RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513522.5

CCSER1-211, Transcript of coiled-coil serine rich protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene CCSER1, Length 605 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER1-211ENST00000513522 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
CCSER1-211ENST00000513522 ANKS1AQ92625 1134 aa4.86□□□□□ -1.63
CCSER1-211ENST00000513522 CHMP4CQ96CF2 233 aa4.86□□□□□ -1.63
CCSER1-211ENST00000513522 HHIPL1Q96JK4 782 aa4.86□□□□□ -1.63
CCSER1-211ENST00000513522 CAPNS2Q96L46 248 aa4.86□□□□□ -1.63
CCSER1-211ENST00000513522 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
CCSER1-211ENST00000513522 NEK1Q96PY6 1258 aa4.86□□□□□ -1.63
CCSER1-211ENST00000513522 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
CCSER1-211ENST00000513522 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
CCSER1-211ENST00000513522 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa4.86□□□□□ -1.63
CCSER1-211ENST00000513522 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
CCSER1-211ENST00000513522 CABP5Q9NP86 173 aa4.86□□□□□ -1.63
CCSER1-211ENST00000513522 PICK1Q9NRD5 415 aa4.86□□□□□ -1.63
CCSER1-211ENST00000513522 TOMM22Q9NS69 142 aa4.86□□□□□ -1.63
CCSER1-211ENST00000513522 GINM1Q9NU53 330 aa4.86□□□□□ -1.63
CCSER1-211ENST00000513522 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa4.86□□□□□ -1.63
CCSER1-211ENST00000513522 FAM105AQ9NUU6 356 aa4.86□□□□□ -1.63
CCSER1-211ENST00000513522 NYAP2Q9P242 653 aa4.86□□□□□ -1.63
CCSER1-211ENST00000513522 CSADQ9Y600 493 aa4.86□□□□□ -1.63
CCSER1-211ENST00000513522 PLIN4Q96Q06 1357 aa4.86□□□□□ -1.63
CCSER1-211ENST00000513522 ECM29Q5VYK3 1845 aa4.86□□□□□ -1.63
CCSER1-211ENST00000513522 NAV1Q8NEY1 1877 aa4.86□□□□□ -1.63
CCSER1-211ENST00000513522 TMEM265A0A087WTH1 108 aa4.85□□□□□ -1.63
CCSER1-211ENST00000513522 TSPY2A6NKD2 308 aa4.85□□□□□ -1.63
CCSER1-211ENST00000513522 BTBD19C9JJ37 291 aa4.85□□□□□ -1.63
CCSER1-211ENST00000513522 F5H6K3 240 aa4.85□□□□□ -1.63
CCSER1-211ENST00000513522 ETV2O00321 342 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
CCSER1-211ENST00000513522 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
CCSER1-211ENST00000513522 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP4.85□□□□□ -1.63
CCSER1-211ENST00000513522 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
CCSER1-211ENST00000513522 PRC1O43663 620 aa4.85□□□□□ -1.63
CCSER1-211ENST00000513522 PEX10O60683 326 aa4.85□□□□□ -1.63
CCSER1-211ENST00000513522 NDUFB10O96000 172 aa4.85□□□□□ -1.63
CCSER1-211ENST00000513522 PCP11498 1178 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
CCSER1-211ENST00000513522 GLDCP23378 1020 aa4.85□□□□□ -1.63
CCSER1-211ENST00000513522 RPS6KB1P23443 525 aa4.85□□□□□ -1.63
CCSER1-211ENST00000513522 RBM25P49756 843 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
CCSER1-211ENST00000513522 HMGCS2P54868 508 aa4.85□□□□□ -1.63
CCSER1-211ENST00000513522 ATP2B2Q01814 1243 aa4.85□□□□□ -1.63
CCSER1-211ENST00000513522 KLRC3Q07444 240 aa4.85□□□□□ -1.63
CCSER1-211ENST00000513522 IKBKEQ14164 716 aa4.85□□□□□ -1.63
CCSER1-211ENST00000513522 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
CCSER1-211ENST00000513522 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
CCSER1-211ENST00000513522 DYMQ7RTS9 669 aa4.85□□□□□ -1.63
CCSER1-211ENST00000513522 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa4.85□□□□□ -1.63
CCSER1-211ENST00000513522 FAM43AQ8N2R8 423 aa4.85□□□□□ -1.63
CCSER1-211ENST00000513522 RGS22Q8NE09 1264 aa4.85□□□□□ -1.63
