RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490540.1

ASIC3-208, Transcript of acid sensing ion channel subunit 3, human

TSL 2

Gene ASIC3, Length 520 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ASIC3-208	ENST00000490540	SCRN1	Q12765	414 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ASIC3-208	ENST00000490540	NPY5R	Q15761	445 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ASIC3-208	ENST00000490540	PUS10	Q3MIT2	529 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
ASIC3-208	ENST00000490540	ZNF746	Q6NUN9	644 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
ASIC3-208	ENST00000490540	TMEM192	Q8IY95	271 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ASIC3-208	ENST00000490540	TBCK	Q8TEA7	893 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ASIC3-208	ENST00000490540	SH3GLB2	Q9NR46	395 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ASIC3-208	ENST00000490540	TBC1D22B	Q9NU19	505 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ASIC3-208	ENST00000490540	GABBR1	Q9UBS5	961 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ASIC3-208	ENST00000490540	TCEAL9	Q9UHQ7	104 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ASIC3-208	ENST00000490540	PCDHA4	Q9UN74	947 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ASIC3-208	ENST00000490540	KCNJ14	Q9UNX9	436 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ASIC3-208	ENST00000490540	GINS2	Q9Y248	185 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ASIC3-208	ENST00000490540	SMIM35	A0A1B0GVV1	85 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ASIC3-208	ENST00000490540		H3BNC9	293 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ASIC3-208	ENST00000490540		M0QZ92	97 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ASIC3-208	ENST00000490540	DCX	O43602	365 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ASIC3-208	ENST00000490540	CSPG5	O95196	566 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ASIC3-208	ENST00000490540	TDP2	O95551	362 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ASIC3-208	ENST00000490540	IBSP	P21815	317 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
ASIC3-208	ENST00000490540	SLC26A2	P50443	739 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ASIC3-208	ENST00000490540	KRT76	Q01546	638 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ASIC3-208	ENST00000490540	TMEM266	Q2M3C6	531 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ASIC3-208	ENST00000490540	IER5	Q5VY09	327 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ASIC3-208	ENST00000490540	ERICH6B	Q5W0A0	696 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ASIC3-208	ENST00000490540	BLID	Q8IZY5	108 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ASIC3-208	ENST00000490540	TNPO1	Q92973	898 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
ASIC3-208	ENST00000490540	SAMD11	Q96NU1	681 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ASIC3-208	ENST00000490540	CELF4	Q9BZC1	486 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
ASIC3-208	ENST00000490540	NSUN3	Q9H649	340 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
ASIC3-208	ENST00000490540	CDHR5	Q9HBB8	845 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ASIC3-208	ENST00000490540	GJB4	Q9NTQ9	266 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ASIC3-208	ENST00000490540	CLDND1	Q9NY35	253 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ASIC3-208	ENST00000490540	TPCN1	Q9ULQ1	816 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ASIC3-208	ENST00000490540	SAMM50	Q9Y512	469 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ASIC3-208	ENST00000490540	MUC6	Q6W4X9	2439 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ASIC3-208	ENST00000490540	C22orf31	O95567	290 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ASIC3-208	ENST00000490540	PSAP	P07602	524 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ASIC3-208	ENST00000490540	MRE11	P49959	708 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ASIC3-208	ENST00000490540	ZP2	Q05996	745 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ASIC3-208	ENST00000490540	PAK2	Q13177	524 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ASIC3-208	ENST00000490540	CLUL1	Q15846	466 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ASIC3-208	ENST00000490540	UGCG	Q16739	394 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ASIC3-208	ENST00000490540	ZNF484	Q5JVG2	852 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ASIC3-208	ENST00000490540	CPLX2	Q6PUV4	134 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
ASIC3-208	ENST00000490540	RTN4RL1	Q86UN2	441 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
ASIC3-208	ENST00000490540	SMAP1	Q8IYB5	467 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
ASIC3-208	ENST00000490540	KIAA0319L	Q8IZA0	1049 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ASIC3-208	ENST00000490540	PABPC5	Q96DU9	382 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
