RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519076.5

TRPS1-208, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TRPS1, Length 3,329 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-208ENST00000519076 GYPCP04921 128 aa8.58□□□□□ -1.04
TRPS1-208ENST00000519076 RPL13P26373 211 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
TRPS1-208ENST00000519076 KIF5AQ12840 1032 aa8.58□□□□□ -1.04
TRPS1-208ENST00000519076 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
TRPS1-208ENST00000519076 CCDC51Q96ER9 411 aa8.58□□□□□ -1.04
TRPS1-208ENST00000519076 NUP58Q9BVL2 599 aa8.58□□□□□ -1.04
TRPS1-208ENST00000519076 WDR11Q9BZH6 1224 aa8.58□□□□□ -1.04
TRPS1-208ENST00000519076 JADE2Q9NQC1 790 aa8.58□□□□□ -1.04
TRPS1-208ENST00000519076 HOMER3Q9NSC5 361 aa8.58□□□□□ -1.04
TRPS1-208ENST00000519076 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
TRPS1-208ENST00000519076 CSADQ9Y600 493 aa8.58□□□□□ -1.04
TRPS1-208ENST00000519076 ZNF831Q5JPB2 1677 aa8.58□□□□□ -1.04
TRPS1-208ENST00000519076 CTAGE9A4FU28 777 aa8.57□□□□□ -1.04
TRPS1-208ENST00000519076 CCDC169A6NNP5 214 aa8.57□□□□□ -1.04
TRPS1-208ENST00000519076 NFIBO00712 420 aa8.57□□□□□ -1.04
TRPS1-208ENST00000519076 KRT86O43790 486 aa8.57□□□□□ -1.04
TRPS1-208ENST00000519076 CYP2J2P51589 502 aa8.57□□□□□ -1.04
TRPS1-208ENST00000519076 CLCN6P51797 869 aa8.57□□□□□ -1.04
TRPS1-208ENST00000519076 USP14P54578 494 aa8.57□□□□□ -1.04
TRPS1-208ENST00000519076 PSMC6P62333 389 aa8.57□□□□□ -1.04
TRPS1-208ENST00000519076 KRT83P78385 493 aa8.57□□□□□ -1.04
TRPS1-208ENST00000519076 MAN2A1Q16706 1144 aa8.57□□□□□ -1.04
TRPS1-208ENST00000519076 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
TRPS1-208ENST00000519076 TTI2Q6NXR4 508 aa8.57□□□□□ -1.04
TRPS1-208ENST00000519076 RNF207Q6ZRF8 634 aa8.57□□□□□ -1.04
TRPS1-208ENST00000519076 SPATA21Q7Z572 469 aa8.57□□□□□ -1.04
TRPS1-208ENST00000519076 NLRX1Q86UT6 975 aa8.57□□□□□ -1.04
TRPS1-208ENST00000519076 KIAA0895Q8NCT3 520 aa8.57□□□□□ -1.04
TRPS1-208ENST00000519076 GLIS3Q8NEA6 775 aa8.57□□□□□ -1.04
TRPS1-208ENST00000519076 PARD3BQ8TEW8 1205 aa8.57□□□□□ -1.04
TRPS1-208ENST00000519076 SAAL1Q96ER3 474 aa8.57□□□□□ -1.04
TRPS1-208ENST00000519076 PANX2Q96RD6 677 aa8.57□□□□□ -1.04
TRPS1-208ENST00000519076 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
TRPS1-208ENST00000519076 ABHD10Q9NUJ1 306 aa8.57□□□□□ -1.04
TRPS1-208ENST00000519076 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
TRPS1-208ENST00000519076 KLRC4O43908 158 aa8.57□□□□□ -1.04
TRPS1-208ENST00000519076 EPB41P11171 864 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
TRPS1-208ENST00000519076 SREBF1P36956 1147 aa8.57□□□□□ -1.04
TRPS1-208ENST00000519076 CYP27A1Q02318 531 aa8.57□□□□□ -1.04
TRPS1-208ENST00000519076 LRRC63Q05C16 580 aa8.57□□□□□ -1.04
TRPS1-208ENST00000519076 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa8.57□□□□□ -1.04
TRPS1-208ENST00000519076 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
TRPS1-208ENST00000519076 KRT26Q7Z3Y9 468 aa8.57□□□□□ -1.04
TRPS1-208ENST00000519076 CHP1Q99653 195 aa8.57□□□□□ -1.04
TRPS1-208ENST00000519076 TRIM7Q9C029 511 aa8.57□□□□□ -1.04
TRPS1-208ENST00000519076 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
TRPS1-208ENST00000519076 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP8.57□□□□□ -1.04
TRPS1-208ENST00000519076 KLK7P49862 253 aa8.57□□□□□ -1.04
TRPS1-208ENST00000519076 IFT88Q13099 833 aa8.57□□□□□ -1.04
TRPS1-208ENST00000519076 MTMR1Q13613 665 aa8.57□□□□□ -1.04
