RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524095.5

CLVS1-211, Transcript of clavesin 1, humanhuman

TSL 3

Gene CLVS1, Length 709 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLVS1-211ENST00000524095 RIOX1Q9H6W3 641 aa8.49□□□□□ -1.05
CLVS1-211ENST00000524095 DLL3Q9NYJ7 618 aa8.49□□□□□ -1.05
CLVS1-211ENST00000524095 LRFN2Q9ULH4 789 aa8.49□□□□□ -1.05
CLVS1-211ENST00000524095 LZTS1Q9Y250 596 aa8.49□□□□□ -1.05
CLVS1-211ENST00000524095 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa8.49□□□□□ -1.05
CLVS1-211ENST00000524095 CCDC171Q6TFL3 1326 aa8.49□□□□□ -1.05
CLVS1-211ENST00000524095 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa8.49□□□□□ -1.05
CLVS1-211ENST00000524095 FRYLO94915 3013 aa8.48□□□□□ -1.05
CLVS1-211ENST00000524095 RRN3P2A6NIE6 340 aa8.48□□□□□ -1.05
CLVS1-211ENST00000524095 C9IYK1 514 aa8.48□□□□□ -1.05
CLVS1-211ENST00000524095 ZNF213O14771 459 aa8.48□□□□□ -1.05
CLVS1-211ENST00000524095 CYTH3O43739 400 aa8.48□□□□□ -1.05
CLVS1-211ENST00000524095 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
CLVS1-211ENST00000524095 LMNAP02545 664 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
CLVS1-211ENST00000524095 KCNA2P16389 499 aa8.48□□□□□ -1.05
CLVS1-211ENST00000524095 AOC1P19801 751 aa8.48□□□□□ -1.05
CLVS1-211ENST00000524095 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
CLVS1-211ENST00000524095 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
CLVS1-211ENST00000524095 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP8.48□□□□□ -1.05
CLVS1-211ENST00000524095 IQCA1Q86XH1 822 aa8.48□□□□□ -1.05
CLVS1-211ENST00000524095 DCLK2Q8N568 766 aa8.48□□□□□ -1.05
CLVS1-211ENST00000524095 KCNG4Q8TDN1 519 aa8.48□□□□□ -1.05
CLVS1-211ENST00000524095 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
CLVS1-211ENST00000524095 ADAM2Q99965 735 aa8.48□□□□□ -1.05
CLVS1-211ENST00000524095 MFSD1Q9H3U5 465 aa8.48□□□□□ -1.05
CLVS1-211ENST00000524095 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa8.48□□□□□ -1.05
CLVS1-211ENST00000524095 ERVK-5Q9HDB9 667 aa8.48□□□□□ -1.05
CLVS1-211ENST00000524095 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
CLVS1-211ENST00000524095 RGS18Q9NS28 235 aa8.48□□□□□ -1.05
CLVS1-211ENST00000524095 ERAP1Q9NZ08 941 aa8.48□□□□□ -1.05
CLVS1-211ENST00000524095 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
CLVS1-211ENST00000524095 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
CLVS1-211ENST00000524095 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa8.48□□□□□ -1.05
CLVS1-211ENST00000524095 TRPV2Q9Y5S1 764 aa8.48□□□□□ -1.05
CLVS1-211ENST00000524095 KMT2EQ8IZD2 1858 aa8.48□□□□□ -1.05
CLVS1-211ENST00000524095 ZMYM6O95789 1325 aa8.48□□□□□ -1.05
CLVS1-211ENST00000524095 FRMPD4Q14CM0 1322 aa8.48□□□□□ -1.05
CLVS1-211ENST00000524095 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa8.48□□□□□ -1.05
CLVS1-211ENST00000524095 TTC3P53804 2025 aa8.47□□□□□ -1.05
CLVS1-211ENST00000524095 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
CLVS1-211ENST00000524095 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa8.47□□□□□ -1.05
CLVS1-211ENST00000524095 FSD2A1L4K1 749 aa8.47□□□□□ -1.05
CLVS1-211ENST00000524095 C2orf71A6NGG8 1288 aa8.47□□□□□ -1.05
CLVS1-211ENST00000524095 FGFR1P11362 822 aa8.47□□□□□ -1.05
CLVS1-211ENST00000524095 ITIH3Q06033 890 aa8.47□□□□□ -1.05
CLVS1-211ENST00000524095 PAK2Q13177 524 aa8.47□□□□□ -1.05
CLVS1-211ENST00000524095 SEC23AQ15436 765 aa8.47□□□□□ -1.05
CLVS1-211ENST00000524095 TPRNQ4KMQ1 711 aa8.47□□□□□ -1.05
