RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558639.5

PSMA4-208, Transcript of proteasome subunit alpha 4, humanhuman

TSL 3

Gene PSMA4, Length 733 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA4-208ENST00000558639 TMPRSS2O15393 492 aa9□□□□□ -0.97
PSMA4-208ENST00000558639 HTR3BO95264 441 aa9□□□□□ -0.97
PSMA4-208ENST00000558639 SELPP16109 830 aa9□□□□□ -0.97
PSMA4-208ENST00000558639 SYN1P17600 705 aa9□□□□□ -0.97
PSMA4-208ENST00000558639 CNGA1P29973 690 aa9□□□□□ -0.97
PSMA4-208ENST00000558639 MAPK4P31152 587 aa9□□□□□ -0.97
PSMA4-208ENST00000558639 ETF1P62495 437 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
PSMA4-208ENST00000558639 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
PSMA4-208ENST00000558639 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
PSMA4-208ENST00000558639 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa9□□□□□ -0.97
PSMA4-208ENST00000558639 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa9□□□□□ -0.97
PSMA4-208ENST00000558639 ANKRD34AQ69YU3 496 aa9□□□□□ -0.97
PSMA4-208ENST00000558639 CEP85Q6P2H3 762 aa9□□□□□ -0.97
PSMA4-208ENST00000558639 PLEKHH3Q7Z736 793 aa9□□□□□ -0.97
PSMA4-208ENST00000558639 ERC1Q8IUD2 1116 aa9□□□□□ -0.97
PSMA4-208ENST00000558639 TRIB2Q92519 343 aa9□□□□□ -0.97
PSMA4-208ENST00000558639 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
PSMA4-208ENST00000558639 CRIM1Q9NZV1 1036 aa9□□□□□ -0.97
PSMA4-208ENST00000558639 MORF4L1Q9UBU8 362 aa9□□□□□ -0.97
PSMA4-208ENST00000558639 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa9□□□□□ -0.97
PSMA4-208ENST00000558639 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa9□□□□□ -0.97
PSMA4-208ENST00000558639 C9orf172C9J069 976 aa8.99□□□□□ -0.97
PSMA4-208ENST00000558639 FANCGO15287 622 aa8.99□□□□□ -0.97
PSMA4-208ENST00000558639 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
PSMA4-208ENST00000558639 PGRP06401 933 aa8.99□□□□□ -0.97
PSMA4-208ENST00000558639 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
PSMA4-208ENST00000558639 ADH5P11766 374 aa8.99□□□□□ -0.97
PSMA4-208ENST00000558639 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
PSMA4-208ENST00000558639 PLCG1P19174 1290 aa8.99□□□□□ -0.97
PSMA4-208ENST00000558639 LORP23490 312 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
PSMA4-208ENST00000558639 ETFBP38117 255 aa8.99□□□□□ -0.97
PSMA4-208ENST00000558639 RGS2P41220 211 aa8.99□□□□□ -0.97
PSMA4-208ENST00000558639 GIPRP48546 466 aa8.99□□□□□ -0.97
PSMA4-208ENST00000558639 PLCD1P51178 756 aa8.99□□□□□ -0.97
PSMA4-208ENST00000558639 USP14P54578 494 aa8.99□□□□□ -0.97
PSMA4-208ENST00000558639 CCNA1P78396 465 aa8.99□□□□□ -0.97
PSMA4-208ENST00000558639 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
PSMA4-208ENST00000558639 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
PSMA4-208ENST00000558639 CCL14Q16627 93 aa8.99□□□□□ -0.97
PSMA4-208ENST00000558639 PPM1JQ5JR12 505 aa8.99□□□□□ -0.97
PSMA4-208ENST00000558639 TATDN1Q6P1N9 297 aa8.99□□□□□ -0.97
PSMA4-208ENST00000558639 SHISA2Q6UWI4 295 aa8.99□□□□□ -0.97
PSMA4-208ENST00000558639 DYMQ7RTS9 669 aa8.99□□□□□ -0.97
PSMA4-208ENST00000558639 GPR142Q7Z601 462 aa8.99□□□□□ -0.97
PSMA4-208ENST00000558639 CERS3Q8IU89 383 aa8.99□□□□□ -0.97
PSMA4-208ENST00000558639 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
PSMA4-208ENST00000558639 ACER1Q8TDN7 264 aa8.99□□□□□ -0.97
PSMA4-208ENST00000558639 SHDQ96IW2 340 aa8.99□□□□□ -0.97
PSMA4-208ENST00000558639 WNT10AQ9GZT5 417 aa8.99□□□□□ -0.97
