RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541280.1

SUDS3-202, Transcript of SDS3 homolog, SIN3A corepressor complex component, humanhuman

TSL 5

Gene SUDS3, Length 659 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUDS3-202ENST00000541280 CPLX3Q8WVH0 158 aa7.33□□□□□ -1.24
SUDS3-202ENST00000541280 FGD4Q96M96 766 aa7.33□□□□□ -1.24
SUDS3-202ENST00000541280 HYPKQ9NX55 129 aa7.33□□□□□ -1.24
SUDS3-202ENST00000541280 RNF123Q5XPI4 1314 aa7.32□□□□□ -1.24
SUDS3-202ENST00000541280 PXDNLA1KZ92 1463 aa7.32□□□□□ -1.24
SUDS3-202ENST00000541280 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa7.32□□□□□ -1.24
SUDS3-202ENST00000541280 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
SUDS3-202ENST00000541280 VAMP4O75379 141 aa7.32□□□□□ -1.24
SUDS3-202ENST00000541280 SRGNP10124 158 aa7.32□□□□□ -1.24
SUDS3-202ENST00000541280 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
SUDS3-202ENST00000541280 MYL6BP14649 208 aa7.32□□□□□ -1.24
SUDS3-202ENST00000541280 NPR1P16066 1061 aa7.32□□□□□ -1.24
SUDS3-202ENST00000541280 BMP7P18075 431 aa7.32□□□□□ -1.24
SUDS3-202ENST00000541280 CHRNA5P30532 468 aa7.32□□□□□ -1.24
SUDS3-202ENST00000541280 BICRALQ6AI39 1079 aa7.32□□□□□ -1.24
SUDS3-202ENST00000541280 KIAA1211LQ6NV74 962 aa7.32□□□□□ -1.24
SUDS3-202ENST00000541280 VHLLQ6RSH7 139 aa7.32□□□□□ -1.24
SUDS3-202ENST00000541280 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
SUDS3-202ENST00000541280 WDR63Q8IWG1 891 aa7.32□□□□□ -1.24
SUDS3-202ENST00000541280 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP7.32□□□□□ -1.24
SUDS3-202ENST00000541280 RNF38Q9H0F5 515 aa7.32□□□□□ -1.24
SUDS3-202ENST00000541280 ZCCHC4Q9H5U6 513 aa7.32□□□□□ -1.24
SUDS3-202ENST00000541280 CCSER2Q9H7U1 834 aa7.32□□□□□ -1.24
SUDS3-202ENST00000541280 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa7.32□□□□□ -1.24
SUDS3-202ENST00000541280 IL16Q14005 1332 aa7.31□□□□□ -1.24
SUDS3-202ENST00000541280 A0A1W2PQJ5 194 aa7.31□□□□□ -1.24
SUDS3-202ENST00000541280 C2orf71A6NGG8 1288 aa7.31□□□□□ -1.24
SUDS3-202ENST00000541280 STXBP3O00186 592 aa7.31□□□□□ -1.24
SUDS3-202ENST00000541280 PFKLP17858 780 aa7.31□□□□□ -1.24
SUDS3-202ENST00000541280 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
SUDS3-202ENST00000541280 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
SUDS3-202ENST00000541280 CTSWP56202 376 aa7.31□□□□□ -1.24
SUDS3-202ENST00000541280 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
SUDS3-202ENST00000541280 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
SUDS3-202ENST00000541280 HLFQ16534 295 aa7.31□□□□□ -1.24
SUDS3-202ENST00000541280 PPP2R5EQ16537 467 aa7.31□□□□□ -1.24
SUDS3-202ENST00000541280 SLC10A5Q5PT55 438 aa7.31□□□□□ -1.24
SUDS3-202ENST00000541280 CCDC30Q5VVM6 783 aa7.31□□□□□ -1.24
SUDS3-202ENST00000541280 COPS6Q7L5N1 327 aa7.31□□□□□ -1.24
SUDS3-202ENST00000541280 ZNF34Q8IZ26 560 aa7.31□□□□□ -1.24
SUDS3-202ENST00000541280 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
SUDS3-202ENST00000541280 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
SUDS3-202ENST00000541280 EMC9Q9Y3B6 208 aa7.31□□□□□ -1.24
SUDS3-202ENST00000541280 ITGB4P16144 1822 aa7.31□□□□□ -1.24
SUDS3-202ENST00000541280 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
SUDS3-202ENST00000541280 NCANO14594 1321 aa7.3□□□□□ -1.24
SUDS3-202ENST00000541280 DDX58O95786 925 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
SUDS3-202ENST00000541280 NAT2P11245 290 aa7.3□□□□□ -1.24
