RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552222.5

CS-231, Transcript of citrate synthase, human

TSL 4

Gene CS, Length 555 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-231	ENST00000552222	MYO10	Q9HD67	2058 aa		15.82	■□□□□ 0.12
CS-231	ENST00000552222	PALM3	A6NDB9	673 aa	Predicted RBP	15.81	■□□□□ 0.12
CS-231	ENST00000552222	MGEA5	O60502	916 aa		15.81	■□□□□ 0.12
CS-231	ENST00000552222	FGF18	O76093	207 aa		15.81	■□□□□ 0.12
CS-231	ENST00000552222	PARP1	P09874	1014 aa	Known RBP	15.81	■□□□□ 0.12
CS-231	ENST00000552222	EVC	P57679	992 aa		15.81	■□□□□ 0.12
CS-231	ENST00000552222	SPOUT1	Q5T280	376 aa	Known RBP	15.81	■□□□□ 0.12
CS-231	ENST00000552222	DGLUCY	Q7Z3D6	616 aa		15.81	■□□□□ 0.12
CS-231	ENST00000552222	DCLK2	Q8N568	766 aa		15.81	■□□□□ 0.12
CS-231	ENST00000552222	TRAPPC12	Q8WVT3	735 aa		15.81	■□□□□ 0.12
CS-231	ENST00000552222	MYL10	Q9BUA6	226 aa		15.81	■□□□□ 0.12
CS-231	ENST00000552222	TMEM260	Q9NX78	707 aa		15.81	■□□□□ 0.12
CS-231	ENST00000552222	LIMD1	Q9UGP4	676 aa		15.81	■□□□□ 0.12
CS-231	ENST00000552222		R4GN57	208 aa		15.81	■□□□□ 0.12
CS-231	ENST00000552222	KLF18	A0A0U1RQI7	1052 aa		15.8	■□□□□ 0.12
CS-231	ENST00000552222	FSCN2	O14926	492 aa		15.8	■□□□□ 0.12
CS-231	ENST00000552222	CALM1	P0DP23	149 aa		15.8	■□□□□ 0.12
CS-231	ENST00000552222	CALM2	P0DP24	149 aa		15.8	■□□□□ 0.12
CS-231	ENST00000552222	CALM3	P0DP25	149 aa		15.8	■□□□□ 0.12
CS-231	ENST00000552222	GNAT1	P11488	350 aa		15.8	■□□□□ 0.12
CS-231	ENST00000552222	NPR3	P17342	541 aa		15.8	■□□□□ 0.12
CS-231	ENST00000552222	CCND2	P30279	289 aa		15.8	■□□□□ 0.12
CS-231	ENST00000552222	NEK4	P51957	841 aa		15.8	■□□□□ 0.12
CS-231	ENST00000552222	RCAN1	P53805	252 aa		15.8	■□□□□ 0.12
CS-231	ENST00000552222	MTMR3	Q13615	1198 aa		15.8	■□□□□ 0.12
CS-231	ENST00000552222	SYNE3	Q6ZMZ3	975 aa		15.8	■□□□□ 0.12
CS-231	ENST00000552222	TSHZ1	Q6ZSZ6	1077 aa		15.8	■□□□□ 0.12
CS-231	ENST00000552222	NPAS4	Q8IUM7	802 aa		15.8	■□□□□ 0.12
CS-231	ENST00000552222	PKD2L1	Q9P0L9	805 aa		15.8	■□□□□ 0.12
CS-231	ENST00000552222	PADI3	Q9ULW8	664 aa		15.8	■□□□□ 0.12
CS-231	ENST00000552222	SORCS3	Q9UPU3	1222 aa		15.8	■□□□□ 0.12
CS-231	ENST00000552222	TBKBP1	A7MCY6	615 aa		15.79	■□□□□ 0.12
