RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541990.5

THBS3-211, Transcript of thrombospondin 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene THBS3, Length 2,928 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THBS3-211ENST00000541990 RETREG2Q8NC44 543 aa10□□□□□ -0.81
THBS3-211ENST00000541990 TRIM9Q9C026 710 aa10□□□□□ -0.81
THBS3-211ENST00000541990 TMBIM4Q9HC24 238 aa10□□□□□ -0.81
THBS3-211ENST00000541990 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP10□□□□□ -0.81
THBS3-211ENST00000541990 A0A1W2PQJ5 194 aa10□□□□□ -0.81
THBS3-211ENST00000541990 PHF20L1A8MW92 1017 aa10□□□□□ -0.81
THBS3-211ENST00000541990 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
THBS3-211ENST00000541990 RPSAP08865 295 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
THBS3-211ENST00000541990 LMNB1P20700 586 aa10□□□□□ -0.81
THBS3-211ENST00000541990 KLRC1P26715 233 aa10□□□□□ -0.81
THBS3-211ENST00000541990 NF2P35240 595 aa10□□□□□ -0.81
THBS3-211ENST00000541990 HSD17B3P37058 310 aa10□□□□□ -0.81
THBS3-211ENST00000541990 UBA7P41226 1012 aa10□□□□□ -0.81
THBS3-211ENST00000541990 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
THBS3-211ENST00000541990 EHHADHQ08426 723 aa10□□□□□ -0.81
THBS3-211ENST00000541990 LETM2Q2VYF4 491 aa10□□□□□ -0.81
THBS3-211ENST00000541990 CFAP221Q4G0U5 840 aa10□□□□□ -0.81
THBS3-211ENST00000541990 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
THBS3-211ENST00000541990 WLSQ5T9L3 541 aa10□□□□□ -0.81
THBS3-211ENST00000541990 HGSNATQ68CP4 663 aa10□□□□□ -0.81
THBS3-211ENST00000541990 DTHD1Q6ZMT9 781 aa10□□□□□ -0.81
THBS3-211ENST00000541990 FAXDC2Q96IV6 333 aa10□□□□□ -0.81
THBS3-211ENST00000541990 ZNF341Q9BYN7 854 aa10□□□□□ -0.81
THBS3-211ENST00000541990 SWAP70Q9UH65 585 aa10□□□□□ -0.81
THBS3-211ENST00000541990 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa10□□□□□ -0.81
THBS3-211ENST00000541990 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa10□□□□□ -0.81
THBS3-211ENST00000541990 FAM170AA1A519 330 aa9.99□□□□□ -0.81
THBS3-211ENST00000541990 TLR2O60603 784 aa9.99□□□□□ -0.81
THBS3-211ENST00000541990 LCA5LO95447 670 aa9.99□□□□□ -0.81
THBS3-211ENST00000541990 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
THBS3-211ENST00000541990 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP9.99□□□□□ -0.81
THBS3-211ENST00000541990 PPP2R5AQ15172 486 aa9.99□□□□□ -0.81
THBS3-211ENST00000541990 CCDC121Q6ZUS5 278 aa9.99□□□□□ -0.81
THBS3-211ENST00000541990 RUBCNQ92622 972 aa9.99□□□□□ -0.81
THBS3-211ENST00000541990 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
THBS3-211ENST00000541990 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
THBS3-211ENST00000541990 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
THBS3-211ENST00000541990 MRIQ9BWK5 157 aa9.99□□□□□ -0.81
THBS3-211ENST00000541990 NDST4Q9H3R1 872 aa9.99□□□□□ -0.81
THBS3-211ENST00000541990 HOMER2Q9NSB8 354 aa9.99□□□□□ -0.81
THBS3-211ENST00000541990 MAST2Q6P0Q8 1798 aa9.99□□□□□ -0.81
THBS3-211ENST00000541990 H0YGN5 161 aa9.99□□□□□ -0.81
THBS3-211ENST00000541990 ENTPD3O75355 529 aa9.99□□□□□ -0.81
THBS3-211ENST00000541990 ZNF844Q08AG5 666 aa9.99□□□□□ -0.81
THBS3-211ENST00000541990 SNCBQ16143 134 aa9.99□□□□□ -0.81
THBS3-211ENST00000541990 QRICH1Q2TAL8 776 aa9.99□□□□□ -0.81
THBS3-211ENST00000541990 VWA3BQ502W6 1294 aa9.99□□□□□ -0.81
THBS3-211ENST00000541990 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