CCSER1-211ENST00000513522 NCOA7Q8NI08 942 aa4.85□□□□□ -1.63
CCSER1-211ENST00000513522 ESR2Q92731 530 aa4.85□□□□□ -1.63
CCSER1-211ENST00000513522 MKL1Q969V6 931 aa4.85□□□□□ -1.63
CCSER1-211ENST00000513522 KIRREL1Q96J84 757 aa4.85□□□□□ -1.63
CCSER1-211ENST00000513522 TTC14Q96N46 770 aa4.85□□□□□ -1.63
CCSER1-211ENST00000513522 KCNC2Q96PR1 638 aa4.85□□□□□ -1.63
CCSER1-211ENST00000513522 TMEM47Q9BQJ4 181 aa4.85□□□□□ -1.63
CCSER1-211ENST00000513522 MKNK1Q9BUB5 465 aa4.85□□□□□ -1.63
CCSER1-211ENST00000513522 C22orf23Q9BZE7 217 aa4.85□□□□□ -1.63
CCSER1-211ENST00000513522 KRT23Q9C075 422 aa4.85□□□□□ -1.63
CCSER1-211ENST00000513522 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa4.85□□□□□ -1.63
CCSER1-211ENST00000513522 VCPKMTQ9H867 229 aa4.85□□□□□ -1.63
CCSER1-211ENST00000513522 KANSL2Q9H9L4 492 aa4.85□□□□□ -1.63
CCSER1-211ENST00000513522 LY9Q9HBG7 655 aa4.85□□□□□ -1.63
CCSER1-211ENST00000513522 FBXO28Q9NVF7 368 aa4.85□□□□□ -1.63
CCSER1-211ENST00000513522 CLIP2Q9UDT6 1046 aa4.85□□□□□ -1.63
CCSER1-211ENST00000513522 BRPF3Q9ULD4 1205 aa4.85□□□□□ -1.63
CCSER1-211ENST00000513522 PLAGL2Q9UPG8 496 aa4.85□□□□□ -1.63
CCSER1-211ENST00000513522 TMX2Q9Y320 296 aa4.85□□□□□ -1.63
CCSER1-211ENST00000513522 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
CCSER1-211ENST00000513522 FOCADQ5VW36 1801 aa4.85□□□□□ -1.63
CCSER1-211ENST00000513522 TNKSO95271 1327 aa4.84□□□□□ -1.63
CCSER1-211ENST00000513522 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa4.84□□□□□ -1.63
CCSER1-211ENST00000513522 OVOL3O00110 214 aa4.84□□□□□ -1.63
CCSER1-211ENST00000513522 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
CCSER1-211ENST00000513522 DTNBO60941 627 aa4.84□□□□□ -1.63
CCSER1-211ENST00000513522 TTLL1O95922 423 aa4.84□□□□□ -1.63
CCSER1-211ENST00000513522 SNHG28P0DPA3 235 aa4.84□□□□□ -1.63
CCSER1-211ENST00000513522 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
CCSER1-211ENST00000513522 PDHBP11177 359 aa4.84□□□□□ -1.63
CCSER1-211ENST00000513522 TOP1P11387 765 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
CCSER1-211ENST00000513522 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
CCSER1-211ENST00000513522 VCAM1P19320 739 aa4.84□□□□□ -1.63
CCSER1-211ENST00000513522 RXRAP19793 462 aa4.84□□□□□ -1.63
CCSER1-211ENST00000513522 CASTP20810 708 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
CCSER1-211ENST00000513522 MCCP23508 829 aa4.84□□□□□ -1.63
CCSER1-211ENST00000513522 MCM5P33992 734 aa4.84□□□□□ -1.63
CCSER1-211ENST00000513522 TM4SF4P48230 202 aa4.84□□□□□ -1.63
CCSER1-211ENST00000513522 ANAPC15P60006 121 aa4.84□□□□□ -1.63
CCSER1-211ENST00000513522 CAP1Q01518 475 aa4.84□□□□□ -1.63
CCSER1-211ENST00000513522 PDE4CQ08493 712 aa4.84□□□□□ -1.63
CCSER1-211ENST00000513522 TROAPQ12815 778 aa4.84□□□□□ -1.63
CCSER1-211ENST00000513522 TRDNQ13061 729 aa4.84□□□□□ -1.63
CCSER1-211ENST00000513522 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
CCSER1-211ENST00000513522 SNAPC2Q13487 334 aa4.84□□□□□ -1.63
CCSER1-211ENST00000513522 MTMR3Q13615 1198 aa4.84□□□□□ -1.63
CCSER1-211ENST00000513522 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
CCSER1-211ENST00000513522 CCL15Q16663 113 aa4.84□□□□□ -1.63
CCSER1-211ENST00000513522 SLFN13Q68D06 897 aa4.84□□□□□ -1.63
CCSER1-211ENST00000513522 TTBK2Q6IQ55 1244 aa4.84□□□□□ -1.63
CCSER1-211ENST00000513522 GADL1Q6ZQY3 521 aa4.84□□□□□ -1.63
CCSER1-211ENST00000513522 Q6ZUG5 572 aa4.84□□□□□ -1.63
CCSER1-211ENST00000513522 KCTD1Q719H9 257 aa4.84□□□□□ -1.63
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