RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493660.5

SMARCE1-211, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 2,284 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-211ENST00000493660 SNX29Q8TEQ0 813 aa7.97□□□□□ -1.13
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SMARCE1-211ENST00000493660 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP7.97□□□□□ -1.13
SMARCE1-211ENST00000493660 MMP19Q99542 508 aa7.97□□□□□ -1.13
SMARCE1-211ENST00000493660 ZNF577Q9BSK1 485 aa7.97□□□□□ -1.13
SMARCE1-211ENST00000493660 TEKT3Q9BXF9 490 aa7.97□□□□□ -1.13
SMARCE1-211ENST00000493660 ACBD3Q9H3P7 528 aa7.97□□□□□ -1.13
SMARCE1-211ENST00000493660 ANO10Q9NW15 660 aa7.97□□□□□ -1.13
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SMARCE1-211ENST00000493660 POTEMA6NI47 508 aa7.96□□□□□ -1.13
SMARCE1-211ENST00000493660 PP2D1A8MPX8 630 aa7.96□□□□□ -1.13
SMARCE1-211ENST00000493660 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP7.96□□□□□ -1.13
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SMARCE1-211ENST00000493660 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP7.96□□□□□ -1.13
SMARCE1-211ENST00000493660 GAS7O60861 476 aa7.96□□□□□ -1.13
SMARCE1-211ENST00000493660 CYP2C8P10632 490 aa7.96□□□□□ -1.13
SMARCE1-211ENST00000493660 FCER1AP12319 257 aa7.96□□□□□ -1.13
SMARCE1-211ENST00000493660 ITGB5P18084 799 aa7.96□□□□□ -1.13
SMARCE1-211ENST00000493660 EDNRBP24530 442 aa7.96□□□□□ -1.13
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SMARCE1-211ENST00000493660 UBXN2AP68543 259 aa7.96□□□□□ -1.13
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SMARCE1-211ENST00000493660 GRB10Q13322 594 aa7.96□□□□□ -1.13
SMARCE1-211ENST00000493660 MTMR1Q13613 665 aa7.96□□□□□ -1.13
SMARCE1-211ENST00000493660 KCTD2Q14681 263 aa7.96□□□□□ -1.13
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SMARCE1-211ENST00000493660 FILIP1LQ4L180 1135 aa7.96□□□□□ -1.13
SMARCE1-211ENST00000493660 HHATQ5VTY9 493 aa7.96□□□□□ -1.13
SMARCE1-211ENST00000493660 B3GNT9Q6UX72 402 aa7.96□□□□□ -1.13
SMARCE1-211ENST00000493660 DRC7Q8IY82 874 aa7.96□□□□□ -1.13
SMARCE1-211ENST00000493660 CYP2W1Q8TAV3 490 aa7.96□□□□□ -1.13
SMARCE1-211ENST00000493660 SPATA20Q8TB22 786 aa7.96□□□□□ -1.13
SMARCE1-211ENST00000493660 PTPN18Q99952 460 aa7.96□□□□□ -1.13
SMARCE1-211ENST00000493660 SLX1AQ9BQ83 275 aa7.96□□□□□ -1.13
SMARCE1-211ENST00000493660 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP7.96□□□□□ -1.13
SMARCE1-211ENST00000493660 LRRC27Q9C0I9 530 aa7.96□□□□□ -1.13
SMARCE1-211ENST00000493660 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP7.96□□□□□ -1.13
SMARCE1-211ENST00000493660 ARFGAP3Q9NP61 516 aa7.96□□□□□ -1.13
SMARCE1-211ENST00000493660 TBC1D22BQ9NU19 505 aa7.96□□□□□ -1.13
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SMARCE1-211ENST00000493660 EFCAB8A8MWE9 144 aa7.96□□□□□ -1.14
SMARCE1-211ENST00000493660 STRNO43815 780 aa7.96□□□□□ -1.14
SMARCE1-211ENST00000493660 ARP10275 920 aa7.96□□□□□ -1.14
SMARCE1-211ENST00000493660 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP7.96□□□□□ -1.14
SMARCE1-211ENST00000493660 PLCG1P19174 1290 aa7.96□□□□□ -1.14
SMARCE1-211ENST00000493660 RPA1P27694 616 aa7.96□□□□□ -1.14
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SMARCE1-211ENST00000493660 SARSP49591 514 aaKnown RBP7.96□□□□□ -1.14