PSMA4-208ENST00000558639 PORCNQ9H237 461 aa8.99□□□□□ -0.97
PSMA4-208ENST00000558639 C11orf49Q9H6J7 331 aa8.99□□□□□ -0.97
PSMA4-208ENST00000558639 AKTIPQ9H8T0 292 aa8.99□□□□□ -0.97
PSMA4-208ENST00000558639 MCM9Q9NXL9 1143 aa8.99□□□□□ -0.97
PSMA4-208ENST00000558639 PRKAG3Q9UGI9 489 aa8.99□□□□□ -0.97
PSMA4-208ENST00000558639 CORINQ9Y5Q5 1042 aa8.99□□□□□ -0.97
PSMA4-208ENST00000558639 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
PSMA4-208ENST00000558639 PTPRFP10586 1907 aa8.99□□□□□ -0.97
PSMA4-208ENST00000558639 ATAD5Q96QE3 1844 aa8.98□□□□□ -0.97
PSMA4-208ENST00000558639 F8W735 103 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
PSMA4-208ENST00000558639 GOLIM4O00461 696 aa8.98□□□□□ -0.97
PSMA4-208ENST00000558639 SART1O43290 800 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
PSMA4-208ENST00000558639 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
PSMA4-208ENST00000558639 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa8.98□□□□□ -0.97
PSMA4-208ENST00000558639 ANKS3Q6ZW76 656 aa8.98□□□□□ -0.97
PSMA4-208ENST00000558639 DPH6Q7L8W6 267 aa8.98□□□□□ -0.97
PSMA4-208ENST00000558639 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP8.98□□□□□ -0.97
PSMA4-208ENST00000558639 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
PSMA4-208ENST00000558639 SOCS4Q8WXH5 440 aa8.98□□□□□ -0.97
PSMA4-208ENST00000558639 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
PSMA4-208ENST00000558639 TRIM55Q9BYV6 548 aa8.98□□□□□ -0.97
PSMA4-208ENST00000558639 CEP41Q9BYV8 373 aa8.98□□□□□ -0.97
PSMA4-208ENST00000558639 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
PSMA4-208ENST00000558639 PIDD1Q9HB75 910 aa8.98□□□□□ -0.97
PSMA4-208ENST00000558639 REV1Q9UBZ9 1251 aa8.98□□□□□ -0.97
PSMA4-208ENST00000558639 ADAM30Q9UKF2 790 aa8.98□□□□□ -0.97
PSMA4-208ENST00000558639 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa8.98□□□□□ -0.97
PSMA4-208ENST00000558639 ZNF532Q9HCE3 1301 aa8.98□□□□□ -0.97
PSMA4-208ENST00000558639 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
PSMA4-208ENST00000558639 DRD2P14416 443 aa8.97□□□□□ -0.97
PSMA4-208ENST00000558639 RING1Q06587 406 aa8.97□□□□□ -0.97
PSMA4-208ENST00000558639 PLS1Q14651 629 aa8.97□□□□□ -0.97
PSMA4-208ENST00000558639 SEPT2Q15019 361 aa8.97□□□□□ -0.97
PSMA4-208ENST00000558639 ZBTB37Q5TC79 503 aa8.97□□□□□ -0.97
PSMA4-208ENST00000558639 MFSD14CQ5VZR4 134 aa8.97□□□□□ -0.97
PSMA4-208ENST00000558639 DPP9Q86TI2 863 aa8.97□□□□□ -0.97
PSMA4-208ENST00000558639 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
PSMA4-208ENST00000558639 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
PSMA4-208ENST00000558639 KCT2Q8NC54 265 aa8.97□□□□□ -0.97
PSMA4-208ENST00000558639 RNF214Q8ND24 703 aa8.97□□□□□ -0.97
PSMA4-208ENST00000558639 ZNF507Q8TCN5 953 aa8.97□□□□□ -0.97
PSMA4-208ENST00000558639 SDR42E1Q8WUS8 393 aa8.97□□□□□ -0.97
PSMA4-208ENST00000558639 FANCD2OSQ96PS1 177 aa8.97□□□□□ -0.97
PSMA4-208ENST00000558639 BOLA2Q9H3K6 86 aa8.97□□□□□ -0.97
PSMA4-208ENST00000558639 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
PSMA4-208ENST00000558639 ARMT1Q9H993 441 aa8.97□□□□□ -0.97
PSMA4-208ENST00000558639 HOXC10Q9NYD6 342 aa8.97□□□□□ -0.97
PSMA4-208ENST00000558639 FAM181BA6NEQ2 426 aa8.96□□□□□ -0.98
PSMA4-208ENST00000558639 PDE6AP16499 860 aa8.96□□□□□ -0.98
PSMA4-208ENST00000558639 SHMT1P34896 483 aa8.96□□□□□ -0.98
PSMA4-208ENST00000558639 ASPAP45381 313 aa8.96□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 78.5 ms