RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522928.1

CLVS1-209, Transcript of clavesin 1, humanhuman

TSL 2

Gene CLVS1, Length 464 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLVS1-209ENST00000522928 C16orf92Q96LL3 132 aa5.51□□□□□ -1.53
CLVS1-209ENST00000522928 ZCCHC4Q9H5U6 513 aa5.51□□□□□ -1.53
CLVS1-209ENST00000522928 OXSMQ9NWU1 459 aa5.51□□□□□ -1.53
CLVS1-209ENST00000522928 UCKL1Q9NWZ5 548 aa5.51□□□□□ -1.53
CLVS1-209ENST00000522928 CUX1P39880 1505 aa5.51□□□□□ -1.53
CLVS1-209ENST00000522928 WDR97A6NE52 1622 aa5.51□□□□□ -1.53
CLVS1-209ENST00000522928 CEP170Q5SW79 1584 aa5.5□□□□□ -1.53
CLVS1-209ENST00000522928 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
CLVS1-209ENST00000522928 TGM5O43548 720 aa5.5□□□□□ -1.53
CLVS1-209ENST00000522928 B4GALT3O60512 393 aa5.5□□□□□ -1.53
CLVS1-209ENST00000522928 CHGBP05060 677 aa5.5□□□□□ -1.53
CLVS1-209ENST00000522928 TMEM132BQ14DG7 1078 aa5.5□□□□□ -1.53
CLVS1-209ENST00000522928 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
CLVS1-209ENST00000522928 ARHGAP44Q17R89 818 aa5.5□□□□□ -1.53
CLVS1-209ENST00000522928 FRMD5Q7Z6J6 570 aa5.5□□□□□ -1.53
CLVS1-209ENST00000522928 RNF180Q86T96 592 aa5.5□□□□□ -1.53
CLVS1-209ENST00000522928 SP8Q8IXZ3 490 aa5.5□□□□□ -1.53
CLVS1-209ENST00000522928 GBP4Q96PP9 640 aa5.5□□□□□ -1.53
CLVS1-209ENST00000522928 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
CLVS1-209ENST00000522928 INCENPQ9NQS7 918 aa5.5□□□□□ -1.53
CLVS1-209ENST00000522928 GALNT8Q9NY28 637 aa5.5□□□□□ -1.53
CLVS1-209ENST00000522928 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa5.5□□□□□ -1.53
CLVS1-209ENST00000522928 KRT37O76014 449 aa5.49□□□□□ -1.53
CLVS1-209ENST00000522928 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
CLVS1-209ENST00000522928 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
CLVS1-209ENST00000522928 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa5.49□□□□□ -1.53
CLVS1-209ENST00000522928 Q6ZUG5 572 aa5.49□□□□□ -1.53
CLVS1-209ENST00000522928 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
CLVS1-209ENST00000522928 STRA8Q7Z7C7 330 aa5.49□□□□□ -1.53
CLVS1-209ENST00000522928 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
CLVS1-209ENST00000522928 KIAA1958Q8N8K9 716 aa5.49□□□□□ -1.53
CLVS1-209ENST00000522928 SMC1BQ8NDV3 1235 aa5.49□□□□□ -1.53
CLVS1-209ENST00000522928 CHTF18Q8WVB6 975 aa5.49□□□□□ -1.53
CLVS1-209ENST00000522928 KATNBL1Q9H079 304 aa5.49□□□□□ -1.53
CLVS1-209ENST00000522928 ZMAT4Q9H898 229 aa5.49□□□□□ -1.53
CLVS1-209ENST00000522928 RTEL1Q9NZ71 1219 aa5.49□□□□□ -1.53
CLVS1-209ENST00000522928 PTPN22Q9Y2R2 807 aa5.49□□□□□ -1.53
CLVS1-209ENST00000522928 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
CLVS1-209ENST00000522928 TSPOAP1O95153 1857 aa5.49□□□□□ -1.53
CLVS1-209ENST00000522928 NCANO14594 1321 aa5.48□□□□□ -1.53
CLVS1-209ENST00000522928 GRIN2AQ12879 1464 aa5.48□□□□□ -1.53
CLVS1-209ENST00000522928 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa5.48□□□□□ -1.53
CLVS1-209ENST00000522928 C9orf118A6NHY6 69 aa5.48□□□□□ -1.53
CLVS1-209ENST00000522928 PDE8AO60658 829 aa5.48□□□□□ -1.53
CLVS1-209ENST00000522928 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
CLVS1-209ENST00000522928 SLC9A1P19634 815 aa5.48□□□□□ -1.53
CLVS1-209ENST00000522928 ECE1P42892 770 aa5.48□□□□□ -1.53
CLVS1-209ENST00000522928 MASP1P48740 699 aa5.48□□□□□ -1.53
CLVS1-209ENST00000522928 NEK4P51957 841 aa5.48□□□□□ -1.53
CLVS1-209ENST00000522928 KIF11P52732 1056 aa5.48□□□□□ -1.53
