RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543658.5

DDB1-223, Transcript of damage specific DNA binding protein 1, human

TSL 4

Gene DDB1, Length 571 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DDB1-223	ENST00000543658	PPME1	Q9Y570	386 aa		13.25	□□□□□ -0.29
DDB1-223	ENST00000543658	COL1A2	P08123	1366 aa		13.24	□□□□□ -0.29
DDB1-223	ENST00000543658	ZNF862	O60290	1169 aa		13.24	□□□□□ -0.29
DDB1-223	ENST00000543658	USO1	O60763	962 aa	Known RBP	13.24	□□□□□ -0.29
DDB1-223	ENST00000543658	TFRC	P02786	760 aa	Known RBP	13.24	□□□□□ -0.29
DDB1-223	ENST00000543658	AFM	P43652	599 aa		13.24	□□□□□ -0.29
DDB1-223	ENST00000543658	POLG	P54098	1239 aa	Predicted RBP	13.24	□□□□□ -0.29
DDB1-223	ENST00000543658	PSMC6	P62333	389 aa		13.24	□□□□□ -0.29
DDB1-223	ENST00000543658	IRX5	P78411	483 aa	Predicted RBP	13.24	□□□□□ -0.29
DDB1-223	ENST00000543658	SNW1	Q13573	536 aa	Known RBP	13.24	□□□□□ -0.29
DDB1-223	ENST00000543658	E2F4	Q16254	413 aa		13.24	□□□□□ -0.29
DDB1-223	ENST00000543658	KIAA0753	Q2KHM9	967 aa		13.24	□□□□□ -0.29
DDB1-223	ENST00000543658	LONRF3	Q496Y0	759 aa		13.24	□□□□□ -0.29
DDB1-223	ENST00000543658	PLA2G4F	Q68DD2	849 aa		13.24	□□□□□ -0.29
DDB1-223	ENST00000543658	LHX8	Q68G74	356 aa		13.24	□□□□□ -0.29
DDB1-223	ENST00000543658	CXCL17	Q6UXB2	119 aa		13.24	□□□□□ -0.29
DDB1-223	ENST00000543658	KCNK18	Q7Z418	384 aa		13.24	□□□□□ -0.29
DDB1-223	ENST00000543658	GPBP1	Q86WP2	473 aa		13.24	□□□□□ -0.29
DDB1-223	ENST00000543658	KLHDC9	Q8NEP7	349 aa		13.24	□□□□□ -0.29
DDB1-223	ENST00000543658	ENGASE	Q8NFI3	743 aa		13.24	□□□□□ -0.29
DDB1-223	ENST00000543658	GLT1D1	Q96MS3	346 aa		13.24	□□□□□ -0.29
DDB1-223	ENST00000543658	JPH2	Q9BR39	696 aa	Predicted RBP	13.24	□□□□□ -0.29
DDB1-223	ENST00000543658	DNM1L	O00429	736 aa		13.23	□□□□□ -0.29
DDB1-223	ENST00000543658	CTAGE5	O15320	804 aa		13.23	□□□□□ -0.29
DDB1-223	ENST00000543658	ACTN4	O43707	911 aa	Known RBP	13.23	□□□□□ -0.29
DDB1-223	ENST00000543658	TRAK2	O60296	914 aa		13.23	□□□□□ -0.29
DDB1-223	ENST00000543658	MYL1	P05976	194 aa		13.23	□□□□□ -0.29
DDB1-223	ENST00000543658	GJB1	P08034	283 aa		13.23	□□□□□ -0.29
DDB1-223	ENST00000543658	GNAT1	P11488	350 aa		13.23	□□□□□ -0.29
DDB1-223	ENST00000543658	CAPN2	P17655	700 aa		13.23	□□□□□ -0.29
DDB1-223	ENST00000543658	RARRES1	P49788	294 aa		13.23	□□□□□ -0.29
