RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513165.1

HOXC-AS3-202, HOXC cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene HOXC-AS3, Length 533 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS3-202ENST00000513165 KCNJ14Q9UNX9 436 aa19.01■□□□□ 0.63
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP19.01■□□□□ 0.63
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TDP2O95551 362 aa19■□□□□ 0.63
HOXC-AS3-202ENST00000513165 C22orf31O95567 290 aa19■□□□□ 0.63
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NEK4P51957 841 aa19■□□□□ 0.63
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP19■□□□□ 0.63
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TMEM62Q0P6H9 643 aa19■□□□□ 0.63
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ZNF710Q8N1W2 664 aa19■□□□□ 0.63
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MICALL1Q8N3F8 863 aa19■□□□□ 0.63
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ASB2Q96Q27 587 aa19■□□□□ 0.63
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP19■□□□□ 0.63
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa18.99■□□□□ 0.63
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SEC24BO95487 1268 aa18.99■□□□□ 0.63
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ME3Q16798 604 aa18.99■□□□□ 0.63
HOXC-AS3-202ENST00000513165 INF2Q27J81 1249 aa18.99■□□□□ 0.63
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ODR4Q5SWX8 454 aa18.99■□□□□ 0.63
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PPP4R3AQ6IN85 833 aa18.99■□□□□ 0.63
HOXC-AS3-202ENST00000513165 B3GNT9Q6UX72 402 aa18.99■□□□□ 0.63
HOXC-AS3-202ENST00000513165 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP18.99■□□□□ 0.63
HOXC-AS3-202ENST00000513165 FBXO22Q8NEZ5 403 aa18.99■□□□□ 0.63
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ETNPPLQ8TBG4 499 aa18.99■□□□□ 0.63
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP18.99■□□□□ 0.63
HOXC-AS3-202ENST00000513165 C17orf80Q9BSJ5 609 aa18.99■□□□□ 0.63
HOXC-AS3-202ENST00000513165 UNC45AQ9H3U1 944 aa18.99■□□□□ 0.63
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MTUS1Q9ULD2 1270 aa18.99■□□□□ 0.63
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SIP14410 1827 aa18.99■□□□□ 0.63
HOXC-AS3-202ENST00000513165 COL4A6Q14031 1691 aa18.98■□□□□ 0.63
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TTC3P53804 2025 aa18.98■□□□□ 0.63
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ZNF862O60290 1169 aa18.98■□□□□ 0.63
HOXC-AS3-202ENST00000513165 OATP04181 439 aa18.98■□□□□ 0.63
HOXC-AS3-202ENST00000513165 FDPSP14324 419 aaKnown RBP18.98■□□□□ 0.63
HOXC-AS3-202ENST00000513165 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP18.98■□□□□ 0.63
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PAK2Q13177 524 aa18.98■□□□□ 0.63
HOXC-AS3-202ENST00000513165 EPC2Q52LR7 807 aa18.98■□□□□ 0.63
HOXC-AS3-202ENST00000513165 KRT40Q6A162 431 aa18.98■□□□□ 0.63
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CRIPAKQ8N1N5 446 aa18.98■□□□□ 0.63
HOXC-AS3-202ENST00000513165 GDPD5Q8WTR4 605 aa18.98■□□□□ 0.63
HOXC-AS3-202ENST00000513165 GTF3C6Q969F1 213 aa18.98■□□□□ 0.63
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP18.98■□□□□ 0.63
HOXC-AS3-202ENST00000513165 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP18.98■□□□□ 0.63
HOXC-AS3-202ENST00000513165 COG5Q9UP83 839 aa18.98■□□□□ 0.63
HOXC-AS3-202ENST00000513165 VCANP13611 3396 aa18.98■□□□□ 0.63
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CHMP2AO43633 222 aa18.97■□□□□ 0.63
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TMOD1P28289 359 aa18.97■□□□□ 0.63
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP18.97■□□□□ 0.63
HOXC-AS3-202ENST00000513165 AAK1Q2M2I8 961 aa18.97■□□□□ 0.63
HOXC-AS3-202ENST00000513165 LETM2Q2VYF4 491 aa18.97■□□□□ 0.63
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP18.97■□□□□ 0.63