CLVS1-211ENST00000524095 CES5AQ6NT32 575 aa8.47□□□□□ -1.05
CLVS1-211ENST00000524095 USP17L6PQ6QN14 398 aa8.47□□□□□ -1.05
CLVS1-211ENST00000524095 SLC24A5Q71RS6 500 aa8.47□□□□□ -1.05
CLVS1-211ENST00000524095 TMC7Q7Z402 723 aa8.47□□□□□ -1.05
CLVS1-211ENST00000524095 HOMER1Q86YM7 354 aa8.47□□□□□ -1.05
CLVS1-211ENST00000524095 NME8Q8N427 588 aa8.47□□□□□ -1.05
CLVS1-211ENST00000524095 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa8.47□□□□□ -1.05
CLVS1-211ENST00000524095 CASP10Q92851 521 aa8.47□□□□□ -1.05
CLVS1-211ENST00000524095 GLG1Q92896 1179 aa8.47□□□□□ -1.05
CLVS1-211ENST00000524095 NECTIN4Q96NY8 510 aa8.47□□□□□ -1.05
CLVS1-211ENST00000524095 CASD1Q96PB1 797 aa8.47□□□□□ -1.05
CLVS1-211ENST00000524095 SEMA4AQ9H3S1 761 aa8.47□□□□□ -1.05
CLVS1-211ENST00000524095 RNF19AQ9NV58 838 aa8.47□□□□□ -1.05
CLVS1-211ENST00000524095 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa8.47□□□□□ -1.05
CLVS1-211ENST00000524095 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa8.47□□□□□ -1.05
CLVS1-211ENST00000524095 R4GN57 208 aa8.47□□□□□ -1.05
CLVS1-211ENST00000524095 MEIS2O14770 477 aa8.46□□□□□ -1.06
CLVS1-211ENST00000524095 CXCL14O95715 111 aa8.46□□□□□ -1.06
CLVS1-211ENST00000524095 SRGAP2BP0DMP2 458 aa8.46□□□□□ -1.06
CLVS1-211ENST00000524095 ITGB5P18084 799 aa8.46□□□□□ -1.06
CLVS1-211ENST00000524095 PBX3P40426 434 aa8.46□□□□□ -1.06
CLVS1-211ENST00000524095 MTHFRP42898 656 aa8.46□□□□□ -1.06
CLVS1-211ENST00000524095 PDE1AP54750 535 aa8.46□□□□□ -1.06
CLVS1-211ENST00000524095 KRT76Q01546 638 aa8.46□□□□□ -1.06
CLVS1-211ENST00000524095 PLCB4Q15147 1175 aa8.46□□□□□ -1.06
CLVS1-211ENST00000524095 ATAT1Q5SQI0 421 aa8.46□□□□□ -1.06
CLVS1-211ENST00000524095 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
CLVS1-211ENST00000524095 PCNX4Q63HM2 1172 aa8.46□□□□□ -1.06
CLVS1-211ENST00000524095 KCNT2Q6UVM3 1135 aa8.46□□□□□ -1.06
CLVS1-211ENST00000524095 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa8.46□□□□□ -1.06
CLVS1-211ENST00000524095 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
CLVS1-211ENST00000524095 TMEM40Q8WWA1 233 aa8.46□□□□□ -1.06
CLVS1-211ENST00000524095 RTP3Q9BQQ7 232 aa8.46□□□□□ -1.06
CLVS1-211ENST00000524095 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa8.46□□□□□ -1.06
CLVS1-211ENST00000524095 SENP2Q9HC62 589 aa8.46□□□□□ -1.06
CLVS1-211ENST00000524095 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa8.46□□□□□ -1.06
CLVS1-211ENST00000524095 CYP26B1Q9NR63 512 aa8.46□□□□□ -1.06
CLVS1-211ENST00000524095 USTQ9Y2C2 406 aa8.46□□□□□ -1.06
CLVS1-211ENST00000524095 ZNF292O60281 2723 aa8.46□□□□□ -1.06
CLVS1-211ENST00000524095 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa8.46□□□□□ -1.06
CLVS1-211ENST00000524095 NCOR2Q9Y618 2525 aa8.45□□□□□ -1.06
CLVS1-211ENST00000524095 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa8.45□□□□□ -1.06
CLVS1-211ENST00000524095 RPS6KA5O75582 802 aa8.45□□□□□ -1.06
CLVS1-211ENST00000524095 EOMESO95936 686 aa8.45□□□□□ -1.06
CLVS1-211ENST00000524095 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
CLVS1-211ENST00000524095 LAG3P18627 525 aa8.45□□□□□ -1.06
CLVS1-211ENST00000524095 PDE4AP27815 886 aa8.45□□□□□ -1.06
CLVS1-211ENST00000524095 NT5C2P49902 561 aa8.45□□□□□ -1.06
CLVS1-211ENST00000524095 KRT17Q04695 432 aa8.45□□□□□ -1.06
CLVS1-211ENST00000524095 TDGQ13569 410 aa8.45□□□□□ -1.06
CLVS1-211ENST00000524095 DSC3Q14574 896 aa8.45□□□□□ -1.06
CLVS1-211ENST00000524095 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26 ms