DDB1-223	ENST00000543658	ACLY	P53396	1101 aa		13.23	□□□□□ -0.29
DDB1-223	ENST00000543658	IGBP1	P78318	339 aa		13.23	□□□□□ -0.29
DDB1-223	ENST00000543658	TBC1D8B	Q0IIM8	1120 aa		13.23	□□□□□ -0.29
DDB1-223	ENST00000543658	PPFIA1	Q13136	1202 aa		13.23	□□□□□ -0.29
DDB1-223	ENST00000543658	FAM47C	Q5HY64	1035 aa		13.23	□□□□□ -0.29
DDB1-223	ENST00000543658	ZNF484	Q5JVG2	852 aa		13.23	□□□□□ -0.29
DDB1-223	ENST00000543658	CCDC183	Q5T5S1	534 aa		13.23	□□□□□ -0.29
DDB1-223	ENST00000543658	CAVIN1	Q6NZI2	390 aa	Known RBP	13.23	□□□□□ -0.29
DDB1-223	ENST00000543658	ANO5	Q75V66	913 aa		13.23	□□□□□ -0.29
DDB1-223	ENST00000543658	C7orf31	Q8N865	590 aa		13.23	□□□□□ -0.29
DDB1-223	ENST00000543658	SYT2	Q8N9I0	419 aa	Predicted RBP	13.23	□□□□□ -0.29
DDB1-223	ENST00000543658	U2AF1L4	Q8WU68	220 aa	Known RBP	13.23	□□□□□ -0.29
DDB1-223	ENST00000543658	SLC7A3	Q8WY07	619 aa		13.23	□□□□□ -0.29
DDB1-223	ENST00000543658	ATP6V0A4	Q9HBG4	840 aa		13.23	□□□□□ -0.29
DDB1-223	ENST00000543658	CYP26B1	Q9NR63	512 aa		13.23	□□□□□ -0.29
DDB1-223	ENST00000543658	BLOC1S4	Q9NUP1	217 aa		13.23	□□□□□ -0.29
DDB1-223	ENST00000543658	KCND2	Q9NZV8	630 aa		13.23	□□□□□ -0.29
DDB1-223	ENST00000543658		A0A087WWV3	80 aa		13.22	□□□□□ -0.29
DDB1-223	ENST00000543658	RRN3P2	A6NIE6	340 aa		13.22	□□□□□ -0.29
DDB1-223	ENST00000543658	TBCA	O75347	108 aa	Known RBP	13.22	□□□□□ -0.29
DDB1-223	ENST00000543658	DGAT1	O75907	488 aa		13.22	□□□□□ -0.29
DDB1-223	ENST00000543658	SMC2	O95347	1197 aa		13.22	□□□□□ -0.29
DDB1-223	ENST00000543658	SGPL1	O95470	568 aa		13.22	□□□□□ -0.29
DDB1-223	ENST00000543658	ATP4A	P20648	1035 aa		13.22	□□□□□ -0.29
DDB1-223	ENST00000543658	RFC5	P40937	340 aa		13.22	□□□□□ -0.29
DDB1-223	ENST00000543658	SLC12A3	P55017	1021 aa		13.22	□□□□□ -0.29
DDB1-223	ENST00000543658	NPEPPS	P55786	919 aa		13.22	□□□□□ -0.29
DDB1-223	ENST00000543658	ASIC1	P78348	528 aa		13.22	□□□□□ -0.29
DDB1-223	ENST00000543658	POSTN	Q15063	836 aa		13.22	□□□□□ -0.29
DDB1-223	ENST00000543658	GRIK4	Q16099	956 aa		13.22	□□□□□ -0.29
DDB1-223	ENST00000543658	NAALADL2	Q58DX5	795 aa		13.22	□□□□□ -0.29
DDB1-223	ENST00000543658	PADI6	Q6TGC4	694 aa		13.22	□□□□□ -0.29
DDB1-223	ENST00000543658	RETREG2	Q8NC44	543 aa		13.22	□□□□□ -0.29
DDB1-223	ENST00000543658	STAM	Q92783	540 aa		13.22	□□□□□ -0.29
DDB1-223	ENST00000543658	PAGE5	Q96GU1	130 aa		13.22	□□□□□ -0.29