CS-231	ENST00000552222	SPATA31C2	B4DYI2	1134 aa		15.79	■□□□□ 0.12
CS-231	ENST00000552222	KLRF2	D3W0D1	207 aa		15.79	■□□□□ 0.12
CS-231	ENST00000552222	KIF5B	P33176	963 aa		15.79	■□□□□ 0.12
CS-231	ENST00000552222	PPFIA1	Q13136	1202 aa		15.79	■□□□□ 0.12
CS-231	ENST00000552222	GRIK4	Q16099	956 aa		15.79	■□□□□ 0.12
CS-231	ENST00000552222	NAALADL2	Q58DX5	795 aa		15.79	■□□□□ 0.12
CS-231	ENST00000552222	KCNV1	Q6PIU1	500 aa		15.79	■□□□□ 0.12
CS-231	ENST00000552222	METTL7B	Q6UX53	244 aa		15.79	■□□□□ 0.12
CS-231	ENST00000552222	MICU3	Q86XE3	530 aa		15.79	■□□□□ 0.12
CS-231	ENST00000552222	HOMER1	Q86YM7	354 aa		15.79	■□□□□ 0.12
CS-231	ENST00000552222	KCNG4	Q8TDN1	519 aa		15.79	■□□□□ 0.12
CS-231	ENST00000552222	AMN	Q9BXJ7	453 aa		15.79	■□□□□ 0.12
CS-231	ENST00000552222	MFSD1	Q9H3U5	465 aa		15.79	■□□□□ 0.12
CS-231	ENST00000552222	TYW1	Q9NV66	732 aa	Known RBP	15.79	■□□□□ 0.12
CS-231	ENST00000552222	RALY	Q9UKM9	306 aa	Known RBP	15.79	■□□□□ 0.12
CS-231	ENST00000552222	PCDHA1	Q9Y5I3	950 aa		15.79	■□□□□ 0.12
CS-231	ENST00000552222	NCOR2	Q9Y618	2525 aa		15.79	■□□□□ 0.12
CS-231	ENST00000552222	CACNA1B	Q00975	2339 aa		15.79	■□□□□ 0.12
CS-231	ENST00000552222	WDR87	Q6ZQQ6	2873 aa		15.79	■□□□□ 0.12
CS-231	ENST00000552222	NRCAM	Q92823	1304 aa		15.78	■□□□□ 0.12
CS-231	ENST00000552222	ZBTB43	O43298	467 aa		15.78	■□□□□ 0.12
CS-231	ENST00000552222	ATP9A	O75110	1047 aa		15.78	■□□□□ 0.12
CS-231	ENST00000552222	TGFB3	P10600	412 aa		15.78	■□□□□ 0.12
CS-231	ENST00000552222	FGFR1	P11362	822 aa		15.78	■□□□□ 0.12
CS-231	ENST00000552222	SCG2	P13521	617 aa		15.78	■□□□□ 0.12
CS-231	ENST00000552222	RXRA	P19793	462 aa		15.78	■□□□□ 0.12
CS-231	ENST00000552222	MRPS6	P82932	125 aa	Known RBP	15.78	■□□□□ 0.12
CS-231	ENST00000552222	RABEP1	Q15276	862 aa		15.78	■□□□□ 0.12
CS-231	ENST00000552222	ANGPT1	Q15389	498 aa		15.78	■□□□□ 0.12
CS-231	ENST00000552222	RAB11FIP4	Q86YS3	637 aa		15.78	■□□□□ 0.12
CS-231	ENST00000552222	THNSL1	Q8IYQ7	743 aa		15.78	■□□□□ 0.12
CS-231	ENST00000552222	FANCB	Q8NB91	859 aa		15.78	■□□□□ 0.12
CS-231	ENST00000552222	CTCFL	Q8NI51	663 aa	Predicted RBP	15.78	■□□□□ 0.12
CS-231	ENST00000552222	PIBF1	Q8WXW3	757 aa		15.78	■□□□□ 0.12
CS-231	ENST00000552222	RIN2	Q8WYP3	895 aa	Predicted RBP	15.78	■□□□□ 0.12