CLVS1-209ENST00000522928 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa5.48□□□□□ -1.53
CLVS1-209ENST00000522928 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
CLVS1-209ENST00000522928 AJUBAQ96IF1 538 aa5.48□□□□□ -1.53
CLVS1-209ENST00000522928 SSBP3Q9BWW4 388 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
CLVS1-209ENST00000522928 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa5.48□□□□□ -1.53
CLVS1-209ENST00000522928 ADAM29Q9UKF5 820 aa5.48□□□□□ -1.53
CLVS1-209ENST00000522928 ASB1Q9Y576 335 aa5.48□□□□□ -1.53
CLVS1-209ENST00000522928 SPO11Q9Y5K1 396 aa5.48□□□□□ -1.53
CLVS1-209ENST00000522928 KDM6BO15054 1643 aa5.48□□□□□ -1.53
CLVS1-209ENST00000522928 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
CLVS1-209ENST00000522928 MROH6A6NGR9 719 aa5.47□□□□□ -1.53
CLVS1-209ENST00000522928 PRRG2O14669 202 aa5.47□□□□□ -1.53
CLVS1-209ENST00000522928 SASH1O94885 1247 aa5.47□□□□□ -1.53
CLVS1-209ENST00000522928 CSF2RBP32927 897 aa5.47□□□□□ -1.53
CLVS1-209ENST00000522928 FLT3P36888 993 aa5.47□□□□□ -1.53
CLVS1-209ENST00000522928 FNTBP49356 437 aa5.47□□□□□ -1.53
CLVS1-209ENST00000522928 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
CLVS1-209ENST00000522928 CD83Q01151 205 aa5.47□□□□□ -1.53
CLVS1-209ENST00000522928 NFATC3Q12968 1075 aa5.47□□□□□ -1.53
CLVS1-209ENST00000522928 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP5.47□□□□□ -1.53
CLVS1-209ENST00000522928 FERMT3Q86UX7 667 aa5.47□□□□□ -1.53
CLVS1-209ENST00000522928 WRNIP1Q96S55 665 aa5.47□□□□□ -1.53
CLVS1-209ENST00000522928 BTBD2Q9BX70 525 aa5.47□□□□□ -1.53
CLVS1-209ENST00000522928 SEMA4AQ9H3S1 761 aa5.47□□□□□ -1.53
CLVS1-209ENST00000522928 MS4A5Q9H3V2 200 aa5.47□□□□□ -1.53
CLVS1-209ENST00000522928 L2HGDHQ9H9P8 463 aa5.47□□□□□ -1.53
CLVS1-209ENST00000522928 CABP5Q9NP86 173 aa5.47□□□□□ -1.53
CLVS1-209ENST00000522928 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa5.46□□□□□ -1.54
CLVS1-209ENST00000522928 LCHNA4D1U4 455 aa5.46□□□□□ -1.54
CLVS1-209ENST00000522928 BPIP17213 487 aa5.46□□□□□ -1.54
CLVS1-209ENST00000522928 ADCYAP1R1P41586 468 aa5.46□□□□□ -1.54
CLVS1-209ENST00000522928 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
CLVS1-209ENST00000522928 EP400NLQ6ZTU2 488 aa5.46□□□□□ -1.54
CLVS1-209ENST00000522928 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP5.46□□□□□ -1.54
CLVS1-209ENST00000522928 PPM1KQ8N3J5 372 aa5.46□□□□□ -1.54
CLVS1-209ENST00000522928 UBR7Q8N806 425 aa5.46□□□□□ -1.54
CLVS1-209ENST00000522928 LCORQ96JN0 433 aaPredicted RBP5.46□□□□□ -1.54
CLVS1-209ENST00000522928 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP5.46□□□□□ -1.54
CLVS1-209ENST00000522928 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP5.46□□□□□ -1.54
CLVS1-209ENST00000522928 TMEM168Q9H0V1 697 aa5.46□□□□□ -1.54
CLVS1-209ENST00000522928 OR10A5Q9H207 317 aa5.46□□□□□ -1.54
CLVS1-209ENST00000522928 ACSS2Q9NR19 701 aa5.46□□□□□ -1.54
CLVS1-209ENST00000522928 SPTLC3Q9NUV7 552 aa5.46□□□□□ -1.54
CLVS1-209ENST00000522928 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
CLVS1-209ENST00000522928 MAPRE3Q9UPY8 281 aa5.46□□□□□ -1.54
CLVS1-209ENST00000522928 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa5.45□□□□□ -1.54
CLVS1-209ENST00000522928 H0Y858 1186 aa5.45□□□□□ -1.54
CLVS1-209ENST00000522928 HIP1RO75146 1068 aa5.45□□□□□ -1.54
CLVS1-209ENST00000522928 MAFO75444 373 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
CLVS1-209ENST00000522928 CYP7B1O75881 506 aa5.45□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.3 ms