ASIC3-208	ENST00000490540	TMX1	Q9H3N1	280 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ASIC3-208	ENST00000490540	UNC45A	Q9H3U1	944 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ASIC3-208	ENST00000490540	PADI3	Q9ULW8	664 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ASIC3-208	ENST00000490540	PCDHA10	Q9Y5I2	948 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ASIC3-208	ENST00000490540	MAFB	Q9Y5Q3	323 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
ASIC3-208	ENST00000490540	IGSF9B	Q9UPX0	1349 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ASIC3-208	ENST00000490540	COL1A2	P08123	1366 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ASIC3-208	ENST00000490540	WDR64	B1ANS9	1081 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ASIC3-208	ENST00000490540		M0R2N6	131 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ASIC3-208	ENST00000490540	ZNF862	O60290	1169 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ASIC3-208	ENST00000490540	GAS7	O60861	476 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ASIC3-208	ENST00000490540	LARGE1	O95461	756 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ASIC3-208	ENST00000490540	RPLP2	P05387	115 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
ASIC3-208	ENST00000490540	CTNNB1	P35222	781 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ASIC3-208	ENST00000490540	USP11	P51784	963 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ASIC3-208	ENST00000490540	AK2	P54819	239 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ASIC3-208	ENST00000490540	LRCH2	Q5VUJ6	765 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ASIC3-208	ENST00000490540	FIBCD1	Q8N539	461 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ASIC3-208	ENST00000490540	NECAB1	Q8N987	351 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ASIC3-208	ENST00000490540	DAGLB	Q8NCG7	672 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ASIC3-208	ENST00000490540	TMEM40	Q8WWA1	233 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ASIC3-208	ENST00000490540	BBX	Q8WY36	941 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
ASIC3-208	ENST00000490540	SLC5A5	Q92911	643 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ASIC3-208	ENST00000490540	IL17RA	Q96F46	866 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ASIC3-208	ENST00000490540	SLK	Q9H2G2	1235 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
ASIC3-208	ENST00000490540	RC3H2	Q9HBD1	1191 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
ASIC3-208	ENST00000490540	DISC1	Q9NRI5	854 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ASIC3-208	ENST00000490540	FAM50B	Q9Y247	325 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ASIC3-208	ENST00000490540	NOC2L	Q9Y3T9	749 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
ASIC3-208	ENST00000490540	MICAL3	Q7RTP6	2002 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ASIC3-208	ENST00000490540	COL4A6	Q14031	1691 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ASIC3-208	ENST00000490540	ADGRA3	Q8IWK6	1321 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ASIC3-208	ENST00000490540	MGEA5	O60502	916 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ASIC3-208	ENST00000490540	PFKFB2	O60825	505 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ASIC3-208	ENST00000490540	CTDNEP1	O95476	244 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ASIC3-208	ENST00000490540	SEC24B	O95487	1268 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ASIC3-208	ENST00000490540	VTN	P04004	478 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ASIC3-208	ENST00000490540	GATM	P50440	423 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ASIC3-208	ENST00000490540	CLCN3	P51790	818 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ASIC3-208	ENST00000490540	PRKCE	Q02156	737 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ASIC3-208	ENST00000490540	NHLH1	Q02575	133 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ASIC3-208	ENST00000490540	NFX1	Q12986	1120 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
ASIC3-208	ENST00000490540	INF2	Q27J81	1249 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ASIC3-208	ENST00000490540	KIZ	Q2M2Z5	673 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ASIC3-208	ENST00000490540	NME8	Q8N427	588 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ASIC3-208	ENST00000490540	LRRC71	Q8N4P6	559 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ASIC3-208	ENST00000490540	METTL13	Q8N6R0	699 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ASIC3-208	ENST00000490540	OXER1	Q8TDS5	423 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ASIC3-208	ENST00000490540	ZNF668	Q96K58	619 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
ASIC3-208	ENST00000490540	FBXL18	Q96ME1	805 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ASIC3-208	ENST00000490540	OSMR	Q99650	979 aa		13.54	□□□□□ -0.24

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