SUDS3-202ENST00000541280 SEPHS1P49903 392 aa7.3□□□□□ -1.24
SUDS3-202ENST00000541280 NCKAP1LP55160 1127 aa7.3□□□□□ -1.24
SUDS3-202ENST00000541280 TCIRG1Q13488 830 aa7.3□□□□□ -1.24
SUDS3-202ENST00000541280 TTLL7Q6ZT98 887 aa7.3□□□□□ -1.24
SUDS3-202ENST00000541280 LRP10Q7Z4F1 713 aa7.3□□□□□ -1.24
SUDS3-202ENST00000541280 RTKN2Q8IZC4 609 aa7.3□□□□□ -1.24
SUDS3-202ENST00000541280 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
SUDS3-202ENST00000541280 LINC01356Q8N9X3 169 aa7.3□□□□□ -1.24
SUDS3-202ENST00000541280 PLBD2Q8NHP8 589 aa7.3□□□□□ -1.24
SUDS3-202ENST00000541280 COPS5Q92905 334 aa7.3□□□□□ -1.24
SUDS3-202ENST00000541280 TSPAN17Q96FV3 270 aa7.3□□□□□ -1.24
SUDS3-202ENST00000541280 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
SUDS3-202ENST00000541280 MTA3Q9BTC8 594 aa7.3□□□□□ -1.24
SUDS3-202ENST00000541280 XYLT2Q9H1B5 865 aa7.3□□□□□ -1.24
SUDS3-202ENST00000541280 APEX2Q9UBZ4 518 aa7.3□□□□□ -1.24
SUDS3-202ENST00000541280 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
SUDS3-202ENST00000541280 COL24A1Q17RW2 1714 aa7.3□□□□□ -1.24
SUDS3-202ENST00000541280 KDM2BQ8NHM5 1336 aa7.29□□□□□ -1.24
SUDS3-202ENST00000541280 ATP10DQ9P241 1426 aa7.29□□□□□ -1.24
SUDS3-202ENST00000541280 SCN11AQ9UI33 1791 aa7.29□□□□□ -1.24
SUDS3-202ENST00000541280 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
SUDS3-202ENST00000541280 TACR1P25103 407 aa7.29□□□□□ -1.24
SUDS3-202ENST00000541280 C1QTNF8P60827 252 aa7.29□□□□□ -1.24
SUDS3-202ENST00000541280 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
SUDS3-202ENST00000541280 NCAPHQ15003 741 aa7.29□□□□□ -1.24
SUDS3-202ENST00000541280 DPY19L1Q2PZI1 675 aa7.29□□□□□ -1.24
SUDS3-202ENST00000541280 CRY2Q49AN0 593 aa7.29□□□□□ -1.24
SUDS3-202ENST00000541280 SUSD4Q5VX71 490 aa7.29□□□□□ -1.24
SUDS3-202ENST00000541280 NETO2Q8NC67 525 aa7.29□□□□□ -1.24
SUDS3-202ENST00000541280 PWWP2AQ96N64 755 aa7.29□□□□□ -1.24
SUDS3-202ENST00000541280 CRAMP1Q96RY5 1269 aa7.29□□□□□ -1.24
SUDS3-202ENST00000541280 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
SUDS3-202ENST00000541280 RTEL1Q9NZ71 1219 aa7.29□□□□□ -1.24
SUDS3-202ENST00000541280 AKT3Q9Y243 479 aa7.29□□□□□ -1.24
SUDS3-202ENST00000541280 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa7.29□□□□□ -1.24
SUDS3-202ENST00000541280 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa7.29□□□□□ -1.24
SUDS3-202ENST00000541280 F8W031 263 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
SUDS3-202ENST00000541280 BBOX1O75936 387 aa7.28□□□□□ -1.24
SUDS3-202ENST00000541280 PAMP19021 973 aa7.28□□□□□ -1.24
SUDS3-202ENST00000541280 PRR5P85299 388 aa7.28□□□□□ -1.24
SUDS3-202ENST00000541280 CCDC93Q567U6 631 aa7.28□□□□□ -1.24
SUDS3-202ENST00000541280 POMZP3Q6PJE2 187 aa7.28□□□□□ -1.24
SUDS3-202ENST00000541280 SP8Q8IXZ3 490 aa7.28□□□□□ -1.24
SUDS3-202ENST00000541280 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
SUDS3-202ENST00000541280 BVESQ8NE79 360 aa7.28□□□□□ -1.24
SUDS3-202ENST00000541280 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
SUDS3-202ENST00000541280 APBA2Q99767 749 aa7.28□□□□□ -1.24
SUDS3-202ENST00000541280 STK31Q9BXU1 1019 aa7.28□□□□□ -1.24
SUDS3-202ENST00000541280 VPS33BQ9H267 617 aa7.28□□□□□ -1.24
SUDS3-202ENST00000541280 RNF181Q9P0P0 153 aa7.28□□□□□ -1.24
SUDS3-202ENST00000541280 CHPF2Q9P2E5 772 aa7.28□□□□□ -1.24
SUDS3-202ENST00000541280 FBLN5Q9UBX5 448 aa7.28□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.6 ms