CS-231	ENST00000552222	CDHR5	Q9HBB8	845 aa		15.78	■□□□□ 0.12
CS-231	ENST00000552222	TUBE1	Q9UJT0	475 aa		15.78	■□□□□ 0.12
CS-231	ENST00000552222	NID2	Q14112	1375 aa		15.77	■□□□□ 0.12
CS-231	ENST00000552222	MYH6	P13533	1939 aa		15.77	■□□□□ 0.12
CS-231	ENST00000552222	GSTTP1	A0A1W2PQM5	241 aa		15.77	■□□□□ 0.12
CS-231	ENST00000552222	GOLGA8B	A8MQT2	603 aa		15.77	■□□□□ 0.12
CS-231	ENST00000552222	PDIA3	P30101	505 aa	Known RBP	15.77	■□□□□ 0.12
CS-231	ENST00000552222	TCF7	P36402	384 aa	Predicted RBP	15.77	■□□□□ 0.12
CS-231	ENST00000552222	NUBP1	P53384	320 aa		15.77	■□□□□ 0.12
CS-231	ENST00000552222	AK2	P54819	239 aa		15.77	■□□□□ 0.12
CS-231	ENST00000552222	GHRHR	Q02643	423 aa		15.77	■□□□□ 0.12
CS-231	ENST00000552222	ANKRD1	Q15327	319 aa		15.77	■□□□□ 0.12
CS-231	ENST00000552222	COLGALT1	Q8NBJ5	622 aa		15.77	■□□□□ 0.12
CS-231	ENST00000552222	ZNF274	Q96GC6	653 aa	Predicted RBP	15.77	■□□□□ 0.12
CS-231	ENST00000552222	PIGS	Q96S52	555 aa		15.77	■□□□□ 0.12
CS-231	ENST00000552222	TCF25	Q9BQ70	676 aa		15.77	■□□□□ 0.12
CS-231	ENST00000552222	AAAS	Q9NRG9	546 aa		15.77	■□□□□ 0.12
CS-231	ENST00000552222	GOLGA8A	A7E2F4	631 aa		15.76	■□□□□ 0.11
CS-231	ENST00000552222	GNAQ	P50148	359 aa		15.76	■□□□□ 0.11
CS-231	ENST00000552222	RTN1	Q16799	776 aa		15.76	■□□□□ 0.11
CS-231	ENST00000552222	TMEM184A	Q6ZMB5	413 aa		15.76	■□□□□ 0.11
CS-231	ENST00000552222	UBALD2	Q8IYN6	164 aa		15.76	■□□□□ 0.11
CS-231	ENST00000552222	INPP4A	Q96PE3	977 aa	Predicted RBP	15.76	■□□□□ 0.11
CS-231	ENST00000552222	PPP1R16B	Q96T49	567 aa		15.76	■□□□□ 0.11
CS-231	ENST00000552222	LZTS2	Q9BRK4	669 aa		15.76	■□□□□ 0.11
CS-231	ENST00000552222	LARP6	Q9BRS8	491 aa	Known RBP	15.76	■□□□□ 0.11
CS-231	ENST00000552222	RIOX1	Q9H6W3	641 aa		15.76	■□□□□ 0.11
CS-231	ENST00000552222	CWH43	Q9H720	699 aa		15.76	■□□□□ 0.11
CS-231	ENST00000552222	FAM217B	Q9NTX9	383 aa	Predicted RBP	15.76	■□□□□ 0.11
CS-231	ENST00000552222	ZNF215	Q9UL58	517 aa	Predicted RBP	15.76	■□□□□ 0.11
CS-231	ENST00000552222	LRFN2	Q9ULH4	789 aa		15.76	■□□□□ 0.11
CS-231	ENST00000552222	NAP1L2	Q9ULW6	460 aa	Predicted RBP	15.76	■□□□□ 0.11
CS-231	ENST00000552222	EP300	Q09472	2414 aa	Predicted RBP	15.76	■□□□□ 0.11

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