SMARCE1-211ENST00000493660 ZNF75DP51815 510 aa7.96□□□□□ -1.14
SMARCE1-211ENST00000493660 NLRP12P59046 1061 aa7.96□□□□□ -1.14
SMARCE1-211ENST00000493660 AMPD3Q01432 767 aa7.96□□□□□ -1.14
SMARCE1-211ENST00000493660 STXBP2Q15833 593 aa7.96□□□□□ -1.14
SMARCE1-211ENST00000493660 Q3C1V9 767 aa7.96□□□□□ -1.14
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SMARCE1-211ENST00000493660 OTOP1Q7RTM1 612 aa7.96□□□□□ -1.14
SMARCE1-211ENST00000493660 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP7.96□□□□□ -1.14
SMARCE1-211ENST00000493660 RDM1Q8NG50 284 aa7.96□□□□□ -1.14
SMARCE1-211ENST00000493660 FAM200AQ8TCP9 573 aa7.96□□□□□ -1.14
SMARCE1-211ENST00000493660 PNMA5Q96PV4 448 aa7.96□□□□□ -1.14
SMARCE1-211ENST00000493660 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa7.96□□□□□ -1.14
SMARCE1-211ENST00000493660 TUFT1Q9NNX1 390 aa7.96□□□□□ -1.14
SMARCE1-211ENST00000493660 KCNH7Q9NS40 1196 aa7.96□□□□□ -1.14
SMARCE1-211ENST00000493660 KBTBD4Q9NVX7 518 aa7.96□□□□□ -1.14
SMARCE1-211ENST00000493660 MYO6Q9UM54 1294 aa7.96□□□□□ -1.14
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SMARCE1-211ENST00000493660 CDC25AP30304 524 aa7.95□□□□□ -1.14
SMARCE1-211ENST00000493660 MAPK4P31152 587 aa7.95□□□□□ -1.14
SMARCE1-211ENST00000493660 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
SMARCE1-211ENST00000493660 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
SMARCE1-211ENST00000493660 DPYDQ12882 1025 aa7.95□□□□□ -1.14
SMARCE1-211ENST00000493660 PNOCQ13519 176 aa7.95□□□□□ -1.14
SMARCE1-211ENST00000493660 EPHA7Q15375 998 aa7.95□□□□□ -1.14
SMARCE1-211ENST00000493660 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP7.95□□□□□ -1.14
SMARCE1-211ENST00000493660 CNNM4Q6P4Q7 775 aa7.95□□□□□ -1.14
SMARCE1-211ENST00000493660 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP7.95□□□□□ -1.14
SMARCE1-211ENST00000493660 IFNL1Q8IU54 200 aa7.95□□□□□ -1.14
SMARCE1-211ENST00000493660 MORC4Q8TE76 937 aa7.95□□□□□ -1.14
SMARCE1-211ENST00000493660 GSDMAQ96QA5 445 aa7.95□□□□□ -1.14
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SMARCE1-211ENST00000493660 BATF3Q9NR55 127 aa7.95□□□□□ -1.14
SMARCE1-211ENST00000493660 SUN2Q9UH99 717 aa7.95□□□□□ -1.14
SMARCE1-211ENST00000493660 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa7.95□□□□□ -1.14
SMARCE1-211ENST00000493660 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
SMARCE1-211ENST00000493660 ARID2Q68CP9 1835 aa7.95□□□□□ -1.14
SMARCE1-211ENST00000493660 THSD7BQ9C0I4 1608 aa7.95□□□□□ -1.14
SMARCE1-211ENST00000493660 SOWAHBA6NEL2 793 aa7.95□□□□□ -1.14
SMARCE1-211ENST00000493660 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
SMARCE1-211ENST00000493660 SFNP31947 248 aa7.95□□□□□ -1.14
SMARCE1-211ENST00000493660 TM4SF4P48230 202 aa7.95□□□□□ -1.14
SMARCE1-211ENST00000493660 KRT76Q01546 638 aa7.95□□□□□ -1.14
SMARCE1-211ENST00000493660 NCAPH2Q6IBW4 605 aa7.95□□□□□ -1.14
SMARCE1-211ENST00000493660 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
SMARCE1-211ENST00000493660 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa7.95□□□□□ -1.14
SMARCE1-211ENST00000493660 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
SMARCE1-211ENST00000493660 C3orf20Q8ND61 904 aa7.95□□□□□ -1.14
SMARCE1-211ENST00000493660 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
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