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MIER3Q7Z3K6 550 aa18.97■□□□□ 0.63
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NEK8Q86SG6 692 aa18.97■□□□□ 0.63
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TMEM192Q8IY95 271 aa18.97■□□□□ 0.63
HOXC-AS3-202ENST00000513165 FIBCD1Q8N539 461 aa18.97■□□□□ 0.63
HOXC-AS3-202ENST00000513165 METTL13Q8N6R0 699 aa18.97■□□□□ 0.63
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NECAB1Q8N987 351 aa18.97■□□□□ 0.63
HOXC-AS3-202ENST00000513165 LINC01599Q8WXQ3 324 aa18.97■□□□□ 0.63
HOXC-AS3-202ENST00000513165 GJA10Q969M2 543 aa18.97■□□□□ 0.63
HOXC-AS3-202ENST00000513165 FAM20AQ96MK3 541 aa18.97■□□□□ 0.63
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CDHR5Q9HBB8 845 aa18.97■□□□□ 0.63
HOXC-AS3-202ENST00000513165 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP18.97■□□□□ 0.63
HOXC-AS3-202ENST00000513165 RWDD3Q9Y3V2 267 aa18.97■□□□□ 0.63
HOXC-AS3-202ENST00000513165 EVPLQ92817 2033 aa18.96■□□□□ 0.63
HOXC-AS3-202ENST00000513165 H3BNC9 293 aa18.96■□□□□ 0.63
HOXC-AS3-202ENST00000513165 GPR182O15218 404 aa18.96■□□□□ 0.63
HOXC-AS3-202ENST00000513165 RPS6KA5O75582 802 aa18.96■□□□□ 0.63
HOXC-AS3-202ENST00000513165 DGKIO75912 1065 aa18.96■□□□□ 0.63
HOXC-AS3-202ENST00000513165 RB1P06400 928 aa18.96■□□□□ 0.63
HOXC-AS3-202ENST00000513165 STAG3L1P0CL83 205 aa18.96■□□□□ 0.63
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PRKCEQ02156 737 aa18.96■□□□□ 0.63
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP18.96■□□□□ 0.63
HOXC-AS3-202ENST00000513165 EFCAB12Q6NXP0 572 aa18.96■□□□□ 0.63
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NPAS4Q8IUM7 802 aa18.96■□□□□ 0.63
HOXC-AS3-202ENST00000513165 LINC01465Q8N7H1 131 aa18.96■□□□□ 0.63
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP18.96■□□□□ 0.63
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ERVK-5Q9HDB9 667 aa18.96■□□□□ 0.63
HOXC-AS3-202ENST00000513165 GJB4Q9NTQ9 266 aa18.96■□□□□ 0.63
HOXC-AS3-202ENST00000513165 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP18.96■□□□□ 0.63
HOXC-AS3-202ENST00000513165 GINS2Q9Y248 185 aa18.96■□□□□ 0.63
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP18.96■□□□□ 0.63
HOXC-AS3-202ENST00000513165 C5orf67F2Z3F1 127 aa18.95■□□□□ 0.62
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TBX3O15119 743 aa18.95■□□□□ 0.62
HOXC-AS3-202ENST00000513165 GPR32O75388 356 aa18.95■□□□□ 0.62
HOXC-AS3-202ENST00000513165 LARGE1O95461 756 aa18.95■□□□□ 0.62
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP18.95■□□□□ 0.62
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP18.95■□□□□ 0.62
HOXC-AS3-202ENST00000513165 UGCGQ16739 394 aa18.95■□□□□ 0.62
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PTPROQ16827 1216 aa18.95■□□□□ 0.62
HOXC-AS3-202ENST00000513165 XKR3Q5GH77 459 aa18.95■□□□□ 0.62
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa18.95■□□□□ 0.62
HOXC-AS3-202ENST00000513165 OXER1Q8TDS5 423 aa18.95■□□□□ 0.62
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TMEM40Q8WWA1 233 aa18.95■□□□□ 0.62
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP18.95■□□□□ 0.62
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TMX1Q9H3N1 280 aa18.95■□□□□ 0.62
HOXC-AS3-202ENST00000513165 BRMS1Q9HCU9 246 aa18.95■□□□□ 0.62
HOXC-AS3-202ENST00000513165 KCNMB3Q9NPA1 279 aa18.95■□□□□ 0.62
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa18.95■□□□□ 0.62
HOXC-AS3-202ENST00000513165 REV3LO60673 3130 aa18.94■□□□□ 0.62
HOXC-AS3-202ENST00000513165 WDR81Q562E7 1941 aa18.94■□□□□ 0.62
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TTC28Q96AY4 2481 aa18.94■□□□□ 0.62
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SLC37A4O43826 429 aa18.94■□□□□ 0.62
HOXC-AS3-202ENST00000513165 BMPR1AP36894 532 aa18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.6 ms