DDB1-223	ENST00000543658	MTR	Q99707	1265 aa		13.22	□□□□□ -0.29
DDB1-223	ENST00000543658	TIPIN	Q9BVW5	301 aa		13.22	□□□□□ -0.29
DDB1-223	ENST00000543658	NIFK	Q9BYG3	293 aa	Known RBP	13.22	□□□□□ -0.29
DDB1-223	ENST00000543658	RNPEP	Q9H4A4	650 aa		13.22	□□□□□ -0.29
DDB1-223	ENST00000543658	CLSTN2	Q9H4D0	955 aa		13.22	□□□□□ -0.29
DDB1-223	ENST00000543658	STARD7	Q9NQZ5	370 aa		13.22	□□□□□ -0.29
DDB1-223	ENST00000543658	KBTBD4	Q9NVX7	518 aa		13.22	□□□□□ -0.29
DDB1-223	ENST00000543658	OGDHL	Q9ULD0	1010 aa		13.22	□□□□□ -0.29
DDB1-223	ENST00000543658	NRCAM	Q92823	1304 aa		13.21	□□□□□ -0.29
DDB1-223	ENST00000543658		A0A0U1RQG5	324 aa	Predicted RBP	13.21	□□□□□ -0.29
DDB1-223	ENST00000543658	C17orf102	A2RUQ5	167 aa		13.21	□□□□□ -0.29
DDB1-223	ENST00000543658	TMEM150B	A6NC51	233 aa		13.21	□□□□□ -0.29
DDB1-223	ENST00000543658	ZBTB39	O15060	712 aa		13.21	□□□□□ -0.29
DDB1-223	ENST00000543658	MAGEB2	O15479	319 aa		13.21	□□□□□ -0.29
DDB1-223	ENST00000543658	GTPBP6	O43824	516 aa	Predicted RBP	13.21	□□□□□ -0.29
DDB1-223	ENST00000543658	GAS2	O43903	313 aa	Known RBP	13.21	□□□□□ -0.29
DDB1-223	ENST00000543658	SMIM10L2A	P0DMW4	78 aa		13.21	□□□□□ -0.29
DDB1-223	ENST00000543658	SMIM10L2B	P0DMW5	78 aa		13.21	□□□□□ -0.29
DDB1-223	ENST00000543658	INSRR	P14616	1297 aa		13.21	□□□□□ -0.29
DDB1-223	ENST00000543658	IDE	P14735	1019 aa		13.21	□□□□□ -0.29
DDB1-223	ENST00000543658	CAMK4	Q16566	473 aa		13.21	□□□□□ -0.29
DDB1-223	ENST00000543658	DYM	Q7RTS9	669 aa		13.21	□□□□□ -0.29
DDB1-223	ENST00000543658	ELOA2	Q8IYF1	753 aa	Predicted RBP	13.21	□□□□□ -0.29
DDB1-223	ENST00000543658	MCPH1	Q8NEM0	835 aa		13.21	□□□□□ -0.29
DDB1-223	ENST00000543658	DDX12P	Q92771	950 aa		13.21	□□□□□ -0.29
DDB1-223	ENST00000543658	KAT2B	Q92831	832 aa		13.21	□□□□□ -0.29
DDB1-223	ENST00000543658	SH2D3A	Q9BRG2	576 aa		13.21	□□□□□ -0.29
DDB1-223	ENST00000543658	ZHX3	Q9H4I2	956 aa		13.21	□□□□□ -0.29
DDB1-223	ENST00000543658		A0A1W2PQ45	241 aa	Predicted RBP	13.2	□□□□□ -0.3
DDB1-223	ENST00000543658		A0A1W2PQY0	241 aa		13.2	□□□□□ -0.3
DDB1-223	ENST00000543658	HAS3	O00219	553 aa		13.2	□□□□□ -0.3
DDB1-223	ENST00000543658	FAM13A	O94988	1023 aa		13.2	□□□□□ -0.3
DDB1-223	ENST00000543658	CYP11B2	P19099	503 aa		13.2	□□□□□ -0.3
DDB1-223	ENST00000543658	TMOD1	P28289	359 aa		13.2	□□□□□ -0.3

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