THBS3-211ENST00000541990 CD302Q8IX05 232 aa9.99□□□□□ -0.81
THBS3-211ENST00000541990 BLIDQ8IZY5 108 aa9.99□□□□□ -0.81
THBS3-211ENST00000541990 CPXCR1Q8N123 301 aa9.99□□□□□ -0.81
THBS3-211ENST00000541990 MREGQ8N565 214 aa9.99□□□□□ -0.81
THBS3-211ENST00000541990 ANKS1AQ92625 1134 aa9.99□□□□□ -0.81
THBS3-211ENST00000541990 WNK4Q96J92 1243 aa9.99□□□□□ -0.81
THBS3-211ENST00000541990 NOX5Q96PH1 765 aa9.99□□□□□ -0.81
THBS3-211ENST00000541990 ZNF408Q9H9D4 720 aa9.99□□□□□ -0.81
THBS3-211ENST00000541990 GPRC5DQ9NZD1 345 aa9.99□□□□□ -0.81
THBS3-211ENST00000541990 PCDHA6Q9UN73 950 aa9.99□□□□□ -0.81
THBS3-211ENST00000541990 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa9.99□□□□□ -0.81
THBS3-211ENST00000541990 NFS1Q9Y697 457 aa9.99□□□□□ -0.81
THBS3-211ENST00000541990 MYO3BQ8WXR4 1341 aa9.98□□□□□ -0.81
THBS3-211ENST00000541990 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa9.98□□□□□ -0.81
THBS3-211ENST00000541990 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
THBS3-211ENST00000541990 SCTRP47872 440 aa9.98□□□□□ -0.81
THBS3-211ENST00000541990 TRAPPC10P48553 1259 aa9.98□□□□□ -0.81
THBS3-211ENST00000541990 ARID5AQ03989 594 aa9.98□□□□□ -0.81
THBS3-211ENST00000541990 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
THBS3-211ENST00000541990 FIGNQ5HY92 759 aa9.98□□□□□ -0.81
THBS3-211ENST00000541990 EMC10Q5UCC4 262 aa9.98□□□□□ -0.81
THBS3-211ENST00000541990 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
THBS3-211ENST00000541990 MDM1Q8TC05 714 aa9.98□□□□□ -0.81
THBS3-211ENST00000541990 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
THBS3-211ENST00000541990 SEC16BQ96JE7 1060 aa9.98□□□□□ -0.81
THBS3-211ENST00000541990 WRNIP1Q96S55 665 aa9.98□□□□□ -0.81
THBS3-211ENST00000541990 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
THBS3-211ENST00000541990 PGAP2Q9UHJ9 254 aa9.98□□□□□ -0.81
THBS3-211ENST00000541990 QSER1Q2KHR3 1735 aa9.98□□□□□ -0.81
THBS3-211ENST00000541990 GMNCA6NCL1 334 aa9.98□□□□□ -0.81
THBS3-211ENST00000541990 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
THBS3-211ENST00000541990 PJA2O43164 708 aa9.98□□□□□ -0.81
THBS3-211ENST00000541990 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
THBS3-211ENST00000541990 TNNI2P48788 182 aa9.98□□□□□ -0.81
THBS3-211ENST00000541990 SPP2Q13103 211 aa9.98□□□□□ -0.81
THBS3-211ENST00000541990 LRRC41Q15345 812 aa9.98□□□□□ -0.81
THBS3-211ENST00000541990 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
THBS3-211ENST00000541990 PDXDC1Q6P996 788 aa9.98□□□□□ -0.81
THBS3-211ENST00000541990 TMEM179Q6ZVK1 233 aa9.98□□□□□ -0.81
THBS3-211ENST00000541990 RPAINQ86UA6 219 aa9.98□□□□□ -0.81
THBS3-211ENST00000541990 RAPGEF5Q92565 580 aa9.98□□□□□ -0.81
THBS3-211ENST00000541990 TBC1D31Q96DN5 1066 aa9.98□□□□□ -0.81
THBS3-211ENST00000541990 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
THBS3-211ENST00000541990 MTA3Q9BTC8 594 aa9.98□□□□□ -0.81
THBS3-211ENST00000541990 AP1M1Q9BXS5 423 aa9.98□□□□□ -0.81
THBS3-211ENST00000541990 TRAPPC3O43617 180 aa9.97□□□□□ -0.81
THBS3-211ENST00000541990 CDC25CP30307 473 aa9.97□□□□□ -0.81
THBS3-211ENST00000541990 CAP2P40123 477 aa9.97□□□□□ -0.81
THBS3-211ENST00000541990 CDR1P51861 262 aa9.97□□□□□ -0.81
THBS3-211ENST00000541990 KCNMA1Q12791 1236 aa9.97□□□□□ -0.81
THBS3-211ENST00000541990 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
THBS3-211ENST00000541990 BARHL2Q9NY43 387 aa9.97□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.2 ms