RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000510829.6

RABGEF1-208, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,553 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-208ENST00000510829 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP12.1□□□□□ -0.47
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RABGEF1-208ENST00000510829 PON1P27169 355 aa12.07□□□□□ -0.48
RABGEF1-208ENST00000510829 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP12.07□□□□□ -0.48
RABGEF1-208ENST00000510829 CLEC4DQ8WXI8 215 aa12.07□□□□□ -0.48
RABGEF1-208ENST00000510829 MTFR1LQ9H019 292 aa12.07□□□□□ -0.48
RABGEF1-208ENST00000510829 ABCB6Q9NP58 842 aa12.07□□□□□ -0.48
RABGEF1-208ENST00000510829 TBC1D22BQ9NU19 505 aa12.07□□□□□ -0.48
RABGEF1-208ENST00000510829 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP12.07□□□□□ -0.48
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