□□ -1.7
FAM227B-211ENST00000560557 MSRB2Q9Y3D2 182 aa4.45□□□□□ -1.7
FAM227B-211ENST00000560557 CCDC85CA6NKD9 419 aa4.44□□□□□ -1.7
FAM227B-211ENST00000560557 CAPN14A8MX76 684 aa4.44□□□□□ -1.7
FAM227B-211ENST00000560557 PDPK1O15530 556 aa4.44□□□□□ -1.7
FAM227B-211ENST00000560557 PAK1Q13153 545 aa4.44□□□□□ -1.7
FAM227B-211ENST00000560557 NFYCQ13952 458 aa4.44□□□□□ -1.7
FAM227B-211ENST00000560557 TBR1Q16650 682 aa4.44□□□□□ -1.7
FAM227B-211ENST00000560557 FAM209AQ5JX71 171 aa4.44□□□□□ -1.7
FAM227B-211ENST00000560557 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa4.44□□□□□ -1.7
FAM227B-211ENST00000560557 DPH6Q7L8W6 267 aa4.44□□□□□ -1.7
FAM227B-211ENST00000560557 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP4.44□□□□□ -1.7
FAM227B-211ENST00000560557 CDC6Q99741 560 aa4.44□□□□□ -1.7
FAM227B-211ENST00000560557 MSL2Q9HCI7 577 aa4.44□□□□□ -1.7
FAM227B-211ENST00000560557 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa4.44□□□□□ -1.7
FAM227B-211ENST00000560557 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa4.43□□□□□ -1.7
FAM227B-211ENST00000560557 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP4.43□□□□□ -1.7
FAM227B-211ENST00000560557 FAM90A27PA6NNH2 459 aa4.43□□□□□ -1.7
FAM227B-211ENST00000560557 AQP7O14520 342 aa4.43□□□□□ -1.7
FAM227B-211ENST00000560557 CYP27B1O15528 508 aa4.43□□□□□ -1.7
FAM227B-211ENST00000560557 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP4.43□□□□□ -1.7
FAM227B-211ENST00000560557 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP4.43□□□□□ -1.7
FAM227B-211ENST00000560557 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP4.43□□□□□ -1.7
FAM227B-211ENST00000560557 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP4.43□□□□□ -1.7
FAM227B-211ENST00000560557 POLD1P28340 1107 aa4.43□□□□□ -1.7
FAM227B-211ENST00000560557 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP4.43□□□□□ -1.7
FAM227B-211ENST00000560557 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP4.43□□□□□ -1.7
FAM227B-211ENST00000560557 CRHR2Q13324 411 aa4.43□□□□□ -1.7
FAM227B-211ENST00000560557 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP4.43□□□□□ -1.7
FAM227B-211ENST00000560557 RASGRF1Q13972 1273 aa4.43□□□□□ -1.7
FAM227B-211ENST00000560557 MTERF2Q49AM1 385 aa4.43□□□□□ -1.7
FAM227B-211ENST00000560557 NAALADL2Q58DX5 795 aa4.43□□□□□ -1.7
FAM227B-211ENST00000560557 STRIP1Q5VSL9 837 aa4.43□□□□□ -1.7
FAM227B-211ENST00000560557 BTBD8Q5XKL5 378 aa4.43□□□□□ -1.7
FAM227B-211ENST00000560557 ADGRE4PQ86SQ3 457 aa4.43□□□□□ -1.7
FAM227B-211ENST00000560557 PCDH19Q8TAB3 1148 aa4.43□□□□□ -1.7
FAM227B-211ENST00000560557 PTPRN2Q92932 1015 aa4.43□□□□□ -1.7
FAM227B-211ENST00000560557 RIC8BQ9NVN3 520 aa4.43□□□□□ -1.7
FAM227B-211ENST00000560557 SRPK3Q9UPE1 567 aa4.43□□□□□ -1.7
FAM227B-211ENST00000560557 COX11Q9Y6N1 276 aa4.43□□□□□ -1.7
FAM227B-211ENST00000560557 ESYT3A0FGR9 886 aa4.42□□□□□ -1.7
FAM227B-211ENST00000560557 MAN2B1O00754 1011 aa4.42□□□□□ -1.7
FAM227B-211ENST00000560557 WNT9AO14904 365 aa4.42□□□□□ -1.7
FAM227B-211ENST00000560557 ARHGAP6O43182 974 aa4.42□□□□□ -1.7
FAM227B-211ENST00000560557 CUTAO60888 179 aa4.42□□□□□ -1.7
FAM227B-211ENST00000560557 AMY2AP04746 511 aa4.42□□□□□ -1.7
FAM227B-211ENST00000560557 PYGMP11217 842 aa4.42□□□□□ -1.7
FAM227B-211ENST00000560557 PDE6AP16499 860 aa4.42□□□□□ -1.7
FAM227B-211ENST00000560557 AMY2BP19961 511 aa4.42□□□□□ -1.7
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.1 ms