TRPS1-208ENST00000519076 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa8.57□□□□□ -1.04
TRPS1-208ENST00000519076 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
TRPS1-208ENST00000519076 GADL1Q6ZQY3 521 aa8.57□□□□□ -1.04
TRPS1-208ENST00000519076 ANKRD35Q8N283 1001 aa8.57□□□□□ -1.04
TRPS1-208ENST00000519076 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
TRPS1-208ENST00000519076 RNF146Q9NTX7 359 aa8.57□□□□□ -1.04
TRPS1-208ENST00000519076 CASZ1Q86V15 1759 aa8.56□□□□□ -1.04
TRPS1-208ENST00000519076 CHUKO15111 745 aa8.56□□□□□ -1.04
TRPS1-208ENST00000519076 WDR46O15213 610 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
TRPS1-208ENST00000519076 CALUO43852 315 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
TRPS1-208ENST00000519076 TUBB4AP04350 444 aa8.56□□□□□ -1.04
TRPS1-208ENST00000519076 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
TRPS1-208ENST00000519076 RPS12P25398 132 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
TRPS1-208ENST00000519076 RPA1P27694 616 aa8.56□□□□□ -1.04
TRPS1-208ENST00000519076 CHMP4BP1P59074 171 aa8.56□□□□□ -1.04
TRPS1-208ENST00000519076 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
TRPS1-208ENST00000519076 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
TRPS1-208ENST00000519076 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
TRPS1-208ENST00000519076 ECM1Q16610 540 aa8.56□□□□□ -1.04
TRPS1-208ENST00000519076 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
TRPS1-208ENST00000519076 VWA3BQ502W6 1294 aa8.56□□□□□ -1.04
TRPS1-208ENST00000519076 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa8.56□□□□□ -1.04
TRPS1-208ENST00000519076 FBXO41Q8TF61 875 aa8.56□□□□□ -1.04
TRPS1-208ENST00000519076 LPAR1Q92633 364 aa8.56□□□□□ -1.04
TRPS1-208ENST00000519076 ATG4CQ96DT6 458 aa8.56□□□□□ -1.04
TRPS1-208ENST00000519076 NACC1Q96RE7 527 aa8.56□□□□□ -1.04
TRPS1-208ENST00000519076 REEP2Q9BRK0 252 aa8.56□□□□□ -1.04
TRPS1-208ENST00000519076 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa8.56□□□□□ -1.04
TRPS1-208ENST00000519076 RNF181Q9P0P0 153 aa8.56□□□□□ -1.04
TRPS1-208ENST00000519076 STK24Q9Y6E0 443 aa8.56□□□□□ -1.04
TRPS1-208ENST00000519076 RSPH10B2B2RC85 870 aa8.56□□□□□ -1.04
TRPS1-208ENST00000519076 NFKBIEO00221 500 aa8.56□□□□□ -1.04
TRPS1-208ENST00000519076 EXOC3O60645 756 aa8.56□□□□□ -1.04
TRPS1-208ENST00000519076 RSPH10BP0C881 870 aa8.56□□□□□ -1.04
TRPS1-208ENST00000519076 ARP10275 920 aa8.56□□□□□ -1.04
TRPS1-208ENST00000519076 PYGBP11216 843 aa8.56□□□□□ -1.04
TRPS1-208ENST00000519076 CYP11B2P19099 503 aa8.56□□□□□ -1.04
TRPS1-208ENST00000519076 KCNA3P22001 575 aa8.56□□□□□ -1.04
TRPS1-208ENST00000519076 RPS6P62753 249 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
TRPS1-208ENST00000519076 XKR9Q5GH70 373 aa8.56□□□□□ -1.04
TRPS1-208ENST00000519076 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa8.56□□□□□ -1.04
TRPS1-208ENST00000519076 FKBP1CQ5VVH2 108 aa8.56□□□□□ -1.04
TRPS1-208ENST00000519076 RAD9BQ6WBX8 426 aa8.56□□□□□ -1.04
TRPS1-208ENST00000519076 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
TRPS1-208ENST00000519076 CAPZA3Q96KX2 299 aa8.56□□□□□ -1.04
TRPS1-208ENST00000519076 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
TRPS1-208ENST00000519076 SEMA6BQ9H3T3 888 aa8.56□□□□□ -1.04
TRPS1-208ENST00000519076 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
TRPS1-208ENST00000519076 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
TRPS1-208ENST00000519076 CDR1P51861 262 aa8.55□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 113.7 ms