RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515159.5

SLC38A9-222, Transcript of solute carrier family 38 member 9, human

TSL 2

Gene SLC38A9, Length 3,509 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SLC38A9-222	ENST00000515159	PLAGL2	Q9UPG8	496 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	RIPOR2	Q9Y4F9	1068 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	SRPRB	Q9Y5M8	271 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	COL4A4	P53420	1690 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	TTC26	A0AVF1	554 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	FRMD3	A2A2Y4	597 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	DNAJC6	O75061	913 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	TACC1	O75410	805 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	TMCC1	O94876	653 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	UBOX5	O94941	541 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	GSTT1	P30711	240 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	RAP1GDS1	P52306	607 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	RCAN1	P53805	252 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	AP1B1	Q10567	949 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	MSLN	Q13421	630 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	MFSD10	Q14728	455 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	PDIA6	Q15084	440 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	RHBDF2	Q6PJF5	856 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	ZNF554	Q86TJ5	538 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	RNF10	Q8N5U6	811 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	METTL25	Q8N6Q8	603 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	RETREG2	Q8NC44	543 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	SUPT20H	Q8NEM7	779 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	ADAMTS16	Q8TE57	1224 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	LENG1	Q96BZ8	264 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	AGBL1	Q96MI9	1066 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	LZTFL1	Q9NQ48	299 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	SH3GLB1	Q9Y371	365 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	SNX9	Q9Y5X1	595 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	UMODL1	Q5DID0	1318 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	LOC285556	D6RIA3	1793 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	NKRF	O15226	690 aa	Known RBP eCLIP	4.9	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	TTI1	O43156	1089 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	FUT4	P22083	530 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	USP46	P62068	366 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	CUL1	Q13616	776 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	NAA25	Q14CX7	972 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	GJC2	Q5T442	439 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	UBAP2	Q5T6F2	1119 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	DEPDC1	Q5TB30	811 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	SGMS1	Q86VZ5	419 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	COL23A1	Q86Y22	540 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	ARHGAP18	Q8N392	663 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	NAT14	Q8WUY8	206 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	RUFY2	Q8WXA3	655 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	LPIN2	Q92539	896 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	SYN2	Q92777	582 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	CCDC114	Q96M63	670 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	BIRC8	Q96P09	236 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	GSDMA	Q96QA5	445 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	CTAGE1	Q96RT6	745 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	DUSP9	Q99956	384 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	UNC45A	Q9H3U1	944 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	RMI1	Q9H9A7	625 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	CABP2	Q9NPB3	220 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	TIMMDC1	Q9NPL8	285 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	ARHGAP20	Q9P2F6	1191 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	ZRANB1	Q9UGI0	708 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	PADI4	Q9UM07	663 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	NEU2	Q9Y3R4	380 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	ATP6V0A2	Q9Y487	856 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	DUSP10	Q9Y6W6	482 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	ADGRA3	Q8IWK6	1321 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	DICER1	Q9UPY3	1922 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	STRC	Q7RTU9	1775 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	ZSCAN5C	A6NGD5	496 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	BECN2	A8MW95	431 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159		F6X3S4	739 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	IGF2BP3	O00425	579 aa	Known RBP eCLIP	4.9	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	TBC1D12	O60347	775 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	VCAM1	P19320	739 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	RDX	P35241	583 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	RFC5	P40937	340 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	MCL1	Q07820	350 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	NONO	Q15233	471 aa	Known RBP eCLIP	4.9	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	SAFB	Q15424	915 aa	Known RBP eCLIP	4.9	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	LIN52	Q52LA3	116 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	SPECC1	Q5M775	1068 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	TTI2	Q6NXR4	508 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	PI16	Q6UXB8	463 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	SND1	Q7KZF4	910 aa	Known RBP eCLIP	4.9	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	EXOC8	Q8IYI6	725 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	MB21D1	Q8N884	522 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	SLCO2A1	Q92959	643 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	MS4A3	Q96HJ5	214 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	RANBP9	Q96S59	729 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	SRPK1	Q96SB4	655 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	CRISPLD2	Q9H0B8	497 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	ZCWPW1	Q9H0M4	648 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	GRHL1	Q9NZI5	618 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	CEP131	Q9UPN4	1083 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	PLAA	Q9Y263	795 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	SPATA31A5	Q5VU36	1347 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	SPATA31A6	Q5VVP1	1343 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	SPATA31A7	Q8IWB4	1347 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159		A0A0G2JS52	829 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SLC38A9-222	ENST00000515159	UNCX	A6NJT0	531 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SLC38A9-222	ENST00000515159	CREB3	O43889	395 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SLC38A9-222	ENST00000515159	IL17A	Q16552	155 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SLC38A9-222	ENST00000515159	FAM209A	Q5JX71	171 aa		4.9	□□□□□ -1.63

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